Klinische FragestellungLungenfibrose, idiopathische familiäre; Differentialdiagnose
Zusammenfassung
Umfassendes differentialdiagnostisches panel für idiopathische familiäre Lungenfibrose mit 5 Leitlinien-kuratierten Genen bzw. zusammen genommen 43 kuratierten Genen gemäß klinischer Verdachtsdiagnose
63,1 kb (Erweitertes Panel: inkl. additional genes)
- EDTA-Blut (3-5 ml)
NGS +
[Sanger]
Genpanel
Ausgewählte Gene
Name | Exon-Länge (bp) | OMIM-G | Referenz-Seq. | Erbgang |
---|---|---|---|---|
AP3B1 | 3138 | NM_001271769.2 | AR | |
DKC1 | 1545 | NM_001363.5 | XLR | |
HPS1 | 2103 | NM_000195.5 | AR | |
HPS4 | 2127 | NM_022081.6 | AR | |
PARN | 1920 | NM_002582.4 | AD | |
RTEL1 | 3732 | NM_032957.5 | AD | |
SFTPA2 | 747 | NM_001098668.4 | AD | |
SFTPB | 1146 | NM_000542.5 | AR | |
SFTPC | 594 | NM_003018.4 | AD | |
TERT | 3399 | NM_198253.3 | AD | |
TINF2 | 1356 | NM_001099274.3 | AD | |
ZCCHC8 | 2124 | NM_017612.5 | AD | |
ABCA3 | 5115 | NM_001089.3 | AR | |
ASAH1 | 1188 | NM_177924.5 | AR | |
BLOC1S3 | 609 | NM_212550.5 | AR | |
BLOC1S6 | 519 | NM_012388.4 | AR | |
CASR | 3237 | NM_000388.4 | AD | |
CSF2RA | 1203 | NM_006140.6 | PD/PR | |
CSF2RB | 2694 | NM_000395.3 | AR | |
DTNBP1 | 813 | NM_001271667.2 | AR | |
FAM111B | 2115 | NM_001142703.2 | AD | |
FARSB | 1787 | NM_005687.5 | AR | |
GBA1 | 1611 | NM_001005741.3 | AR | |
HPS3 | 3015 | NM_032383.5 | AR | |
HPS5 | 3048 | NM_007216.4 | AR | |
HPS6 | 2328 | NM_024747.6 | AR | |
ITGA3 | 3156 | NM_002204.4 | AR | |
NKX2-1 | 1206 | NM_001079668.3 | PD/PR | |
SLC34A2 | 2070 | NM_001177998.2 | AR | |
SLC7A7 | 1536 | NM_001126105.3 | AR | |
SMPD1 | 1896 | NM_000543.5 | AR |
Infos zur Erkrankung
Patienten mit Lungenfibrose leiden typischerweise unter Kurzatmigkeit bei Anstrengung und trockenem Husten. Am häufigsten tritt die Krankheit im Erwachsenenalter auf, aber der Beginn kann sich über mehrere Jahrzehnte erstrecken. Die meisten Personen mit Lungenfibrose haben in ihrer Vergangenheit geraucht oder waren fibrogenen Umweltbelastungen ausgesetzt. Die Prävalenz der fibrotischen Lungenerkrankung nimmt mit dem Alter zu. Trockene Rasselgeräusche werden durch Auskultation der Lunge festgestellt. Hypoxämie bei Anstrengung ist normalerweise eines der frühesten Anzeichen. Bei Fortschreiten der Krankheit tritt Hypoxämie in Ruhe auf. Die Symptome verschlechtern sich mit der Zeit, wenn die Vernarbung der Lunge fortschreitet. Spätere Befunde umfassen Trommelschlägelfinger als Anzeichen einer Lungenerkrankung. Personen mit familiärer Lungenfibrose haben im Vergleich zur Allgemeinbevölkerung ein dreifach höheres Risiko, an Adenokarzinom der Lunge zu erkranken. Die meisten Personen sterben an Atemwegserkrankungen. Das Vorhandensein einer genetischen Ursache für eine Prädisposition für Lungenfibrose kann durch die Familienanamnese oder durch klinische Merkmale einer bekannten genetischen Ursache für Lungenfibrose, Bluthochdruck und Folgen einer Rechtsherzinsuffizienz nahegelegt werden. Die Prädisposition zur Lungenfibrose ist genetisch außerordentlich heterogen, und es bestehen komplexe Genotyp-Phänotyp-Beziehungen.
