©istock.com/Andrea Obzerova
Interdisciplinary CompetenceMolecular Diagnostics
Know how in the analysis of genetic material.
For the benefit of patients.

IllnessThrombozytopenien + Thrombozytopathien, hereditäre; Differentialdiagnose

Summary

Short information

Comprehensive differential diagnostic panel for Thrombocytopenias + thrombocytopathies comprising 25 or altogether 59 curated genes according to the clinical signs

ID
TP5445
Number of loci
Loci typeCount
Gen55
Accredited laboratory test
Examined sequence length
16,9 kb (Core-/Core-canditate-Genes)
127,9 kb (Extended panel: incl. additional genes)
Analysis Duration
on request
Test material
  • EDTA-anticoagulated blood (3-5 ml)
Diagnostic indications

NGS +

[Sanger]

 

Loci panel

Gen

NameExon Length (bp)OMIM-GReferenz-Seq.Heredity
GP1BA1959NM_000173.7AD, AR
GP1BB621NM_000407.5AD, AR
GP9534NM_000174.5AR
ITGA2B3120NM_000419.5AD, AR
ITGB32367NM_000212.3AD, AR
NBEAL28265NM_015175.3AR
ABCG51956NM_022436.3AR
ABCG82022NM_022437.3AR
ACTB1128NM_001101.5AD
ACTN12745NM_001130004.2AD
ACVRL11512NM_000020.3AD
ANKRD265133NM_014915.3AD
ANO62733NM_001025356.3AR
AP3B13138NM_001271769.2AR
ARPC1B1141NM_005720.4AR
BLOC1S3609NM_212550.5AR
BLOC1S6519NM_012388.4AR
CDC42576NM_001791.4AD
CYCS318NM_018947.6AD
DIAPH13819NM_005219.5AD
DTNBP1813NM_001271667.2AR
ETV61359NM_001987.5AD
FERMT31992NM_031471.6AR
FLI11359NM_002017.5AD, AR
FLNA7920NM_001456.4XL
FYB12783NM_001243093.2AR
GATA11242NM_002049.4XLR
GFI1B993NM_004188.8AD, AR
GNE2262NM_001128227.3AR
GP61863NM_001083899.2AR
HOXA11942NM_005523.6AD
HPS12103NM_000195.5AR
HPS33015NM_032383.5AR
HPS42127NM_022081.6AR
HPS53048NM_007216.4AR
HPS62328NM_024747.6AR
MECOM3351NM_001105077.4AD
MPIG6B910NM_025260.4AR
MPL1908NM_005373.3AR, AD
MYH95883NM_002473.6AD
PLA2G4A2250NM_024420.3AR
PLAU1245NM_001145031.3AD
PRKACG1056NM_002732.4AR
PTPN111782NM_002834.5AD
RASGRP21830NM_153819.1AR
RUNX11443NM_001754.5AD
SLFN142743NM_001129820.2AD
SRC1611NM_005417.5AD
STIM12058NM_003156.4AD
TBXA2R1032NM_001060.6AD, AR
THBD1728NM_000361.3AD
THPO1062NM_000460.4AD
TNXB12729NM_019105.8AR
TUBB11356NM_030773.4AD, AR
WAS1509NM_000377.3XLR

Informations about the disease

Clinical Comment

Group of diseases

 

