Klinische FragestellungMentale Retardierung bei Makrozephalie, Differentialdiagnose
Zusammenfassung
Umfassendes differentialdiagnostisches panel für Mentale Retardierung bei Makrozephalie mit 1 "core"-Gen, 12 "core candidate"-Genen bzw. zusammen genommen 62 kuratierten Genen gemäß klinischer Verdachtsdiagnose
117,7 kb (Erweitertes Panel: inkl. additional genes)
- EDTA-Blut (3-5 ml)
NGS +
[Sanger]
Genpanel
Ausgewählte Gene
Name | Exon-Länge (bp) | OMIM-G | Referenz-Seq. | Erbgang |
---|---|---|---|---|
CDKN1C | 951 | NM_000076.2 | AD | |
EZH2 | 2256 | NM_004456.5 | AD | |
FMR1 | 1899 | NM_002024.6 | XL | |
NFIA | 1497 | NM_005595.5 | AD | |
NFIB | 1485 | NM_001190737.2 | AD | |
NFIX | 1533 | NM_001271043.2 | AD | |
NSD1 | 8091 | NM_022455.5 | AD | |
PTEN | 1212 | NM_000314.8 | AD | |
ADK | 1038 | NM_001123.4 | AR | |
APC2 | 6912 | NM_005883.3 | AR | |
BRWD3 | 5409 | NM_153252.5 | XLR | |
CACNA1E | 6813 | NM_000721.4 | AD | |
CHD3 | 6180 | NM_001005271.3 | AD | |
CUL4B | 2742 | NM_003588.4 | XLR | |
DICER1 | 5769 | NM_177438.3 | SMu | |
EED | 2100 | NM_003797.5 | AD | |
EXT2 | 2157 | NM_207122.2 | AR | |
GCDH | 1317 | NM_000159.4 | AR | |
GRIA3 | 2685 | NM_000828.5 | XLR | |
H1-4 | 661 | NM_005321.3 | AD | |
HEPACAM | 1251 | NM_152722.5 | AD, AR | |
HERC1 | 14586 | NM_003922.4 | AR | |
HRAS | 570 | NM_005343.4 | AD | |
HUWE1 | 13125 | NM_031407.7 | XLR | |
KPTN | 1311 | NM_007059.4 | AR | |
MED12 | 6534 | NM_005120.3 | XL | |
NONO | 1426 | NM_001145408.2 | XL | |
PAK1 | 1702 | NM_001128620.2 | AD | |
PPP2R5D | 1356 | NM_006245.4 | AD | |
RAB39B | 642 | NM_171998.4 | XLR | |
RHEB | 583 | NM_005614.4 | AD | |
SHANK3 | 5386 | NM_001372044.2 | AD | |
SNX14 | 2841 | NM_153816.6 | AR | |
SUZ12 | 2220 | NM_015355.4 | AD | |
UPF3B | 1452 | NM_080632.3 | XLR |
Infos zur Erkrankung
Intellektuelle Behinderung ist auf neurologische Entwicklungsdefizite zurückzuführen und durch Einschränkungen der intellektuellen Funktionsfähigkeit und des Anpassungsverhaltens gekennzeichnet (mangelnde Kompetenz in sozialen, konzeptionellen und praktischen Fähigkeiten). Die häufigste chromosomale Ursache intellektueller Behinderung ist das Down-Syndrom, die häufigste genetische Ursache das Fragile-X-Syndrom, die häufigste bekannte vermeidbare oder umweltbedingte Ursache ist das fetale Alkoholsyndrom. Viele genetische Störungen umfassen neben intellektuellen Defiziten auch Makrozephalie. Letztere ist ein weit gefasster Begriff, der die Megalenzephalie und andere Ursachen für eine Vergrößerung des Kopfes ohne zerebrales Überwachstum wie z.B. subdurale Flüssigkeitsansammlung, umfasst. Makrozephalie ist häufig (2,5% der Bevölkerung) und oft auch genetisch (mit-)bedingt (<200 OMIM-Einträge). Bei einer ganzen Reihe von Syndromen treten geistige Behinderung und Makrozephalie kombiniert auf: Beckwith-Wiedemann, Cowden, IMAGE, Sotos, Marshall-Smith, Weaver und seltenere Syndrome; Holoprosenzephalie, Hydrozephalus, Leukodystrophien etc. Ein unauffälliger genetischer Befund bedeutet keinen Ausschluss der klinischen Verdachtsdiagnose.
