Klinische FragestellungKleinwuchs im Kindesalter, Differentialdiagnose
Zusammenfassung
Umfassendes differentialdiagnostisches panel für Kleinwuchs im Kindesalter mit 12 bzw. 70 kuratierten Genen gemäß klinischer Verdachtsdiagnose
210,6 kb (Erweitertes Panel: inkl. additional genes)
- EDTA-Blut (3-5 ml)
NGS +
Genpanel
Ausgewählte Gene
Name | Exon-Länge (bp) | OMIM-G | Referenz-Seq. | Erbgang |
---|---|---|---|---|
ACAN | 7593 | NM_013227.4 | AD, AR | |
CDKN1C | 951 | NM_000076.2 | AD | |
FGFR3 | 2421 | NM_000142.5 | AD | |
GH1 | 654 | NM_000515.5 | AD, AR | |
GHR | 1917 | NM_000163.5 | AR, AD | |
GHRHR | 1272 | NM_000823.4 | AR | |
IGF1 | 462 | NM_000618.5 | AR | |
IGF2 | 543 | NM_000612.6 | AD | |
IGFALS | 1818 | NM_004970.3 | AR | |
PTPN11 | 1782 | NM_002834.5 | AD | |
SHOX | 879 | NM_000451.4, NM_006883.2 | PD/PR | |
SOS1 | 4002 | NM_005633.4 | AD | |
ANKRD11 | 7992 | NM_013275.6 | AD | |
ATR | 7935 | NM_001184.4 | AR | |
BLM | 4254 | NM_000057.4 | AR | |
BRAF | 2301 | NM_004333.6 | AD | |
BRIP1 | 3750 | NM_032043.3 | AR | |
CBL | 2721 | NM_005188.4 | AD | |
CCDC8 | 1617 | NM_032040.5 | AR | |
CEP57 | 1476 | NM_001243776.2 | AR | |
COL1A1 | 4395 | NM_000088.4 | AD | |
COL1A2 | 4101 | NM_000089.4 | AD | |
COL2A1 | 4464 | NM_001844.5 | AD | |
COL9A1 | 2766 | NM_001851.6 | AD, AR | |
CRIPT | 306 | NM_014171.6 | AR | |
CUL7 | 5097 | NM_014780.5 | AR | |
ERCC4 | 2751 | NM_005236.3 | AR | |
ERCC6 | 4482 | NM_000124.4 | AR | |
ERCC8 | 1191 | NM_000082.4 | AR | |
FANCA | 4368 | NM_000135.4 | AR | |
FANCB | 2580 | NM_001018113.3 | XL | |
FANCC | 1677 | NM_000136.3 | AR | |
FANCE | 1611 | NM_021922.3 | AR | |
FANCF | 1125 | NM_022725.4 | AR | |
FANCG | 1869 | NM_004629.2 | AR | |
FANCI | 3987 | NM_001113378.2 | AR | |
FANCL | 1128 | NM_018062.4 | AR | |
FBN1 | 8616 | NM_000138.5 | AD | |
FGD1 | 2886 | NM_004463.3 | XLR | |
HMGA2 | 330 | NM_003483.6 | AD | |
HRAS | 570 | NM_005343.4 | AD | |
HSPG2 | 13176 | NM_005529.7 | AR | |
IGF1R | 4104 | NM_000875.5 | AD, AR | |
KRAS | 567 | NM_004985.5 | AD | |
LARP7 | 1770 | NM_001267039.2 | AR | |
LZTR1 | 2523 | NM_006767.4 | AD, AR | |
MAP2K1 | 1182 | NM_002755.4 | AD | |
MAP2K2 | 1203 | NM_030662.4 | AD | |
NBN | 2265 | NM_002485.5 | AR | |
NF1 | 8457 | NM_001042492.3 | AD | |
NIN | 4134 | NM_016350.5 | AR | |
NPR2 | 3144 | NM_003995.4 | AD, AR | |
NRAS | 570 | NM_002524.5 | AD | |
OBSL1 | 5691 | NM_015311.3 | AR | |
PALB2 | 3561 | NM_024675.4 | AR | |
PIK3R1 | 2175 | NM_181523.3 | AD | |
PLAG1 | 1503 | NM_002655.3 | Gen Fusion | |
PTH1R | 1782 | NM_000316.3 | AD, AR | |
RAF1 | 1947 | NM_002880.4 | AD | |
RASA2 | 2550 | NM_006506.5 | AD | |
RIT1 | 660 | NM_006912.6 | AD | |
SHOC2 | 1749 | NM_007373.4 | AD | |
SLX4 | 5505 | NM_032444.4 | AR | |
SOS2 | 3999 | NM_006939.4 | AD | |
SRCAP | 9693 | NM_006662.3 | AD | |
STAT5B | 2364 | NM_012448.4 | AR, AD | |
TOP3A | 3006 | NM_004618.5 | AR | |
TRIM37 | 2895 | NM_015294.6 | AR | |
UBE2T | 594 | NM_014176.4 | AR | |
WNT5A | 1143 | NM_003392.7 | AD |
Infos zur Erkrankung
