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Interdisciplinary CompetenceMolecular Diagnostics
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For the benefit of patients.

IllnessSilver-Russell syndrome, differential diagnosis

Summary

Short information

Comprehensive differential diagnostic panel for Silver-Russell syndrome containing 2 core genes, 4 core candidate genes and altogether 21 curated genes according to the clinical suspicion

ID
SP5030
Number of genes
20 Accredited laboratory test
Examined sequence length
7,9 kb (Core-/Core-canditate-Genes)
43,9 kb (Extended panel: incl. additional genes)
Analysis Duration
on request
Test material
  • EDTA-anticoagulated blood (3-5 ml)
Diagnostic indications

Step 1: MS-MLPA chromosome 11

Step 2: MS-MLPA UPD7 > eventually also parental DNA anased after index case

Step 3: NGS +

 

Gene panel

Selected genes

NameExon Length (bp)OMIM-GReferenz-Seq.Heredity
CDKN1C951NM_000076.2AD
HMGA2330NM_003483.6AD
IGF1462NM_000618.5AR
IGF1R4104NM_000875.5AD, AR
IGF2543NM_000612.6AD
PLAG11503NM_002655.3Gen Fusion
BLM4254NM_000057.4AR
CCDC81617NM_032040.5AR
CDC451819NM_001178010.2AR
CDC61683NM_001254.4AR
CDT11641NM_030928.4AR
CUL75097NM_014780.5AR
FANCA4368NM_000135.4AR
GMNN670NM_001251989.2AD
MCM52205NM_006739.4AR
NBN2265NM_002485.5AR
OBSL15691NM_015311.3AR
ORC12586NM_004153.4AR
ORC41311NM_002552.5AR
ORC6759NM_014321.4AR

Informations about the disease

Clinical Comment

Silver-Russell syndrome (SRS) is characterized by slow growth before and after birth. The infants are small and do not thrive, while on the other hand the head size is appropriate for the age. Affected infants suffer from hypoglycemia due to feeding problems. Adults with SRS have also short statures, men averaging ~150 cm and women ~140 cm. Many children with SRS have a small, triangular face with prominent forehead, narrow chin, small jaw and down-turned corners of the mouth. In addition, clinodactyly, asymmetrical or uneven growth of some body parts are observed as well as digestive system abnormalities. SRS is also associated with an increased risk of developmental delays, speech and learning problems. The genetic causes of SRS are complex and are often due to abnormal gene regulation concerning chromosomes 7 and 11. Some 30-50% of SRS cases are due to changes in methylation on chromosome 11p in the H19 and IGF2 genes. Gene alterations on chromosome 7 can cause SRS by, for example, uniparental disomy (7-10% of cases). In ~40%, the cause of SRS remains unexplained. Negative molecular genetic test results do not, therefore, exclude the clinical diagnosis of SRS. Most cases of SRS occur sporadically; only in rare cases the disease appears to be inherited in an autosomal dominant or autosomal recessive manner.

Reference: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1324/

 

Synonyms
  • Alias: Russel-Silver syndrome
  • Alias: Silver-Russell dwarfism
  • Allelic: Adenomas, salivary gland pleomorphic, somatic (PLAG1)
  • Allelic: Aplastic anemia (NBN)
  • Allelic: Beckwith-Wiedemann syndrome (CDKN1C)
  • Allelic: Leukemia, acute lymphoblastic (NBN)
  • 3-M syndrome 1 (CUL7)
  • 3-M syndrome 2 (OBSL1)
  • 3-M syndrome 3 (CCDC8)
  • Bloom syndrome (BLM)
  • Fanconi anemia (BRCA2, BRIP1, ERCC4, MAD2L2, PALB2, RAD51, RAD51C, RFWD3, SLX4, UBE2T, XRCC2)
  • Fanconi anemia (FANCA-FANCL/FANCW)
  • Growth retardation with deafness + mental retardation due to IGF1 deficiency (IGF1)
  • IMAGE syndrome (CDKN1C)
  • Insulin-like growth factor I, resistance to (IGF1R)
  • Meier-Gorlin syndrome 1 (ORC)
  • Meier-Gorlin syndrome 2 (ORC4)
  • Meier-Gorlin syndrome 3 (ORC6)
  • Meier-Gorlin syndrome 4 (CDT1)
  • Meier-Gorlin syndrome 5 (CDC6)
  • Meier-Gorlin syndrome 6 (GMNN)
  • Meier-Gorlin syndrome 7 (CDC45)
  • Meier-Gorlin syndrome 8 (MCM5)
  • Nijmegen breakage syndrome (NBN)
  • Silver-Russell syndrome 1 (ICR1)
  • Silver-Russell syndrome 2 (uniparental disomy, maternal)
  • Silver-Russell syndrome 3 (IGF2)
  • Silver-Russell syndrome 4 (PLAG1)
  • Silver-Russell syndrome 5 (HMGA2)
  • Warsaw breakage syndrome (DDX11)
Heredity, heredity patterns etc.
  • AD
  • AR
  • Gen Fusion
OMIM-Ps
  • Multiple OMIM-Ps
ICD10 Code

Bioinformatics and clinical interpretation

Test-Stärken

  • DAkkS-akkreditiertes Labor
  • EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
  • Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
  • Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
  • Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
  • eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
  • unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
  • unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
  • unsere umfassenden klinischen Aussagen

Testeinschränkungen

  • Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
  • Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
  • es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
  • die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
  • Gen-Konversionen
  • komplexe Inversionen
  • Balancierte Translokationen
  • Mitochondriale Varianten
  • Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
  • nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
  • niedriger Mosaik-Status
  • Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
  • Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
  • Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
  • Varianten innerhalb von Pseudogenen
  • die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde

Laboratory requirement

  • Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.

  • Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.

  • Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.

  • Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.