Synonyms
  • Allelic: Alzheimer disease, late-onset, susceptibility to (PLAU)
  • Allelic: Amyotrophic lateral sclerosis-parkinsonism/dementia complex, susceptibility to (TRPM7)
  • Allelic: Anemia, XL, with/without neutropenia and/or platelet abnormalities (GATA1)
  • Allelic: Cardiac valvular dysplasia, XL (FLNA)
  • Allelic: Colon cancer, advanced, somatic (SRC)
  • Allelic: Deafness, AD 17 (MYH9)
  • Allelic: Erythrokeratodermia variabilis et progressiva 4 (KDSR)
  • Allelic: FG syndrome 2 (FLNA)
  • Allelic: Frontometaphyseal dysplasia 1 (FLNA)
  • Allelic: Hemolytic uremic syndrome, atypical, susceptibility to, 6 (THBD)
  • Allelic: Heterotopia, periventricular, 1 (FLNA)
  • Allelic: Leukemia, acute myeloid (RUNX1)
  • Allelic: Leukemia, acute myeloid, somatic (ETV6)
  • Allelic: Leukemia, megakaryoblastic, with/-out Down syndrome, somatic (GATA1)
  • Allelic: Melnick-Needles syndrome (FLNA)
  • Allelic: Metachondromatosis (PTPN11)
  • Allelic: Myelofibrosis with myeloid metaplasia, somatic (MPL)
  • Allelic: Myocardial infarction, susceptibility to (ITGB3)
  • Allelic: Neutropenia, severe congenital, XL (WASP)
  • Allelic: Nonarteritic anterior ischemic optic neuropathy, susceptibility to (GP1BA)
  • Allelic: Otopalatodigital syndrome, type I (FLNA)
  • Allelic: Otopalatodigital syndrome, type II (FLNA)
  • Allelic: Purpura, posttransfusion (ITGB3)
  • Allelic: Seizures, cortical blindness, microcephaly syndrome (DIAPH1)
  • Allelic: Terminal osseous dysplasia (FLNA)
  • Allelic: Thrombocytopenia, neonatal alloimmune (ITGB3)
  • Allelic: Thrombocytopenia, neonatal alloimmune, BAK antigen related (ITGA2B)
  • Allelic: Vesicoureteral reflux 8 (TNXB)
  • Allelic: Wiskott-Aldrich syndrome (WASP)
  • Bernard-Soulier syndrome, type B (GP1BB)
  • Bernard-Soulier syndrome, type C (GP9)
  • Bernard-Soulier syndrome, types A1 [AR] + A2 [AD] (GP1BA)
  • Bleeding disorder, platelet-type, 1 [Bernard-Soulier syndrome] (GP9, GP1BA, GP1BB)
  • Bleeding disorder, platelet-type, 11 (GP6)
  • Bleeding disorder, platelet-type, 12 (PTGS1)
  • Bleeding disorder, platelet-type, 13, susceptibility to (TBXA2R)
  • Bleeding disorder, platelet-type, 15 (ACTN1)
  • Bleeding disorder, platelet-type, 16, AD (ITGA2B)
  • Bleeding disorder, platelet-type, 17 (GFI1B)
  • Bleeding disorder, platelet-type, 18 (RASGRP)
  • Bleeding disorder, platelet-type, 19 (PRKACG)
  • Bleeding disorder, platelet-type, 20 (SLFN14)
  • Bleeding disorder, platelet-type, 21 (FLI1)
  • Bleeding disorder, platelet-type, 24, AD (ITGB3)
  • Bleeding disorder, platelet-type, 7 [Scott syndrome] (ANO6)
  • Bleeding disorder, platelet-type, 8 (P2RY12)
  • Congenital short bowel syndrome (FLNA)
  • Deafness, AD 1, with/-out thrombocytopenia (DIAPH1)
  • Dominant macrothrombocytopenia, mild bleeding, disrupted cytoskeleton remodeling [lit.] (TPM4)
  • Ehlers-Danlos syndrome due to tenascin X deficiency [panelapp] (TNXB)
  • Ehlers-Danlos syndrome, classic-like, 1 (TNXB)
  • Ehlers-Danlos syndrome, musculocontractural type 1 (CHST14)
  • Gastrointestinal ulceration, recurrent, with dysfunctional platelets (PLA2G4A)
  • Ghosal hematodiaphyseal syndrome (TBXAS1)
  • Giant platelet disorder, isolated (GP1BB)
  • Glanzmann thrombasthenia (ITGA2B, ITGB3)
  • Gray platelet syndrome (NBEAL2)
  • Hemophagocytic lymphohistiocytosis, familial, 3 (UNC13D)
  • Hemophagocytic lymphohistiocytosis, familial, 5, with/-out microvillus inclusion disease (STXBP2)
  • Hermansky-Pudlak syndrome 1, 3, 4, 5, 6 (HPS1, HPS3, HPS4, HPS5, HPS6)
  • Hermansky-Pudlak syndrome 10 (AP3D1)
  • Hermansky-Pudlak syndrome 2 (AP3B1)
  • Hermansky-Pudlak syndrome 7 (DTNBP1)
  • Hermansky-Pudlak syndrome 8, 9 (BLOC1S3, BLOC1S6)
  • Immunodeficiency 71 with inflammatory disease + congenital thrombocytopenia (ARPC1B)
  • Inherited Thrombocytopenia assiciated with mutation of UDP-Galactose-4-Epimerase (GALE)