Die Körpergröße des Menschen ist ein ausgesprochen polygenes Merkmal mit ~80%iger Erblichkeit. Mehr als 700 häufige genetische Varianten erklären 20% der Größenvariation in der Normalbevölkerung. Kleinwuchs ist definiert als Körpergröße, die 2 Standardabweichungen oder mehr unter der mittleren Körpergröße für Kinder dieses Geschlechts und chronologischen Alters in einer gegebenen Population liegt. Dies entspricht einer Körpergröße, die unter der 2,3-Perzentile liegt. Kleinwuchs wird vor allem im Kleinkindalter auffällig, da hier normalerweise größere Wachstumsschübe ablaufen. Das Ursachen-Spektrum ist außerordentlich heterogen. Zu den endogenen Auslösern zählen genetisch bedingte endokrine Störungen, Chromosomenanomalien, Stoffwechselerkrankungen sowie syndromaler Kleinwuchs. Weitere Ursachen für Kleinwuchs sind familiäre und konstitutionelle Verzögerung von Wachstum und Pubertät. Fast jede schwere Systemerkrankung kann zu reduziertem Wachstum als sekundärer Auswirkung führen. Monogen bedingter Kleinwuchs kann allen klassischen Erbschemata folgen. Weiterhin sind eine Vielzahl von genetischen Syndromen und angeborenen Fehlbildungen mit Kleinwuchs assoziiert. Systematische Phänotypisierung und umfangreiche genetische Tests ermöglichen in >30% der Fälle, die Entstehung des Kleinwuchses zu eruieren. Aber ein unauffälliger genetischer Befund bedeutet keinen sicheren Ausschluss der genetischen Beteiligung.
Referenzen: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1215/
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/28476223/
- Alias: Short stature, infantile
- Allelic: Beckwith-Wiedemann syndrome (CDKN1C)
- Allelic: Bladder cancer, somatic (FGFR3)
- Allelic: Breast cancer, susceptibility to (RAD51)
- Allelic: CATSHL syndrome (FGFR3)
- Allelic: Cervical cancer, somatic (FGFR3)
- Allelic: Colorectal cancer, somatic (FGFR3)
- Allelic: Crouzon syndrome with acanthosis nigricans (FGFR3)
- Allelic: Fibromatosis, gingival, 1 (SOS1)
- Allelic: Hydatidiform mole, recurrent, 1 (NLRP7)
- Allelic: Hypercholesterolemia, familial, modifier of (GHR)
- Allelic: Increased responsiveness to growth hormone (GHR)
- Allelic: LADD syndrome (FGFR3)
- Allelic: Leri-Weill dyschondrosteosis (SHOX)
- Allelic: Leukemia, juvenile myelomonocytic (NF1)
- Allelic: Leukemia, juvenile myelomonocytic, somatic (PTPN11)
- Allelic: Metachondromatosis (PTPN11)
- Allelic: Mirror movements 2 (RAD51)
- Allelic: Muenke syndrome (FGFR3)
- Allelic: Multi Locus Imprinting Disturbance (PADI6)
- Allelic: Neurofibromatosis, familial spinal (NF1)
- Allelic: Neurofibromatosis, type 1 (NF1)
- Allelic: Nevus, epidermal, somatic (FGFR3)
- Allelic: Oocyte/zygote/embryo maturation arrest 16 (PADI6)
- Allelic: Oocyte/zygote/embryo maturation arrest 18 (NLRP2)
- Allelic: Preimplantation embryonic lethality 2 [MONDO:0014978, panelapp] (PADI6)
- Allelic: SADDAN (FGFR3)
- Allelic: Spermatocytic seminoma, somatic (FGFR3)
- Allelic: Thanatophoric dysplasia, type I-II (FGFR3)
- Allelic: Watson syndrome (NF1)
- 3-M syndrome 1 (CUL7)
- 3-M syndrome 2 (OBSL1)
- 3-M syndrome 3 (CCDC8)
- Aarskog-Scott syndrome (FGD1)
- Achondroplasia (FGFR3)
- Acid-labile subunit, deficiency of (IGFALS)
- Acromesomelic dysplasia, Maroteaux type (NPR2)
- Allelic: Infantile liver failure syndrome 2 (NBAS)
- Allelic: Ovarian carcinoma (RRAS2)
- Bloom syndrome (BLM)
- Cardiofaciocutaneous syndrome (BRAF)
- Cardiofaciocutaneous syndrome 2 (KRAS)
- Cardiofaciocutaneous syndrome 3 (MAP3K1)
- Cardiofaciocutaneous syndrome 4 (MAP2K2)
- Cerebrooculofacioskeletal syndrome 1 (ERCC6)
- Cockayne syndrome (ERCC4)
- Cockayne syndrome, type A (ERCC8)
- Cockayne syndrome, type B (ERCC6)
- Coffin-Lowry syndrome (RPS6KA3)
- Cornelia de Lange syndrome 1 (NIPBL)
- Cornelia de Lange syndrome 2 (SMC1A)
- Cornelia de Lange syndrome 3 (SMC3)
- Cornelia de Lange syndrome 4 (RAD21)
- Cornelia de Lange syndrome 5 (HDAC8)
- Costello syndrome (HRAS)
- Crouzon syndrome with acanthosis nigricans (FGFR3)
- Culler-Jones syndrome (GLI2)
- De Sanctis-Cacchione syndrome (ERCC6)
