Klinische FragestellungJoubert-Syndrom, Differentialdiagnose
Zusammenfassung
Umfassendes differentialdiagnostisches panel für Joubert-Syndrom mit 37 Leitlinien-kuratierten bzw. insgesamt 39 kuratierten Genen gemäß klinischer Verdachtsdiagnose
98,4 kb (Erweitertes Panel: inkl. additional genes)
- EDTA-Blut (3-5 ml)
JP5180_DH
Genpanel
Ausgewählte Gene
Name | Exon-Länge (bp) | OMIM-G | Referenz-Seq. | Erbgang |
---|---|---|---|---|
AHI1 | 3591 | NM_017651.5 | AR | |
CC2D2A | 4863 | NM_001080522.2 | AR | |
CEP290 | 7440 | NM_025114.4 | AR | |
CPLANE1 | 9864 | NM_023073.4 | AR | |
KIAA0586 | 5005 | NM_001244189.2 | AR | |
MKS1 | 1680 | NM_017777.4 | AR | |
TMEM67 | 2988 | NM_153704.6 | AR | |
ARL13B | 1287 | NM_182896.3 | AR | |
ARL3 | 549 | NM_004311.4 | AR | |
ARMC9 | 3275 | NM_025139.6 | AR | |
B9D1 | 615 | NM_015681.5 | AR | |
B9D2 | 528 | NM_030578.4 | AR | |
C2CD3 | 5892 | NM_015531.6 | AR | |
CEP104 | 3059 | NM_014704.4 | AR | |
CEP120 | 2961 | NM_153223.4 | AR | |
CEP41 | 1122 | NM_018718.3 | AR | |
CSPP1 | 3666 | NM_024790.6 | AR | |
FAM149B1 | 2067 | NM_173348.2 | AR | |
HYLS1 | 900 | NM_145014.3 | AR | |
IFT172 | 5250 | NM_015662.3 | AR | |
INPP5E | 1945 | NM_019892.6 | AR | |
KIAA0753 | 2989 | NM_014804.3 | AR | |
KIF7 | 4032 | NM_198525.3 | AR | |
NPHP1 | 2202 | NM_000272.5 | AR | |
OFD1 | 3039 | NM_003611.3 | XL | |
PDE6D | 453 | NM_002601.4 | AR | |
PIBF1 | 2274 | NM_006346.4 | AR | |
RPGRIP1L | 3948 | NM_015272.5 | AR | |
SUFU | 1455 | NM_016169.4 | AR | |
TCTN1 | 1764 | NM_001082538.3 | AR | |
TCTN2 | 2094 | NM_024809.5 | AR | |
TCTN3 | 1824 | NM_015631.6 | AR | |
TMEM107 | 514 | NM_032354.5 | AR | |
TMEM138 | 489 | NM_016464.5 | AR | |
TMEM216 | 438 | NM_001173990.3 | AR | |
TMEM231 | 1110 | NM_001077416.2 | AR | |
TMEM237 | 1227 | NM_001044385.3 | AR |
Infos zur Erkrankung
Das Joubert-Syndrom (JS) kann viele Teile des Organismus betreffen, die Symptome variieren allerdings sogar bei Mitgliedern derselben Familie. Diagnose-weisend ist eine Kombination von Hirnanomalien, die im MRT als „molar tooth sign“ dargestellt werden und auf abnorme Kleinhirnwurm- und Hirnstamm-Strukturen zurückzuführen sind. Die meisten Säuglinge mit JS weisen Hypotonie und Ataxie zusammen mit Hyperpnoe oder Apnoe sowie okulomotorischer Apraxie auf, begleitet von verzögerter Entwicklung und mentaler Retardierung. Zu den charakteristischen Gesichtsmerkmalen gehören breite Stirn, gewölbte Augenbrauen, Ptosis, Hypertelorismus, tief angesetzte Ohren und ein dreieckiger Mund. Die Erkrankung ist manchmal mit Netzhautdystrophie und Kolobom, polyzystischen Nieren und Nephronophthisis, Leberfibrose, oralen Hamartomen, Polydaktylie oder endokrinen Problemen verbunden. Alle Fälle, bei denen das Backenzahn-Zeichen auftritt, werden in der Regel als JS betrachtet. Sie werden durch Mutationen in mindestens 34 Genen verursacht, die für Proteine der Primärzilien kodieren, und sind für >60->90% der JS-Fälle verantwortlich. Pathogene