Klinische FragestellungHämatologische Malignität, Keimbahnmutationen; Differentialdiagnose
Zusammenfassung
Umfassendes differentialdiagnostisches panel für Hämatologische Tumore, Keimbahnmutationen mit 10 "core candidare"-Genen bzw. insgesamt 91 kuratierten Genen gemäß klinischer Verdachtsdiagnose
90,8 kb (Erweitertes Panel: inkl. additional genes)
- EDTA-Blut (3-5 ml)
NGS +
Genpanel
Ausgewählte Gene
Name | Exon-Länge (bp) | OMIM-G | Referenz-Seq. | Erbgang |
---|---|---|---|---|
ANKRD26 | 5133 | NM_014915.3 | AD | |
CEBPA | 1077 | NM_004364.5 | AD | |
DDX41 | 1935 | NM_016222.4 | AD | |
ELANE | 804 | NM_001972.4 | AD | |
ETV6 | 1359 | NM_001987.5 | Gen Fusion | |
GATA2 | 1443 | NM_032638.5 | AD | |
HAX1 | 840 | NM_006118.4 | AR | |
RUNX1 | 1443 | NM_001754.5 | AD, Gen Fusion | |
SAMD9L | 4756 | NM_152703.5 | AD | |
SRP72 | 1833 | NM_001267722.2 | AD | |
ATM | 9171 | NM_000051.4 | AR | |
BRCA1 | 5592 | NM_007294.4 | AR | |
BRCA2 | 10257 | NM_000059.4 | AR | |
BRIP1 | 3750 | NM_032043.3 | AR | |
CHEK2 | 1632 | NM_007194.4 | AD | |
ERCC4 | 2751 | NM_005236.3 | AR | |
MLH1 | 2271 | NM_000249.4 | AR | |
MSH2 | 2805 | NM_000251.3 | AR | |
MSH6 | 4083 | NM_000179.3 | AR | |
NBN | 2265 | NM_002485.5 | AR | |
NF1 | 8457 | NM_001042492.3 | AD | |
PALB2 | 3561 | NM_024675.4 | AR | |
PMS2 | 2589 | NM_000535.7 | AR | |
PTPN11 | 1782 | NM_002834.5 | AD | |
RPL35A | 333 | NM_000996.4 | AD | |
RPS17 | 408 | NM_001021.6 | AD | |
RPS24 | 393 | NM_033022.4 | AD | |
SAMD9 | 4770 | NM_001193307.2 | AD | |
STN1 | 1221 | NM_024928.5 | AR | |
TP53 | 1182 | NM_000546.6 | AD | |
XRCC2 | 843 | NM_005431.2 | AR |
Infos zur Erkrankung
Leukämie-Prädispositionsgene: Fanconi-Anämie, Diamant-Blackfan-Anämie, Dyskeratosis congenita, Shwachman-Diamond-Syndrom, schwere angeborene Neutropenie, familiäre MDS/AML mit mutiertem GATA2 Gen (Emberger-Syndrom, MonoMac-Syndrom), MIRAGE-Syndrom, Ataxie-Pancytopenia-Syndrom, Knochenmarkversagen-Syndrom 1, familiäre MDS/AML mit mutiertem DDX41 Gen, familiäre Thrombozytenstörung mit Neigung zu myeloischer Malignität, Thrombozytopenie 2+ 5, familiäre AML mit CEBPA-Mutation, Li-Fraumeni-Syndrom, Anfälligkeit für ALL3, konstitutionelles Mismatch-Reparatur-Mangelsyndrom
- Alias: Myeloide Leukämie, Prädisposition
- Allelic: Adrenocortical carcinoma, pediatric (TP53)
- Allelic: Anauxetic dysplasia 1 (RMRP)
- Allelic: Basal cell carcinoma 7 (TP53)
- Allelic: Breast cancer, early-onset, susceptibility to (BRIP1)
- Allelic: Breast cancer, male, susceptibility to(BRCA2)
- Allelic: Breast cancer, susceptibility to (ATM)
- Allelic: Breast cancer, susceptibility to (CHEK2)
- Allelic: Breast cancer, susceptibility to (PALB2)
- Allelic: Breast-ovarian cancer, familial, 1 (BRCA1)
- Allelic: Breast-ovarian cancer, familial, 2 (BRCA2)
- Allelic: Cartilage-hair hypoplasia (RMRP)
- Allelic: Cerebroretinal microangiopathy with calcifications + cysts (CTC1)
- Allelic: Cerebroretinal microangiopathy with calcifications + cysts (STN1)
- Allelic: Choroid plexus papilloma (TP53)
