IllnessPorphyria, differential diagnosis
Summary
Comprehensive differential diagnostic panel for Porphyria containing 4 core genes, 5 core candidate genes and altogether 14 curated genes according to the clinical signs
19,8 kb (Extended panel: incl. additional genes)
- EDTA-anticoagulated blood (3-5 ml)
NGS +
[Sanger]
Gene panel
Selected genes
Name | Exon Length (bp) | OMIM-G | Referenz-Seq. | Heredity |
---|---|---|---|---|
ALAD | 993 | NM_000031.6 | AR | |
ALAS2 | 1764 | NM_000032.5 | XL | |
CPOX | 1365 | NM_000097.7 | AD, AR | |
FECH | 1272 | NM_000140.5 | AR | |
GATA1 | 1242 | NM_002049.4 | XLR | |
HMBS | 1086 | NM_000190.4 | AD | |
PPOX | 1434 | NM_000309.5 | AD, AR | |
UROD | 1104 | NM_000374.5 | AD, AR | |
UROS | 798 | NM_000375.3 | AR | |
CLPX | 1916 | NM_006660.5 | AD | |
HFE | 1047 | NM_000410.4 | AD, AR, Sus | |
RECQL4 | 3628 | NM_004260.4 | AR | |
UVSSA | 2130 | NM_020894.4 | AR |
Informations about the disease
The porphyria group consists of hereditary metabolic diseases that lead to enzyme defects in the synthesis of the red blood pigment heme as a result of pathogenic variants in different genes. Depending on the enzyme affected, various intermediate products accumulate which are responsible for the characteristic symptoms of the various forms of porphyrias. Blood, stool and/or urine analyses of total porphyrins and the intermediate products of heme synthesis can be used to make a suspected diagnosis, which can be confirmed by genetic testing.
Porphyrias are divided into two forms according to clinical symptoms: On the one hand, “acute porphyrias” (ALA dehydrase deficiency porphyria, acute intermittent porphyria, porphyria variegata, hereditary coproporphyria), in which acute abdominal symptoms (colicky abdominal pain, vomiting, constipation) occur in episodes together with neurological deficits (seizures, paresis), neurovegetative symptoms (tachycardia, hypertension) and psychiatric abnormalities (so-called neuro-visceral form). Reddish urine is typical, but only during acute attacks. The most common acute porphyria is acute intermittent porphyria (AIP), which can lead to coma and tetraplegia in severe cases. On the other hand, there are the so-called “non-acute porphyrias” (porphyria cutanea tarda, hepatoerythropoietic porphyria, congenital erythropoietic porphyria, erythropoietic protoporphyria, X-linked dominant protoporphyria), which usually involve the skin (photodermatoses, blistering, pigment disorders, hypersensitivity (pain, burning, itching, redness, especially after sun exposure). In two forms of porphyrias, hereditary coproporphyria and porphyria variegata, both acute neurovisceral and chronic cutaneous symptoms can occur.
Porphyrias can be further subdivided according to the main site of formation of the intermediate products of haem synthesis: hepatic porphyrias (main site of formation in the liver) and erythropoietic porphyrias (main site of formation in the bone marrow).
In the case of porphyria, the genes coding for the enzymes of heme synthesis are examined so that all forms of porphyria and genetic differential diagnoses (e.g. hemochromatosis, UV hypersensitivity) are covered. The various forms of porphyrias are inherited differently: most forms are inherited autosomal-dominantly with reduced penetrance. Autosomal recessive (e.g. variants in ALAD) and X-linked inheritance (e.g. variants in ALAS2) are also possible. If a genetic diagnosis has been confirmed in the family, predictive tests for the gene variant(s) can be carried out on relatives.
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1193/
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK143129/
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK121283/
https://flexikon.doccheck.com/de/Porphyrie
- Alias: Inherited defects in the biosynthesis of heme
- Allelic: Alzheimer disease, susceptibility to (HFE)
- Allelic: Anemia, XL, with/-out neutropenia and/or platelet abnormalities (GATA1)
- Allelic: Anemia, sideroblastic, 1 (ALAS2)
- Allelic: Hemochromatosis (HFE)
- Allelic: Lead poisoning, susceptibility to (ALAD)
- Allelic: Leukemia, megakaryoblastic, with/-out Down syndrome, somatic (GATA1)
- Allelic: Microvascular complications of diabetes 7 (HFE)
- Allelic: Thrombocytopenia with beta-thalassemia, XL (GATA1)
- Allelic: Transferrin serum level QTL2 (HFE)
- Coproporphyria (CPOX)
- Ferrochelatase deficiency; Haem-synthetase deficiency (FECH)
- Harderoporphyria (CPOX)
- Porphyria cutanea tarda (UROD)
- Porphyria cutanea tarda, susceptibility to (HFE)
- Porphyria variegata (PPOX)
- Porphyria variegata, susceptibility to (HFE)
- Porphyria, acute hepatic (ALAD)
- Porphyria, acute intermittent (HMBS)
- Porphyria, acute intermittent, nonerythroid variant (HMBS)
- Porphyria, congenital erythropoietic (UROS)
- Porphyria, hepatoerythropoietic (UROD)
- Protoporphyria, erythropoietic, 1 (FECH)
- Protoporphyria, erythropoietic, 2 (CLPX)
- Protoporphyria, erythropoietic, XL (ALAS2)
- Rothmund-Thomson syndrome, type 1 (ANAPC1)
- Rothmund-Thomson syndrome, type 2 (RECQLA4)
- Thrombocytopenia, XL, with/-out dyserythropoietic anemia (GATA1)
- AD
- AR
- Sus
- XL
- XLR
- Multiple OMIM-Ps
Bioinformatics and clinical interpretation
Test-Stärken
- DAkkS-akkreditiertes Labor
- EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
- Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
- Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
- Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
- eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
- unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
- unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
- unsere umfassenden klinischen Aussagen
Testeinschränkungen
- Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
- Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
- es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
- die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
- Gen-Konversionen
- komplexe Inversionen
- Balancierte Translokationen
- Mitochondriale Varianten
- Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
- nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
- niedriger Mosaik-Status
- Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
- Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
- Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
- Varianten innerhalb von Pseudogenen
- die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde
Laboratory requirement
Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.
Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.
Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.
Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.