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Klinische FragestellungThrombozytopenien + Thrombozytopathien, hereditäre; Differentialdiagnose

Zusammenfassung

Kurzinformation

Umfassendes differentialdiagnostisches panel für Thrombozytopenien + Thrombozytopathien mit 6 "core candidate"-Genen bzw. zusammen genommen 71 kuratierten Genen gemäß klinischer Verdachtsdiagnose

ID
TP5445
Anzahl Gene
55 Akkreditierte Untersuchung
Untersuchte Sequenzlänge
16,9 kb (Core-/Core-canditate-Gene)
127,9 kb (Erweitertes Panel: inkl. additional genes)
Analyse-Dauer
auf Anfrage
Untersuchungsmaterial
  • EDTA-Blut (3-5 ml)
Diagnostische Hinweise

NGS +

[Sanger]

 

Genpanel

Ausgewählte Gene

NameExon-Länge (bp)OMIM-GReferenz-Seq.Erbgang
GP1BA1959NM_000173.7AD, AR
GP1BB621NM_000407.5AD, AR
GP9534NM_000174.5AR
ITGA2B3120NM_000419.5AD, AR
ITGB32367NM_000212.3AD, AR
NBEAL28265NM_015175.3AR
ABCG51956NM_022436.3AR
ABCG82022NM_022437.3AR
ACTB1128NM_001101.5AD
ACTN12745NM_001130004.2AD
ACVRL11512NM_000020.3AD
ANKRD265133NM_014915.3AD
ANO62733NM_001025356.3AR
AP3B13138NM_001271769.2AR
ARPC1B1141NM_005720.4AR
BLOC1S3609NM_212550.5AR
BLOC1S6519NM_012388.4AR
CDC42576NM_001791.4AD
CYCS318NM_018947.6AD
DIAPH13819NM_005219.5AD
DTNBP1813NM_001271667.2AR
ETV61359NM_001987.5AD
FERMT31992NM_031471.6AR
FLI11359NM_002017.5AD, AR
FLNA7920NM_001456.4XL
FYB12783NM_001243093.2AR
GATA11242NM_002049.4XLR
GFI1B993NM_004188.8AD, AR
GNE2262NM_001128227.3AR
GP61863NM_001083899.2AR
HOXA11942NM_005523.6AD
HPS12103NM_000195.5AR
HPS33015NM_032383.5AR
HPS42127NM_022081.6AR
HPS53048NM_007216.4AR
HPS62328NM_024747.6AR
MECOM3351NM_001105077.4AD
MPIG6B910NM_025260.4AR
MPL1908NM_005373.3AR, AD
MYH95883NM_002473.6AD
PLA2G4A2250NM_024420.3AR
PLAU1245NM_001145031.3AD
PRKACG1056NM_002732.4AR
PTPN111782NM_002834.5AD
RASGRP21830NM_153819.1AR
RUNX11443NM_001754.5AD
SLFN142743NM_001129820.2AD
SRC1611NM_005417.5AD
STIM12058NM_003156.4AD
TBXA2R1032NM_001060.6AD, AR
THBD1728NM_000361.3AD
THPO1062NM_000460.4AD
TNXB12729NM_019105.8AR
TUBB11356NM_030773.4AD, AR
WAS1509NM_000377.3XLR

Infos zur Erkrankung

Klinischer Kommentar

Thrombozyten stoppen den Blutfluss unmittelbar nach Verletzungen durch grundlegend verschiedene Mechanismen: Aktivierung, Adhäsion, Aggregation, Sekretion und Förderung der Gerinnung. Die klinischen Komplikationen bei Patienten mit Thrombozyten-Störungen ist sehr unterschiedlich, selbst innerhalb ein und desselben Typs, und reicht von nahezu unbedeutend bis lebensbedrohlich. Bei Thrombozytopenien (z.B. Wiskott-Aldrich-Syndrom) oder Thrombozytopathien (z.B. Bernard-Soulier-Syndrom, Glanzmann-Thrombasthenie) treten die Blutungen im Allgemeinen unmittelbar nach der Verletzung auf, vor allem in der Haut, den Schleimhäuten, der Nase, dem Magen-Darm-Trakt und den Harnwegen. Im Allgemeinen sind die Gelenke und Muskeln von den Blutungen nicht betroffen. Angeborene Erkrankungen sind selten und können mitunter nur schwer von erworbenen Störungen differenziert werden, wobei letztere in der klinischen Praxis viel häufiger vorkommen. Die Differentialdiagnose ist oft komplex. Eine lebenslange Blutungsneigung kann auf eine angeborene Thrombozyten-Funktionsstörung hindeuten, die oft in der Kindheit erkannt wird, aber ein Auftreten im Erwachsenenalter schließt einen angeborenen Defekt nicht aus. Erbliche Thrombozyten-Störungen umfassen eine heterogene Gruppe von >60 seltenen Krankheiten, die durch Mutationen in >70 Genen verursacht werden. Die Vererbungsmuster umfassen autosomal dominante und rezessive sowie X-chromosomale Transmission. Die DNA-diagnostische Ausbeute hängt stark von der Qualität der klinischen Phänotypisierung ab und liegt bei Thrombozytopenien bei <25 % und bei Thrombozytopathien bei ~40 %. Daher schließt ein negatives molekulargenetisches Testergebnis die klinische Diagnose nicht aus.

