Klinische FragestellungCholestase, intrahepatische, Schwangerschaft; Differentialdiagnose
Zusammenfassung
Umfassendes differentialdiagnostisches panel für intrahepatische Cholestase in der Schwangerschaft mit 6 "core"-Genen bzw. insgesamt 26 kuratierten Genen gemäß klinischer Verdachtsdiagnose
51,2 kb (Erweitertes Panel: inkl. additional genes)
- EDTA-Blut (3-5 ml)
NGS +
[Sanger]
Genpanel
Ausgewählte Gene
Name | Exon-Länge (bp) | OMIM-G | Referenz-Seq. | Erbgang |
---|---|---|---|---|
ABCB11 | 3966 | NM_003742.4 | AR | |
ABCB4 | 3840 | NM_000443.4 | AR, AD | |
ABCC2 | 4638 | NM_000392.5 | AR | |
ATP8B1 | 3756 | NM_005603.6 | AD | |
NR1H4 | 1419 | NM_005123.4 | AR | |
TJP2 | 3063 | NM_004817.4 | AR | |
AKR1D1 | 858 | NM_001190906.2 | AR | |
ALDOB | 1095 | NM_000035.4 | AR | |
AMACR | 1185 | NM_001167595.2 | AR | |
BAAT | 1257 | NM_001127610.2 | AR | |
CLDN1 | 636 | NM_021101.5 | AR | |
CYP7B1 | 1521 | NM_004820.5 | AR | |
DCDC2 | 1431 | NM_016356.5 | AR | |
FAH | 1260 | NM_000137.4 | AR | |
HSD3B7 | 591 | NM_001142777.2 | AR | |
JAG1 | 3657 | NM_000214.3 | AD | |
PEX1 | 3852 | NM_000466.3 | AR | |
PEX12 | 1080 | NM_000286.3 | AR | |
PEX26 | 918 | NM_017929.6 | AR | |
PEX6 | 2943 | NM_000287.4 | AR | |
SERPINA1 | 1257 | NM_000295.5 | AR | |
SLC25A13 | 2031 | NM_001160210.2 | AR | |
UGT1A1 | 1602 | NM_000463.3 | AR | |
VIPAS39 | 1482 | NM_022067.4 | AR | |
VPS33B | 1854 | NM_018668.5 | AR |
Infos zur Erkrankung
Bei intrahepatischer Cholestase in der Schwangerschaft ist die Freisetzung von Gallenflüssigkeit aus den Leberzellen beeinträchtigt, meist im dritten Trimester begleitet von Juckreiz und eventuell gering-gradigem Ikterus. Nach der Entbindung normalisiert sich der Gallenfluss wieder, die Symptome können aber bei späteren Schwangerschaften erneut auftreten. Die Cholestase kann zu Problemen in der Schwangerschaft führen (fetaler Stress, Früh- oder sogar Totgeburt) und betrifft 1 % der Frauen in (Nord-)Europa. Genetische Veränderungen im ABCB11- oder ABCB4-Gen können die Wahrscheinlichkeit einer Frau erhöhen, intrahepatische Cholestase in der Schwangerschaft zu entwickeln. Das ABCB11-Gen kodiert für eine Gallensalzexportpumpe. Veränderungen im ABCB11-Gen in Verbindung mit erhöhten Östrogen- und Progesteron-Spiegeln verringern die Funktion dieser Pumpe. Das ABCB4-Gen kodiert für ein Protein, das Phospholipide in die Galle transportiert. Die meisten Frauen mit intrahepatischer Cholestase in der Schwangerschaft weisen keine genetischen Varianten im ABCB11- oder ABCB4-Gen auf. Andere genetische und umweltbedingte Faktoren spielen wahrscheinlich eine Rolle bzgl. der Anfälligkeit für diese Störung; sie wird autosomal-dominant mit reduzierter Penetranz vererbt. Die DNA-diagnostische Ausbeute ist weitgehend unbekannt.
