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Interdisciplinary CompetenceMolecular Diagnostics
Know how in the analysis of genetic material.
For the benefit of patients.

IllnessPulmonary fibrosis, idiopathic familial; differential diagnosis

Summary

Short information

Comprehensive differential diagnostic panel for idiopathische familial pulmonary fibrosis comprising 5 guideline-curated genes and altogether 43 curated genes according to the clinical signs

ID
FP9483
Number of genes
31 Accredited laboratory test
Examined sequence length
24,0 kb (Core-/Core-canditate-Genes)
63,1 kb (Extended panel: incl. additional genes)
Analysis Duration
on request
Test material
  • EDTA-anticoagulated blood (3-5 ml)
Diagnostic indications

NGS +

[Sanger]

 

Gene panel

Selected genes

NameExon Length (bp)OMIM-GReferenz-Seq.Heredity
AP3B13138NM_001271769.2AR
DKC11545NM_001363.5XLR
HPS12103NM_000195.5AR
HPS42127NM_022081.6AR
PARN1920NM_002582.4AD
RTEL13732NM_032957.5AD
SFTPA2747NM_001098668.4AD
SFTPB1146NM_000542.5AR
SFTPC594NM_003018.4AD
TERT3399NM_198253.3AD
TINF21356NM_001099274.3AD
ZCCHC82124NM_017612.5AD
ABCA35115NM_001089.3AR
ASAH11188NM_177924.5AR
BLOC1S3609NM_212550.5AR
BLOC1S6519NM_012388.4AR
CASR3237NM_000388.4AD
CSF2RA1203NM_006140.6PD/PR
CSF2RB2694NM_000395.3AR
DTNBP1813NM_001271667.2AR
FAM111B2115NM_001142703.2AD
FARSB1787NM_005687.5AR
GBA11611NM_001005741.3AR
HPS33015NM_032383.5AR
HPS53048NM_007216.4AR
HPS62328NM_024747.6AR
ITGA33156NM_002204.4AR
NKX2-11206NM_001079668.3PD/PR
SLC34A22070NM_001177998.2AR
SLC7A71536NM_001126105.3AR
SMPD11896NM_000543.5AR

Informations about the disease

Clinical Comment

Non-neoplastic disease that is characterized by the formation of scar tissue within the lungs in the absence of any known cause

 

