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Klinische FragestellungIPEX-Syndrom, Differentialdiagnose

Zusammenfassung

Kurzinformation

Umfassendes differentialdiagnostisches panel für IPEX-Syndrom, Differentialdiagnose, mit 18 Leitlinien-kuratierten bzw. zusammen genommen 41 kuratierten Genen gemäß klinischer Verdachtsdiagnose

ID
IP0511
Anzahl Gene
33 Akkreditierte Untersuchung
Untersuchte Sequenzlänge
22,7 kb (Core-/Core-canditate-Gene)
76,9 kb (Erweitertes Panel: inkl. additional genes)
Analyse-Dauer
auf Anfrage
Untersuchungsmaterial
  • EDTA-Blut (3-5 ml)
Diagnostische Hinweise

NGS +

 

Genpanel

Ausgewählte Gene

NameExon-Länge (bp)OMIM-GReferenz-Seq.Erbgang
AIRE1638NM_000383.4AD, AR
CTLA4525NM_001037631.3AD
DCLRE1C2079NM_001033855.3AR
DOCK86300NM_203447.4AR
FOXP31296NM_014009.4XLR
RAG13132NM_000448.3AR
RAG21584NM_000536.4AR
STAT12253NM_007315.4AD, AR
STAT32313NM_139276.3AD
WAS1509NM_000377.3XLR
ABCC84746NM_000352.6AD, AR
BACH22542NM_001170794.2AD
CASP101368NM_001206524.2AD
EPCAM945NM_002354.3AR
FAS1008NM_000043.6AD, AR
FASLG846NM_000639.3AD, AR
GATA61788NM_005257.6AD
GCK1398NM_000162.5AD, AR
IL10RA1737NM_001558.4AR
IL10RB978NM_000628.5AR
IL2RA819NM_000417.3AR
INS333NM_000207.3AD, AR
ITCH2712NM_001257137.3AR
KCNJ111173NM_000525.4AD
LRBA8556NM_001199282.2AR
MALT12475NM_006785.4AR
MYO5B5547NM_001080467.3AR
PDX1852NM_000209.4AR
PTF1A987NM_178161.3AR
SKIC23741NM_006929.5AR
SKIC34695NM_014639.4AR
STAT5B2364NM_012448.4AR
TTC7A2577NM_020458.4AR

Infos zur Erkrankung

Klinischer Kommentar

Das IPEX-Syndrom („Immune dysregulation, polyendocrinopathy, enteropathy, X-linked“) betrifft vor allem das männliche Geschlecht und wird durch Fehlfunktionen des Immunsystems verursacht, die Gewebe und Organe des eigenen Organismus angreifen. Das IPEX-Syndrom ist durch die Entwicklung mehrerer Autoimmun-Erkrankungen bei den betroffenen Personen gekennzeichnet, insbesondere durch eine Autoimmun-Enteropathie mit schwerem Durchfall als erstem Symptom, Dermatitis und Polyendokrinopathie (Diabetes mellitus Typ 1, Hyperthyreose, Anämie, Thrombozytopenie oder Neutropenie). Das IPEX-Syndrom kann in der frühen Kindheit lebensbedrohlich sein. Mutationen im FOXP3-Gen verursachen dieses Syndrom. Das kodierte Protein ist für die Produktion und normale Funktion von regulatorischen T-Lymphozyten unerlässlich. IPEX-Syndrom wird X-chromosomal-rezessiv vererbt. Bezüglich der engeren Differentialdiagnose werden mindestens 9 weitere Leitlinien-kuratierte IPEX-ähnliche Syndrome überwiegend autosomal rezessiv, selten auch autosomal dominant oder X-gebunden vererbt. Insgesamt kommen differentialdiagnostisch >30 Gene in Betracht. Aufgrund seines seltenen Auftretens ist der molekulargenetische diagnostische Ertrag des IPEX-Syndroms derzeit noch unbekannt. Daher schließt ein negatives DNA-Testergebnis die klinische Diagnose keineswegs aus.