Varianten wurden auch bei Erkrankungen mit klinischen Befunden identifiziert, die sich mit JS lediglich überschneiden. In vielen Fällen ist es schwierig festzustellen, ob eine zuvor anerkannte Störung wirklich von JS als allelische Störung zu unterscheiden ist oder ob sie Teil des JS-Spektrums ist. JS wird in der Regel autosomal rezessiv vererbt, seltene Fälle werden X-chromosomal rezessiv vererbt. Da die diagnostische Ausbeute nicht ganz vollständig ist, schließt ein negatives molekulargenetisches Ergebnis die klinische Diagnose nicht aus.
Referenz: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1325/
- Alias: Cerebellooculorenal syndrome
- Alias: Cerebellooculorenal syndrome 1
- Alias: Cerebelloparenchymal disorder IV
- Alias: Joubert-Boltshauser syndrome
- Allelic: Acrocallosal syndrome (KIF7)
- Allelic: Basal cell naevus syndrome (SUFU)
- Allelic: Cone-rod dystrophy 20 (POC1B)
- Allelic: Hydrolethalus syndrome 2 (KIF7)
- Allelic: Leber congenital amaurosis 10 (CEP290)
- Allelic: Medulloblastoma, desmoplastic (SUFU)
- Allelic: Meningioma, familial, susceptibility to (SUFU)
- Allelic: Mental retardation, truncal obesity, retinal dystrophy + micropenis (INPP5E)
- Allelic: Nephronophthisis 1, juvenile (NPHP1)
- Allelic: Nephronophthisis 11 (TMEM67)
- Allelic: Nephronophthisis 12 (TTC21B)
- Allelic: Nephronophthisis 14 (ZNF423)
- Allelic: Nephronophthisis 3 (NPHP3)
- Allelic: Retinitis pigmentosa 23 (OFD1)
- Allelic: Retinitis pigmentosa 71 (IFT172)
- Acrocallosal syndrome (KIF7)
- Al-Gazali-Bakalinova syndrome (KIF7)
- Bardet-Biedl syndrome 13 (MKS1)
- Bardet-Biedl syndrome 14 (CEP290)
- Bardet-Biedl syndrome 14, modifier of (TMEM67)
- COACH syndrome 1 (TMEM67)
- COACH syndrome 2 (CC2D2A)
- COACH syndrome 3 (RPGRIP1L)
- Cone-rod dystrophy 20 (POC1B)
- Greig cephalopolysyndactyly syndrome (GLI3)
- Hydrolethalus syndrome (HYLS1)
- Hydrolethalus syndrome 2 (KIF7)
- Joubert syndrome 1 (INPP5E)
- Joubert syndrome 10 (OFD1)
- Joubert syndrome 12 (KIF7)
- Joubert syndrome 13 (TCTN1)
- Joubert syndrome 14 (TMEM237)
- Joubert syndrome 15 (CEP41)
- Joubert syndrome 16 (TMEM138)
- Joubert syndrome 17 (C5orf42 syn. CPLANE1)
- Joubert syndrome 18 (TCTN3)
- Joubert syndrome 19 (ZNF423)
- Joubert syndrome 2 (TMEM216)
- Joubert syndrome 20 (TMEM231)
- Joubert syndrome 21 (CSPP1)
- Joubert syndrome 22 (PDE6D)
- Joubert syndrome 23 (KIAA0586)
- Joubert syndrome 24 (TCTN2)
- Joubert syndrome 25 (CEP104)
- Joubert syndrome 26 (KATNIP syn. KIAA0556)
- Joubert syndrome 27 (B9D1)
- Joubert syndrome 28 (MKS1)
- Joubert syndrome 29 (TMEM107)
- Joubert syndrome 3 (AHI1)
- Joubert syndrome 30 (ARMC9)
- Joubert syndrome 31 (CEP120)
- Joubert syndrome 32 (SUFU)
- Joubert syndrome 33 (PIBF1)
- Joubert syndrome 34 (B9D2)
- Joubert syndrome 35 (ARL3)
- Joubert syndrome 36 (FAM149B1)
- Joubert syndrome 37 (TOGARAM1)
- Joubert syndrome 4 (NPHP1)
- Joubert syndrome 5 (CEP290)
- Joubert syndrome 6 (TMEM67)
- Joubert syndrome 7 (RPGRIP1L)
