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Interdisciplinary CompetenceMolecular Diagnostics
Know how in the analysis of genetic material.
For the benefit of patients.

IllnessSpotted retina syndrome, differential diagnosis

Summary

Short information

Comprehensive differential diagnostic panel for Choroideremia syndrome comprising 9 or 10 curated genes according to the clinical signs

ID
GP0040
Number of genes
10 Accredited laboratory test
Examined sequence length
20,7 kb (Core-/Core-canditate-Genes)
21,3 kb (Extended panel: incl. additional genes)
Analysis Duration
on request
Test material
  • EDTA-anticoagulated blood (3-5 ml)
Diagnostic indications

NGS +

 

Gene panel

Selected genes

NameExon Length (bp)OMIM-GReferenz-Seq.Heredity
CHM1962NM_000390.4XL
EFEMP11482NM_001039348.3AD
PLA2G5417NM_000929.3AR
PRPH21041NM_000322.5AD, AR, digenisch
RDH5957NM_002905.5AD, AR
RHO1047NM_000539.3AD, AR
RLBP1954NM_000326.5AD, AR
RS1675NM_000330.4XL
VPS13B12069NM_017890.5AR
LRAT693NM_004744.5AR

Informations about the disease

Clinical Comment

Fundus albipunctatus is a form of congenital stationary night blindness (CSNB) characterized by early onset in the presence of whitish-yellow spots in the retina. Notably, these patients have delayed dark adaptation; vision in bright light is usually normal. The spots are particularly common in the retinal periphery. Spot density varies among affected individuals; some affected individuals have numerous spots that overlap, while others show fewer. In some patients, the spots become smaller or fade with age, although night vision does not improve. Although fundus albipunctatus usually does not progress, some affecteds develop other eye diseases, such as macular degeneration. Fundus albipunctatus is mainly caused by RDH5 mutations. In some cases, fundus albipunctatus or especially CSNB is caused by mutations in other genes that play a role in the visual cycle. Fleck-retina is inherited in an autosomal recessive or dominant manner. Since the DNA diagnostic yield is not precisely known - also due to the often difficult clinical demarcations - a negative molecular genetic test result does not exclude the ophthalmological diagnosis.

Reference: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1245/

 

Synonyms
  • Alias: Albipunctate retinal dystrophy
  • Alias: Kandori fleck retina
  • Alias: Lauber's disease
  • Alias: Pigmentary retinal dystrophy
  • Allelic: Hypotonia, obesity, prominent incisors (VPS13B)
  • Allelic: Leber congenital amaurosis 14 (LRAT)
  • Allelic: Macular dystrophy, vitelliform, 3; Retinitis pigmentosa 7 + digenic form (PRPH2)
  • Allelic: Retinoschisis (RS1)
  • Bothnia retinal dystrophy; Fundus albipunctatus (RLBP1)
  • Choroidal dystrophy, central areolar 2; Leber congenital amaurosis 18 (PRPH2)
  • Choroideraemia; Tapetochoroidal dystrophy, progressive (CHM)
  • Cohen syndrome; Pepper syndrome (VPS13B)
  • Doyne honeycomb degeneration of retina (EFEMP1)
  • Fundus albipunctatus (RDH5)
  • Macular dystrophy, patterned, 1; Retinitis punctata albescens (PRPH2)
  • Newfoundland rod-cone dystrophy; Retinitis punctata albescens (RLBP1)
  • Retinal dystrophy, early-onset severe (LRAT)
  • Retinitis pigmentosa 4, AD/AR; Retinitis punctata albescens (RHO)
  • Retinitis pigmentosa, juvenile (LRAT)
Heredity, heredity patterns etc.
  • AD
  • AR
  • XL
  • digenisch
OMIM-Ps
  • Multiple OMIM-Ps
ICD10 Code

Bioinformatics and clinical interpretation

Test-Stärken

  • DAkkS-akkreditiertes Labor
  • EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
  • Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
  • Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
  • Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
  • eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
  • unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
  • unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
  • unsere umfassenden klinischen Aussagen

Testeinschränkungen

  • Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
  • Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
  • es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
  • die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
  • Gen-Konversionen
  • komplexe Inversionen
  • Balancierte Translokationen
  • Mitochondriale Varianten
  • Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
  • nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
  • niedriger Mosaik-Status
  • Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
  • Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
  • Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
  • Varianten innerhalb von Pseudogenen
  • die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde

Laboratory requirement

  • Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.

  • Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.

  • Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.

  • Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.