Klinische FragestellungKallmann-Syndrom, hypogonadotroper Hypogonadismus; Differentialdiagnose
Zusammenfassung
Umfassendes differentialdiagnostisches panel für Kallmann-Syndrom, hypogonadotropen Hypogonadismus, mit 1 "core"-Gen und 15 weiteren "core-candidate" Genen bzw. insgesamt 40 kuratierten Genen gemäß klinischer Verdachtsdiagnose
71,2 kb (Erweitertes Panel: inkl. additional genes)
- EDTA-Blut (3-5 ml)
NGS +
[Sanger]
Genpanel
Ausgewählte Gene
Name | Exon-Länge (bp) | OMIM-G | Referenz-Seq. | Erbgang |
---|---|---|---|---|
ANOS1 | 2043 | NM_000216.4 | XLR | |
CHD7 | 8994 | NM_017780.4 | AD | |
FEZF1 | 1428 | NM_001024613.4 | AR | |
FGF8 | 735 | NM_033163.5 | AD, AR | |
FGFR1 | 2469 | NM_023110.3 | AR | |
GNRH1 | 291 | NM_000825.3 | AR | |
GNRHR | 987 | NM_000406.3 | AR | |
IL17RD | 2220 | NM_017563.5 | AR | |
KISS1 | 417 | NM_002256.4 | AR | |
KISS1R | 1197 | NM_032551.5 | AR | |
NSMF | 1587 | NM_015537.5 | AR | |
PROK2 | 390 | NM_001126128.2 | AR, Oligo | |
PROKR2 | 1155 | NM_144773.4 | AR, Oligo | |
TAC3 | 366 | NM_013251.4 | AR | |
TACR3 | 1398 | NM_001059.3 | AR | |
WDR11 | 3675 | NM_018117.12 | AD | |
AXL | 1881 | NM_001278599.2 | AD | |
CCDC141 | 4895 | NM_173648.4 | AD | |
CLPP | 834 | NM_006012.4 | AR | |
CUL4B | 2742 | NM_003588.4 | XLR | |
DCAF17 | 1563 | NM_025000.4 | AR | |
DUSP6 | 1146 | NM_001946.4 | AD | |
FGF17 | 651 | NM_003867.4 | AD | |
FLRT3 | 1950 | NM_198391.3 | AD | |
FSHB | 390 | NM_000510.4 | AR | |
GLI2 | 4761 | NM_005270.5 | AD | |
HESX1 | 558 | NM_003865.3 | AD, AR | |
HS6ST1 | 1236 | NM_004807.3 | AD | |
KLB | 3135 | NM_175737.4 | AD | |
LHB | 426 | NM_000894.3 | AR | |
LHX4 | 1173 | NM_033343.4 | AD | |
NR0B1 | 1413 | NM_000475.5 | XL | |
POLR3B | 3402 | NM_018082.6 | AR | |
PROP1 | 681 | NM_006261.5 | AR | |
SEMA3A | 2316 | NM_006080.3 | AD, Oligo | |
SEMA3E | 2328 | NM_012431.3 | Oligo | |
SEMA7A | 1959 | NM_001146029.3 | Ass | |
SOX10 | 1401 | NM_006941.4 | AD | |
SPRY4 | 969 | NM_030964.5 | AD |
Infos zur Erkrankung
Das Kallmann-Syndrom (KS) ist eine seltene genetische Erkrankung, die durch verzögerte oder fehlende Pubertät mit beeinträchtigtem/ fehlenden Geruchssinn definiert ist. Eng verwandt ist der normosmisch-idiopathische hypogonadotrope Hypogonadismus (nIHH). Bei beiden Erkrankungen fehlt das Gonadotropin-Releasing Hormon. KS und nIHH treten in beiden Geschlechtern auf, bei Männern wird die Diagnose häufiger gestellt. Patienten mit KS/nIHH fallen typischerweise in der Adoleszenz aufgrund verzögerter Pubertät auf. Während die reproduktiven Symptome überwiegen, werden auch Gesichtsanomalien (Lippen-/Gaumenspalten), das Fehlen einer Niere, verkürzte Finger, Taubheit, Knochen- und Zahnfehler sowie gestörte Augenbewegungen beobachtet. Alle monogenen Erbgänge werden beobachtet, die Penetranz für den KS-Phänotyp ist für einige Gene wie ANOS1 bzgl. der Kernsymptome praktisch vollständig und hoch für rezessiv vererbte Formen. Die umfangreiche Genpanel-Diagnostik erbringt in bis zu 60% der Betroffenen pathogene Sequenzveränderungen, ein normales DNA-Ergebnis schließt die klinische Diagnose nicht aus.
