Klinische Fragestellung46XX - indifferentes Genitale, Differentialdiagnose
Zusammenfassung
Ein kuratiertes panel mit 13 "core"-/"core candidate"-Genen bzw. zusammen genommen 26 kuratierten Genen zur umfassenden Untersuchung von genetisch bedingten Ursachen bei 46XX-Patienten mit indifferentem Genitale
44,2 kb (Erweitertes Panel: inkl. additional genes)
- EDTA-Blut (3-5 ml)
NGS +
[Sanger]
Genpanel
Ausgewählte Gene
Name | Exon-Länge (bp) | OMIM-G | Referenz-Seq. | Erbgang |
---|---|---|---|---|
CYP11B1 | 1512 | NM_000497.4 | AR | |
CYP17A1 | 1527 | NM_000102.4 | AR | |
CYP19A1 | 1512 | NM_031226.3 | AR | |
CYP21A2 | 1488 | NM_000500.9 | AR | |
HSD17B4 | 2211 | NM_000414.4 | AR | |
HSD3B2 | 1119 | NM_000198.4 | AR | |
NR0B1 | 1413 | NM_000475.5 | XL | |
NR5A1 | 1386 | NM_004959.5 | AD | |
POR | 2043 | NM_001395413.1 | AR | |
RSPO1 | 792 | NM_001038633.4 | AR | |
SOX9 | 1530 | NM_000346.4 | AD | |
SRY | 615 | NM_003140.3 | YL | |
WNT4 | 1056 | NM_030761.5 | AR, AD | |
AR | 2763 | NM_000044.6 | XLR | |
CDKN1C | 951 | NM_000076.2 | AD | |
CHD7 | 8994 | NM_017780.4 | AD | |
CYP11A1 | 1566 | NM_000781.3 | AR, AD | |
DHCR7 | 1428 | NM_001360.3 | AR | |
FSHR | 2088 | NM_000145.4 | AR | |
HSD17B3 | 933 | NM_000197.2 | AR | |
SAMD9 | 4770 | NM_001193307.2 | AD | |
STAR | 858 | NM_000349.3 | AR | |
WT1 | 1569 | NM_024426.6 | AD |
Infos zur Erkrankung
Die weiblichen und männlichen Geschlechtsmerkmale werden während des fötalen Lebens durch komplexe biologische Prozesse bestimmt, an denen Kaskaden der Genexpression beteiligt sind. Die kodierten Proteine haben hochspezifische Funktionen in Bezug auf Ort und Zeit der Entwicklung. Das genetische Geschlecht wird bei der Empfängnis festgelegt. Die Differenzierung in innere und äußere Genitalien hängt von der Sekretion spezifischer Hormone durch die Hoden in ausreichender Menge und nach einem definierten Zeitplan ab. Bei Fehlen von AMH und niedrigen Androgen-Konzentrationen entwickeln sich innere und äußere weibliche Genitalien. Die weibliche Differenzierung des inneren Genitaltrakts ist durch das Verschwinden der Wolffschen Gänge gekennzeichnet. Die Müllerschen Gänge bleiben bestehen und bilden das Endometrium, während sich das umgebende Mesenchym in das utrine Myometrium und der Eileiter differenziert. Der obere Teil der Vagina wird von den Müllerschen Gängen und der untere Teil von den Sinovaginal-Bulben gebildet. Die weibliche Ausrichtung des Sinus urogenitalis ist durch das Fehlen der Prostata-Differenzierung und den Erwerb einer separaten Vaginalöffnung auf der Oberfläche des Perineums gekennzeichnet. Jede Veränderung in den einzelnen Entwicklungsstadien kann die normale Geschlechtsentwicklung stören und zu Unterschieden in der Geschlechtsentwicklung führen, bei denen die Genitalentwicklung atypisch ist oder sich von den häufigsten Entwicklungsformen unterscheidet. Alle Vererbungsmuster für monogene Defekte werden beobachtet. Der molekulargenetische Ertrag ist gemeinhin unbekannt. Daher kann ein negatives DNA-Testergebnis die klinische Diagnose nicht ausschließen.
