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Klinische FragestellungKolorektale Karzinome, erbliche; Differentialdiagnose

Zusammenfassung

Kurzinformation

Umfassendes differentialdiagnostisches panel für Erbliche kolorektale Karzinome mit 11 Leitlinien-kuratierten Genen sowie weiteren 3 Leitlinien-erwähnten "core candidate"-Genen bzw. insgesamt 23 kuratierten Genen gemäß klinischer Verdachtsdiagnose

ID
KP1729
Anzahl Gene
23 Akkreditierte Untersuchung
Untersuchte Sequenzlänge
39,8 kb (Core-/Core-canditate-Gene)
63,3 kb (Erweitertes Panel: inkl. additional genes)
Analyse-Dauer
auf Anfrage
Untersuchungsmaterial
  • EDTA-Blut (3-5 ml)
Diagnostische Hinweise

NGS +

[Sanger]

 

Genpanel

Ausgewählte Gene

NameExon-Länge (bp)OMIM-GReferenz-Seq.Erbgang
APC8532NM_000038.6AD
BMPR1A1599NM_004329.3AD
EPCAM945NM_002354.3AD
MLH12271NM_000249.4AD
MSH22805NM_000251.3AD
MSH64083NM_000179.3AD
MUTYH1650NM_001128425.2AR
NTHL1915NM_002528.7AR
PMS22589NM_000535.7AD
POLD13324NM_002691.4AD
POLE6861NM_006231.4AD
PTEN1212NM_000314.8AD
SMAD41659NM_005359.6AD
STK111302NM_000455.5AD
AXIN22532NM_004655.4AD
CDH12649NM_004360.5AD
CHEK21632NM_007194.4AD
GREM1555NM_013372.7AD
MLH34362NM_001040108.2AD
MSH33414NM_002439.5AR
RNF435500NM_017763.6AD
TGFBR21704NM_003242.6AD
TP531182NM_000546.6AD

Infos zur Erkrankung

Klinischer Kommentar

Das kolorektale Karzinom (CRC) ist als Volkskrankheit der 3.-häufigste Krebs bei Männern und der 2.-häufigste bei Frauen. Das hereditäre CRC hat zwei gut bekannte Formen: [A] Polyposis einschließlich der familiären adenomatösen Polyposis (FAP) und der abgeschwächten FAP, verursacht durch pathogene Varianten im APC-Gen, MUTYH-assoziierte Polyposis, verursacht durch pathogene Varianten im MUTYH-Gen; [B] Lynch-Syndrom - oft als hereditäres nicht polypöses CRC bezeichnet - verursacht durch pathogene Keimbahnvarianten in den DNA-"Mismatch-Reparatur"-Genen (MLH1-, MSH2-, MSH6-, PMS2-Gene) und EPCAM-Gen. Weitere CRC-Syndrome und deren assoziierte Gene sind Oligopolyposis (POLE-, POLD1-Gene), NTHL1, juveniles Polyposis-Syndrom (BMPR1A-, SMAD4-Gene), Cowden (PTEN-Gen) und Peutz-Jeghers Syndrom (STK11-Gen). Viele der aufgeführten Syndrome sind auch mit extra-kolonischen Karzinomen und anderen Manifestationen assoziiert. Das Serratierte-Polyposis-Syndrom ist durch hyperplastische Polypen gekennzeichnet. Zumindest in einigen Fällen hat es auch familiäre Komponenten. Ungefähr ein Viertel der CRC- und/oder Adenom-Fälle scheint familiär bedingt zu sein, aber nur ein Teil davon basierend auf einem identifizierbaren erblichen Syndrom. Die meisten Personen mit CRC, die vor dem 50. Lebensjahr diagnostiziert werden und keine familiäre Krebsvorgeschichte haben, weisen keine pathogenen Varianten auf, die mit einem erblichen Krebssyndrom assoziiert sind. Die DNA-diagnostische Ausbeute wird mit bis über 90% angegeben. Dennoch stellt ein negatives molekulargenetisches Ergebnis keinen absolut sicheren Ausschluss der klinischen Diagnose dar.

Referenzen: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1211/

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1345/

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1469/

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1266/

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1488/

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK107219/

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK555473/

 

