Klinische FragestellungIPEX-Syndrom, Differentialdiagnose
Zusammenfassung
Umfassendes differentialdiagnostisches panel für IPEX-Syndrom, Differentialdiagnose, mit 18 Leitlinien-kuratierten bzw. zusammen genommen 41 kuratierten Genen gemäß klinischer Verdachtsdiagnose
76,9 kb (Erweitertes Panel: inkl. additional genes)
- EDTA-Blut (3-5 ml)
NGS +
Genpanel
Ausgewählte Gene
Name | Exon-Länge (bp) | OMIM-G | Referenz-Seq. | Erbgang |
---|---|---|---|---|
AIRE | 1638 | NM_000383.4 | AD, AR | |
CTLA4 | 525 | NM_001037631.3 | AD | |
DCLRE1C | 2079 | NM_001033855.3 | AR | |
DOCK8 | 6300 | NM_203447.4 | AR | |
FOXP3 | 1296 | NM_014009.4 | XLR | |
RAG1 | 3132 | NM_000448.3 | AR | |
RAG2 | 1584 | NM_000536.4 | AR | |
STAT1 | 2253 | NM_007315.4 | AD, AR | |
STAT3 | 2313 | NM_139276.3 | AD | |
WAS | 1509 | NM_000377.3 | XLR | |
ABCC8 | 4746 | NM_000352.6 | AD, AR | |
BACH2 | 2542 | NM_001170794.2 | AD | |
CASP10 | 1368 | NM_001206524.2 | AD | |
EPCAM | 945 | NM_002354.3 | AR | |
FAS | 1008 | NM_000043.6 | AD, AR | |
FASLG | 846 | NM_000639.3 | AD, AR | |
GATA6 | 1788 | NM_005257.6 | AD | |
GCK | 1398 | NM_000162.5 | AD, AR | |
IL10RA | 1737 | NM_001558.4 | AR | |
IL10RB | 978 | NM_000628.5 | AR | |
IL2RA | 819 | NM_000417.3 | AR | |
INS | 333 | NM_000207.3 | AD, AR | |
ITCH | 2712 | NM_001257137.3 | AR | |
KCNJ11 | 1173 | NM_000525.4 | AD | |
LRBA | 8556 | NM_001199282.2 | AR | |
MALT1 | 2475 | NM_006785.4 | AR | |
MYO5B | 5547 | NM_001080467.3 | AR | |
PDX1 | 852 | NM_000209.4 | AR | |
PTF1A | 987 | NM_178161.3 | AR | |
SKIC2 | 3741 | NM_006929.5 | AR | |
SKIC3 | 4695 | NM_014639.4 | AR | |
STAT5B | 2364 | NM_012448.4 | AR | |
TTC7A | 2577 | NM_020458.4 | AR |
Infos zur Erkrankung
Das IPEX-Syndrom („Immune dysregulation, polyendocrinopathy, enteropathy, X-linked“) betrifft vor allem das männliche Geschlecht und wird durch Fehlfunktionen des Immunsystems verursacht, die Gewebe und Organe des eigenen Organismus angreifen. Das IPEX-Syndrom ist durch die Entwicklung mehrerer Autoimmun-Erkrankungen bei den betroffenen Personen gekennzeichnet, insbesondere durch eine Autoimmun-Enteropathie mit schwerem Durchfall als erstem Symptom, Dermatitis und Polyendokrinopathie (Diabetes mellitus Typ 1, Hyperthyreose, Anämie, Thrombozytopenie oder Neutropenie). Das IPEX-Syndrom kann in der frühen Kindheit lebensbedrohlich sein. Mutationen im FOXP3-Gen verursachen dieses Syndrom. Das kodierte Protein ist für die Produktion und normale Funktion von regulatorischen T-Lymphozyten unerlässlich. IPEX-Syndrom wird X-chromosomal-rezessiv vererbt. Bezüglich der engeren Differentialdiagnose werden mindestens 9 weitere Leitlinien-kuratierte IPEX-ähnliche Syndrome überwiegend autosomal rezessiv, selten auch autosomal dominant oder X-gebunden vererbt. Insgesamt kommen differentialdiagnostisch >30 Gene in Betracht. Aufgrund seines seltenen Auftretens ist der molekulargenetische diagnostische Ertrag des IPEX-Syndroms derzeit noch unbekannt. Daher schließt ein negatives DNA-Testergebnis die klinische Diagnose keineswegs aus.
