Klinische FragestellungEpilepsie, progressive myoklonische; Differentialdiagnose
Zusammenfassung
Umfassendes differentialdiagnostisches panel für Epilepsie, progressive myoklonische mit 14 bzw. 32 kuratierten Genen gemäß klinischer Verdachtsdiagnose
42,9 kb (Erweitertes Panel: inkl. additional genes)
- EDTA-Blut (3-5 ml)
NGS +
CSTB Gen: oft 12mer repeat [(CCCCGCCCCGCG)n] Expansion
Genpanel
Ausgewählte Gene
Name | Exon-Länge (bp) | OMIM-G | Referenz-Seq. | Erbgang |
---|---|---|---|---|
AMT | 1212 | NM_000481.4 | AR | |
EPM2A | 996 | NM_005670.4 | AR | |
FOLR1 | 774 | NM_016725.3 | AR | |
GLDC | 3063 | NM_000170.3 | AR | |
GOSR2 | 639 | NM_004287.5 | AR | |
KCNC1 | 1758 | NM_001112741.2 | AD | |
KCTD7 | 870 | NM_153033.5 | AR | |
LMNB2 | 1863 | NM_032737.4 | AR | |
NEU1 | 1248 | NM_000434.4 | AR | |
NHLRC1 | 1188 | NM_198586.3 | AR | |
PRICKLE1 | 2496 | NM_153026.3 | AR | |
PRICKLE2 | 2535 | NM_198859.4 | AR | |
SCARB2 | 1437 | NM_005506.4 | AR | |
ASAH1 | 1188 | NM_177924.5 | AR | |
CACNB4 | 1563 | NM_000726.5 | AD | |
CERS1 | 1064 | NM_021267.5 | AR | |
CUX2 | 4461 | NM_015267.4 | AD | |
D2HGDH | 1566 | NM_152783.5 | AR | |
GABRA1 | 1371 | NM_000806.5 | AD | |
GBA1 | 1611 | NM_001005741.3 | AR | |
HEXB | 1671 | NM_000521.4 | AD | |
PRDM8 | 2078 | NM_001099403.2 | AR | |
SEMA6B | 2701 | NM_032108.4 | AD | |
SLC6A1 | 1800 | NM_003042.4 | AD | |
TBC1D24 | 1680 | NM_001199107.2 | AR |
Infos zur Erkrankung
Patienten mit progressiver Myoclonus, Unverricht-Lundborg, Epilepsie (EPM1) zeigen erste Symptome mit 6-15 Jahren mit zunehmend häufigeren Myoklonusepisoden, die z.B. das Gehen im Verlauf zunehmend behindern. In der weiteren Progression können sich ggf. Ataxie, Dysarthrie, Intentionstremor, Depression und intellektueller Abbau entwickeln. Abhängig vom Schweregrad der Erkrankung und dem Ansprechen auf die Behandlung kann die Lebenserwartung normal sein. Die EPM1-Diagnose wird häufig (90%) durch biallelisch verlängerte CCC CGC CCC GCG (Dodekamer-) Expansionen im CSTB Gen oder Compound-Heterozygotie für eine CSTB-Dodecamer-Expansion und eine CSTB-Mutation gestellt (10%). Normal sind 2-3 Dodekamer-Wiederholungen, unbestimmte diagnostische Bedeutung weisen Allele mit 12-17 Dodecamer-Wiederholungen auf (instabil, aber nicht klinisch gesichert). Pathogene ≥30 Dodecamer-Wiederholungen zeigen volle Penetranz. Die diagnostische Ausbeute ist bisher nur selten und unzureichend mit <70% beschrieben. Unauffällige Befunde schließen die klinische Diagnose keinesfalls aus.