- Allelic: Cleft palate, psychomotor retardation + distinctive facial features (KDM1A)
- Allelic: Colorectal cancer (TP53)
- Allelic: Colorectal cancer, susceptibility to (CHEK2)
- Allelic: Emberger syndrome (GATA2)
- Allelic: Endometrial cancer, familial (MSH6)
- Allelic: Gaucher disease, perinatal lethal (GBA)
- Allelic: Glioblastoma 3(BRCA2)
- Allelic: Glioma susceptibility 1 (TP53)
- Allelic: LEOPARD syndrome 1 (PTPN11)
- Allelic: Lewy body dementia, susceptibility to (GBA)
- Allelic: Medulloblastoma (BRCA2)
- Allelic: Melanoma, cutaneous malignant, 9 (TERT)
- Allelic: Metachondromatosis 156250 AD 3
- Allelic: Metaphyseal dysplasia without hypotrichosis (RMRP)
- Allelic: Muir-Torre syndrome (MLH1, MSh2)
- Allelic: Neurofibromatosis, familial spinal (NF1)
- Allelic: Osteosarcoma (TP53)
- Allelic: Osteosarcoma, soft tissue sarcomas [panelapp)] (RPS27A)
- Allelic: Osteosarcoma, soft tissue sarcomas [panelapp] (RPL23)
- Allelic: Osteosarcoma, soft tissue sarcomas [panelapp] (RPL27)
- Allelic: Osteosarcoma, soft tissue sarcomas [panelapp] (RPL36)
- Allelic: Osteosarcoma, soft tissue sarcomas [panelapp] (RPS15)
- Allelic: Pancreatic cancer 2 (BRCA2)
- Allelic: Pancreatic cancer, susceptibility to, 3 (PALB2)
- Allelic: Pancreatic cancer, susceptibility to, 4 (BRCA1)
- Allelic: Parkinson disease, late-onset, susceptibility to (GBA)
- Allelic: Premature ovarian failure 17 (XRCC2)
- Allelic: Prostate cancer (BRCA2)
- Allelic: Prostate cancer, familial, susceptibility to (CHEK2)
- Allelic: Spermatogenic failure (XRCC2)
- Allelic: Tumoral calcinosis, familial, normophosphatemic (SAMD9)
- Allelic: Watson syndrome (NF1)
- Allelic: Wilms tumor (BRCA2)
- Allelic: XFE progeroid syndrome (ERCC4)
- Anemia, XL, with/-out neutropenia and/or platelet abnormalities (GATA1)
- Aplastic anemia (NBN)
- Aplastic anemia (PRF1)
- Aplastic anemia, susceptibility to (SBDS)
- Ataxia-pancytopenia syndrome (SAMD9L)
- Ataxia-telangiectasia (ATM)
- Autoimmune disease, multisystem, infantile-onset, 1 (STAT3)
- Autoimmune lymphoproliferative syndrome (FAS)
- Autoimmune lymphoproliferative syndrome, type IA (FAS)
- Bloom syndrome (BLM)
- Bone marrow failure syndrome 1 (SRP72)
- Bone marrow failure syndrome 2 (ERCC6L2)
- Bone marrow failure syndrome 3 (DNAJC21)
- Bone marrow failure syndrome 5 (TP53)
- Bone marrow failure syndrome, typ AR [panelapp] (RPL23)
- Bone marrow failure syndrome, typ AR [panelapp] (RPL27)
- Bone marrow failure syndrome, typ AR [panelapp] (RPL36)
- Bone marrow failure syndrome, typ AR [panelapp] (RPS15)
- Bonne marrow failure syndrome, typ AR [panelapp)] (RPS27A)
- Colorectal cancer, hereditary nonpolyposis, type 1 (MSH1)
- Colorectal cancer, hereditary nonpolyposis, type 2 (MLH1)
- Colorectal cancer, hereditary nonpolyposis, type 4 (PMS2)
- Colorectal cancer, hereditary nonpolyposis, type 5 (MSH6)
- Diamond-Blackfan anemia 1 (RPS19)
- Diamond-Blackfan anemia 10 (RPS26)
- Diamond-Blackfan anemia 11 (RPL26)
- Diamond-Blackfan anemia 12 (RPL15)
- Diamond-Blackfan anemia 13 (RPS29)
