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Klinische FragestellungOsteogenesis imperfecta, Differentialdiagnose

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Zusammenfassung

Kurzinformation

Umfassendes differentialdiagnostisches panel für Osteogenesis imperfecta mit 16 Leitlinien-kuratierten bzw. zusammengenommen 39 kuratierten Genen gemäß klinischer Verdachtsdiagnose

ID
OP0100
Anzahl Gene
33 Akkreditierte Untersuchung
Untersuchte Sequenzlänge
28,9 kb (Core-/Core-canditate-Gene)
66,2 kb (Erweitertes Panel: inkl. additional genes)
Analyse-Dauer
auf Anfrage
Untersuchungsmaterial
  • EDTA-Blut (3-5 ml)
Diagnostische Hinweise

NGS +

[Sanger]

 

Genpanel

Ausgewählte Gene

NameExon-Länge (bp)OMIM-GReferenz-Seq.Erbgang
BMP12961NM_006129.5AR
COL1A14395NM_000088.4AD
COL1A24101NM_000089.4AD
CREB3L11560NM_052854.4AD
CRTAP1206NM_006371.5AR
FKBP101749NM_021939.4AR
IFITM5399NM_001025295.3AD
P3H12211NM_022356.4AR
P4HB1540NM_000918.4AD
PLOD22277NM_182943.3AR
PPIB651NM_000942.5AD
SERPINF11257NM_002615.7AR
SERPINH11257NM_001235.5AR
SP71296NM_001173467.3AR
TMEM38B876NM_018112.3AD
WNT11113NM_005430.4AD, AR
ALPL1575NM_000478.6AD, AR
B3GALT6990NM_080605.4AR
B4GALT7984NM_007255.3AR
CASR3237NM_000388.4AD, AR
COPB22743NM_004766.3AR
GORAB1185NM_152281.3AR
LRP54848NM_002335.4AD, AR
MBTPS21560NM_015884.4XLR
MESD705NM_015154.3AR
NBAS7116NM_015909.4AR
NUDT6951NM_007083.5AR
PLS31893NM_005032.7XL
SEC24D3099NM_014822.4AD
SPARC1037NM_003118.4AR
TAPT11745NM_153365.3AR
TENT5A1368NM_017633.3AR
TRPV62313NM_018646.6AR

Infos zur Erkrankung

Klinischer Kommentar

Osteogenesis imperfecta (OI) umfasst eine heterogene Gruppe von genetischen Störungen mit erhöhter Knochenbrüchigkeit, geringer Knochenmasse und Anfälligkeit für Knochenbrüche mit unterschiedlichem Schweregrad, mitunter sogar schon pränatal. Mindestens 20 OI-Formen sind anerkannt, mehrere Typen werden durch ihre Symptomatik unterschieden, obwohl sich auch charakteristische Merkmale überlappen. Zunehmend werden die mutierten Gene herangezogen, um seltenere OI-Formen zu definieren. Typ I ist die mildeste Form und bekannt als klassische nicht-deformierende OI mit blauen Skleren. Typ II (auch bekannt als perinatal tödlich) ist die schwerste Form. Andere Verlaufsformen einschließlich der Typen III (progressiv deformierende OI) und IV (häufige, variable OI mit normalen Skleren), weisen Symptome auf, die zwischen den oben genannten Extremen liegen. Neben allen klassischen Erbgängen (mit variabler Expressivität) treten einige schwerste OI-Formen auch oder nur nach sporadischen Neumutationen auf. Mutationen in den COL1A1- (5-70%) und COL1A2-Genen (5-30%) machen den weitaus größten Anteil der OI-Ursachen aus. Die diagnostische Ausbeute ist bei OI sehr hoch, insbesondere erreicht man mit einem umfangreichen panel 98% und mehr eindeutige diagnostische Aussagen.

Referenz: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1295/

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK540447/

 