Referenz: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1118/
- Alias: Immune dysregulation, Polyendocrinopathy, Enteropathy, XL, IPEX syndrome
- Alias: Autoimmune enteropathy type 1
- Alias: Autoimmunity-immunodeficiency syndrome, XL
- Alias: Diabetes mellitus, congenital insulin-dependent, with fatal secretory diarrhea
- Alias: Diarrhea, polyendocinopathy, fatal infection syndrome, XL
- Alias: Enteropathy, autoimmune, with hemolytiv anemia + polyendocrinopathy
- Alias: IDDM-secretory diarrhea syndrome
- Alias: Insulin-dependent diabetes mellitus secretory diarrhea syndrome
- Alias: Polyendocrinopathy, immune dysfunction + diarrhea, XL; XPID
- Alias: XL autoimmunity-allergic dysregulation syndrome
- Allelic: Atrial septal defect 9 (GATA6)
- Allelic: Atrioventricular septal defect 5 (GATA6)
- Allelic: Blood group, Rodgers (C4A)
- Allelic: C1r/C1s deficiency, combined, Lupus [panelapp] (C1R/C1S)
- Allelic: Celiac disease, susceptibility to, 3 (CTLA4)
- Allelic: Colorectal cancer, hereditary nonpolyposis, type 8 (EPCAM)
- Allelic: Diabetes mellitus, insulin-dependent, 12 (CTLA4)
- Allelic: Diabetes mellitus, noninsulin-dependent, late onset (GCK)
- Allelic: Diabetes mellitus, transient neonatal 2 (ABCC8)
- Allelic: Diabetes mellitus, transient neonatal 3 (KCNJ11)
- Allelic: Diabetes mellitus, type 2, susceptibility to (KCNJ11)
- Allelic: Diabetes mellitus, type II, susceptibility to (PDX1)
- Allelic: Diabetes, mellitus, insulin-dependent, susceptibility to, 10 (IL2RA)
- Allelic: Ehlers-Danlos syndrome, periodontal type, 1 (C1R)
- Allelic: Ehlers-Danlos syndrome, periodontal type, 2 (C1S)
- Allelic: Hashimoto thyroiditis (CTLA4)
- Allelic: Hepatitis B virus, susceptibility to (IL10RB)
- Allelic: Immunodeficiency due to C1, C4 or C2 component complement deficiency
- Allelic: Immunodeficiency due to an early component of complement deficiency
- Allelic: Lung cancer, susceptibility to FASLG)
- Allelic: MODY, type II (GCK)
- Allelic: MODY, type IV (PDX1)
- Allelic: Macular degeneration, age-related, 14, reduced risk of (C2)
- Allelic: Maturity-onset diabetes of the young, type 10 (INS)
- Allelic: Maturity-onset diabetes of the young, type 13 (KCNJ11)
- Allelic: Persistent truncus arteriosus (GATA6)
- Allelic: SLE, infections with encapsulated organisms [panelapp] (C1R)
- Allelic: Systemic lupus erythematosus, susceptibility to (CTLA4)
- Allelic: Tetralogy of Fallot (GATA6)
- Autoimmune disease, multisystem, infantile-onset, 1 (STAT3)
- Autoimmune disease, multisystem, with facial dysmorphism (ITCH)
- Autoimmune lymphoproliferative syndrome, type IA (FAS)
- Autoimmune lymphoproliferative syndrome, type IB (FASLG)
- Autoimmune lymphoproliferative syndrome, type II (CASP10)
- Autoimmune polyendocrinopathy syndrome , type I, with/-out reversible metaphyseal dysplasia (AIRE)
- C1q deficiency (C1QA)
- C1q deficiency (C1QB)
- C1q deficiency (C1QC)
- C1s deficiency (C1S)
- C2 deficiency (C2)
- C4B deficiency (C4B)
- C4a deficiency (C4A)
- Combined cellular + humoral immune defects with granulomas (RAG1, RAG2)
- Complement component 1 deficiency [panelapp] (C1R)
- Diabetes mellitus, insulin-dependent, 2 (INS)
- Diabetes mellitus, noninsulin-dependent (ABCC8)
- Diabetes mellitus, permanent neonatal 1 (GCK)
- Diabetes mellitus, permanent neonatal 3, with/-out neurologic features (ABCC8)
- Diabetes mellitus, permanent neonatal 4 (INS)
- Diabetes, permanent neonatal 2, with/-out neurologic features (KCNJ11)
- Diarrhea 2, with microvillus atrophy (MYO5B)
- Diarrhea 5, with tufting enteropathy, congenital (EPCAM)