- Diamond-Blackfan anemia 14 with mandibulofacial dysostosis (TSR2)
- Diamond-Blackfan anemia 15 with mandibulofacial dysostosis (RPS28)
- Diamond-Blackfan anemia 16 (RPL27)
- Diamond-Blackfan anemia 17 (RPS27)
- Diamond-Blackfan anemia 4 (RPS17)
- Diamond-Blackfan anemia 5 (RPL35A)
- Diamond-Blackfan anemia 6 (RPL5)
- Diamond-Blackfan anemia 7 (RPL11)
- Diamond-Blackfan anemia 8 (RPS7)
- Diamond-Blackfan anemia 9 (RPS10)
- Diamond-Blackfan anemia [panelapp)] (RPS27A)
- Diamond-Blackfan anemia [panelapp] (RPL23)
- Diamond-Blackfan anemia [panelapp] (RPL27)
- Diamond-Blackfan anemia [panelapp] (RPL36)
- Diamond-Blackfan anemia [panelapp] (RPS15)
- Diamond-blackfan anemia 3 (RPS24)
- Dyskeratosis congenita, AD 2 (TERT)
- Dyskeratosis congenita, AD 3 (TINF2)
- Dyskeratosis congenita, AD 4 (RTEL1)
- Dyskeratosis congenita, AD 6 (ACD)
- Dyskeratosis congenita, AR 1 (NOP10)
- Dyskeratosis congenita, AR 2 (NHP2)
- Dyskeratosis congenita, AR 3 (WRAP53)
- Dyskeratosis congenita, AR 4 (TERT)
- Dyskeratosis congenita, AR 5 (RTEL1)
- Dyskeratosis congenita, AR 6 (PARN)
- Dyskeratosis congenita, AR 7 (ACD)
- Dyskeratosis congenita, XL (DKC1)
- Fanconi anemia, complementation group A, B, C, D2, E, F, G, I, L (FANCA, ... FANCL)
- Fanconi anemia, complementation group D1 (BRCA2)
- Fanconi anemia, complementation group J (BRIP1)
- Fanconi anemia, complementation group N (PALB2)
- Fanconi anemia, complementation group P (SLX4)
- Fanconi anemia, complementation group Q (ERCC4)
- Fanconi anemia, complementation group S (BRCA1)
- Fanconi anemia, complementation group T (UBE2T)
- Fanconi anemia, complementation group U (XRCC2)
- Fanconi anemia, complementation group V (MAD2L2)
- Gaucher disease, type I, II, III, IIIC (GBA)
- Hemophagocytic lymphohistiocytosis, familial, 2 (PRF1)
- Hyper-IgE recurrent infection syndrome (STAT3)
- Hyper-IgE recurrent infection syndrome, AR (DOCK8)
- Immunodeficiency 21 (GATA2)
- Immunodeficiency, common variable, 13 (IKZF1)
- Juvenile myelomonocytic leukemia (CBL)
- LIG4 syndrome (LIG4)
- Leukemia, acute lymphoblastic (NBN)
- Leukemia, acute lymphoblastic, susceptibility to, 3 (PAX5)
- Leukemia, acute myeloid (CEBPA)
- Leukemia, acute myeloid (RUNX1)
- Leukemia, acute myeloid (TERT)
- Leukemia, acute myeloid, somatic (CEBPA)
- Leukemia, acute myeloid, somatic (ETV6)
- Leukemia, acute myeloid, susceptibility to (GATA2)
- Leukemia, juvenile myelomonocytic (NF1)
- Leukemia, juvenile myelomonocytic, somatic (PTPN11)
- Li-Fraumeni syndrome (TP53)
- Li-Fraumeni syndrome 2 (CHEK2)
- Lymphoma, non-Hodgkin (PRF1)
- Lymphoproliferative syndrome 1 (ITK)
- Lymphoproliferative syndrome, XL, 1 (SH2D1A)
- MDS, AML [panelapp)] (RPS27A)
- MDS, AML [panelapp] (RPL23)
- MDS, AML [panelapp] (RPL27)
- MDS, AML [panelapp] (RPL36)
- MDS, AML [panelapp] (RPS15)
- MIRAGE syndrome (SAMD9)
- Mismatch repair cancer syndrome 1 (MLH1)
- Mismatch repair cancer syndrome 2 (MSH2)
- Mismatch repair cancer syndrome 3 (MSH6)
- Mismatch repair cancer syndrome 4 (PMS2)
- Monosomy 7 myelodysplasia + leukemia syndrome 1 (SAMD9L)
