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Klinische FragestellungKallmann-Syndrom, hypogonadotroper Hypogonadismus; Differentialdiagnose

Zusammenfassung

Kurzinformation

Umfassendes differentialdiagnostisches panel für Kallmann-Syndrom, hypogonadotropen Hypogonadismus, mit 1 "core"-Gen und 15 weiteren "core-candidate" Genen bzw. insgesamt 40 kuratierten Genen gemäß klinischer Verdachtsdiagnose

ID
KP1010
Anzahl Gene
39 Akkreditierte Untersuchung
Untersuchte Sequenzlänge
29,4 kb (Core-/Core-canditate-Gene)
71,2 kb (Erweitertes Panel: inkl. additional genes)
Analyse-Dauer
auf Anfrage
Untersuchungsmaterial
  • EDTA-Blut (3-5 ml)
Diagnostische Hinweise

NGS +

[Sanger]

 

Genpanel

Ausgewählte Gene

NameExon-Länge (bp)OMIM-GReferenz-Seq.Erbgang
ANOS12043NM_000216.4XLR
CHD78994NM_017780.4AD
FEZF11428NM_001024613.4AR
FGF8735NM_033163.5AD, AR
FGFR12469NM_023110.3AR
GNRH1291NM_000825.3AR
GNRHR987NM_000406.3AR
IL17RD2220NM_017563.5AR
KISS1417NM_002256.4AR
KISS1R1197NM_032551.5AR
NSMF1587NM_015537.5AR
PROK2390NM_001126128.2AR, Oligo
PROKR21155NM_144773.4AR, Oligo
TAC3366NM_013251.4AR
TACR31398NM_001059.3AR
WDR113675NM_018117.12AD
AXL1881NM_001278599.2AD
CCDC1414895NM_173648.4AD
CLPP834NM_006012.4AR
CUL4B2742NM_003588.4XLR
DCAF171563NM_025000.4AR
DUSP61146NM_001946.4AD
FGF17651NM_003867.4AD
FLRT31950NM_198391.3AD
FSHB390NM_000510.4AR
GLI24761NM_005270.5AD
HESX1558NM_003865.3AD, AR
HS6ST11236NM_004807.3AD
KLB3135NM_175737.4AD
LHB426NM_000894.3AR
LHX41173NM_033343.4AD
NR0B11413NM_000475.5XL
POLR3B3402NM_018082.6AR
PROP1681NM_006261.5AR
SEMA3A2316NM_006080.3AD, Oligo
SEMA3E2328NM_012431.3Oligo
SEMA7A1959NM_001146029.3Ass
SOX101401NM_006941.4AD
SPRY4969NM_030964.5AD

Infos zur Erkrankung

Klinischer Kommentar

Das Kallmann-Syndrom (KS) ist eine seltene genetische Erkrankung, die durch verzögerte oder fehlende Pubertät mit beeinträchtigtem/ fehlenden Geruchssinn definiert ist. Eng verwandt ist der normosmisch-idiopathische hypogonadotrope Hypogonadismus (nIHH). Bei beiden Erkrankungen fehlt das Gonadotropin-Releasing Hormon. KS und nIHH treten in beiden Geschlechtern auf, bei Männern wird die Diagnose häufiger gestellt. Patienten mit KS/nIHH fallen typischerweise in der Adoleszenz aufgrund verzögerter Pubertät auf. Während die reproduktiven Symptome überwiegen, werden auch Gesichtsanomalien (Lippen-/Gaumenspalten), das Fehlen einer Niere, verkürzte Finger, Taubheit, Knochen- und Zahnfehler sowie gestörte Augenbewegungen beobachtet. Alle monogenen Erbgänge werden beobachtet, die Penetranz für den KS-Phänotyp ist für einige Gene wie ANOS1 bzgl. der Kernsymptome praktisch vollständig und hoch für rezessiv vererbte Formen. Die umfangreiche Genpanel-Diagnostik erbringt in bis zu 60% der Betroffenen pathogene Sequenzveränderungen, ein normales DNA-Ergebnis schließt die klinische Diagnose nicht aus.

Referenz: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1334/

 

