IllnessOsteogenesis imperfecta, differential diagnosis
Summary
Comprehensive differential diagnostic panel for Osteogenesis imperfecta comprising 16 guideline-curated and altogether 39 curated genes according to the clinical signs
66,2 kb (Extended panel: incl. additional genes)
- EDTA-anticoagulated blood (3-5 ml)
NGS +
[Sanger]
Gene panel
Selected genes
Name | Exon Length (bp) | OMIM-G | Referenz-Seq. | Heredity |
---|---|---|---|---|
BMP1 | 2961 | NM_006129.5 | AR | |
COL1A1 | 4395 | NM_000088.4 | AD | |
COL1A2 | 4101 | NM_000089.4 | AD | |
CREB3L1 | 1560 | NM_052854.4 | AD | |
CRTAP | 1206 | NM_006371.5 | AR | |
FKBP10 | 1749 | NM_021939.4 | AR | |
IFITM5 | 399 | NM_001025295.3 | AD | |
P3H1 | 2211 | NM_022356.4 | AR | |
P4HB | 1540 | NM_000918.4 | AD | |
PLOD2 | 2277 | NM_182943.3 | AR | |
PPIB | 651 | NM_000942.5 | AD | |
SERPINF1 | 1257 | NM_002615.7 | AR | |
SERPINH1 | 1257 | NM_001235.5 | AR | |
SP7 | 1296 | NM_001173467.3 | AR | |
TMEM38B | 876 | NM_018112.3 | AD | |
WNT1 | 1113 | NM_005430.4 | AD, AR | |
ALPL | 1575 | NM_000478.6 | AD, AR | |
B3GALT6 | 990 | NM_080605.4 | AR | |
B4GALT7 | 984 | NM_007255.3 | AR | |
CASR | 3237 | NM_000388.4 | AD, AR | |
COPB2 | 2743 | NM_004766.3 | AR | |
GORAB | 1185 | NM_152281.3 | AR | |
LRP5 | 4848 | NM_002335.4 | AD, AR | |
MBTPS2 | 1560 | NM_015884.4 | XLR | |
MESD | 705 | NM_015154.3 | AR | |
NBAS | 7116 | NM_015909.4 | AR | |
NUDT6 | 951 | NM_007083.5 | AR | |
PLS3 | 1893 | NM_005032.7 | XL | |
SEC24D | 3099 | NM_014822.4 | AD | |
SPARC | 1037 | NM_003118.4 | AR | |
TAPT1 | 1745 | NM_153365.3 | AR | |
TENT5A | 1368 | NM_017633.3 | AR | |
TRPV6 | 2313 | NM_018646.6 | AR |
Informations about the disease
Osteogenesis imperfecta (OI) comprises a heterogeneous group of genetic disorders with increased bone fragility, low bone mass and susceptibility to fractures of varying degrees of severity, sometimes even prenatally. At least 20 forms of OI are recognised and several types are distinguished by their symptoms, although characteristic features also overlap. Increasingly, mutated genes are used to define rarer OI forms. Type I is the mildest form and is known as classical non-deforming OI with blue sclerae. Type II (also known as perinatal lethal) is the most severe form. Other forms, including types III (progressively deforming OI) and IV (frequent variable OI with normal sclerae), have symptoms that lie between the above extremes. In addition to all classic hereditary forms (with variable expressivity), some of the most severe OI forms also or only after sporadic new mutations. Mutations in the COL1A1 (5-70%) and COL1A2 (5-30%) genes make up by far the largest proportion of OI causes. The diagnostic yield of OI is very high, especially with a large panel 98% and more clear diagnostic statements can be achieved.