Referenz: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK279001/
- Alias: Genetic 46XX disorder of sex development - DSD; Genetic female pseudohermaphroditism
- Allelic: 46XY sex reversal 1 (SRY)
- Allelic: Acampomelic campomelic dysplasia (SOX9)
- Allelic: Beckwith-Wiedemann syndrome (CDKN1C)
- Allelic: Campomelic dysplasia (SOX9)
- Allelic: D-bifunctional protein deficiency (HSD17B4)
- Allelic: Disordered steroidogenesis due to cytochrome P450 oxidoreductase (POR)
- Allelic: Hydrops, lactic acidosis, and sideroblastic anemia (LARS2)
- Allelic: Leydig cell adenoma, somatic, with precocious puberty (LHCGR)
- Allelic: Leydig cell hypoplasia with hypergonadotropic hypogonadism (LHCGR)
- Allelic: Leydig cell hypoplasia with pseudohermaphroditism (LHCGR)
- Allelic: Mental retardation, XL, with isolated growth hormone deficiency (SOX3)
- Allelic: Ovarian hyperstimulation syndrome (FSHR)
- Allelic: Ovarian response to FSH stimulation (FSHR)
- Allelic: Precocious puberty, male (LHCGR)
- Allelic: Spinal and bulbar muscular atrophy of Kennedy (AR)
- Allelic: Testicular anomalies with or without congenital heart disease (GATA4)
- Allelic: Tetralogy of Fallot (GATA4)
- 17-alpha-hydroxylase/17,20-lyase deficiency (CYP17A1)
- 46XX sex reversal 1 (SRY)
- 46XX sex reversal 4 (NR5A1)
- 46XY gonadal dysgenesis with minifascicular neuropathy (DHH)
- 46XY sex reversal 2, dosage-sensitive (NR0B1)
- 46XY sex reversal 3 (NR5A1)
- 46XY sex reversal 6 (MAP3K1)
- 46XY sex reversal 7 (DHH)
- Adrenal hyperplasia, congenital, due to 11-beta-hydroxylase deficiency (CYP11B1)
- Adrenal hyperplasia, congenital, due to 21-hydroxylase deficiency (CYP21A2)
- Adrenal hyperplasia, congenital, due to 3-beta-hydroxysteroid dehydrogenase 2 deficiency (HSD3B2)
- Adrenal hypoplasia, congenital (NR0B1)
- Adrenal insufficiency, congenital, with 46XY sex reversal, partial or complete (CYP11A1)
- Adrenocortical insufficiency (NR5A1)
- Aldosteronism, glucocorticoid-remediable (CYP11B1)
- Androgen insensitivity (AR)
- Androgen insensitivity, partial, with/-out breast cancer (AR)
- Antley-Bixler syndrome with genital anomalies + disordered steroidogenesis (POR)
- Aromatase deficiency (CYP19A1)
- Aromatase excess syndrome (CYP19A1)
- CHARGE syndrome (CHD7)
- Campomelic dysplasia with autosomal sex reversal (SOX9)
- Denys-Drash syndrome (WT1)
- Frasier syndrome (WT1)
- Hyperandrogenism, nonclassic type, due to 21-hydroxylase deficiency (CYP21A2)
- Hypogonadotropic hypogonadism 5 with/-out anosmia (CHD7)
- Hypospadias 1, XL (AR)
- Hypospadias 2, XL (MAMLD1)
- IMAGE syndrome (CDKN1C)
- Lipoid adrenal hyperplasia (STAR)
- Luteinizing hormone resistance, female (LHCGR)
- MIRAGE syndrome (SAMD9)
- Meacham syndrome (WT1)
- Mental retardation, XL, syndromic 15 [Cabezas type] (CUL4B)
- Mullerian aplasia + hyperandrogenism (WNT4)
- Ovarian dysgenesis 1 (FSHR)
- Palmoplantar hyperkeratosis + true hermaphroditism (RSPO1)
- Palmoplantar hyperkeratosis with squamous cell carcinoma of skin + sex reversal (RSPO1)
- Panhypopituitarism, XL (SOX3)
- Perrault syndrome 1 (HSD17B4)
- Perrault syndrome 2 (HARS2)
- Perrault syndrome 3 (CLPP)
- Perrault syndrome 4 (LARS2)
- Proud syndrome (ARX)
- Pseudohermaphroditism, male, with gynecomastia (HSD17B3)
- Pseudovaginal perineoscrotal hypospadias (SRD5A2)
- SERKAL syndrome (WNT4)
- Smith-Lemli-Opitz syndrome (DHCR7)
- Testicular anomalies with/-out congenital heart disease (GATA4)
- AD
- AR
- XL
- XLR
- YL
- Multiple OMIM-Ps
Bioinformatik und klinische Interpretation
Test-Stärken
- DAkkS-akkreditiertes Labor
- EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
- Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
- Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
- Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
- eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
- unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
- unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
- unsere umfassenden klinischen Aussagen
Testeinschränkungen
- Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
- Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
- es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
- die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
- Gen-Konversionen
- komplexe Inversionen
- Balancierte Translokationen
- Mitochondriale Varianten
- Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
- nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
- niedriger Mosaik-Status
- Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
- Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
- Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
- Varianten innerhalb von Pseudogenen
- die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde
Laboranforderung
Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.
Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.
Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.
Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.