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Interdisciplinary CompetenceMolecular Diagnostics
Know how in the analysis of genetic material.
For the benefit of patients.

IllnessPubertas praecox, central; differential diagnosis

Summary

Short information

Comprehensive differential diagnostic panel for Pubertas praecox, central, containing 5 core and core candidate genes and altogether 11 curated genes according to the clinical signs

ID
PP9638
Number of genes
11 Accredited laboratory test
Examined sequence length
7,5 kb (Core-/Core-canditate-Genes)
26,5 kb (Extended panel: incl. additional genes)
Analysis Duration
on request
Test material
  • EDTA-anticoagulated blood (3-5 ml)
Diagnostic indications

NGS +

[Sanger]

 

Gene panel

Selected genes

NameExon Length (bp)OMIM-GReferenz-Seq.Heredity
CYP21A21488NM_000500.9AR
GNAS1185NM_000516.7; NM_016592.3; NM_080425.3AD
KISS1R1197NM_032551.5AD
LHCGR2100NM_000233.4AD, AR
MKRN31524NM_005664.4AD
CYP11B11512NM_000497.4AR
CYP19A11512NM_031226.3AR
DLK11306NM_003836.7AD
GLI34743NM_000168.6AD
NF18457NM_001042492.3AD
NR0B11413NM_000475.5XL

Informations about the disease

Clinical Comment

Central pubertas praecox leads to premature sexual development in both sexes: affected girls show signs of puberty before the age of 8, boys before the age of 9. The signs include the development of pubic and underarm hair, a growth spurt, acne and bone maturation. Girls also develop breasts and have their first period. In boys, the penis and testicles grow and the voice breaks. After the early growth spurt, patients often stop growing prematurely and often remain smaller than expected according to their parents. Early development before peers can be emotionally difficult and lead to psychological and behavioral problems. The cause of central precocious puberty is often unknown. The most common known genetic cause of central precocious puberty is mutations in the MKRN3 gene, with girls being more severely affected than boys. LHCGR gene variants cause male-limited precocious puberty. Mutations in other genes are less common causes. Of the 2 MKRN3 gene copies, only the paternal copy is activated in the offspring via genomic imprinting. Central precocious puberty follows an autosomal dominant inheritance pattern. The molecular genetic diagnostic yield is not exactly known - a negative DNA test result cannot rule out the clinical diagnosis.

Reference: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1330/

 

Synonyms
  • Alias: Central precocious puberty
  • Allelic: 46XY sex reversal 2, dosage-sensitive (NR0B1)
  • Allelic: Aldosteronism, glucocorticoid-remediable (CYP11B1)
  • Allelic: Aromatase deficiency (CYP19A1)
  • Allelic: Greig cephalopolysyndactyly syndrome (GLI3)
  • Allelic: Hypogonadotropic hypogonadism 13 with/-out anosmia (KISS1)
  • Allelic: Hypogonadotropic hypogonadism 8 with/-out anosmia (KISS1R)
  • Allelic: Leydig cell hypoplasia with hypergonadotropic hypogonadism (LHCGR)
  • Allelic: Leydig cell hypoplasia with pseudohermaphroditism (LHCGR)
  • Allelic: Luteinizing hormone resistance, female (LHCGR)
  • Allelic: McCune-Albright syndrome, somatic, mosaic (GNAS)
  • Allelic: Osseous heteroplasia, progressive (GNAS)
  • Allelic: Polydactyly, postaxial, types A1 + B (GLI3)
  • Allelic: Polydactyly, preaxial, type IV (GLI3)
  • Allelic: Pseudohypoparathyroidism Ia, Ib, Ic (GNAS)
  • Allelic: Pseudopseudohypoparathyroidism (GNAS)
  • ACTH-independent macronodular adrenal hyperplasia (GNAS)
  • Adrenal hyperplasia, congenital, due to 11-beta-hydroxylase deficiency (CYP11B1)
  • Adrenal hyperplasia, congenital, due to 21-hydroxylase deficiency (CYP21A2)
  • Adrenal hypoplasia, congenital (NR0B1)
  • Allelic: Leukemia, juvenile myelomonocytic (NF1)
  • Allelic: Watson syndrome (NF1)
  • Aromatase excess syndrome (CYP19A1)
  • Hyperandrogenism, nonclassic type, due to 21-hydroxylase deficiency (CYP21A2)
  • Hypothalamic hamartomas, somatic (GLI3)
  • Leydig cell adenoma, somatic, with precocious puberty (LHCGR)
  • Neurofibromatosis, familial spinal (NF1)
  • Neurofibromatosis, type 1 (NF1)
  • Neurofibromatosis-Noonan syndrome (NF1)
  • Pallister-Hall syndrome (GLI3)
  • Pituitary adenoma 3, multiple types, somatic (GNAS)
  • Precocious puberty, central, 1 (KISS1R)
  • Precocious puberty, central, 2 (MKRN3)
  • Precocious puberty, male (LHCGR)
Heredity, heredity patterns etc.
  • AD
  • AR
  • XL
OMIM-Ps
  • Multiple OMIM-Ps
ICD10 Code

Bioinformatics and clinical interpretation

Test-Stärken

  • DAkkS-akkreditiertes Labor
  • EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
  • Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
  • Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
  • Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
  • eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
  • unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
  • unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
  • unsere umfassenden klinischen Aussagen

Testeinschränkungen

  • Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
  • Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
  • es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
  • die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
  • Gen-Konversionen
  • komplexe Inversionen
  • Balancierte Translokationen
  • Mitochondriale Varianten
  • Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
  • nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
  • niedriger Mosaik-Status
  • Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
  • Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
  • Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
  • Varianten innerhalb von Pseudogenen
  • die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde

Laboratory requirement

  • Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.

  • Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.

  • Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.

  • Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.