Klinische FragestellungLipodystrophie, familiäre; Differentialdiagnose
Zusammenfassung
Umfassendes differentialdiagnostisches panel für Lipodystrophie, familiäre, mit 15 Leitlinien-kuratierten Genen bzw. zusammen genommen 26 kuratierten Genen gemäß klinischer Verdachtsdiagnose
57,7 kb (Erweitertes Panel: inkl. additional genes)
- EDTA-Blut (3-5 ml)
NGS +
[Sanger]
Genpanel
Ausgewählte Gene
Name | Exon-Länge (bp) | OMIM-G | Referenz-Seq. | Erbgang |
---|---|---|---|---|
AGPAT2 | 837 | NM_006412.4 | AR | |
BSCL2 | 1197 | NM_032667.6 | AR | |
CAV1 | 537 | NM_001753.5 | AD, AR | |
CAVIN1 | 1173 | NM_012232.6 | AR | |
CIDEC | 717 | NM_022094.3 | AR | |
LIPE | 3231 | NM_005357.4 | AD | |
LMNA | 1995 | NM_170707.4 | AD | |
PIK3R1 | 2175 | NM_181523.3 | AD | |
PLIN1 | 1569 | NM_002666.5 | AD | |
POLD1 | 3324 | NM_002691.4 | AD | |
PPARG | 1518 | NM_015869.5 | AD | |
PSMB8 | 831 | NM_148919.4 | AR | |
ZMPSTE24 | 1428 | NM_005857.5 | AR | |
FBN1 | 8616 | NM_000138.5 | AD | |
GALC | 2058 | NM_000153.4 | AR | |
INSR | 4149 | NM_000208.4 | AR | |
LMNB2 | 1863 | NM_032737.4 | AD, Sus | |
MTX2 | 813 | NM_006554.5 | AR | |
PCNT | 10011 | NM_006031.6 | AR | |
PCYT1A | 1104 | NM_005017.4 | AR | |
POLR3A | 4173 | NM_007055.4 | AR | |
WRN | 4299 | NM_000553.6 | AR |
Infos zur Erkrankung
Die kongenitale generalisierte Lipodystrophie (Berardinelli-Seip kongenitale Lipodystrophie) ist eine seltene Erkrankung, die durch einen fast vollständigen Mangel an Fettgewebe gekennzeichnet ist. Sie gehört zu einer Gruppe verwandter Erkrankungen, die alle durch den Verlust von Fettgewebe gekennzeichnet sind. Die Symptome zeigen sich meist früh und umfassen Insulinresistenz, die sich zu Diabetes mellitus entwickeln kann, Hypertriglyceridämie (mit eruptiven Xanthomen und Pankreatitis), Lebersteatose, Hepatomegalie, Leberversagen und hypertrophe Kardiomyopathie. Im weiblichen Geschlecht können Klitoromegalie, Hirsutismus, unregelmäßige Menstruation und multiple Zysten an den Eierstöcken auffallen. Viele Patienten entwickeln Akanthosis nigricans. Es gibt verschiedene genetische Typen der kongenitalen generalisierten Lipodystrophie: Typ-1-Patienten entwickeln nach der Pubertät Zysten in den langen Extremitätenknochen. Typ 2 kann mit geistiger Behinderung einhergehen. Typ 3 scheint das Wachstum zu beeinträchtigen. Typ 4 ist mit Muskelschwäche, verzögerter Entwicklung, Gelenkanomalien, Pylorusstenose und schweren Herzrhythmusstörungen verbunden. Die Vererbung ist entweder autosomal-dominant oder autosomal-rezessiv. Die DNA-Ausbeute bei Berardinelli-Seip kongenitaler Lipodystrophie ist sehr hoch; insgesamt ist die molekulargenetische Ausbeute jedoch unbekannt und niedrig, kann durch Next-Generation-Sequenzanalyse von bekannten Lipodystrophie-assoziierten Genen gesteigert werden.
