Klinische FragestellungChondrodysplasia punctata, Differentialdiagnose
Zusammenfassung
Umfassendes differentialdiagnostisches panel für Chondrodysplasia punctata mit 4 "core"-Genen, 3 "core candidate"-Genen bzw. insgesamt 18 kuratierten Genen gemäß klinischer Verdachtsdiagnose
26,9 kb (Erweitertes Panel: inkl. additional genes)
- EDTA-Blut (3-5 ml)
NGS +
[Sanger]
Genpanel
Ausgewählte Gene
Name | Exon-Länge (bp) | OMIM-G | Referenz-Seq. | Erbgang |
---|---|---|---|---|
AGPS | 1977 | NM_003659.4 | AR | |
ARSL | 1780 | NM_000047.3 | XLR | |
EBP | 693 | NM_006579.3 | XL | |
GNPAT | 2043 | NM_014236.4 | AR | |
MGP | 312 | NM_000900.5 | AR | |
PEX5 | 1920 | NM_001131025.2 | AR | |
PEX7 | 972 | NM_000288.4 | AR | |
DHCR24 | 1551 | NM_014762.4 | AR | |
DHCR7 | 1428 | NM_001360.3 | AR | |
FAR1 | 1548 | NM_032228.6 | AR | |
GGCX | 2277 | NM_000821.7 | AR | |
LBR | 1848 | NM_002296.4 | AR | |
MSMO1 | 489 | NM_001017369.3 | AR | |
NSDHL | 1122 | NM_015922.3 | XL | |
POR | 2043 | NM_001395413.1 | AR | |
SC5D | 900 | NM_001024956.3 | AR | |
VKORC1 | 492 | NM_024006.6 | AD, AR | |
VPS35L | 3462 | NM_020314.7 | AR |
Infos zur Erkrankung
Alle Formen der Chondrodysplasia punctata (CP) beeinträchtigen die Knorpel- und Knochenentwicklung und zeigen sich auf Röntgenbildern als „stippling“. Bei der X-gebundenen CP (XLCP) 1 verschwindet die Tüpfelung im Allgemeinen in der frühen Kindheit. Zu den charakteristischen Merkmalen gehören Kleinwuchs, ungewöhnlich kurze Fingerspitzen und Zehen sowie auffällige Gesichtszüge. Die in der Regel männlichen Patienten sind gewöhnlich normal intelligent und haben normale Lebenserwartung. Bei einigen Betroffenen kommt es zu schwerwiegenden Komplikationen wie Obstruktion der Atemwege, Kompression des Rückenmarks, Entwicklungsverzögerung, Hörverlust, Sehstörungen und Herzfehler. XLCP 2 ist durch neben Knochen-Schäden durch Haut- und Augen-Anomalien gekennzeichnet. Die Symptome sind sehr unterschiedlich, aber die Tüpfelung verschwindet in der frühen Kindheit. Weitere Skelettanomalien sind asymmetrische Rhizomelien und progressive Kyphoskoliose mit Kleinwuchs. Neugeborene haben Ichthyose, später follikuläre Atrophodermie mit spärlichem, grobem Kopfhaar sowie angeborener oder früher Katarakt, Mikrophthalmie und Mikro-Cornea. Im weiblichen Gschlecht geht XLCP 2 in der Regel mit normaler Intelligenz und Lebenserwartung einher. Eine sehr viel schwerere Form tritt bei ganz wenigen Knaben auf, die mit Hypotonie, starker Entwicklungsverzögerung, Krampfanfällen und anderen Geburtsfehlern einhergeht. Bei der rhizomelischen CP (RCP) ist die normale Entwicklung beeinträchtigt und es kommt zu Skelettanomalien, geistiger Behinderung, Atemproblemen, Kontrakturen und angeborenem oder frühem Katarakt. Betroffene Säuglinge wachsen sehr langsam, viele haben Krampfanfälle. Wiederkehrende Atemwegsinfekte und schwere respiratorische Probleme sind häufig. Daher überleben die meisten Patienten nur bis ins Kindesalter. Drei RCP-Subtypen mit ähnlichen Merkmalen werden durch Mutationen in den Genen PEX7, GNPAT und AGPS unterschieden, während XLCP 1 und 2 durch ARSL- bzw. EBP-Mutationen verursacht werden. Ein negatives DNA-Testergebnis kann die klinische Diagnose nicht sicher ausschließen.