Referenzen: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1178/

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK7014/

https://www.mdpi.com/1422-0067/22/9/4521/htm

 

Synonyme
  • Allelic: Alzheimer disease, late-onset, susceptibility to (PLAU)
  • Allelic: Amyotrophic lateral sclerosis-parkinsonism/dementia complex, susceptibility to (TRPM7)
  • Allelic: Anemia, XL, with/without neutropenia and/or platelet abnormalities (GATA1)
  • Allelic: Cardiac valvular dysplasia, XL (FLNA)
  • Allelic: Colon cancer, advanced, somatic (SRC)
  • Allelic: Deafness, AD 17 (MYH9)
  • Allelic: Erythrokeratodermia variabilis et progressiva 4 (KDSR)
  • Allelic: FG syndrome 2 (FLNA)
  • Allelic: Frontometaphyseal dysplasia 1 (FLNA)
  • Allelic: Hemolytic uremic syndrome, atypical, susceptibility to, 6 (THBD)
  • Allelic: Heterotopia, periventricular, 1 (FLNA)
  • Allelic: Leukemia, acute myeloid (RUNX1)
  • Allelic: Leukemia, acute myeloid, somatic (ETV6)
  • Allelic: Leukemia, megakaryoblastic, with/-out Down syndrome, somatic (GATA1)
  • Allelic: Melnick-Needles syndrome (FLNA)
  • Allelic: Metachondromatosis (PTPN11)
  • Allelic: Myelofibrosis with myeloid metaplasia, somatic (MPL)
  • Allelic: Myocardial infarction, susceptibility to (ITGB3)
  • Allelic: Neutropenia, severe congenital, XL (WASP)
  • Allelic: Nonarteritic anterior ischemic optic neuropathy, susceptibility to (GP1BA)
  • Allelic: Otopalatodigital syndrome, type I (FLNA)
  • Allelic: Otopalatodigital syndrome, type II (FLNA)
  • Allelic: Purpura, posttransfusion (ITGB3)
  • Allelic: Seizures, cortical blindness, microcephaly syndrome (DIAPH1)
  • Allelic: Terminal osseous dysplasia (FLNA)
  • Allelic: Thrombocytopenia, neonatal alloimmune (ITGB3)
  • Allelic: Thrombocytopenia, neonatal alloimmune, BAK antigen related (ITGA2B)
  • Allelic: Vesicoureteral reflux 8 (TNXB)
  • Allelic: Wiskott-Aldrich syndrome (WASP)
  • Bernard-Soulier syndrome, type B (GP1BB)
  • Bernard-Soulier syndrome, type C (GP9)
  • Bernard-Soulier syndrome, types A1 [AR] + A2 [AD] (GP1BA)
  • Bleeding disorder, platelet-type, 1 [Bernard-Soulier syndrome] (GP9, GP1BA, GP1BB)
  • Bleeding disorder, platelet-type, 11 (GP6)
  • Bleeding disorder, platelet-type, 12 (PTGS1)
  • Bleeding disorder, platelet-type, 13, susceptibility to (TBXA2R)
  • Bleeding disorder, platelet-type, 15 (ACTN1)
  • Bleeding disorder, platelet-type, 16, AD (ITGA2B)
  • Bleeding disorder, platelet-type, 17 (GFI1B)
  • Bleeding disorder, platelet-type, 18 (RASGRP)
  • Bleeding disorder, platelet-type, 19 (PRKACG)
  • Bleeding disorder, platelet-type, 20 (SLFN14)
  • Bleeding disorder, platelet-type, 21 (FLI1)
  • Bleeding disorder, platelet-type, 24, AD (ITGB3)
  • Bleeding disorder, platelet-type, 7 [Scott syndrome] (ANO6)
  • Bleeding disorder, platelet-type, 8 (P2RY12)
  • Congenital short bowel syndrome (FLNA)
  • Deafness, AD 1, with/-out thrombocytopenia (DIAPH1)
  • Dominant macrothrombocytopenia, mild bleeding, disrupted cytoskeleton remodeling [lit.] (TPM4)
  • Ehlers-Danlos syndrome due to tenascin X deficiency [panelapp] (TNXB)
  • Ehlers-Danlos syndrome, classic-like, 1 (TNXB)
  • Ehlers-Danlos syndrome, musculocontractural type 1 (CHST14)
  • Gastrointestinal ulceration, recurrent, with dysfunctional platelets (PLA2G4A)
  • Ghosal hematodiaphyseal syndrome (TBXAS1)
  • Giant platelet disorder, isolated (GP1BB)
  • Glanzmann thrombasthenia (ITGA2B, ITGB3)
  • Gray platelet syndrome (NBEAL2)
  • Hemophagocytic lymphohistiocytosis, familial, 3 (UNC13D)
  • Hemophagocytic lymphohistiocytosis, familial, 5, with/-out microvillus inclusion disease (STXBP2)
  • Hermansky-Pudlak syndrome 1, 3, 4, 5, 6 (HPS1, HPS3, HPS4, HPS5, HPS6)
  • Hermansky-Pudlak syndrome 10 (AP3D1)
  • Hermansky-Pudlak syndrome 2 (AP3B1)
  • Hermansky-Pudlak syndrome 7 (DTNBP1)
  • Hermansky-Pudlak syndrome 8, 9 (BLOC1S3, BLOC1S6)
  • Immunodeficiency 71 with inflammatory disease + congenital thrombocytopenia (ARPC1B)