  • Intestinal pseudoobstruction, neuronal (FLNA)
  • LEOPARD syndrome 1 (PTPN11)
  • Leukocyte adhesion deficiency, type III (FERMT3)
  • Macrothrombocytopenia + granulocyte incl. with/-out nephritis/sensorineural hearing loss (MYH9)
  • Macrothrombocytopenia [panelapp] (TRPM7)
  • Macrothrombocytopenia, AD, TUBB1-related (TUBB1)
  • Myopathy associated with thrombocytopenia [panelapp] (GNE)
  • Noonan syndrome 1 (PTPN11)
  • Platelet disorder, familial, with associated myeloid malignancy (RUNX1)
  • Purinergic receptor P2X, ligand-gated ion channel, 1 deficiency (P2RX1)
  • Quebec platelet disorder (PLAU)
  • Radioulnar synostosis with amegakaryocytic thrombocytopenia 1 (HOXA11)
  • Radioulnar synostosis with amegakaryocytic thrombocytopenia 2 (MECOM)
  • Recessive severe thrombocytopenia with progression to marrow fibrosis at young age [panelapp] (KDSR)
  • Significant bruising/haematomas [panelapp] (TNXB)
  • Sitosterolemia 1 (ABCG8)
  • Sitosterolemia 2 (ABCG5)
  • Stormorken syndrome [YORK platelet syndrome] (STIM1)
  • Takenouchi-Kosaki syndrome (CDC42)
  • Telangiectasia, hereditary hemorrhagic, type 1 (ENG)
  • Telangiectasia, hereditary hemorrhagic, type 2 (ACVRL1)
  • Thrombocythemia 1 (THPO)
  • Thrombocythemia 2 (MPL)
  • Thrombocytopenia 2 (ANKRD26)
  • Thrombocytopenia 3 (FYB1)
  • Thrombocytopenia 4 (CYCS)
  • Thrombocytopenia 5 (ETV6)
  • Thrombocytopenia 6 (SRC)
  • Thrombocytopenia with beta-thalassemia, XL (GATA1)
  • Thrombocytopenia, AD, 7 (IKZF5)
  • Thrombocytopenia, XL (WASP)
  • Thrombocytopenia, XL, intermittent (WASP)
  • Thrombocytopenia, XL, with/-out dyserythropoietic anemia (GATA1)
  • Thrombocytopenia, anemia + myelofibrosis (MPIG6B)
  • Thrombocytopenia, congenital amegakaryocytic (MPL)
  • Thrombocytopenia, neonatal alloimmune (ITGB3)
  • Thrombocytopenia-absent radius syndrome (RBM8A)
  • Thrombophilia due to thrombomodulin defect (THBD)
  • Thrombotic thrombocytopenic purpura, hereditary (ADAMTS13)
  • von Willebrand disease, platelet-type (GP1BA)
  • von Willebrand disease, type 1 (VWF)
  • von Willebrand disease, type 3 (VWF)
  • von Willebrand disease, types 2A, 2B, 2M + 2N (VWF)
Heredity, heredity patterns etc.
  • AD
  • AR
  • XL
  • XLR
OMIM-Ps
  • Multiple OMIM-Ps
ICD10 Code

Bioinformatics and clinical interpretation

Test-Stärken

  • DAkkS-akkreditiertes Labor
  • EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
  • Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
  • Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
  • Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
  • eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
  • unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
  • unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
  • unsere umfassenden klinischen Aussagen

Testeinschränkungen

  • Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
  • Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
  • es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
  • die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
  • Gen-Konversionen
  • komplexe Inversionen
  • Balancierte Translokationen
  • Mitochondriale Varianten
  • Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
  • nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
  • niedriger Mosaik-Status
  • Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
  • Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
  • Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
  • Varianten innerhalb von Pseudogenen
  • die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde

Laboratory requirement

  • Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.

  • Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.

  • Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.

  • Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.