- Gastrointestinal defects + immunodeficiency syndrome (TTC7A)
- Growth hormone insensitivity with immune dysregulation 1, AR (STAT5B)
- Growth hormone insensitivity with immune dysregulation 2, AD (STAT5B)
- Hyper-IgE recurrent infection syndrome (STAT3)
- Hyper-IgE recurrent infection syndrome, AR (DOCK8)
- Hyperinsulinemic hypoglycemia, familial, 1 (ABCC8)
- Hyperinsulinemic hypoglycemia, familial, 2 (KCNJ11)
- Hyperinsulinemic hypoglycemia, familial, 3 (GCK)
- Hyperproinsulinemia (INS)
- Hypoglycemia of infancy, leucine-sensitive (ABCC8)
- IDDM-Secretory diarrhea syndrome; DMSD
- Immune dysregulation with autoimmunity, immunodeficiency + lymphoproliferation (CTLA4)
- Immune dysregulation-polyendocrinopathy-enteropathy-XL syndrome (FOXP3)
- Immunodeficiency 12 (MALT1)
- Immunodeficiency 31A, mycobacteriosis, AD (STAT1)
- Immunodeficiency 31B, mycobacterial + viral infections, AR (STAT1)
- Immunodeficiency 31C, chronic mucocutaneous candidiasis, AD (STAT1)
- Immunodeficiency 41 with lymphoproliferation + autoimmunity (IL2RA)
- Immunodeficiency 60 (BACH2)
- Immunodeficiency, common variable, 8, with autoimmunity (LRBA)
- Immunodysregulation, polyendocrinopathy, enteropathy, XL (FOXP3)
- Inflammatory bowel disease 25, early onset, (IL10RB)
- Inflammatory bowel disease 28, early onset, AR (IL10RA)
- Neutropenia, severe congenital, XL (WAS)
- Omenn syndrome (DCLRE1C, RAG1, RAG2)
- Pancreatic + cerebellar agenesis (PTF1A)
- Pancreatic agenesis + congenital heart defects (GATA6)
- Pancreatic agenesis 1 (PDX1)
- Pancreatic agenesis 2 (PTF1A)
- Severe combined immunodeficiency, Athabascan type (DCLRE1C)
- Severe combined immunodeficiency, B cell-negative (RAG1, RAG2)
- Thrombocytopenia, XL (WAS)
- Thrombocytopenia, XL, intermittent (WAS)
- Trichohepatoenteric syndrome 1 (TTC37)
- Trichohepatoenteric syndrome 2 (SKIV2L)
- Wiskott-Aldrich syndrome (WAS)
- a/b T-cell lymphopenia + g/d T-cell expansion, severe cytomegalovirus infection, autoimmunity (RAG1)
- AD
- AR
- XLR
- Multiple OMIM-Ps
Bioinformatik und klinische Interpretation
Test-Stärken
- DAkkS-akkreditiertes Labor
- EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
- Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
- Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
- Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
- eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
- unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
- unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
- unsere umfassenden klinischen Aussagen
Testeinschränkungen
- Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
- Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
- es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
- die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
- Gen-Konversionen
- komplexe Inversionen
- Balancierte Translokationen
- Mitochondriale Varianten
- Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
- nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
- niedriger Mosaik-Status
- Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
- Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
- Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
- Varianten innerhalb von Pseudogenen
- die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde
Laboranforderung
Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.
Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.
Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.
Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.