Synonyme
  • Alias: Brittle bone disease
  • Alias: Glass bone disease
  • Alias: Lobstein disease
  • Alias: Osteopsathyrosis
  • Allelic: Bone mineral density variability 1 (LRP5)
  • Allelic: Bone mineral density variation QTL, osteoporosis (COL1A1)
  • Allelic: Deafness, AD 39, with dentinogenesis (DSPP)
  • Allelic: Exudative vitreoretinopathy 4 (LRP5)
  • Allelic: Hyperostosis, endosteal (LRP5)
  • Allelic: IFAP syndrome with/-out BRESHECK syndrome (MBTPS2)
  • Allelic: Keratosis follicularis spinulosa decalvans, XL (MBTPS2)
  • Allelic: Microcephaly 19, primary, AR (COPB2)
  • Allelic: Olmsted syndrome, XL (MBTPS2)
  • Allelic: Osteopenia [panelapp] (SUCO)
  • Allelic: Osteoporosis (LRP5)
  • Allelic: Osteoporosis, early-onset, susceptibility to, AD (WNT1)
  • Allelic: Osteoporosis-pseudoglioma syndrome (LRP5)
  • Allelic: Osteosclerosis (LRP5)
  • Allelic: Polycystic liver disease 4 with/-out kidney cysts (LRP5)
  • Allelic: Preterm premature rupture of the membranes, susceptibility to (SERPINH1)
  • Allelic: Skeletal dysplasia [HP:0002652, panelapp] (SUCO)
  • Allelic: Skeletal dysplasias [panelapp] (NOTCH2)
  • Allelic: van Buchem disease, type 2 (LRP5)
  • Bruck syndrome 1 (FKBP10)
  • Caffey disease (COL1A1)
  • Cole-Carpenter syndrome 1 (P4HB)
  • Dentin dysplasia, type II (DSPP)
  • Dentinogenesis imperfecta, Shields type II (DSPP)
  • Dentinogenesis imperfecta, Shields type III (DSPP)
  • Ehlers-Danlos syndrome, arthrochalasia type, 1 (COL1A1)
  • Ehlers-Danlos syndrome, arthrochalasia type, 2 (COL1A2)
  • Ehlers-Danlos syndrome, cardiac valvular type (COL1A2)
  • Hyperparathyroidism, transient neonatal (TRPV6)
  • Microcephaly 19, primary, AR (COPB2)
  • No fracture [panelapp] (DSPP)
  • Osteochondrodysplasia, complex lethal, Symoens-Barnes-Gistelinck type (TAPT1)
  • Osteogenesis imperfecta + decreased bone density [panelapp] (NOTCH2)
  • Osteogenesis imperfecta [MONDO:0019019, panelapp] (SUCO)
  • Osteogenesis imperfecta, type I-IV (COL1A1)
  • Osteogenesis imperfecta, type II-IV (COL1A2)
  • Osteogenesis imperfecta, type V (IFITM5)
  • Osteogenesis imperfecta, type VI (SERPINF1)
  • Osteogenesis imperfecta, type VII (CRTAP)
  • Osteogenesis imperfecta, type VIII (P3H1 syn. LEPRE1)
  • Osteogenesis imperfecta, type X (SERPINH1)
  • Osteogenesis imperfecta, type XI (FKBP10)
  • Osteogenesis imperfecta, type XII (SP7)
  • Osteogenesis imperfecta, type XIII (BMP1)
  • Osteogenesis imperfecta, type XIV (TMEM38B)
  • Osteogenesis imperfecta, type XIX (MBTPS2)
  • Osteogenesis imperfecta, type XV (WNT1)
  • Osteogenesis imperfecta, type XVI (CREB3L1)
  • Osteogenesis imperfecta, type XVII (SPARC)
  • Osteogenesis imperfecta, type XVIII (TENT5A syn. FAM46A)
  • Osteogenesis imperfecta, type XX (MESD)
  • Osteogenesis imperfecta, type XXI (KDELR2)
  • Osteootohepatoenteric syndrome (UNC45A)
  • Osteopetrosis, AD 1 (LRP5)
  • Osteoporosis, childhood- or juvenile-onset, with developmental delay (COPB2)
  • Osteoporosis, postmenopausal (COL1A2)
  • Recurr. fractures, add. skelet. signs, short-limb dwarfism, bowed legs, scoliosis [panelapp] (NUDT6)
Erbgänge, Vererbungsmuster etc.
  • AD
  • AR
  • XL
  • XLR
OMIM-Ps
  • Multiple OMIM-Ps
ICD10 Code

Bioinformatik und klinische Interpretation

Test-Stärken

  • DAkkS-akkreditiertes Labor
  • EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
  • Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
  • Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
  • Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
  • eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
  • unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
  • unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
  • unsere umfassenden klinischen Aussagen

Testeinschränkungen

  • Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
  • Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
  • es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
  • die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
  • Gen-Konversionen
  • komplexe Inversionen
  • Balancierte Translokationen
  • Mitochondriale Varianten
  • Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
  • nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
  • niedriger Mosaik-Status
  • Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
  • Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
  • Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
  • Varianten innerhalb von Pseudogenen
  • die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde

Laboranforderung

  • Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.

  • Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.

  • Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.

  • Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.