Referenzen: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1212/
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK201365/
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1307/
- Alias: Berardinelli-Seip congenital lipodystrophy, BSCL
- Alias: Insulin-Resistenz incl. Lipodystrophie
- Allelic: Agammaglobulinemia 7, AR (PIK3R1)
- Allelic: Cardiomyopathy, dilated, 1A (LMNA)
- Allelic: Carotid intimal medial thickness 1 (PPARG)
- Allelic: Charcot-Marie-Tooth disease, type 2B1 (LMNA)
- Allelic: Colorectal cancer, susceptibility to, 10 (POLD1)
- Allelic: Diabetes mellitus, insulin-resistant, with acanthosis nigricans (INSR)
- Allelic: Diabetes, type 2 (PPARG)
- Allelic: Ectopia lentis, familial (FBN1)
- Allelic: Emery-Dreifuss muscular dystrophy 2, AD; 3, AR (LMNA)
- Allelic: Encephalopathy, progressive, with or without lipodystrophy (BSCL2)
- Allelic: Epilepsy, progressive myoclonic, 9 (LMNB2)
- Allelic: Heart-hand syndrome, Slovenian type (LMNA)
- Allelic: Hutchinson-Gilford progeria (LMNA)
- Allelic: Hyperinsulinemic hypoglycemia, familial, 5 (INSR)
- Allelic: Immunodeficiency 36 (PIK3R1)
- Allelic: Insulin resistance, severe, digenic (PPARG)
- Allelic: Leukodystrophy, hypomyelin., 7, with/-out oligodontia, hypogonadotr. hypogonadism (POLR3A)
- Allelic: MASS syndrome (FBN1)
- Allelic: Malouf syndrome (LMNA)
- Allelic: Mandibuloacral dysplasia (LMNA)
- Allelic: Marfan syndrome (FBN1)
- Allelic: Muscular dystrophy, congenital (LMNA)
- Allelic: Neuropathy, distal hereditary motor, type VA (BSCL2)
- Allelic: Obesity, resistance to (PPARG)
- Allelic: Obesity, severe (PPARG)
- Allelic: Pulmonary hypertension, primary, 3 (CAV1)
- Allelic: Restrictive dermopathy, lethal (LMNA)
- Allelic: Restrictive dermopathy, lethal (ZMPSTE24)
- Allelic: Silver spastic paraplegia syndrome (BSCL2)
- Allelic: Weill-Marchesani syndrome 2, AD (FBN1)
- Acromicric dysplasia (FBN1)
- Allelic: Gaucher disease, perinatal lethal (GBA1)
- Allelic: Gaucher disease, type I, III, IIIC (GBA1)
- Allelic: Lewy body dementia, susceptibility to (GBA1)
- Allelic: Parkinson disease, late-onset, susceptibility to (GBA1)
- Autoinflammation, panniculitis + dermatosis syndrome (OTULIN)
- Berardinelli-Seip congenital lipodystrophy (AGPAT2)
- Diabetes mellitus, type II (AKT2)
- Gaucher disease, type II (GBA1)
- Geleophysic dysplasia 2 (FBN1)
- Hypoinsulinemic hypoglycemia with hemihypertrophy (AKT2)
- Keppen-Lubinsky syndrome (KCNJ6)
- Krabbe disease (GALC)
- Leprechaunism (INSR)
- Lipodystrophy, congenital generalized, type 1 (AGPAT2)
- Lipodystrophy, congenital generalized, type 2 (BSCL2)
- Lipodystrophy, congenital generalized, type 3 (CAV1)
- Lipodystrophy, congenital generalized, type 4 (CAVIN1)
- Lipodystrophy, familial partial, type 2 (LMNA)
- Lipodystrophy, familial partial, type 3 (PPARG)
- Lipodystrophy, familial partial, type 4 (PLIN1)
- Lipodystrophy, familial partial, type 5 (CIDEC)
- Lipodystrophy, familial partial, type 6 (LIPE)
- Lipodystrophy, familial partial, type 7 (CAV1)
- Lipodystrophy, partial, acquired, susceptibility to (LMNB2)
- Mandibular hypoplasia, deafness, progeroid features + lipodystrophy syndrome (POLD1)
- Mandibuloacral dysplasia progeroid syndrome (MTX2)
- Mandibuloacral dysplasia with type B lipodystrophy (ZMPSTE24)
- Marfan lipodystrophy syndrome (FBN1)
- Microcephalic osteodysplastic primordial dwarfism, type II (PCNT)
- Nestor-Guillermo progeria syndrome (BANF1)
- Proteasome-associated autoinflammatory syndrome 1 + digenic forms (PSMB8)
- Ruijs-Aalfs syndrome (SPRTN)
- SHORT syndrome [Partial lipodystrophy, Rieger anomaly, short sture] (PIK3R1)
- Spondylometaphyseal dysplasia with cone-rod dystrophy (PCYT1A)
- Stiff skin syndrome (FBN1)
- Wiedemann-Rautenstrauch syndrome (POLR3A)
- AD
- AR
- Sus
- Multiple OMIM-Ps
Bioinformatik und klinische Interpretation
Test-Stärken
- DAkkS-akkreditiertes Labor
- EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
- Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
- Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
- Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
- eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
- unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
- unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
- unsere umfassenden klinischen Aussagen
Testeinschränkungen
- Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
- Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
- es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
- die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
- Gen-Konversionen
- komplexe Inversionen
- Balancierte Translokationen
- Mitochondriale Varianten
- Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
- nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
- niedriger Mosaik-Status
- Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
- Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
- Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
- Varianten innerhalb von Pseudogenen
- die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde
Laboranforderung
Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.
Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.
Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.
Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.