Referenz: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1118/

 

Synonyme
  • Alias: Immune dysregulation, Polyendocrinopathy, Enteropathy, XL, IPEX syndrome
  • Alias: Autoimmune enteropathy type 1
  • Alias: Autoimmunity-immunodeficiency syndrome, XL
  • Alias: Diabetes mellitus, congenital insulin-dependent, with fatal secretory diarrhea
  • Alias: Diarrhea, polyendocinopathy, fatal infection syndrome, XL
  • Alias: Enteropathy, autoimmune, with hemolytiv anemia + polyendocrinopathy
  • Alias: IDDM-secretory diarrhea syndrome
  • Alias: Insulin-dependent diabetes mellitus secretory diarrhea syndrome
  • Alias: Polyendocrinopathy, immune dysfunction + diarrhea, XL; XPID
  • Alias: XL autoimmunity-allergic dysregulation syndrome
  • Allelic: Atrial septal defect 9 (GATA6)
  • Allelic: Atrioventricular septal defect 5 (GATA6)
  • Allelic: Blood group, Rodgers (C4A)
  • Allelic: C1r/C1s deficiency, combined, Lupus [panelapp] (C1R/C1S)
  • Allelic: Celiac disease, susceptibility to, 3 (CTLA4)
  • Allelic: Colorectal cancer, hereditary nonpolyposis, type 8 (EPCAM)
  • Allelic: Diabetes mellitus, insulin-dependent, 12 (CTLA4)
  • Allelic: Diabetes mellitus, noninsulin-dependent, late onset (GCK)
  • Allelic: Diabetes mellitus, transient neonatal 2 (ABCC8)
  • Allelic: Diabetes mellitus, transient neonatal 3 (KCNJ11)
  • Allelic: Diabetes mellitus, type 2, susceptibility to (KCNJ11)
  • Allelic: Diabetes mellitus, type II, susceptibility to (PDX1)
  • Allelic: Diabetes, mellitus, insulin-dependent, susceptibility to, 10 (IL2RA)
  • Allelic: Ehlers-Danlos syndrome, periodontal type, 1 (C1R)
  • Allelic: Ehlers-Danlos syndrome, periodontal type, 2 (C1S)
  • Allelic: Hashimoto thyroiditis (CTLA4)
  • Allelic: Hepatitis B virus, susceptibility to (IL10RB)
  • Allelic: Immunodeficiency due to C1, C4 or C2 component complement deficiency
  • Allelic: Immunodeficiency due to an early component of complement deficiency
  • Allelic: Lung cancer, susceptibility to FASLG)
  • Allelic: MODY, type II (GCK)
  • Allelic: MODY, type IV (PDX1)
  • Allelic: Macular degeneration, age-related, 14, reduced risk of (C2)
  • Allelic: Maturity-onset diabetes of the young, type 10 (INS)
  • Allelic: Maturity-onset diabetes of the young, type 13 (KCNJ11)
  • Allelic: Persistent truncus arteriosus (GATA6)
  • Allelic: SLE, infections with encapsulated organisms [panelapp] (C1R)
  • Allelic: Systemic lupus erythematosus, susceptibility to (CTLA4)
  • Allelic: Tetralogy of Fallot (GATA6)
  • Autoimmune disease, multisystem, infantile-onset, 1 (STAT3)
  • Autoimmune disease, multisystem, with facial dysmorphism (ITCH)
  • Autoimmune lymphoproliferative syndrome, type IA (FAS)
  • Autoimmune lymphoproliferative syndrome, type IB (FASLG)
  • Autoimmune lymphoproliferative syndrome, type II (CASP10)
  • Autoimmune polyendocrinopathy syndrome , type I, with/-out reversible metaphyseal dysplasia (AIRE)
  • C1q deficiency (C1QA)
  • C1q deficiency (C1QB)
  • C1q deficiency (C1QC)
  • C1s deficiency (C1S)
  • C2 deficiency (C2)
  • C4B deficiency (C4B)
  • C4a deficiency (C4A)
  • Combined cellular + humoral immune defects with granulomas (RAG1, RAG2)
  • Complement component 1 deficiency [panelapp] (C1R)
  • Diabetes mellitus, insulin-dependent, 2 (INS)
  • Diabetes mellitus, noninsulin-dependent (ABCC8)
  • Diabetes mellitus, permanent neonatal 1 (GCK)
  • Diabetes mellitus, permanent neonatal 3, with/-out neurologic features (ABCC8)
  • Diabetes mellitus, permanent neonatal 4 (INS)
  • Diabetes, permanent neonatal 2, with/-out neurologic features (KCNJ11)
  • Diarrhea 2, with microvillus atrophy (MYO5B)
  • Diarrhea 5, with tufting enteropathy, congenital (EPCAM)
