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Interdisciplinary CompetenceMolecular Diagnostics
Know how in the analysis of genetic material.
For the benefit of patients.

IllnessOptic atrophy, autosomal dominant; differential diagnosis

Summary

Short information

Comprehensive differential diagnostic panel for Optic atrophy, autosomal dominant, comprising 3 core and altogether 15 curated genes according to the clinical signs

ID
OP0050
Number of genes
11 Accredited laboratory test
Examined sequence length
22,6 kb (Core-/Core-canditate-Genes)
- (Extended panel: incl. additional genes)
Analysis Duration
on request
Test material
  • EDTA-anticoagulated blood (3-5 ml)
Diagnostic indications

NGS +

[Sanger]

 

Gene panel

Selected genes

NameExon Length (bp)OMIM-GReferenz-Seq.Heredity
AFG3L22394NM_006796.3AD, AR
ATAD3A1761NM_001170535.3AD
DNM1L2211NM_012062.5AD
MFN22274NM_014874.4
NR2F11272NM_005654.6AD
OPA12883NM_015560.3AD, AR
OPA3540NM_025136.4AD, AR
POLG3720NM_002693.3AD, AR
SPG72388NM_003119.4AR, AD
SSBP1447NM_001256510.1AD, AR
WFS12673NM_006005.3AD, AR

Informations about the disease

Clinical Comment

Optic atrophy or optic neuropathy is the end stage of a disease process affecting the retinogenic part of the visual pathway by neurovascular degeneration. Dominant optic neuropathies are also characterized by degeneration of retinal ganglion cells, leading to bilateral optic atrophy and progressive loss of visual acuity. In addition, these patients often suffer from impaired color vision. Among the most common forms of hereditary optic neuropathies is dominant optic atrophy, which may be accompanied by sensorineural hearing loss or severe neurologic symptoms in one-fifth of cases. In the disease, neuronal and axonal energy supply by mitochondria is affected. Autosomal dominant optic atrophy is usually diagnosed in the first decade of life. Molecular genetic diagnosis provides a conclusive result in the majority of cases studied. However, inconspicuous genetic findings do not mean exclusion of the suspected ophthalmologic diagnosis.

Reference: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1248/

 

Synonyms
  • Sympt.: Color vision deficits + centrocecal scotoma of variable density
  • Sympt.: Visual impairment in early childhood, loss of visual acuity, temporal optic disc pallor
  • Alias: AD optic atrophy
  • Allelic: 3-methylglutaconic aciduria, type III (OPA3)
  • Allelic: Cataract 41 (WFS1)
  • Allelic: Charcot-Marie-Tooth disease, axonal, types 2A2A + 2A2B (MFN2)
  • Allelic: Deafness, AD 6, 14, 38 (WFS1)
  • Allelic: Diabetes mellitus, noninsulin-dependent, association with (WFS1)
  • Allelic: Encephalopathy, lethal, due to defective mitochondrial peroxisomal fission 1 (DNM1L)
  • Allelic: Glaucoma, normal tension, susceptibility to (OPA1)
  • Allelic: Hemolytic anemia due to hexokinase deficiency (HK1)
  • Allelic: Mitochondrial AR ataxia syndrome, includes SANDO + SCAE (POLG)
  • Allelic: Mitochondrial DNA depletion syndrome 14, encephalocardiomyopathic type (OPA1)
  • Allelic: Mitochondrial DNA depletion syndrome 4A, Alpers + 4B, MNGIE type (POLG)
  • Allelic: Progressive external ophthalmoplegia, AR 1
  • Allelic: Spastic ataxia 5, AR (AFG3L2)
  • Allelic: Spastic paraplegia 43, AR (C19orf12)
  • Allelic: Spinocerebellar ataxia 28 (AFG3L2)
  • Behr syndrome (OPA1)
  • Bosch-Boonstra-Schaaf optic atrophy syndrome (NR2F1)
  • Harel-Yoon syndrome (ATAD3A)
  • Hereditary motor + sensory neuropathy VIA (MFN2)
  • Infantile cerebellar-retinal degeneration (ACO2)
  • Neurodegeneration with brain iron accumulation 4 (C19orf12)
  • Neurodevelopmental disorder with visual defects + brain anomalies (HK1)
  • Neuropathy, hereditary motor + sensory, Russe type (HK1)
  • Optic atrophy 1 (OPA1)
  • Optic atrophy 12 (AFG3L2)
  • Optic atrophy 13 with retinal + foveal abnormalities (SSBP1)
  • Optic atrophy 3 with cataract (OPA3)
  • Optic atrophy 5 (DNM1L)
  • Optic atrophy 9 (ACO2)
  • Optic atrophy plus syndrome (OPA1)
  • Progressive external ophthalmoplegia, AD 1 (POLG)
  • Retinitis pigmentosa 79 (HK1)
  • Wolfram syndrome 1 (WFS1)
  • Wolfram-like syndrome, AD (WFS1)
Heredity, heredity patterns etc.
  • AD
  • AR
OMIM-Ps
  • Multiple OMIM-Ps
ICD10 Code

Bioinformatics and clinical interpretation

Test-Stärken

  • DAkkS-akkreditiertes Labor
  • EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
  • Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
  • Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
  • Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
  • eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
  • unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
  • unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
  • unsere umfassenden klinischen Aussagen

Testeinschränkungen

  • Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
  • Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
  • es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
  • die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
  • Gen-Konversionen
  • komplexe Inversionen
  • Balancierte Translokationen
  • Mitochondriale Varianten
  • Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
  • nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
  • niedriger Mosaik-Status
  • Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
  • Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
  • Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
  • Varianten innerhalb von Pseudogenen
  • die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde

Laboratory requirement

  • Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.

  • Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.

  • Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.

  • Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.