Klinische FragestellungGlykogen-Speicherkrankheiten, Differentialdiagnose
Zusammenfassung
Umfassendes differentialdiagnostisches panel für Glykogen-Speicherkrankheiten mit 10 bzw. 31 meistenteils Leitlinien-kuratierten Genen gemäß klinischer Verdachtsdiagnose
56,3 kb (Erweitertes Panel: inkl. additional genes)
- EDTA-Blut (3-5 ml)
NGS +
[[Sanger]]
Genpanel
Ausgewählte Gene
Name | Exon-Länge (bp) | OMIM-G | Referenz-Seq. | Erbgang |
---|---|---|---|---|
AGL | 4599 | NM_000642.3 | AR | |
ALDOA | 1095 | NM_184041.5 | AR | |
G6PC1 | 1074 | NM_000151.4 | AR | |
GAA | 2859 | NM_000152.5 | AR | |
GBE1 | 2109 | NM_000158.4 | AR | |
PGAM2 | 762 | NM_000290.4 | AR | |
PHKA2 | 3708 | NM_000292.3 | XLR | |
PHKB | 3282 | NM_000293.3 | AR | |
PYGM | 2529 | NM_005609.4 | AR | |
ALDOB | 1095 | NM_000035.4 | AR | |
ENO3 | 1305 | NM_053013.4 | AR | |
EPM2A | 996 | NM_005670.4 | AR | |
FBP1 | 1017 | NM_000507.4 | AR | |
GYG1 | 1053 | NM_004130.4 | AR | |
GYS1 | 2022 | NM_001161587.2 | AR | |
GYS2 | 2112 | NM_021957.4 | AR | |
LAMP2 | 1233 | NM_002294.3 | XL | |
LDHA | 999 | NM_005566.4 | AR | |
LDHB | 1005 | NM_001174097.3 | AR | |
NHLRC1 | 1188 | NM_198586.3 | AR | |
PFKM | 2343 | NM_000289.6 | AR | |
PGK1 | 1254 | NM_000291.4 | XLR | |
PGM1 | 1743 | NM_002633.3 | AR | |
PHKA1 | 3633 | NM_002637.4 | XLR | |
PHKG2 | 1221 | NM_000294.3 | AR | |
PRKAG2 | 1710 | NM_016203.4 | AD | |
PRKAG3 | 1470 | NM_017431.3 | AD | |
PYGL | 2544 | NM_002863.5 | AR | |
RBCK1 | 1407 | NM_006462.6 | AR | |
SLC2A2 | 1575 | NM_000340.2 | AR | |
SLC37A4 | 1291 | NM_001164277.2 | AR, AD |
Infos zur Erkrankung
Glykogenspeicherkrankheiten (Glykogenosen, GSDs) sind Stoffwechselstörungen, die durch Enzymdefekte verursacht werden durch gestörte Glykogensynthese, Glykogenabbau oder Glykolyse, typischerweise in den Muskeln. Abhängig vom Enzymdefekt und seiner Ausprägung in Leber, Niere, Skelettmuskel und/oder Herz variieren die klinischen Zeichen von einer Erkrankung zur anderen. Leber-GSDs treten häufig auf Hypoglykämie, ketotischer Hypoglykämie nach Fasten, Hyperketonämie, Hypoglykämie, postprandialer Hyperglykämie, postprandialer Hyperlaktatämie sowie mit Hepatomegalie. Muskel-GSDs treten auf zweierlei Weise auf: mit Belastungsintoleranz und Rhabdomyolyse oder fixierte Muskelschwäche ohne Rhabdomyolyse. Häufig treten Belastungsunverträglichkeit und Rhabdomyolyse bei dynamischen Störungen wie der McArdle- und Tarui-Krankheit auf, während fixierte Muskelschwäche ohne Rhabdomyolyse bei zytoplasmatischen Störungen in Verbindung mit Glykogenolyse-Defekten auftritt. Je nach GSD sind die ersten Symptome früh in der Säuglingszeit bis hinein ins mittlere Lebensalter zu beobachten. Die meisten GSDs werden autosomal rezessiv vererbt, selten autosomal dominant oder X-gebunden. Die DNA-diagnostische Ausbeute ist nicht genau bekannt. Ein unauffälliger genetischer Befund bedeutet daher keinen Ausschluss der klinischen Verdachtsdiagnose.
Referenz: file:///C:/Users/EppleJoe/AppData/Local/Temp/atm-06-24-474.pdf
https://www.nature.com/articles/gim2015217.pdf?origin=ppub
- DD: Von Gierke, Pompe, Anderson, McArdle, Tarui, Danon, Hers, Fanconi-Bickel et al.
- Allelic: Cardiomyopathy, hypertrophic 6 (PRKAG2)
- Allelic: Cirrhosis due to liver phosphorylase kinase deficiency (PHKG2)
- Allelic: Diabetes mellitus, noninsulin-dependent (SLC2A2)
- Allelic: Polyglucosan body disease, adult form (GBE1)
- Allelic: Polyglucosan body myopathy 2 (GYG1)
- Allelic: Wolff-Parkinson-White syndrome (PRKAG2)
- Congenital disorder of glycosylation, type It (PGM1)
- Danon disease (LAMP2)
- Epilepsy, progressive myoclonic 2A, Lafora (EPM2A)
- Epilepsy, progressive myoclonic 2B, Lafora (NHLRC1)
- Fanconi-Bickel syndrome (SLC2A2)
- Fructose intolerance, hereditary (ALDOB)
- Fructose-1,6-bisphosphatase deficiency (FBP1)
- Glycogen content in skeletal muscle, increased (PRKAG3)
- Glycogen storage disease 0, liver (GYS2)
- Glycogen storage disease 0, muscle (GYS1)
- Glycogen storage disease II (GAA)
- Glycogen storage disease IIIa, IIIb (AGL)
- Glycogen storage disease IV (GBE1)
- Glycogen storage disease IXc (PHKG2)
- Glycogen storage disease Ia (G6PC)
- Glycogen storage disease Ib, Ic (SLC37A4)
- Glycogen storage disease VI (PYGL)
- Glycogen storage disease VII (PFKM)
- Glycogen storage disease X (PGAM2)
- Glycogen storage disease XI (LDHA)
- Glycogen storage disease XII (ALDOA)
- Glycogen storage disease XIII (ENO3)
- Glycogen storage disease XV (GYG1)
- Glycogen storage disease of heart, lethal congenital (PRKAG2)
- Glycogen storage disease, type IXa1, type IXa2 (PHKA2)
- Lactate dehydrogenase-B deficiency (LDHB)
- McArdle disease, Glycogen storage disease V (PYGM)
- Muscle glycogenosis (PHKA1)
- Phosphoglycerate kinase 1 deficiency (PFK1)
- Phosphorylase kinase deficiency of liver and muscle, AR (PHKB)
- Polyglucosan body myopathy 1 +/- immunodeficiency (RBCK1)
- AD
- AR
- XL
- XLR
- Multiple OMIM-Ps
Bioinformatik und klinische Interpretation
Test-Stärken
- DAkkS-akkreditiertes Labor
- EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
- Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
- Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
- Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
- eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
- unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
- unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
- unsere umfassenden klinischen Aussagen
Testeinschränkungen
- Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
- Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
- es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
- die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
- Gen-Konversionen
- komplexe Inversionen
- Balancierte Translokationen
- Mitochondriale Varianten
- Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
- nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
- niedriger Mosaik-Status
- Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
- Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
- Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
- Varianten innerhalb von Pseudogenen
- die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde
Laboranforderung
Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.
Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.
Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.
Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.