Klinische FragestellungHypophosphatämie/Rachitis, Differentialdiagnose
Zusammenfassung
Umfassendes differentialdiagnostisches panel für Hypophosphatämie/ Rachitis mit 20 Leitlinien-kuratierten sowie insgesamt 23 kuratierten Genen
37,1 kb (Erweitertes Panel: inkl. additional genes)
- EDTA-Blut (3-5 ml)
NGS +
[Sanger]
Genpanel
Ausgewählte Gene
Name | Exon-Länge (bp) | OMIM-G | Referenz-Seq. | Erbgang |
---|---|---|---|---|
CLCN5 | 2241 | NM_000084.5 | XLR | |
CTNS | 1203 | NM_001031681.3 | AR | |
CYP27B1 | 1527 | NM_000785.4 | AR | |
CYP2R1 | 1506 | NM_024514.5 | AR | |
CYP3A4 | 1512 | NM_017460.6 | AR | |
DMP1 | 1542 | NM_004407.4 | AR | |
ENPP1 | 2778 | NM_006208.3 | AR | |
FAM20C | 1755 | NM_020223.4 | AR | |
FGF23 | 756 | NM_020638.3 | AD | |
GNAS | 1185 | NM_000516.7; NM_016592.3; NM_080425.3 | AD | |
HNRNPC | 997 | NM_001077442.2 | AR | |
PHEX | 2250 | NM_000444.6 | XL | |
SLC34A1 | 1920 | NM_003052.5 | AD | |
SLC34A3 | 1800 | NM_080877.2 | AR | |
VDR | 1284 | NM_001017535.2 | AR | |
ALPL | 1575 | NM_000478.6 | AR, AD | |
FAH | 1260 | NM_000137.4 | AR | |
FGFR1 | 2469 | NM_023110.3 | AD | |
HRAS | 570 | NM_005343.4 | n.k. | |
KL | 3039 | NM_004795.4 | AR | |
KRAS | 567 | NM_004985.5 | AD | |
NRAS | 570 | NM_002524.5 | AD | |
OCRL | 2706 | NM_000276.4 | XLR |
Infos zur Erkrankung
In den meisten Fällen beginnt die Symptomatik der hereditären Hypophosphatämie/Rachitis in der frühen Kindheit. Diese Merkmale der Störung variieren stark, selbst bei betroffenen Mitgliedern derselben Familie. Mild betroffene Personen zeigen nur Hypophosphatämie. Schwerer betroffene Kinder wachsen langsamer und können Knochenanomalien (O-Bein, Genu valgum, Kraniosynostose, Zahnanomalien) entwickeln, bei Erwachsenen entsteht Osteomalazie. Die häufigste Form ist die X-chromosomal-dominante hypophosphatämische Rachitis (PHEX Gen mutiert); X-chromosomal-rezessive (CLCN5), autosomal-dominante (FGF23, SLC34A1) und rezessive Formen (DMP1, ENPP1) sind viel seltener. Eine weitere seltene Störung ist die hereditäre Hypophosphatämie/Rachitis mit Hyperkalziurie (SLC34A3 Gen mutiert). DNA-diagnostische Ausbeuten für Hypophosphatämie/Rachitis sind derzeit nicht bekannt; PHEX Mutationen betreffen in bis zu >40% indels). Die klinische Diagnose kann durch ein negatives molekulargenetisches Ergebnis keinesfalls ausgeschlossen werden.
