Klinische FragestellungLippen-Kiefer-Gaumen-[Gesichts-]Spalten, nicht-syndromal; Differentialdiagnose
Zusammenfassung
Ein umfassendes differentialdiagnostisches panel mit über 50 kuratierten Genen für genetisch bedingte Lippen-Kiefer-Gaumen-[Gesichts-]Spalten, nicht-syndromal
115,1 kb (Erweitertes Panel: inkl. additional genes)
- EDTA-Blut (3-5 ml)
NGS +
Genpanel
Ausgewählte Gene
Name | Exon-Länge (bp) | OMIM-G | Referenz-Seq. | Erbgang |
---|---|---|---|---|
BCOR | 5166 | NM_017745.6 | XL | |
CDH1 | 2649 | NM_004360.5 | AD | |
COL11A1 | 5421 | NM_001854.4 | AD, AR | |
COL11A2 | 5211 | NM_080680.3 | AD, AR | |
COL2A1 | 4464 | NM_001844.5 | AD | |
EFNB1 | 1041 | NM_004429.5 | XL | |
FGFR1 | 2469 | NM_023110.3 | AD | |
FGFR2 | 2466 | NM_000141.5 | AD | |
FLNA | 7920 | NM_001456.4 | XL | |
GRHL3 | 1671 | NM_198174.3 | AD | |
IRF6 | 1404 | NM_006147.4 | AD | |
MSX1 | 912 | NM_002448.3 | AD | |
OFD1 | 3039 | NM_003611.3 | XL | |
PHF8 | 3075 | NM_015107.3 | XLR | |
SOX9 | 1530 | NM_000346.4 | AD | |
TBX22 | 1563 | NM_001109878.2 | XL | |
TCOF1 | 4467 | NM_001135243.2 | AD | |
AHCY | 1299 | NM_000687.4 | AR | |
BHMT | 1221 | NM_001713.3 | n.k. | |
CRISPLD2 | 1557 | NM_031476.4 | Mult, Ass | |
CTH | 1122 | NM_001902.6 | AR | |
DHFR | 564 | NM_000791.4 | AR | |
DMGDH | 2601 | NM_013391.3 | AR | |
FOLH1 | 2160 | NM_001014986.3 | Mult, Ass | |
FOLR1 | 774 | NM_016725.3 | AR | |
FOLR2 | 797 | NM_000803.5 | Mult, Ass | |
FOLR3 | 741 | NM_000804.4 | Mult, Ass | |
FOXE1 | 1122 | NM_004473.4 | n.k. | |
FTCD | 1626 | NM_006657.3 | AR | |
JAG2 | 3717 | NM_002226.5 | Mult, Ass | |
MAT1A | 1188 | NM_000429.3 | AD, AR | |
MAT2A | 1188 | NM_005911.6 | AD | |
MAT2B | 1103 | NM_013283.5 | Mult, Ass | |
MTHFD1 | 2808 | NM_005956.4 | AR | |
MTHFD2 | 1061 | NM_006636.4 | Mult, Ass | |
MTHFR | 1971 | NM_005957.5 | Mult, Ass | |
MTHFS | 441 | NM_001199758.1 | AR | |
MTR | 3798 | NM_000254.3 | AR | |
MTRR | 2097 | NM_002454.3 | AR | |
NOS3 | 3612 | NM_000603.5 | Mult | |
PAX7 | 1563 | NM_002584.3 | n.k. | |
PON1 | 1068 | NM_000446.7 | Sus | |
PQBP1 | 798 | NM_005710.2 | XLR | |
RFC1 | 3447 | NM_001204747.2 | AR | |
ROCK1 | 4065 | NM_005406.3 | Mult, Ass | |
SHMT1 | 1452 | NM_004169.5 | Mult, Ass | |
SHMT2 | 1555 | NM_005412.6 | AR | |
SLC19A1 | 1470 | NM_001205206.4 | AR | |
SLC46A1 | 1297 | NM_001242366.3 | AR | |
SMS | 942 | NM_004595.5 | XLR | |
SUMO1 | 306 | NM_003352.8 | isolierte Fälle | |
TCN2 | 1284 | NM_000355.4 | AR | |
TGFA | 563 | NM_001099691.3 | Mult, Ass | |
TGFB2 | 1245 | NM_003238.6 | AD | |
TYMS | 942 | NM_001071.4 | Mult, Ass |
Infos zur Erkrankung
Orofaziale Spalten sind die häufigsten orofazialen Fehlbildungen beim Menschen. In den ersten 6-10 Schwangerschaftswochen verschmelzen die Knochen und die Haut des fötalen Oberkiefers, der Nase und des Mundes normal miteinander und bilden das Mund-Dach und die Oberlippe. Spaltbildungen entstehen, wenn Teile der Lippe und/oder des Gaumens nicht vollständig miteinander verschmelzen. Die Gründe für die meisten Spaltbildungen sind nach wie vor unklar, einige können mit genetischen Faktoren zusammenhängen, andere mit Umweltfaktoren (Medikamente und Chemikalien während der Schwangerschaft, Mangel an wichtigen pränatalen Nährstoffen, Rauchen und Alkohol usw.). Ein erhöhtes Wiederholungsrisiko für Spaltbildungen bei Verwandten deutet auf ein hohes Maß an Erblichkeit hin. Monogene Ursachen sind aber die Ausnahme und umfassen Mutationen in Genen, die für Zellproliferation und -migration, Zell-Zell-Adhäsionsproteine, den Folat- und Homocystein-Stoffwechsel kodieren. Im Wesentlichen werden orofaziale Spaltbildungen als typische komplexe und multifaktorielle Erkrankungen betrachtet, die durch mehrere genetische und umweltbedingte Faktoren verursacht werden. Im Gegensatz zu verschiedenen Spaltbildungs-Syndromen übersteigt die molekulargenetische Ausbeute bei nicht-syndromalen Spalten in familiären Fällen kaum 10%. Daher sollten syndromale Spaltbildungsgene-Gene differenzialdiagnostisch mitberücksichtigt werden. Dennoch ist die klinische Diagnose selten von positiven DNA-Testergebnissen begleitet.