- Diabetes mellitus, transient neonatal 1 (ZFP57)
- Diabetes mellitus, transient neonatal, 1; IUGR [MONDO:0011073] (ZFP57)
- Diets-Jongmans syndrome (KDM3B)
- Encephalopathy, progressive, with amyotrophy + optic atrophy (TBCE)
- Epiphyseal chondrodysplasia, Miura type (NPR2)
- Epiphyseal dysplasia, multiple, 6 (COL9A1)
- FINCA syndrome: FIbrosis, Neurodegeneration +Cerebral Angiomatosis (NHLRC2)
- Failure to thrive, developmental delay [panelapp] (CCDC186)
- Fanconi anemia, complementation group A-L (FANCA-L)
- Fanconi anemia, complementation group D1 (BRCA2)
- Fanconi anemia, complementation group J (BRIP1)
- Fanconi anemia, complementation group N (PALB2)
- Fanconi anemia, complementation group P (SLX4)
- Fanconi anemia, complementation group Q (ERCC4)
- Fanconi anemia, complementation group R (RAD51)
- Fanconi anemia, complementation group T (UBE2T)
- Floating-Harbor syndrome (SRCAP)
- Growth hormone deficiency with pituitary anomalies (HESX1)
- Growth hormone deficiency, isolated, type IA, IB, II (GH1)
- Growth hormone deficiency, isolated, type IV (GHRHR)
- Growth hormone insensitivity, partial (GHR)
- Growth retardation with deafness and mental retardation due to IGF1 deficiency (IGF1)
- Holoprosencephaly 9 (GLI2)
- Hypochondroplasia (FGFR3)
- Hypoparathyroidism-retardation-dysmorphism syndrome (TBCE)
- IMAGE syndrome (CDKN1C)
- IUGR phenotypes caused by maternal effect gene IUGR [panelapp] (NLRP2)
- Insulin-like growth factor I, resistance to (IGF1R)
- Intellectual developmental disorder, AD 23 (SETD5)
- Intellectual developmental disorder, XL 19 (RPS6KA3)
- Intellectual developmental disorder, XL, syndromic, 35 (RPL10)
- Intellectual developmental disorder, XL, with isolated growth hormone deficiency (SOX3)
- Isolated growth hormone deficiency due to defect in GHRF (GHRH) 1
- Isolated growth hormone deficiency, type III, with agammaglobulinemia (BTK)
- KBG syndrome (ANKRD11)
- Kabuki syndrome 1 (KMT2D)
- Kabuki syndrome 2 (KDM6A)
- Kenny-Caffey syndrome, type (TBCE)
- Kowarski syndrome (GH1)
- LEOPARD syndrome 1 (PTPN11)
- LEOPARD syndrome 2 (RAF1)
- LEOPARD syndrome 3 (BRAF)
- LIG4 syndrome (LIG4)
- Langer mesomelic dysplasia (SHOX)
- Laron dwarfism (GHR)
- Laurence-Moon syndrome (PNPLA6)
- Leprechaunism (INSR)
- Leri-Weill dyschondrosteosis (SHOX)
- Lowry-Wood syndrome (RNU4ATAC)
- MIRAGE syndrome (SAMD9)
- Mandibuloacral dysplasia progeroid syndrome (MTX2)
- Meier-Gorlin syndrome 1 (ORC1)
- Meier-Gorlin syndrome 2 (ORC4)
- Meier-Gorlin syndrome 3 (ORC6)
- Meier-Gorlin syndrome 4 (CDT1)
- Meier-Gorlin syndrome 5 (CDC6)
- Mental retardation, XL syndromic 16 (FGD1)
- Metachondromatosis (PTPN11)
- Microcephalic osteodysplastic dysplasia, Saul-Wilson type [MONDO:0019407, panelapp] (ANAPC1)
- Microcephalic osteodysplastic primordial dwarfism, type I (RNU4ATAC)
- Microcephalic osteodysplastic primordial dwarfism, type II (PCNT)
- Microcephaly and chorioretinopathy, AR, 2 (PLK4)
- Microcephaly, growth restriction + increased sister chromatid exchange 2 (TOP3A)
- Microphthalmia, syndromic 3 (SOX2)
- Mulibrey nanism (TRIM37)
- Muscular dystrophy, congenital hearing loss, ovarian insufficiency syndrome (GGPS1)
- Myopathy, mitochondrial + ataxia (MSTO1)
- Neurodevelopmental disorder with microcephaly, seizures, neonatal cholestasis (VPS50)
- Neurodevelopmental disorder, cataracts, poor growth, dysmorphic facies (INTS1)
- Neurodevelopmental disorder, multiple congenital abnormalities (FOXP4)
- Neurodevelopmental disorder, poor growth, large ears, dysmorphic face (ZNF668)