- Multiple myeloma, resistance to (LIG4)
- Myelodysplastic syndrome, susceptibility to (GATA2)
- Myeloproliferative/lymphoproliferative neoplasms, familial, multiple types, susceptibility (DDX41)
- Neurofibromatosis, type 1 (NF1)
- Neurofibromatosis-Noonan syndrome (NF1)
- Neutropenia, cyclic (ELANE)
- Neutropenia, severe congenital 1, AD (ELANE)
- Neutropenia, severe congenital 3, AR (HAX1)
- Neutropenia, severe congenital, XL (WAS)
- Nijmegen breakage syndrome (NBN)
- Non-hodgkin lymphoma; Squamous carcinoma; Leukemia [panelapp] (RMRP)
- Noonan syndrome 1 (PTPN11)
- Noonan syndrome-like disorder with/-out juvenile myelomonocytic leukemia (CBL)
- Platelet disorder, familial, with associated myeloid malignancy (RUNX1)
- Pulmonary fibrosis and/or bone marrow failure, telomere-related, 1 (TERT)
- Pulmonary fibrosis and/or bone marrow failure, telomere-related, 3 (RTEL1)
- Pulmonary fibrosis and/or bone marrow failure, telomere-related, 4 (PARN)
- Radioulnar synostosis with amegakaryocytic thrombocytopenia 2 (MECOM)
- Revesz syndrome (TINF2)
- Shwachman-Diamond syndrome (SBDS)
- Thrombocytopenia 2 (ANKRD26)
- Thrombocytopenia 5 (ETV6)
- Thrombocytopenia with beta-thalassemia, XL (GATA1)
- Thrombocytopenia, XL (WAS)
- Thrombocytopenia, XL, intermittent (WAS)
- Thrombocytopenia, XL, with/-out dyserythropoietic anemia (GATA1)
- Wiskott-Aldrich syndrome (WAS)
- Xeroderma pigmentosum, group F (ERCC4)
- Xeroderma pigmentosum, type F/Cockayne syndrome (ERCC4)
- AD
- AR
- Gen Fusion
- Multiple OMIM-Ps
Bioinformatik und klinische Interpretation
Test-Stärken
- DAkkS-akkreditiertes Labor
- EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
- Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
- Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
- Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
- eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
- unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
- unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
- unsere umfassenden klinischen Aussagen
Testeinschränkungen
- Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
- Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
- es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
- die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
- Gen-Konversionen
- komplexe Inversionen
- Balancierte Translokationen
- Mitochondriale Varianten
- Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
- nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
- niedriger Mosaik-Status
- Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
- Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
- Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
- Varianten innerhalb von Pseudogenen
- die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde
Laboranforderung
Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.
Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.
Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.
Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.