Literatur
Garcia and Talbert: Pulmonary Fibrosis Predisposition Overview. GeneReviews 2024. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1230/
- Alias: Pulmonal-Fibrose
- Alias: Pulmonary fibrosis
- Allelic: Chorea, hereditary benign (NKX2-1)
- Allelic: Epilepsy idiopathic generalized, susceptibility to, 8 (CASR)
- Allelic: Gaucher disease, perinatal lethal (GBA)
- Allelic: Hypocalcemia, AD (CASR)
- Allelic: Hypocalcemia, AD, with Bartter syndrome (CASR)
- Allelic: Leukemia, acute myeloid (TERT)
- Allelic: Lewy body dementia, susceptibility to (GBA)
- Allelic: Melanoma, cutaneous malignant, 9 (TERT)
- Allelic: Parkinson disease, late-onset, susceptibility to (GBA)
- Allelic: Spinal muscular atrophy with progressive myoclonic epilepsy (ASAH1)
- Allelic: Thyroid cancer, nonmedullary, 1 (NKX2-1)
- Cerebroretinal microangiopathy with calcifications + cysts (CTC1)
- Choreoathetosis, hypothyroidism + neonatal respiratory distress (NKX2-1)
- Dyskeratosis congenita, AD (NAF1)
- Dyskeratosis congenita, AD 2 (TERT)
- Dyskeratosis congenita, AD 3 (TINF2)
- Dyskeratosis congenita, AD 4 (RTEL1)
- Dyskeratosis congenita, AD 6 (ACD)
- Dyskeratosis congenita, AR 1 (NOP10)
- Dyskeratosis congenita, AR 2 (NHP2)
- Dyskeratosis congenita, AR 3 (WRAP53)
- Dyskeratosis congenita, AR 4 (TERT)
- Dyskeratosis congenita, AR 5 (RTEL1)
- Dyskeratosis congenita, AR 6 (PARN)
- Dyskeratosis congenita, AR 7 (ACD)
- Dyskeratosis congenita, XL (DKC1)
- Dyskeratosis congenita, XL (FAM111B)
- Farber lipogranulomatosis (ASAH1)
- Gaucher disease, type I, II, III, IIIC (GBA)
- Hermansky-Pudlak syndrome 1 (HPS1)
- Hermansky-Pudlak syndrome 2 (AP3B1)
- Hermansky-Pudlak syndrome 3 (HPS3)
- Hermansky-Pudlak syndrome 4 (HPS4)
- Hermansky-Pudlak syndrome 5 (HPS5)
- Hermansky-Pudlak syndrome 6 (HPS6)
- Hermansky-Pudlak syndrome 7 (DTNBP1)
- Hermansky-Pudlak syndrome 8 (BLOC1S3)
- Hermansky-Pudlak syndrome 9 (BLOC1S6)
- Hyperparathyroidism, neonatal (CASR)
- Hypocalciuric hypercalcemia, type I (CASR)
- Interstitial lung disease 1 (SFTPA1)
- Interstitial lung disease, nephrotic syndrome + epidermolysis bullosa, congenital (ITGA3)
- Lysinuric protein intolerance (SLC7A7)
- Lysinuric protein intolerance (SMPD1)
- Pulmonary alveolar microlithiasis (SLC34A2)
- Pulmonary fibrosis and/or bone marrow failure, telomere-related, 1 (TERT)
- Pulmonary fibrosis and/or bone marrow failure, telomere-related, 3 (RTEL1)
- Pulmonary fibrosis and/or bone marrow failure, telomere-related, 4 (PARN)
- Pulmonary fibrosis and/or bone marrow failure, telomere-related, 5 (ZCCHC8)
- Pulmonary fibrosis, idiopathic (SFTPA2)
- Pulmonary fibrosis, idiopathic, susceptibility to (MUC5B)
- Pulmonary fibrosis-emphysema [panelapp] (NAF1)
- RIDDLE [radiosensitivity, immunodeficiency, dysmorphic face, learning difficult.] syndrome (RNF168)
- Rajab interstitial lung disease with brain calcifications 1 (FARSB)
- Rajab interstitial lung disease with brain calcifications 2 (FARSA)
- Revesz syndrome (TINF2)
- STING-associated vasculopathy, infantile-onset (STING1)
- Surfactant metabolism dysfunction, pulmonary, 1 (SFTPB)
- Surfactant metabolism dysfunction, pulmonary, 2 (SFTPC)
- Surfactant metabolism dysfunction, pulmonary, 3 (ABCA3)
- Surfactant metabolism dysfunction, pulmonary, 4 (CSF2RA)
- Surfactant metabolism dysfunction, pulmonary, 5 (CSF2RB)
- AD
- AR
- PD/PR
- XLR
- Multiple OMIM-Ps
Bioinformatik und klinische Interpretation
Test-Stärken
- DAkkS-akkreditiertes Labor
- EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
- Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
- Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
- Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
- eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
- unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
- unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
- unsere umfassenden klinischen Aussagen
Testeinschränkungen
- Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
- Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
- es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
- die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
- Gen-Konversionen
- komplexe Inversionen
- Balancierte Translokationen
- Mitochondriale Varianten
- Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
- nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
- niedriger Mosaik-Status
- Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
- Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
- Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
- Varianten innerhalb von Pseudogenen
- die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde
Laboranforderung
Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.
Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.
Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.
Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.