Klinische FragestellungAzoospermie-Syndrom, Differentialdiagnose
Zusammenfassung
Ein kuratiertes panel mit 5 Leitlinien-kuratierten und insgesamt 27 kuratierten Genen zur umfassenden Untersuchung von genetisch bedingten Formen der Azoospermie
30,8 kb (Erweitertes Panel: inkl. additional genes)
- EDTA-Blut (3-5 ml)
- AZF
- NGS + [Sanger]
Genpanel
Ausgewählte Gene
Name | Exon-Länge (bp) | OMIM-G | Referenz-Seq. | Erbgang |
---|---|---|---|---|
ADGRG2 | 3081 | NM_001079858.3 | XL | |
AR | 2763 | NM_000044.6 | XLR | |
CFTR | 4443 | NM_000492.4 | AR | |
DMRT1 | 1122 | NM_021951.3 | n.k. | |
NR5A1 | 1386 | NM_004959.5 | AD | |
SYCP3 | 711 | NM_153694.5 | AD | |
TEX11 | 2822 | NM_031276.3 | XLR | |
TEX14 | 4476 | NM_198393.4 | AR | |
CATSPER1 | 2343 | NM_053054.4 | AR | |
CYP21A2 | 1488 | NM_000500.9 | AR | |
FANCM | 6147 | NM_020937.4 | AR, Sus |
Infos zur Erkrankung
Männliche Unfruchtbarkeit kann durch das Fehlen messbarer Mengen an Spermatozoen im Ejakulat (Azoospermie) oder einer Anzahl von Spermien im Ejakulat unter 15 Millionen/ml (Oligozoospermie) gekennzeichnet sein. Die Spermien-Morphologie kann normal sein. Bei obstruktiver Azoospermie werden Spermien produziert, sie können sich aber wegen eines Verschlusses der Samenwege nicht mit der restlichen Ejakulat-Flüssigkeit mischen. Bei nicht-obstruktiver Azoospermie ist die Spermatogenese selbst gestört. Zu den bekannten genetischen Ursachen einer Azoospermie oder Oligospermie zählen Mutationen einzelner Gene bzw. Deletionen der Azoospermie-Faktoren-(AZF-)Region auf dem langen Arm des Y-Chromosoms. Es handelt sich in der Regel um de novo Ereignisse. Die diagnostische Ausbeute bei Azoospermie variiert in den verschiedenen ätiologischen Kategorien, von ~30% bei nicht-obstruktiver Azoospermie auf der Basis primär testikulärer Ursachen und bis zu 90% beim kongenitalen bilateralen Fehlen des Vas deferens.
Referenz: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3583155/
- Alias: Männliche Infertilität mit Azoospermie
- Allelic: Hydatidiform mole, recurrent, 3 (MEI1)
- Allelic: Premature ovarian failure 12 (SYCE1)
- Allelic: Premature ovarian failure 15 (FANCM)
- Allelic: Premature ovarian failure 7 (NR5A1)
- Allelic: Premature ovarian failure 8 (STAG3)
- 46XX sex reversal 4 (NR5A1)
- 46XY sex reversal 3 (NR5A1)
- Adrenal hyperplasia, congenital, due to 21-hydroxylase deficiency (CYP21A2)
- Adrenocortical insufficiency (NR5A1)
- Allelic: Cataract 36 (TDRD7)
- Allelic: Denys-Drash syndrome (WT1)
- Allelic: Frasier syndrome (WT1)
- Allelic: HARP syndrome (PANK2)
- Allelic: Meacham syndrome (WT1)
- Allelic: Nephrotic syndrome, type 4 (WT1)
- Allelic: Neurodegeneration with brain iron accumulation 1 (PANK2)
- Allelic: Premature ovarian failure 20 (MSH4)
- Allelic: Wilms tumor, type 1 (WT1)
- Androgen insensitivity (AR)
- Androgen insensitivity, partial, with/-out breast cancer (AR)
- Associated with nonobstructive azoospermia (NPAS2)
- Bronchiectasis +/- elevated sweat chloride 1 (SCNN1B)
- Congenital adrenal hypoplasia (NR5A1)
- Congenital bilateral absence of vas deferens; Cystic fibrosis (CFTR)
- Endocrine disorders including disorders of sexual development (NR5A1)
- Hyperandrogenism, nonclassic type, due to 21-hydroxylase deficiency (CYP21A2)
- Hypospadias 1, XL (AR)
- Ideopathic primary adrenal failure (NR5A1)
- Liddle syndrome 1 (SCNN1B)
- Male infertility from defect in meiosis (TEX11)
- Pseudohypoaldosteronism, type IB2, AR (SCNN1B)
- Spermatogenic failure (DMRT1)
- Spermatogenic failure (MEI1)
- Spermatogenic failure 1 (SYCP2)
- Spermatogenic failure 15 (SYCE1)
- Spermatogenic failure 2 (MSH4)
- Spermatogenic failure 22 (MEIOB)
- Spermatogenic failure 23 (TEX14)
- Spermatogenic failure 25 (TEX15)
- Spermatogenic failure 28 (FANCM)
- Spermatogenic failure 48 (M1AP)
- Spermatogenic failure 5 (AURKC)
- Spermatogenic failure 60 (TERB1)
- Spermatogenic failure 61 (STAG3)
- Spermatogenic failure 7 (CATSPER1)
- Spermatogenic failure 75 (SHOC1)
- Spermatogenic failure 8 (NR5A1)
- Spermatogenic failure 9 (DPY19L2)
- Spermatogenic failure, XL, 2 (TEX11)
- Spinal and bulbar muscular atrophy of Kennedy (AR)
- AD
- AR
- Sus
- XL
- XLR
- n.k.
- Multiple OMIM-Ps
Bioinformatik und klinische Interpretation
Test-Stärken
- DAkkS-akkreditiertes Labor
- EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
- Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
- Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
- Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
- eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
- unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
- unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
- unsere umfassenden klinischen Aussagen
Testeinschränkungen
- Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
- Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
- es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
- die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
- Gen-Konversionen
- komplexe Inversionen
- Balancierte Translokationen
- Mitochondriale Varianten
- Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
- nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
- niedriger Mosaik-Status
- Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
- Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
- Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
- Varianten innerhalb von Pseudogenen
- die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde
Laboranforderung
Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.
Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.
Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.
Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.