Referenzen: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK83985/
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK274564/
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1480/
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK99494/
- Alias: Dominant hypophosphatemia with nephrolithiasis or osteoporosis, included
- Alias: Hereditary hypophosphatemic rickets with hypercalciuria, included
- Alias: Hypocalcemic vitamin D-resistant rickets, included
- Allelic: Arterial calcification, generalized, of infancy, 1 (ENPP1)
- Allelic: Cole disease (ENPP1)
- Allelic: Cystinosis, ocular nonnephropathic (CTNS)
- Allelic: Diabetes mellitus, non-insulin-dependent, susceptibility to (ENPP1)
- Allelic: Encephalocraniocutaneous lipomatosis, somatic mosaic (FGFR1)
- Allelic: Fanconi renotubular syndrome 2 (PHEX)
- Allelic: Hartsfield syndrome (FDGFR1)
- Allelic: Hypogonadotropic hypogonadism 2 with/-out anosmia (FGFR1)
- Allelic: Jackson-Weiss syndrome (FGFR1)
- Allelic: McCune-Albright syndrome, somatic, mosaic (GNAS)
- Allelic: Nephrolithiasis, type I (CLCN5)
- Allelic: Nephrolithiasis/osteoporosis, hypophosphatemic, 1 (PHEX)
- Allelic: Obesity, susceptibility to (ENPP1)
- Allelic: Osseous heteroplasia, progressive (GNAS)
- Allelic: Pfeiffer syndrome (FGFR1)
- Allelic: Pituitary adenoma 3, multiple types, somatic (GNAS)
- Allelic: Proteinuria, low molecular weight, with hypercalciuric nephrocalcinosis (CLCN5)
- Allelic: Pseudohypoparathyroidism Ia (GNAS)
- Allelic: Pseudohypoparathyroidism Ib (GNAS)
- Allelic: Pseudohypoparathyroidism Ic (GNAS)
- Allelic: Pseudopseudohypoparathyroidism (GNAS)
- Allelic: Trigonocephaly 1 (FGFR1)
- Allelic: Tumoral calcinosis, hyperphosphatemic, familial, 2 (FGF23)
- ACTH-independent macronodular adrenal hyperplasia (GNAS)
- Cystinosis, atypical nephropathic (CTNS)
- Cystinosis, late-onset juvenile or adolescent nephropathic (CTNS)
- Cystinosis, nephropathic (CTNS)
- Dent disease (CLCN5)
- Dent disease 2 (OCRL)
- Hypercalcemia, infantile, 2 (PHEX)
- Hypophosphatasia, adult (ALPL)
- Hypophosphatasia, childhood (ALPL)
- Hypophosphatasia, infantile (ALPL)
- Hypophosphatemic rickets (CLCN5)
- Hypophosphatemic rickets with hypercalciuria (SLC34A3)
- Hypophosphatemic rickets, AD (FGF23)
- Hypophosphatemic rickets, AR (DMP1)
- Hypophosphatemic rickets, AR, 2 (ENPP1)
- Hypophosphatemic rickets, XLD (PHEX)
- Lowe syndrome (OCRL)
- Odontohypophosphatasia (ALPL)
- Osteoglophonic dysplasia (FGFR1)
- Raine syndrome/osteosclerotic bone dysplasia, lethal (FAM20C)
- Rickets due to defect in vitamin D 25-hydroxylation (CYP2R1)
- Rickets, vitamin D-resistant, type IIA (VDR)
- Schimmelpenning-Feuerstein-Mims syndrome, somatic mosaic (HRAS, KRAS, NRAS)
- Tumoral calcinosis, hyperphosphatemic, familial, 3 (KL)
- Tyrosinemia, type I (FAH)
- Vitamin D-dependent rickets type 2B (HNRNPC)
- Vitamin D-dependent rickets, type 3 (CYP3A4)
- Vitamin D-dependent rickets, type I (CYP27B1)
- AD
- AR
- XL
- XLR
- n.k.
- Multiple OMIM-Ps
Bioinformatik und klinische Interpretation
Test-Stärken
- DAkkS-akkreditiertes Labor
- EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
- Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
- Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
- Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
- eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
- unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
- unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
- unsere umfassenden klinischen Aussagen
Testeinschränkungen
- Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
- Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
- es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
- die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
- Gen-Konversionen
- komplexe Inversionen
- Balancierte Translokationen
- Mitochondriale Varianten
- Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
- nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
- niedriger Mosaik-Status
- Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
- Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
- Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
- Varianten innerhalb von Pseudogenen
- die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde
Laboranforderung
Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.
Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.
Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.
Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.