- Joubert syndrome 8 (ARL13B)
- Joubert syndrome 9 (CC2D2A)
- Meckel syndrome 1 (MKS1)
- Meckel syndrome 10 (B9D2)
- Meckel syndrome 11 (TMEM231)
- Meckel syndrome 13 (TMEM107)
- Meckel syndrome 2 (TMEM216)
- Meckel syndrome 3 (TMEM67)
- Meckel syndrome 4 (CEP290)
- Meckel syndrome 5 (RPGRIP1L)
- Meckel syndrome 6 (CC2D2A)
- Meckel syndrome 7 (NPHP3)
- Meckel syndrome 8 (TCTN2)
- Meckel syndrome 9 (B9D1)
- Orofaciodigital syndrome I (OFD1)
- Orofaciodigital syndrome IV (TCTN3)
- Orofaciodigital syndrome VI (CPLANE1 syn. C5orf42)
- Orofaciodigital syndrome XIV (C2CD3)
- Orofaciodigital syndrome XV (KIAA0753)
- Orofaciodigital syndrome XVI (TMEM107)
- Orofaciodigital syndrome XVII (INTU)
- Pallister-Hall syndrome (GLI3)
- Polydactyly, postaxial, types A1 + B (GLI3)
- Polydactyly, preaxial, type IV (GLI3)
- RHYNS syndrome (TMEM67)
- Renal-hepatic-pancreatic dysplasia 1 (NPHP3)
- Retinitis pigmentosa 71 (IFT172)
- Retinitis pigmentosa 83 (ARL3)
- Senior-Loken syndrome (POC1B)
- Senior-Loken syndrome 1 (NPHP1)
- Senior-Loken syndrome 6 (CEP290)
- Short-rib thoracic dysplasia 10 with/-out polydactyly (IFT172)
- Short-rib thoracic dysplasia 13 with/-out polydactyly (CEP120)
- Short-rib thoracic dysplasia 14 with polydactyly (KIAA0586)
- Short-rib thoracic dysplasia 20 with polydactyly (INTU)
- Short-rib thoracic dysplasia 4 with/-out polydactyly (TTC21B)
- Simpson-Golabi-Behmel syndrome, type 2 (OFD1)
- AR
- XL
- Multiple OMIM-Ps
Bioinformatik und klinische Interpretation
Test-Stärken
- DAkkS-akkreditiertes Labor
- EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
- Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
- Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
- Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
- eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
- unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
- unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
- unsere umfassenden klinischen Aussagen
Testeinschränkungen
- Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
- Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
- es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
- die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
- Gen-Konversionen
- komplexe Inversionen
- Balancierte Translokationen
- Mitochondriale Varianten
- Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
- nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
- niedriger Mosaik-Status
- Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
- Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
- Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
- Varianten innerhalb von Pseudogenen
- die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde
Laboranforderung
Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.
Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.
Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.
Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.