Reference: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1295/
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK540447/
- Alias: Brittle bone disease
- Alias: Glass bone disease
- Alias: Lobstein disease
- Alias: Osteopsathyrosis
- Allelic: Bone mineral density variability 1 (LRP5)
- Allelic: Bone mineral density variation QTL, osteoporosis (COL1A1)
- Allelic: Deafness, AD 39, with dentinogenesis (DSPP)
- Allelic: Exudative vitreoretinopathy 4 (LRP5)
- Allelic: Hyperostosis, endosteal (LRP5)
- Allelic: IFAP syndrome with/-out BRESHECK syndrome (MBTPS2)
- Allelic: Keratosis follicularis spinulosa decalvans, XL (MBTPS2)
- Allelic: Microcephaly 19, primary, AR (COPB2)
- Allelic: Olmsted syndrome, XL (MBTPS2)
- Allelic: Osteopenia [panelapp] (SUCO)
- Allelic: Osteoporosis (LRP5)
- Allelic: Osteoporosis, early-onset, susceptibility to, AD (WNT1)
- Allelic: Osteoporosis-pseudoglioma syndrome (LRP5)
- Allelic: Osteosclerosis (LRP5)
- Allelic: Polycystic liver disease 4 with/-out kidney cysts (LRP5)
- Allelic: Preterm premature rupture of the membranes, susceptibility to (SERPINH1)
- Allelic: Skeletal dysplasia [HP:0002652, panelapp] (SUCO)
- Allelic: Skeletal dysplasias [panelapp] (NOTCH2)
- Allelic: van Buchem disease, type 2 (LRP5)
- Bruck syndrome 1 (FKBP10)
- Caffey disease (COL1A1)
- Cole-Carpenter syndrome 1 (P4HB)
- Dentin dysplasia, type II (DSPP)
- Dentinogenesis imperfecta, Shields type II (DSPP)
- Dentinogenesis imperfecta, Shields type III (DSPP)
- Ehlers-Danlos syndrome, arthrochalasia type, 1 (COL1A1)
- Ehlers-Danlos syndrome, arthrochalasia type, 2 (COL1A2)
- Ehlers-Danlos syndrome, cardiac valvular type (COL1A2)
- Hyperparathyroidism, transient neonatal (TRPV6)
- Microcephaly 19, primary, AR (COPB2)
- No fracture [panelapp] (DSPP)
- Osteochondrodysplasia, complex lethal, Symoens-Barnes-Gistelinck type (TAPT1)
- Osteogenesis imperfecta + decreased bone density [panelapp] (NOTCH2)
- Osteogenesis imperfecta [MONDO:0019019, panelapp] (SUCO)
- Osteogenesis imperfecta, type I-IV (COL1A1)
- Osteogenesis imperfecta, type II-IV (COL1A2)
- Osteogenesis imperfecta, type V (IFITM5)
- Osteogenesis imperfecta, type VI (SERPINF1)
- Osteogenesis imperfecta, type VII (CRTAP)
- Osteogenesis imperfecta, type VIII (P3H1 syn. LEPRE1)
- Osteogenesis imperfecta, type X (SERPINH1)
- Osteogenesis imperfecta, type XI (FKBP10)
- Osteogenesis imperfecta, type XII (SP7)
- Osteogenesis imperfecta, type XIII (BMP1)
- Osteogenesis imperfecta, type XIV (TMEM38B)
- Osteogenesis imperfecta, type XIX (MBTPS2)
- Osteogenesis imperfecta, type XV (WNT1)
- Osteogenesis imperfecta, type XVI (CREB3L1)
- Osteogenesis imperfecta, type XVII (SPARC)
- Osteogenesis imperfecta, type XVIII (TENT5A syn. FAM46A)
- Osteogenesis imperfecta, type XX (MESD)
- Osteogenesis imperfecta, type XXI (KDELR2)
- Osteootohepatoenteric syndrome (UNC45A)
- Osteopetrosis, AD 1 (LRP5)
- Osteoporosis, childhood- or juvenile-onset, with developmental delay (COPB2)
- Osteoporosis, postmenopausal (COL1A2)
- Recurr. fractures, add. skelet. signs, short-limb dwarfism, bowed legs, scoliosis [panelapp] (NUDT6)
- AD
- AR
- XL
- XLR
- Multiple OMIM-Ps
Bioinformatics and clinical interpretation
Test-Stärken
- DAkkS-akkreditiertes Labor
- EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
- Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
- Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
- Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
- eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
- unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
- unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
- unsere umfassenden klinischen Aussagen
Testeinschränkungen
- Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
- Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
- es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
- die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
- Gen-Konversionen
- komplexe Inversionen
- Balancierte Translokationen
- Mitochondriale Varianten
- Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
- nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
- niedriger Mosaik-Status
- Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
- Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
- Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
- Varianten innerhalb von Pseudogenen
- die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde
Laboratory requirement
Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.
Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.
Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.
Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.