Referenz: -
- Alias: Byler disease
- Alias: [Progressive] Familial intrahepatic cholestasis, PFIC
- Allelic: Alpha-methylacyl-CoA racemase deficiency (AMAKR)
- Allelic: Bardet-Biedl syndrome 14, modifier of (TMEM67)
- Allelic: Bilirubin, serum level of, QTL1 (UGT1A1)
- Allelic: Bjornstad syndrome (BCS1L)
- Allelic: Citrullinemia, adult-onset type II (SLC25A13)
- Allelic: Deafness, AR 66 (DCDC2)
- Allelic: Deafness, congenital heart defects, posterior embryotoxon (JAG1)
- Allelic: Emphysema due to AAT deficiency (SERPINA1)
- Allelic: Hajdu-Cheney syndrome (NOTCH2)
- Allelic: Heimler syndrome 1 (PEX1)
- Allelic: Heimler syndrome 2 (PEX6)
- Allelic: Hemorrhagic diathesis due to antithrombin Pittsburgh (SERPINA1)
- Allelic: Joubert syndrome 6 (TMEM87)
- Allelic: Joubert syndrome 7 (RPGRIP1L)
- Allelic: Joubert syndrome 9 (CC2D2A)
- Allelic: Mitochondrial complex III deficiency, nuclear type 1 (BCS1L)
- Allelic: Peroxisome biogenesis disorder 1B [NALD/IRD] (PEX1))
- Allelic: Peroxisome biogenesis disorder 3B (PEX12)
- Allelic: Peroxisome biogenesis disorder 4B (PEX6)
- Allelic: Peroxisome biogenesis disorder 7B (PEX26)
- Allelic: RHYNS syndrome (TMEM67)
- Allelic: Spastic paraplegia 5A, AR (CYP7B1)
- Allelic: Tetralogy of Fallot (JAG1)
- Alagille syndrome 1 (JAG1)
- Alagille syndrome 2 (NOTCH2)
- Arthrogryposis, renal dysfunction + cholestasis 1 (VPS33B)
- Arthrogryposis, renal dysfunction + cholestasis 2 (VIPAS39)
- Bile acid synthesis defect, congenital, 1 (HSD3B7)
- Bile acid synthesis defect, congenital, 2 (AKR1D1)
- Bile acid synthesis defect, congenital, 3 (CYP7B1)
- Bile acid synthesis defect, congenital, 4 (AMACR)
- COACH syndrome 1 (TMEM67)
- COACH syndrome 2 (CC2D2A)
- COACH syndrome 3 (RPGRIP1L)
- Cerebrotendinous xanthomatosis (CYP27A1)
- Cholestasis, benign recurrent intrahepatic, 2; Cholestasis, progr. fam. intrahep. 2 (ABCB11)
- Cholestasis, intrahepatic, of pregnancy, 1 (ATP8B1)
- Cholestasis, intrahepatic, of pregnancy; Cholestasis, progressive fam. intrahepatic 3 (ABCB4)
- Cholestasis, progressive familial intrahepatic 1; Cholestasis, benign recurrent intrahepatic ()
- Cholestasis, progressive familial intrahepatic 4 (TJP2)
- Cholestasis, progressive familial intrahepatic 5 (NR1H4)
- Citrullinemia, type II, neonatal-onset (SLC25A13)
- Crigler-Najjar syndrome, type I (UGT1A1)
- Crigler-Najjar syndrome, type II (UGT1A1)
- Deafness, congenital heart defects + posterior embryotoxon (JAG1)
- Dubin-Johnson syndrome (ABCC2)
- Emphysema-cirrhosis, due to AAT deficiency (SERPINA1)
- Fructose intolerance, hereditary (ALDOB)
- GRACILE syndrome (BCS1L)
- Gilbert syndrome (UGT1A1)
- Hyperbilirubinemia, familial transient neonatal (UGT1A1)
- Hypercholanemia, familial (BAAT)
- Hypercholanemia, familial (EPHX1)
- Ichthyosis, leukocyte vacuoles, alopecia, and sclerosing cholangitis (CLDN1)
- Meckel syndrome 3 (TMEM67)
- Meckel syndrome 5 (RPGRIP1L)
- Meckel syndrome 6 (CC2D2A)
- Microvillus inclusion disease (MYO5B)
- Nephronophthisis 11 (TMEM67)
- Nephronophthisis 19 (DCDC2)
- Niemann-Pick disease, type C1 (NPC1)
- Niemann-Pick disease, type D (NPC1)
- Niemann-pick disease, type C2 (NPC2)
- Peroxisome biogenesis disorder 1A [Zellweger] (PEX1)
- Peroxisome biogenesis disorder 3A (Zellweger] (PEX12)
- Peroxisome biogenesis disorder 4A (Zellweger] (PEX6)
- Peroxisome biogenesis disorder 7A [Zellweger] (PEX26)
- Sclerosing cholangitis, neonatal (DCDC2)
- Transaldolase deficiency (TALDO)
- Tyrosinemia, type I (FAH)
- AD
- AR
- Multiple OMIM-Ps
Bioinformatik und klinische Interpretation
Test-Stärken
- DAkkS-akkreditiertes Labor
- EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
- Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
- Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
- Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
- eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
- unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
- unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
- unsere umfassenden klinischen Aussagen
Testeinschränkungen
- Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
- Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
- es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
- die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
- Gen-Konversionen
- komplexe Inversionen
- Balancierte Translokationen
- Mitochondriale Varianten
- Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
- nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
- niedriger Mosaik-Status
- Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
- Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
- Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
- Varianten innerhalb von Pseudogenen
- die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde
Laboranforderung
Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.
Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.
Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.
Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.