Referenz: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1334/
- *PROK/-R2 inheritance: https://eje.bioscientifica.com/downloadpdf/journals/eje/178/3/EJE-17-0749.pdf
- Adrenal hypoplasia, congenital (NR0B1)
- Allelic: 46XY sex reversal 2, dosage-sensitive (NR0B1)
- Allelic: Blood group, John-Milton-Hagen system (SEMA7A)
- Allelic: CHARGE syndrome (CHD7)
- Allelic: Encephalocraniocutaneous lipomatosis; Hartsfield syndrome; Jackson-Weiss syndrome (FGFR1)
- Allelic: Luteinizing hormone resistance, female (LHCGR)
- Allelic: Osteoglophonic dysplasia; Pfeiffer syndrome; Trigonocephaly 1 (FGFR1)
- Allelic: Precocious puberty, central, 1 (KISS1R)
- Allelic: Precocious puberty, male (LHCGR)
- CHARGE syndrome (SEMA3E)
- Congenital hypogonadotropic hypogonadism [panelapp] (KLB)
- Culler-Jones syndrome (GLI2)
- Dworschak-Punetha neurodevelopmental syndrome (PLXNA1)
- Growth hormone deficiency with pituitary anomalies (HESX1)
- Holoprosencephaly 9 (GLI2)
- Hypogonadotropic hypogonadism 1 with/-out anosmia; Kallmann syndrome 1 (ANOS1)
- Hypogonadotropic hypogonadism 10 with/-out anosmia (TAC3)
- Hypogonadotropic hypogonadism 11 with/-out anosmia (TACR3)
- Hypogonadotropic hypogonadism 12 with/without anosmia (GNRH1)
- Hypogonadotropic hypogonadism 13 with or without anosmia (KISS1)
- Hypogonadotropic hypogonadism 14 with/-out anosmia (WDR11)
- Hypogonadotropic hypogonadism 15 with/-out anosmia (HS6ST1)
- Hypogonadotropic hypogonadism 16 with/-out anosmia (SEMA3A)
- Hypogonadotropic hypogonadism 17 with/-out anosmia (SPRY4)
- Hypogonadotropic hypogonadism 18 with/-out anosmia (IL17RD)
- Hypogonadotropic hypogonadism 19 with/-out anosmia (DUSP6)
- Hypogonadotropic hypogonadism 2 with/-out anosmia (FGFR1)
- Hypogonadotropic hypogonadism 20 with/-out anosmia (FGF17)
- Hypogonadotropic hypogonadism 21 with anosmia (FLRT3)
- Hypogonadotropic hypogonadism 22, with/-out anosmia (FEZF1)
- Hypogonadotropic hypogonadism 23 with/-out anosmia (LHB)
- Hypogonadotropic hypogonadism 24 without anosmia (FSHB)
- Hypogonadotropic hypogonadism 3 with/without anosmia (PROKR2)*
- Hypogonadotropic hypogonadism 4 with/without anosmia (PROK2)*
- Hypogonadotropic hypogonadism 5 with/-out anosmia (CHD7)
- Hypogonadotropic hypogonadism 6 with/without anosmia (FGF8)
- Hypogonadotropic hypogonadism 7 without anosmia (GNRHR)
- Hypogonadotropic hypogonadism 8 with/-out anosmia (KISS1R)
- Hypogonadotropic hypogonadism 9 with/-out anosmia (NSMF)
- Hypogonadotropic hypogonadism without anosmia; normosmic IHH [panelapp] (CCDC141)
- Leukodystrophy, hypomyelinating, 8, +/- oligodontia and/or hypogonadotropic hypogonadism (POLR3B)
- Leydig cell hypoplasia with hypergonadotropic hypogonadism (LHCGR)
- Leydig cell hypoplasia with pseudohermaphroditism (LHHCGR)
- Mental retardation, XL, syndromic 15, Cabezas type (CUL4B)
- Normosmic idiopathic hypogionadotrophic Hypogonadism [panelapp] (CCDC141)
- PCWH syndrome (SOX10)
- Perrault syndrome 3 (CLPP)
- Pituitary hormone deficiency, combined, 2 (PROP1)
- Pituitary hormone deficiency, combined, 3 (LHX3)
- Pituitary hormone deficiency, combined, 4 (LHX4)
- Pituitary hormone deficiency, combined, 5 (HESX1)
- Septooptic dysplasia (HESX1)
- Waardenburg syndrome, type 2E, with/-out neurologic involvement (SOX10)
- Waardenburg syndrome, type 4C (SOX10)
- Woodhouse-Sakati syndrome (DCAF17)
- AD
- AR
- Ass
- Oligo
- XL
- XLR
- Multiple OMIM-Ps
Bioinformatik und klinische Interpretation
Test-Stärken
- DAkkS-akkreditiertes Labor
- EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
- Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
- Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
- Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
- eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
- unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
- unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
- unsere umfassenden klinischen Aussagen
Testeinschränkungen
- Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
- Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
- es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
- die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
- Gen-Konversionen
- komplexe Inversionen
- Balancierte Translokationen
- Mitochondriale Varianten
- Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
- nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
- niedriger Mosaik-Status
- Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
- Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
- Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
- Varianten innerhalb von Pseudogenen
- die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde
Laboranforderung
Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.
Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.
Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.
Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.