Referenzen: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1544/
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK55062/
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1270/
- Alias: Arylsulfatase E Deficiency (CDPX1)
- Alias: Brachytelephalangic chondrodysplasia punctata, BCDP
- Alias: Chondrodysplasia punctata 1, XL (ARSL)
- Alias: Chondrodysplasia punctata 2, XL (EBP)
- Alias: Chondrodysplasia punctata, CDP
- Alias: Chondrodysplasia punctata, rhizomelic (PEX7, GNPAT, AGPS)
- Alias: Chondrodysplasie p.
- Alias: Conradi-Hünermann[-Happle] syndrome (EBP)
- Alias: Happle syndrome (EBP)
- Alias: XLR chondrodysplasia punctata 1 (ARSL)
- Allelic: Cataracts, spastic paraparesis + speech delay (FAR1)
- Allelic: Pelger-Huet anomaly (LBR)
- Allelic: Peroxisome biogenesis disorder 2A, Zellweger (PEX5)
- Allelic: Peroxisome biogenesis disorder 2B (PEX5)
- Allelic: Reynolds syndrome (LBR)
- Antley-Bixler syndrome with genital anomalies + disordered steroidogenesis (POR)
- CK syndrome: Mental retardation, XL, thin habitus, cortical malformation (NSDHL)
- Chondrodysplasia punctata, XLD (EBP)
- Chondrodysplasia punctata, rhizomelic, type 2 (GNPAT)
- Congenital hemidysplasia, ichthyosis, limb defects (CHILD) syndrome (NSDHL)
- Conradi-Hünermann syndrome, Happle syndrome (EBP)
- Desmosterolosis (DHCR25)
- Disordered steroidogenesis due to cytochrome P450 oxidoreductase (POR)
- Greenberg skeletal dysplasia (LBR)
- Keutel syndrome: Pulm. stenoses, brachytelephalangy, deafness, abnormal cartilage ossification (MGP)
- Lathosterolosis (SC5D)
- Lipodystrophy, congenital generalized, type 1 (AGPS)
- Male EBP disorder with neurologic defects [MEND] syndrome (EBP)
- Microcephaly, congenital cataract + psoriasiform dermatitis (MSMO1)
- Pelger-Huet anomaly with mild skeletal anomalies (LBR)
- Peroxisomal fatty acyl-CoA reductase 1 disorder (FAR1)
- Pseudoxanthoma elasticum-like disorder with multiple coagulation factor deficiency (GGCX)
- Pulmonic stenoses, brachytelephalangy, deaf, abnormal cartilage ossification/calcification (MGP)
- Refsum peroxisomal disease 9B (PEX7)
- Rhizomelic chondrodysplasia punctata, type 1 (PEX7)
- Rhizomelic chondrodysplasia punctata, type 2 (GNPAT)
- Rhizomelic chondrodysplasia punctata, type 3 (AGPS)
- Rhizomelic chondrodysplasia punctata, type 4 (FAR1)
- Rhizomelic chondrodysplasia punctata, type 5 (PEX5)
- Ritscher-Schinzel syndrome 3 (VPS35L)
- Vitamin K-dependent clotting factors, combined deficiency of, 1 (GGCX)
- XLD chondrodysplasia punctata as phenocopy of warfarin embryopathy (VKORC1)
- AD
- AR
- XL
- XLR
- Multiple OMIM-Ps
Bioinformatik und klinische Interpretation
Test-Stärken
- DAkkS-akkreditiertes Labor
- EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
- Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
- Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
- Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
- eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
- unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
- unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
- unsere umfassenden klinischen Aussagen
Testeinschränkungen
- Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
- Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
- es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
- die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
- Gen-Konversionen
- komplexe Inversionen
- Balancierte Translokationen
- Mitochondriale Varianten
- Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
- nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
- niedriger Mosaik-Status
- Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
- Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
- Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
- Varianten innerhalb von Pseudogenen
- die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde
Laboranforderung
Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.
Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.
Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.
Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.