Referenzen: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1142/
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1389/
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK488189/
- Allelic: Deafness, AD 65 (TBC1D24)
- Allelic: Deafness, Ar 86 (TBC1D24)
- Allelic: Epilepsy, childhood absence, susceptibility to, 4 (GABRA2)
- Allelic: Epilepsy, idiopathic generalized, 10 (GABRD)
- Allelic: Epilepsy, idiopathic generalized, susceptibility to, 9 (CACNB4)
- Allelic: Epilepsy, juvenile absence, susceptibility to, 1 (EFHC1)
- Allelic: Episodic ataxia, type 5 (CACNB4)
- Allelic: Farber lipogranulomatosis (ASAH1)
- Allelic: Generalized epilepsy with febrile seizures plus, type 5, susceptibility to (GABRD)
- Allelic: Lipodystrophy, partial, acquired, susceptibility to (LMNB2)
- Cherry red spot-myoclonus syndrome (NEU1)
- DOORS [deafness, onychodystrophy, osteodystrophy, mental retardation, seizures] syndrome (TBC1D24)
- Epilepsy, familial adult myoclonic, 2 (STARD7)
- Epilepsy, juvenile myoclonic, susceptibility to (GABRD)
- Epilepsy, juvenile myoclonic, susceptibility to, 5 (GABRA2)
- Epilepsy, juvenile myoclonic, susceptibility to, 6 (CACNB4)
- Epilepsy, progressive myoclonic 1A, Unverricht/Lundborg (AMT, CSTB)
- Epilepsy, progressive myoclonic 1B (PRICKLE1)
- Epilepsy, progressive myoclonic 2A, Lafora (EPM2A)
- Epilepsy, progressive myoclonic 2B, Lafora (NHLRC1)
- Epilepsy, progressive myoclonic 3, with/-out intracellular inclusions (KCTD7)
- Epilepsy, progressive myoclonic 4, with or without renal failure (SCARB2)
- Epilepsy, progressive myoclonic 6 (GOSR2)
- Epilepsy, progressive myoclonic 7 (KCNC1)
- Epilepsy, progressive myoclonic, 10 (PRDM8)
- Epilepsy, progressive myoclonic, 11 (SEMA6B)
- Epilepsy, progressive myoclonic, 8 (CERS1)
- Epilepsy, progressive myoclonic, 9 (LMNB2)
- Epilepsy, rolandic, with proxysmal exercise-induce dystonia and writer's cramp (TBC1D24)
- Epileptic encephalopathy, early infantile, 16 (TBC1D24)
- Epileptic encephalopathy, early infantile, 19 (GABRA2)
- Epileptic encephalopathy, early infantile, 67 (CUX2)
- Glycine encephalopathy (GLDC)
- Infantile onset myoclonic epileptic encephalopathy (CUX2)
- Lipomucopolysaccharidosis (NEU1)
- Mucolipidosis I (NEU1)
- Myoclonic atonic seizures [panelapp] (SYNCRIP)
- Myoclonic epilepsy + intellectual disability [panelapp] (CSNK2B)
- Myoclonic epilepsy, infantile, familial (TBC1D24)
- Myoclonic epilepsy, juvenile, susceptibility to, 1 (EFHC1)
- Myoclonic seizures [panelapp] (GRIA2)
- Myoclonic-atonic epilepsy (SLC6A1)
- Neurodevelopmental disorder with language impairment and behavioral abnormalities (GRIA2)
- Poirier-Bienvenu neurodevelopmental syndrome: early-onset seizures + ID (CSNK2B)
- Sandhoff disease, infantile, juvenile + adult forms (HEXB)
- Sialidosis, type I-II (NEU1)
- Spinal muscular atrophy with progressive myoclonic epilepsy (ASAH1)
- AD
- AR
- Multiple OMIM-Ps
Bioinformatik und klinische Interpretation
Test-Stärken
- DAkkS-akkreditiertes Labor
- EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
- Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
- Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
- Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
- eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
- unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
- unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
- unsere umfassenden klinischen Aussagen
Testeinschränkungen
- Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
- Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
- es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
- die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
- Gen-Konversionen
- komplexe Inversionen
- Balancierte Translokationen
- Mitochondriale Varianten
- Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
- nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
- niedriger Mosaik-Status
- Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
- Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
- Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
- Varianten innerhalb von Pseudogenen
- die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde
Laboranforderung
Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.
Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.
Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.
Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.