Referenz: https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fcell.2020.592271/full
- Acampomelic campomelic dysplasia (SOX9)
- Allelic: Abruzzo-Erickson syndrome (TBX22)
- Allelic: Ectodermal dysplasia 3, Witkop type (MSX1)
- Allelic: Joubert syndrome 10 (OFD1)
- Allelic: Simpson-Golabi-Behmel syndrome, type 2 (OFD1)
- Bamforth-Lazarus syndrome (FOXE1)
- Blepharocheilodontic syndrome 1 (CDH1)
- Campomelic dysplasia (SOX9)
- Cerebellar ataxia, neuropathy + vestibular areflexia syndrome (RFC1)
- Cleft palate with ankyloglossia (TBX22)
- Combined immunodeficiency and megaloblastic anemia with or without hyperhomocysteinemia (MTHFD1)
- Craniofrontonasal dysplasia (EFNB1)
- Cystathioninuria (CTH)
- Dimethylglycine dehydrogenase deficiency (DMGDH)
- Folate malabsorption, hereditary (SLC46A1)
- Frontometaphyseal dysplasia 1 (FLNA)
- Gastric cancer, hereditary diffuse, with/-out cleft lip and/or palate (CDH1)
- Glutamate formiminotransferase deficiency (FTCD)
- Glycine N-methyltransferase deficiency (GNMT)
- Homocystinuria due to MTHFR deficiency (MTHFR)
- Homocystinuria, B6-responsive and nonresponsive types (CBS)
- Homocystinuria-megaloblastic anemia, cbl E type (MTRR)
- Homocystinuria-megaloblastic anemia, cblG complementation type (MTR)
- Hypermethioninemia with deficiency of S-adenosylhomocysteine hydrolase (AHCY)
- Jackson-Weiss syndrome (FGFR1, FGFR2)
- Loeys-Dietz syndrome 4 (TGB2)
- Marshall syndrome (COL11A1)
- Megaloblastic anemia due to dihydrofolate reductase deficiency (DHFR)
- Megaloblastic anemia, folate-responsive (SLC19A1)
- Melnick-Needles syndrome (FLNA)
- Mental retardation syndrome, XL, Siderius type (PHF8)
- Mental retardation, XL, Snyder-Robinson type (SMS)
- Methionine adenosyltransferase deficiency, AR (MAT1A)
- Microphthalmia, syndromic 2 (BCOR)
- Myopathy, congenital, progressive, with scoliosis (PAX7)
- Neurodegeneration due to cerebral folate transport deficiency (FOLR1)
- Neurodevelopmental disorder with cardiomyopathy, spasticity + brain abnormalities (SHMT2)
- Neurodevelopmental disorder with microcephaly, epilepsy, and hypomyelination (MTHFS)
- Orofacial cleft 10 (SUMO1)
- Orofacial cleft 5 (MSX1)
- Orofacial cleft 6 (IRF6)
- Orofaciodigital syndrome I (OFD1)
- Otopalatodigital syndrome, type I + II (FLNA)
- Otospondylomegaepiphyseal dysplasia, AD (COL11A2)
- Otospondylomegaepiphyseal dysplasia, AR (COL11A2)
- Renpenning syndrome (PQBP1)
- Stickler syndrome, type I (COL2A1)
- Stickler syndrome, type II (COL11A1)
- Tooth agenesis, selective, 1, with/-out orofacial cleft (MSX1)
- Transcobalamin II deficiency (TCN2)
- Treacher Collins syndrome 1 (TCOF1)
- Van der Woude syndrome (IRF6)
- Van der Woude syndrome 2 (GRHL3)
- AD
- AR
- Ass
- Mult
- Sus
- XL
- XLR
- isolierte Fälle
- n.k.
- Multiple OMIM-Ps
Bioinformatik und klinische Interpretation
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