Synonyms
  • Alias: Pulmonal-Fibrose
  • Alias: Pulmonary fibrosis
  • Allelic: Chorea, hereditary benign (NKX2-1)
  • Allelic: Epilepsy idiopathic generalized, susceptibility to, 8 (CASR)
  • Allelic: Gaucher disease, perinatal lethal (GBA)
  • Allelic: Hypocalcemia, AD (CASR)
  • Allelic: Hypocalcemia, AD, with Bartter syndrome (CASR)
  • Allelic: Leukemia, acute myeloid (TERT)
  • Allelic: Lewy body dementia, susceptibility to (GBA)
  • Allelic: Melanoma, cutaneous malignant, 9 (TERT)
  • Allelic: Parkinson disease, late-onset, susceptibility to (GBA)
  • Allelic: Spinal muscular atrophy with progressive myoclonic epilepsy (ASAH1)
  • Allelic: Thyroid cancer, nonmedullary, 1 (NKX2-1)
  • Cerebroretinal microangiopathy with calcifications + cysts (CTC1)
  • Choreoathetosis, hypothyroidism + neonatal respiratory distress (NKX2-1)
  • Dyskeratosis congenita, AD (NAF1)
  • Dyskeratosis congenita, AD 2 (TERT)
  • Dyskeratosis congenita, AD 3 (TINF2)
  • Dyskeratosis congenita, AD 4 (RTEL1)
  • Dyskeratosis congenita, AD 6 (ACD)
  • Dyskeratosis congenita, AR 1 (NOP10)
  • Dyskeratosis congenita, AR 2 (NHP2)
  • Dyskeratosis congenita, AR 3 (WRAP53)
  • Dyskeratosis congenita, AR 4 (TERT)
  • Dyskeratosis congenita, AR 5 (RTEL1)
  • Dyskeratosis congenita, AR 6 (PARN)
  • Dyskeratosis congenita, AR 7 (ACD)
  • Dyskeratosis congenita, XL (DKC1)
  • Dyskeratosis congenita, XL (FAM111B)
  • Farber lipogranulomatosis (ASAH1)
  • Gaucher disease, type I, II, III, IIIC (GBA)
  • Hermansky-Pudlak syndrome 1 (HPS1)
  • Hermansky-Pudlak syndrome 2 (AP3B1)
  • Hermansky-Pudlak syndrome 3 (HPS3)
  • Hermansky-Pudlak syndrome 4 (HPS4)
  • Hermansky-Pudlak syndrome 5 (HPS5)
  • Hermansky-Pudlak syndrome 6 (HPS6)
  • Hermansky-Pudlak syndrome 7 (DTNBP1)
  • Hermansky-Pudlak syndrome 8 (BLOC1S3)
  • Hermansky-Pudlak syndrome 9 (BLOC1S6)
  • Hyperparathyroidism, neonatal (CASR)
  • Hypocalciuric hypercalcemia, type I (CASR)
  • Interstitial lung disease 1 (SFTPA1)
  • Interstitial lung disease, nephrotic syndrome + epidermolysis bullosa, congenital (ITGA3)
  • Lysinuric protein intolerance (SLC7A7)
  • Lysinuric protein intolerance (SMPD1)
  • Pulmonary alveolar microlithiasis (SLC34A2)
  • Pulmonary fibrosis and/or bone marrow failure, telomere-related, 1 (TERT)
  • Pulmonary fibrosis and/or bone marrow failure, telomere-related, 3 (RTEL1)
  • Pulmonary fibrosis and/or bone marrow failure, telomere-related, 4 (PARN)
  • Pulmonary fibrosis and/or bone marrow failure, telomere-related, 5 (ZCCHC8)
  • Pulmonary fibrosis, idiopathic (SFTPA2)
  • Pulmonary fibrosis, idiopathic, susceptibility to (MUC5B)
  • Pulmonary fibrosis-emphysema [panelapp] (NAF1)
  • RIDDLE [radiosensitivity, immunodeficiency, dysmorphic face, learning difficult.] syndrome (RNF168)
  • Rajab interstitial lung disease with brain calcifications 1 (FARSB)
  • Rajab interstitial lung disease with brain calcifications 2 (FARSA)
  • Revesz syndrome (TINF2)
  • STING-associated vasculopathy, infantile-onset (STING1)
  • Surfactant metabolism dysfunction, pulmonary, 1 (SFTPB)
  • Surfactant metabolism dysfunction, pulmonary, 2 (SFTPC)
  • Surfactant metabolism dysfunction, pulmonary, 3 (ABCA3)
  • Surfactant metabolism dysfunction, pulmonary, 4 (CSF2RA)
  • Surfactant metabolism dysfunction, pulmonary, 5 (CSF2RB)
Heredity, heredity patterns etc.
  • AD
  • AR
  • PD/PR
  • XLR
OMIM-Ps
  • Multiple OMIM-Ps
ICD10 Code

Bioinformatics and clinical interpretation

Test-Stärken

  • DAkkS-akkreditiertes Labor
  • EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
  • Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
  • Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
  • Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
  • eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
  • unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
  • unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
  • unsere umfassenden klinischen Aussagen

Testeinschränkungen

  • Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
  • Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
  • es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
  • die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
  • Gen-Konversionen
  • komplexe Inversionen
  • Balancierte Translokationen
  • Mitochondriale Varianten
  • Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
  • nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
  • niedriger Mosaik-Status
  • Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
  • Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
  • Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
  • Varianten innerhalb von Pseudogenen
  • die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde

Laboratory requirement

  • Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.

  • Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.

  • Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.

  • Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.