Klinische FragestellungLafora-Syndrom, Differentialdiagnose
Zusammenfassung
Umfassendes differentialdiagnostisches panel für Lafora-Syndrom mit 2 Leitlinien-kuratierten "core"-Genen und 7 bzw. insgesamt 31 kuratierten Genen gemäß klinischer Verdachtsdiagnose
52,5 kb (Erweitertes Panel: inkl. additional genes)
- EDTA-Blut (3-5 ml)
NGS + X
Genpanel
Ausgewählte Gene
Name | Exon-Länge (bp) | OMIM-G | Referenz-Seq. | Erbgang |
---|---|---|---|---|
EFHC1 | 1923 | NM_018100.4 | AD | |
EPM2A | 996 | NM_005670.4 | AR | |
GOSR2 | 639 | NM_004287.5 | AD | |
KCNC1 | 1758 | NM_001112741.2 | AD | |
KCTD7 | 870 | NM_153033.5 | AR | |
NHLRC1 | 1188 | NM_198586.3 | AR | |
PRICKLE1 | 2496 | NM_153026.3 | AR | |
SCARB2 | 1437 | NM_005506.4 | AR | |
ADRA2B | 1344 | NM_000682.7 | AR | |
ASAH1 | 1188 | NM_177924.5 | AR | |
CLCN2 | 2697 | NM_004366.6 | AR | |
CNTN2 | 3123 | NM_005076.5 | AR | |
CSNK2B | 665 | NM_001320.7 | AD | |
CUX2 | 4461 | NM_015267.4 | AD | |
D2HGDH | 1566 | NM_152783.5 | AR | |
GABRA1 | 1371 | NM_000806.5 | AD | |
GABRD | 1359 | NM_000815.5 | AD | |
GRIA2 | 2652 | NM_001083619.3 | AD | |
HEXB | 1671 | NM_000521.4 | AR | |
LMNB2 | 1863 | NM_032737.4 | AR | |
NEU1 | 1248 | NM_000434.4 | AR | |
PIGU | 1426 | NM_080476.5 | AR | |
PLA2G6 | 2421 | NM_003560.4 | AR | |
SEMA6B | 2701 | NM_032108.4 | AD | |
SETD1B | 5917 | NM_001353345.2 | AD | |
SLC6A1 | 1800 | NM_003042.4 | AD | |
TBC1D24 | 1680 | NM_001199107.2 | AR |
Infos zur Erkrankung
Schwere, progressive myoklonische Epilepsie, gekennzeichnet durch Myoklonus und/oder generalisierte Anfälle, visuelle Halluzinationen (partielle okzipitale Anfälle), progressiven neurologischen Rückgang
Leitlinie: "Zwar haben die neuesten molekulargenetischen Befunde beigetragen, die Ursachen dieser häufigen idiopathischen Epilepsien etwas besser zu verstehen, doch ist eine routinemäßige genetische Diagnostik derzeit noch nicht sinnvoll." GRIN2A, KCNT1, KCNQ2, KCNQ3, SCN1A Gene explizit erwähnt.
- Alias: Lafora-Body-Epilepsie
- Alias: Myoclonic epilepsy of Lafora
- Alias: Progressive myoclonic epilepsy-2
- Alias: Progressive myoclonus epilepsy
- Allelic: DOORS syndrome (TBC1D24)
- Allelic: Deafness, AR 86 (TBC1D24); AD 65 (TBC1D24)
- Allelic: Hyperaldosteronism, familial, type II (CLCN2)
- Allelic: Infantile neuroaxonal dystrophy (PLA2G6)
- Allelic: Leukoencephalopathy with ataxia (CLCN2)
- Allelic: Lipodystrophy, partial, acquired, susceptibility to (LMNB2)
- Allelic: Parkinson disease 14, AR (PLA2G6)
- Allelic: Spinal muscular atrophy with progressive myoclonic epilepsy (ASAH1)
- D-2-hydroxyglutaric aciduria (D2HGDH)
- Epilepsy, generalized, with febrile seizures plus, type 5, susceptibility to (GABRD)
- Epilepsy, generalized, with febrile seizures plus, type 5, susceptibility to (GRIA2)
- Epilepsy, idiopathic generalized, 10 (GABRD)
- Epilepsy, idiopathic generalized, susceptibility to, 11 (CLCN2)
- Epilepsy, juvenile absence, susceptibility to, 1 (EFHC1)
- Epilepsy, juvenile absence, susceptibility to, 2 (CLCN2)
- Epilepsy, juvenile myoclonic, susceptibility to (GABRD)
- Epilepsy, juvenile myoclonic, susceptibility to, 8 (CLCN2)
- Epilepsy, myoclonic, familial adult, 5 (CNTN2)
- Epilepsy, progressive myoclonic 10 (PRDM8)
- Epilepsy, progressive myoclonic 11 (SEMA6B)
- Epilepsy, progressive myoclonic 12 (SLC7A6OS)
- Epilepsy, progressive myoclonic 1B (PRICKLE1)
- Epilepsy, progressive myoclonic 3 with/-out intracellular inclusions (KCTD7)
- Epilepsy, progressive myoclonic 4 with/-out renal failure (SCARB2)
- Epilepsy, progressive myoclonic 6 (GOSR2)
- Epilepsy, progressive myoclonic 7 (KCNC1)
- Epilepsy, progressive myoclonic 8 (CERS1)
- Epilepsy, progressive myoclonic 9 (LMNB2)
- Epilepsy, progressive myoclonic [Lafora] 2A (EPM2A), 2B (NHLRC1)
- Epilepsy, progressive myoclonic [Unverricht-Lundborg] 1A (CSTB, CSTB_CCCCGCCCCGCG)
- Epilepsy, rolandic, with proxysmal exercise-induce dystonia + writer's cramp (TBC1D24)
- Epileptic encephalopathy, early infantile, 16 (TBC1D24)
- Epileptic encephalopathy, early infantile, 19 (GABRA1)
- Epileptic encephalopathy, early infantile, 67 (CUX2)
- Intellectual developmental disorder with seizures + language delay (SETD1B)
- Myoclonic epilepsy, infantile, familial (TBC1D24)
- Myoclonic epilepsy, juvenile, susceptibility to, 1 (EFHC1)
- Myoclonic-atonic epilepsy (SLC6A1)
- Myoclonus Epilepsie Unverricht-Lundborg (CSTB repeat expansions, rarely other mutations)
- Neurodegeneration with brain iron accumulation 2B (PLA2G6)
- Neurodevelopmental disorder with brain anomalies, seizures + scoliosis (PIGU)
- Poirier-Bienvenu neurodevelopmental syndrome (CSNK2B)
- Sandhoff disease, infantile, juvenile + adult forms (HEXB)
- Sialidosis, type I-II (NEU1)
- AD
- AR
- Multiple OMIM-Ps
Bioinformatik und klinische Interpretation
Test-Stärken
- DAkkS-akkreditiertes Labor
- EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
- Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
- Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
- Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
- eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
- unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
- unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
- unsere umfassenden klinischen Aussagen
Testeinschränkungen
- Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
- Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
- es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
- die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
- Gen-Konversionen
- komplexe Inversionen
- Balancierte Translokationen
- Mitochondriale Varianten
- Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
- nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
- niedriger Mosaik-Status
- Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
- Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
- Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
- Varianten innerhalb von Pseudogenen
- die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde
Laboranforderung
Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.
Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.
Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.
Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.