Synonyme
  • *PROK/-R2 inheritance: https://eje.bioscientifica.com/downloadpdf/journals/eje/178/3/EJE-17-0749.pdf
  • Adrenal hypoplasia, congenital (NR0B1)
  • Allelic: 46XY sex reversal 2, dosage-sensitive (NR0B1)
  • Allelic: Blood group, John-Milton-Hagen system (SEMA7A)
  • Allelic: CHARGE syndrome (CHD7)
  • Allelic: Encephalocraniocutaneous lipomatosis; Hartsfield syndrome; Jackson-Weiss syndrome (FGFR1)
  • Allelic: Luteinizing hormone resistance, female (LHCGR)
  • Allelic: Osteoglophonic dysplasia; Pfeiffer syndrome; Trigonocephaly 1 (FGFR1)
  • Allelic: Precocious puberty, central, 1 (KISS1R)
  • Allelic: Precocious puberty, male (LHCGR)
  • CHARGE syndrome (SEMA3E)
  • Congenital hypogonadotropic hypogonadism [panelapp] (KLB)
  • Culler-Jones syndrome (GLI2)
  • Dworschak-Punetha neurodevelopmental syndrome (PLXNA1)
  • Growth hormone deficiency with pituitary anomalies (HESX1)
  • Holoprosencephaly 9 (GLI2)
  • Hypogonadotropic hypogonadism 1 with/-out anosmia; Kallmann syndrome 1 (ANOS1)
  • Hypogonadotropic hypogonadism 10 with/-out anosmia (TAC3)
  • Hypogonadotropic hypogonadism 11 with/-out anosmia (TACR3)
  • Hypogonadotropic hypogonadism 12 with/without anosmia (GNRH1)
  • Hypogonadotropic hypogonadism 13 with or without anosmia (KISS1)
  • Hypogonadotropic hypogonadism 14 with/-out anosmia (WDR11)
  • Hypogonadotropic hypogonadism 15 with/-out anosmia (HS6ST1)
  • Hypogonadotropic hypogonadism 16 with/-out anosmia (SEMA3A)
  • Hypogonadotropic hypogonadism 17 with/-out anosmia (SPRY4)
  • Hypogonadotropic hypogonadism 18 with/-out anosmia (IL17RD)
  • Hypogonadotropic hypogonadism 19 with/-out anosmia (DUSP6)
  • Hypogonadotropic hypogonadism 2 with/-out anosmia (FGFR1)
  • Hypogonadotropic hypogonadism 20 with/-out anosmia (FGF17)
  • Hypogonadotropic hypogonadism 21 with anosmia (FLRT3)
  • Hypogonadotropic hypogonadism 22, with/-out anosmia (FEZF1)
  • Hypogonadotropic hypogonadism 23 with/-out anosmia (LHB)
  • Hypogonadotropic hypogonadism 24 without anosmia (FSHB)
  • Hypogonadotropic hypogonadism 3 with/without anosmia (PROKR2)*
  • Hypogonadotropic hypogonadism 4 with/without anosmia (PROK2)*
  • Hypogonadotropic hypogonadism 5 with/-out anosmia (CHD7)
  • Hypogonadotropic hypogonadism 6 with/without anosmia (FGF8)
  • Hypogonadotropic hypogonadism 7 without anosmia (GNRHR)
  • Hypogonadotropic hypogonadism 8 with/-out anosmia (KISS1R)
  • Hypogonadotropic hypogonadism 9 with/-out anosmia (NSMF)
  • Hypogonadotropic hypogonadism without anosmia; normosmic IHH [panelapp] (CCDC141)
  • Leukodystrophy, hypomyelinating, 8, +/- oligodontia and/or hypogonadotropic hypogonadism (POLR3B)
  • Leydig cell hypoplasia with hypergonadotropic hypogonadism (LHCGR)
  • Leydig cell hypoplasia with pseudohermaphroditism (LHHCGR)
  • Mental retardation, XL, syndromic 15, Cabezas type (CUL4B)
  • Normosmic idiopathic hypogionadotrophic Hypogonadism [panelapp] (CCDC141)
  • PCWH syndrome (SOX10)
  • Perrault syndrome 3 (CLPP)
  • Pituitary hormone deficiency, combined, 2 (PROP1)
  • Pituitary hormone deficiency, combined, 3 (LHX3)
  • Pituitary hormone deficiency, combined, 4 (LHX4)
  • Pituitary hormone deficiency, combined, 5 (HESX1)
  • Septooptic dysplasia (HESX1)
  • Waardenburg syndrome, type 2E, with/-out neurologic involvement (SOX10)
  • Waardenburg syndrome, type 4C (SOX10)
  • Woodhouse-Sakati syndrome (DCAF17)
Erbgänge, Vererbungsmuster etc.
  • AD
  • AR
  • Ass
  • Oligo
  • XL
  • XLR
OMIM-Ps
  • Multiple OMIM-Ps
ICD10 Code

Bioinformatik und klinische Interpretation

Test-Stärken

  • DAkkS-akkreditiertes Labor
  • EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
  • Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
  • Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
  • Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
  • eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
  • unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
  • unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
  • unsere umfassenden klinischen Aussagen

Testeinschränkungen

  • Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
  • Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
  • es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
  • die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
  • Gen-Konversionen
  • komplexe Inversionen
  • Balancierte Translokationen
  • Mitochondriale Varianten
  • Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
  • nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
  • niedriger Mosaik-Status
  • Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
  • Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
  • Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
  • Varianten innerhalb von Pseudogenen
  • die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde

Laboranforderung

  • Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.

  • Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.

  • Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.

  • Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.