- Neurofibromatosis-Noonan syndrome (NF1)
- Nijmegen breakage syndrome (NBN)
- Noonan syndrome 1 (PTPN11)
- Noonan syndrome 10 (LZTR1)
- Noonan syndrome 11 (MRAS)
- Noonan syndrome 12 (RRAS2)
- Noonan syndrome 13 (MAPK1)
- Noonan syndrome 14 (SPRED2)
- Noonan syndrome 2 (LZTR1)
- Noonan syndrome 3 (KRAS)
- Noonan syndrome 4 (SOS1)
- Noonan syndrome 5 (RAF1)
- Noonan syndrome 6 (NRAS)
- Noonan syndrome 7 (BRAF)
- Noonan syndrome 8 (RIT1)
- Noonan syndrome 9 (SOS2)
- Noonan syndrome [panelapp] (RASA2)
- Noonan syndrome-like disorder +/- juvenile myelomonocytic leukemia (CBL)
- Noonan syndrome-like disorder with loose anagen hair 2 (PPP1CB)
- Noonan syndrome-like with loose anagen hair 1 (SHOC2)
- Pituitary hormone deficiency, combined or isolated, 7 (RNPC3)
- Progressive external ophthalmoplegia with mitochondrial DNA deletions, AR 5 (TOP3A)
- Rabson-Mendenhall syndrome (INSR)
- Robinow syndrome, AD 1 (WNT5A)
- Rothmund-Thomson syndrome, type 1 (ANAPC1)
- SADDAN (FGFR3)
- SHORT syndrome (PIK3R1)
- Short stature with microcephaly and distinctive facies (CRIPT)
- Short stature with nonspecific skeletal abnormalities (NPR2)
- Short stature, IUGR [panelapp] (PADI6)
- Short stature, IUGR, failure to thrive, body asymmetry [panelapp] (NLRP5)
- Short stature, IUGR, fetal wastage [panelapp] (NLRP7)
- Short stature, advanced bone age, early-onset osteoarthritis and/or osteochondritis dissecans (ACAN)
- Short stature, idiopathic familial (SHOX)
- Short stature, optic nerve atrophy +Pelger-Huet anomaly (NBAS)
- Silver-Russell syndrome 3 (IGF2)
- Silver-Russell syndrome 4 (PLAG1)
- Silver-Russell syndrome 5 (HMGA2)
- Spondyloepimetaphyseal dysplasia, aggrecan type (ACAN)
- Spondyloepiphyseal dysplasia, Kimberley type (ACAN)
- Stickler syndrome, type IV (COL9A1)
- Syndromic ID, short stature [panelapp] (RAP1B)
- Thanatophoric dysplasia, type I + II (FGFR3)
- XFE progeroid syndrome (ERCC4)
- AD
- AR
- Gen Fusion
- PD/PR
- XL
- XLR
- Multiple OMIM-Ps
Bioinformatik und klinische Interpretation
Test-Stärken
- DAkkS-akkreditiertes Labor
- EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
- Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
- Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
- Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
- eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
- unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
- unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
- unsere umfassenden klinischen Aussagen
Testeinschränkungen
- Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
- Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
- es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
- die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
- Gen-Konversionen
- komplexe Inversionen
- Balancierte Translokationen
- Mitochondriale Varianten
- Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
- nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
- niedriger Mosaik-Status
- Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
- Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
- Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
- Varianten innerhalb von Pseudogenen
- die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde
Laboranforderung
Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.
Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.
Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.
Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.