Synonyme
  • Alias: Colon-Ca
  • Alias: Darmkrebs
  • Alias: Kolorektalkarzinom
  • Alias: Rektum-Ca
  • Allelic: Adenoma, periampullary, somatic (APC)
  • Allelic: Adrenocortical carcinoma, pediatric (TP53)
  • Allelic: Aplastic anemia (NBN)
  • Allelic: Basal cell carcinoma 7 (TP53)
  • Allelic: Birt-Hogg-Dube syndrome (FLCN)
  • Allelic: Blepharocheilodontic syndrome 1 (CDH1)
  • Allelic: Bone marrow failure syndrome 5 (TP53)
  • Allelic: Brain tumor-polyposis syndrome 2 (APC)
  • Allelic: Breast cancer, lobular (CDH1)
  • Allelic: Breast cancer, somatic (TP53)
  • Allelic: Breast cancer, susceptibility to (CHEK2)
  • Allelic: Choroid plexus papilloma (TP53)
  • Allelic: Desmoid disease, hereditary (APC)
  • Allelic: Diarrhea 5, with tufting enteropathy, congenital (EPCAM)
  • Allelic: Endometrial cancer, familial (MSH6)
  • Allelic: Endometrial carcinoma, somatic (CDH1)
  • Allelic: Endometrial carcinoma, somatic (MSH3)
  • Allelic: Esophageal cancer, somatic (TGFBR2)
  • Allelic: FILS syndrome (POLE)
  • Allelic: Gastric cancer, hereditary diffuse, with/-out cleft lip and/or palate (CDH1)
  • Allelic: Gastric cancer, somatic (APC)
  • Allelic: Gastric cancer, somatic (MUTYH)
  • Allelic: Glioma susceptibility 1 (TP53)
  • Allelic: Hepatoblastoma, somatic (APC)
  • Allelic: Hepatocellular carcinoma, somatic (TP53)
  • Allelic: IMAGE-I syndrome (POLE)
  • Allelic: Juvenile polyposis/hereditary hemorrhagic telangiectasia syndrome (SMAD4)
  • Allelic: Leukemia, acute lymphoblastic (NBN)
  • Allelic: Li-Fraumeni syndrome (CHEK2)
  • Allelic: Li-Fraumeni syndrome (TP53)
  • Allelic: Loeys-Dietz syndrome 2 (TGFBR2)
  • Allelic: Mandibular hypoplasia, deafness, progeroid features, and lipodystrophy syndrome (POLD1)
  • Allelic: Melanoma, malignant, somatic (STK11)
  • Allelic: Mismatch repair cancer syndrome (MLH1, MSH2, MSH6, PMS2)
  • Allelic: Muir-Torre syndrome (MLH1, MSH2)
  • Allelic: Myhre syndrome (SMAD4)
  • Allelic: Nasopharyngeal carcinoma, somatic (TP53)
  • Allelic: Nijmegen breakage syndrome (NBN)
  • Allelic: Oligodontia-colorectal cancer syndrome (AXIN2)
  • Allelic: Osteosarcoma (TP53)
  • Allelic: Osteosarcoma, somatic (CHEK2)
  • Allelic: Ovarian cancer, somatic (CDH1)
  • Allelic: Pancreatic cancer, somatic (SMAD4)
  • Allelic: Pancreatic cancer, somatic (STK11)
  • Allelic: Pancreatic cancer, somatic (TP53)
  • Allelic: Pneumothorax, primary spontaneous (FLCN)
  • Allelic: Prostate cancer, familial, susceptibility to (CHEK2)
  • Allelic: Prostate cancer, susceptibility to (CDH1)
  • Allelic: Renal carcinoma, chromophobe, somatic (FLCN)
  • Allelic: Testicular tumor, somatic (STK11)
  • Adenomas, multiple colorectal (MUTYH)
  • Adenomatous polyposis coli (APC)
  • Breast and colorectal cancer, susceptibility to (CHEK2)
  • Colorectal cancer (TP53)
  • Colorectal cancer, hereditary nonpolyposis, type 1 (MSH2)
  • Colorectal cancer, hereditary nonpolyposis, type 2 (MLH1)
  • Colorectal cancer, hereditary nonpolyposis, type 4 (PMS2)
  • Colorectal cancer, hereditary nonpolyposis, type 5 (MSH6)
  • Colorectal cancer, hereditary nonpolyposis, type 6 (TGFBR2)
  • Colorectal cancer, hereditary nonpolyposis, type 7 (MLH3)
  • Colorectal cancer, hereditary nonpolyposis, type 8 (EPCAM)
  • Colorectal cancer, somatic (APC)
  • Colorectal cancer, somatic (AXIN2)
  • Colorectal cancer, somatic (FLCN)
  • Colorectal cancer, susceptibility to, 1 (GALNT12)
  • Colorectal cancer, susceptibility to, 10 (POLD1)
  • Colorectal cancer, susceptibility to, 12 (POLE)
  • Colorectal cancer, susceptibility to, 3 (SMAD7)
  • Cowden syndrome 1 (PTEN)
  • Diamond Blackfan anaemia (RPS20)
  • Familial adenomatous polyposis 1 (APC)
  • Familial adenomatous polyposis 2 (MUTYH)
  • Familial adenomatous polyposis 3 (NTHL1)
  • Familial adenomatous polyposis 4 (MSH3)
  • Gardner syndrome (APC)
  • Juvenile polyposis syndrome, infantile form (BMPR1A)
  • Lhermitte-Duclos syndrome (PTEN)
  • Peutz-Jeghers syndrome (STK11)
  • Polyposis syndrome, hereditary mixed, 2 (BMPR1A)
  • Polyposis, juvenile intestinal (BMPR1A)
  • Polyposis, juvenile intestinal (SMAD4)
Erbgänge, Vererbungsmuster etc.
  • AD
  • AR
OMIM-Ps
  • Multiple OMIM-Ps
ICD10 Code

Bioinformatik und klinische Interpretation

Test-Stärken

  • DAkkS-akkreditiertes Labor
  • EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
  • Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
  • Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
  • Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
  • eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
  • unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
  • unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
  • unsere umfassenden klinischen Aussagen

Testeinschränkungen

  • Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
  • Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
  • es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
  • die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
  • Gen-Konversionen
  • komplexe Inversionen
  • Balancierte Translokationen
  • Mitochondriale Varianten
  • Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
  • nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
  • niedriger Mosaik-Status
  • Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
  • Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
  • Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
  • Varianten innerhalb von Pseudogenen
  • die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde

Laboranforderung

  • Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.

  • Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.

  • Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.

  • Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.