  • Gastrointestinal defects + immunodeficiency syndrome (TTC7A)
  • Growth hormone insensitivity with immune dysregulation 1, AR (STAT5B)
  • Growth hormone insensitivity with immune dysregulation 2, AD (STAT5B)
  • Hyper-IgE recurrent infection syndrome (STAT3)
  • Hyper-IgE recurrent infection syndrome, AR (DOCK8)
  • Hyperinsulinemic hypoglycemia, familial, 1 (ABCC8)
  • Hyperinsulinemic hypoglycemia, familial, 2 (KCNJ11)
  • Hyperinsulinemic hypoglycemia, familial, 3 (GCK)
  • Hyperproinsulinemia (INS)
  • Hypoglycemia of infancy, leucine-sensitive (ABCC8)
  • IDDM-Secretory diarrhea syndrome; DMSD
  • Immune dysregulation with autoimmunity, immunodeficiency + lymphoproliferation (CTLA4)
  • Immune dysregulation-polyendocrinopathy-enteropathy-XL syndrome (FOXP3)
  • Immunodeficiency 12 (MALT1)
  • Immunodeficiency 31A, mycobacteriosis, AD (STAT1)
  • Immunodeficiency 31B, mycobacterial + viral infections, AR (STAT1)
  • Immunodeficiency 31C, chronic mucocutaneous candidiasis, AD (STAT1)
  • Immunodeficiency 41 with lymphoproliferation + autoimmunity (IL2RA)
  • Immunodeficiency 60 (BACH2)
  • Immunodeficiency, common variable, 8, with autoimmunity (LRBA)
  • Immunodysregulation, polyendocrinopathy, enteropathy, XL (FOXP3)
  • Inflammatory bowel disease 25, early onset, (IL10RB)
  • Inflammatory bowel disease 28, early onset, AR (IL10RA)
  • Neutropenia, severe congenital, XL (WAS)
  • Omenn syndrome (DCLRE1C, RAG1, RAG2)
  • Pancreatic + cerebellar agenesis (PTF1A)
  • Pancreatic agenesis + congenital heart defects (GATA6)
  • Pancreatic agenesis 1 (PDX1)
  • Pancreatic agenesis 2 (PTF1A)
  • Severe combined immunodeficiency, Athabascan type (DCLRE1C)
  • Severe combined immunodeficiency, B cell-negative (RAG1, RAG2)
  • Thrombocytopenia, XL (WAS)
  • Thrombocytopenia, XL, intermittent (WAS)
  • Trichohepatoenteric syndrome 1 (TTC37)
  • Trichohepatoenteric syndrome 2 (SKIV2L)
  • Wiskott-Aldrich syndrome (WAS)
  • a/b T-cell lymphopenia + g/d T-cell expansion, severe cytomegalovirus infection, autoimmunity (RAG1)
Erbgänge, Vererbungsmuster etc.
  • AD
  • AR
  • XLR
OMIM-Ps
  • Multiple OMIM-Ps
ICD10 Code

Bioinformatik und klinische Interpretation

Test-Stärken

  • DAkkS-akkreditiertes Labor
  • EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
  • Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
  • Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
  • Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
  • eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
  • unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
  • unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
  • unsere umfassenden klinischen Aussagen

Testeinschränkungen

  • Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
  • Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
  • es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
  • die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
  • Gen-Konversionen
  • komplexe Inversionen
  • Balancierte Translokationen
  • Mitochondriale Varianten
  • Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
  • nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
  • niedriger Mosaik-Status
  • Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
  • Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
  • Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
  • Varianten innerhalb von Pseudogenen
  • die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde

Laboranforderung

  • Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.

  • Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.

  • Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.

  • Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.