  • Inherited Thrombocytopenia assiciated with mutation of UDP-Galactose-4-Epimerase (GALE)
  • Intestinal pseudoobstruction, neuronal (FLNA)
  • LEOPARD syndrome 1 (PTPN11)
  • Leukocyte adhesion deficiency, type III (FERMT3)
  • Macrothrombocytopenia + granulocyte incl. with/-out nephritis/sensorineural hearing loss (MYH9)
  • Macrothrombocytopenia [panelapp] (TRPM7)
  • Macrothrombocytopenia, AD, TUBB1-related (TUBB1)
  • Myopathy associated with thrombocytopenia [panelapp] (GNE)
  • Noonan syndrome 1 (PTPN11)
  • Platelet disorder, familial, with associated myeloid malignancy (RUNX1)
  • Purinergic receptor P2X, ligand-gated ion channel, 1 deficiency (P2RX1)
  • Quebec platelet disorder (PLAU)
  • Radioulnar synostosis with amegakaryocytic thrombocytopenia 1 (HOXA11)
  • Radioulnar synostosis with amegakaryocytic thrombocytopenia 2 (MECOM)
  • Recessive severe thrombocytopenia with progression to marrow fibrosis at young age [panelapp] (KDSR)
  • Significant bruising/haematomas [panelapp] (TNXB)
  • Sitosterolemia 1 (ABCG8)
  • Sitosterolemia 2 (ABCG5)
  • Stormorken syndrome [YORK platelet syndrome] (STIM1)
  • Takenouchi-Kosaki syndrome (CDC42)
  • Telangiectasia, hereditary hemorrhagic, type 1 (ENG)
  • Telangiectasia, hereditary hemorrhagic, type 2 (ACVRL1)
  • Thrombocythemia 1 (THPO)
  • Thrombocythemia 2 (MPL)
  • Thrombocytopenia 2 (ANKRD26)
  • Thrombocytopenia 3 (FYB1)
  • Thrombocytopenia 4 (CYCS)
  • Thrombocytopenia 5 (ETV6)
  • Thrombocytopenia 6 (SRC)
  • Thrombocytopenia with beta-thalassemia, XL (GATA1)
  • Thrombocytopenia, AD, 7 (IKZF5)
  • Thrombocytopenia, XL (WASP)
  • Thrombocytopenia, XL, intermittent (WASP)
  • Thrombocytopenia, XL, with/-out dyserythropoietic anemia (GATA1)
  • Thrombocytopenia, anemia + myelofibrosis (MPIG6B)
  • Thrombocytopenia, congenital amegakaryocytic (MPL)
  • Thrombocytopenia, neonatal alloimmune (ITGB3)
  • Thrombocytopenia-absent radius syndrome (RBM8A)
  • Thrombophilia due to thrombomodulin defect (THBD)
  • Thrombotic thrombocytopenic purpura, hereditary (ADAMTS13)
  • von Willebrand disease, platelet-type (GP1BA)
  • von Willebrand disease, type 1 (VWF)
  • von Willebrand disease, type 3 (VWF)
  • von Willebrand disease, types 2A, 2B, 2M + 2N (VWF)
Erbgänge, Vererbungsmuster etc.
  • AD
  • AR
  • XL
  • XLR
OMIM-Ps
  • Multiple OMIM-Ps
ICD10 Code

Bioinformatik und klinische Interpretation

Test-Stärken

  • DAkkS-akkreditiertes Labor
  • EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
  • Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
  • Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
  • Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
  • eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
  • unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
  • unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
  • unsere umfassenden klinischen Aussagen

Testeinschränkungen

  • Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
  • Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
  • es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
  • die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
  • Gen-Konversionen
  • komplexe Inversionen
  • Balancierte Translokationen
  • Mitochondriale Varianten
  • Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
  • nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
  • niedriger Mosaik-Status
  • Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
  • Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
  • Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
  • Varianten innerhalb von Pseudogenen
  • die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde

Laboranforderung

  • Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.

  • Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.

  • Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.

  • Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.