Referenz: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK560786/
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK148820/
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK542336/
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1479/
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1151/
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1488/
- Alias: Intellectual disability, macrocephaly
- Alias: Psycho-motor retardation, macrocephaly
- Allelic: Basal cell carcinoma, somatic (PTCH1)
- Allelic: Basal cell nevus syndrome (PTCH1)
- Allelic: Basal cell nevus syndrome 1 (PTCH1)
- Allelic: Basal cell nevus syndrome 2 (SUFU)
- Allelic: Congenital myopathy with excess of muscle spindles (HRAS)
- Allelic: Cortical dysplasia, complex, with other brain malformations 10
- Allelic: Fragile X tremor/ataxia syndrome (FMR1)
- Allelic: Glioma susceptibility 2 (PTEN)
- Allelic: Goiter, multinodular 1,+/- Sertoli-Leydig cell tumors (DICER1)
- Allelic: Intellectual developmental disorder, AD 44, with microcephaly (TRIO)
- Allelic: Lujan-Fryns syndrome (MED12)
- Allelic: Lymphangioleiomyomatosis (TSC1)
- Allelic: Medulloblastoma (SUFU)
- Allelic: Meningioma (PTEN)
- Allelic: Meningioma, familial, susceptibility to (SUFU)
- Allelic: Ohdo syndrome, XL (MED12)
- Allelic: Pleuropulmonary blastoma (DICER1)
- Allelic: Premature ovarian failure 1 (FMR1)
- Allelic: Prostate cancer, somatic (PTEN)
- Allelic: Rhabdomyosarcoma, embryonal, 2 (DICER1)
- Allelic: Waisman syndrome (RAB39B)
- Bachmann-Bupp syndrome (ODC1)
- Beck-Fahrner syndrome (TET3)
- Beckwith-Wiedemann syndrome (CDKN1C)
- Brain malformations with/-out urinary tract defects (NFIA)
- Cohen-Gibson syndrome (EED)
- Costello syndrome (HRAS)
- Cowden syndrome 1 (PTEN)
- Cowden syndrome 5 (PIK3CA)
- Epileptic encephalopathy, early infantile, 69 (CACNA1E)
- Familial Wilms tumor [GeneReviews] (CTR9)
- Fragile X syndrome (FMR1)
- GAND syndrome (GATAD2B)
- GLOW syndrome, somatic mosaic: Global dev. delay, Lung cysts, Overgrowth, Wilms tumor (DICER1)
- Global develop delay, intellectual disability, macrocephal, alopecia, ectodermal dysplasia (ODC1)
- Glutaricaciduria, type I (GCDH)
- Holoprosencephaly 7 (PTCH1)
- Hypermethioninemia due to adenosine kinase deficiency (ADK)
- ID [MONDO:0001071], macrocephaly [HP:0000256] (CTR9)
- IMAGE syndrome (CDKN1C)
- Imagawa-Matsumoto syndrome (SUZ12)
- Intellectual developmental disorder with autism + macrocephaly (CHD8)
- Intellectual developmental disorder with macrocephaly, seizures + speech delay (PAK1)
- Intellectual developmental disorder, AD 48 (RAC1)
- Intellectual developmental disorder, AD 63, with macrocephaly (TRIO)
- Intellectual developmental disorder, AD 70 (SETD2)
- Intellectual developmental disorder, XL, syndromic, Wu type (GRIA3)
- Intellectual disability, macrocephaly [panelapp] (ATXN2L)
- Joubert syndrome 32 (SUFU)
- Kleefstra syndrome 1 (EHMT1)
- Lhermitte-Duclos syndrome (PTEN)
- Luscan-Lumish syndrome (SETD2)
- Macrocephaly, acquired, with impaired intellectual development (NFIB)
- Macrocephaly, dysmorphic facies, and psychomotor retardation (HERC1)
- Macrocephaly, neurodevelopmental delay, lymphoid hyperplasia, persistent fetal hemoglobin (ZBTB7A)
- Macrocephaly/autism syndrome (PTEN)
- Macrocephaly/megalencephaly syndrome, AR (TBC1D7)
- Marshall-Smith syndrome (NFIX)
- Megalencephalic leukoencephalopathy with subcortical cysts (MLC1)
- Megalencephalic leukoencephalopathy with subcortical cysts 2A (HEPACAM)
- Megalencephalic leukoencephalopathy, subcort. cysts 2B, remitting, +/- mental retardation (HEPACAM)
- Megalencephaly-polymicrogyria-polydactyly-hydrocephalus syndrome 1 (PIK3R2)
- Megalencephaly-polymicrogyria-polydactyly-hydrocephalus syndrome 2 (AKT3)
- Megalencephaly-polymicrogyria-polydactyly-hydrocephalus syndrome 3 (CCND2)
- Mental retardation, AD 35 (PPP2R5D)
- Mental retardation, AR 41 (KPTN)
- Mental retardation, XL 72 (RAB39B)
- Mental retardation, XL 93 (BRWD3)
- Mental retardation, XL syndromic, Turner type (HUWE1)
- Mental retardation, XL, syndromic 14 (UPF3B)
- Mental retardation, XL, syndromic 15, Cabezas type (CUL4B)
- Mental retardation, XL, syndromic 34 (NONO)
- Neurodevelopmental disorder, language delay +/- structural brain abnormalities (PPP2CA)
- Opitz-Kaveggia syndrome (MED12)
- Phelan-McDermid syndrome (SHANK3)
- Polyhydramnios, megalencephaly + symptomatic epilepsy (STRADA syn. LYK5)
- Polyhydramnios, megalencephaly + symptomatic epilepsy (STRADA)
- Rabin-Pappas syndrome (SETD2)
- Rahman syndrome (HIST1H1E)
- Short stature, macrocephaly, intellectual disability + autism spectrum disorder [panelapp] (RHEB)
- Simpson-Golabi-Behmel syndrome, type 1 (GPC3)
- Smith-Kingsmore syndrome (MTOR)
- Snijders Blok-Campeau syndrome (CHD3)
- Sotos syndrome 1 (NSD1)
- Sotos syndrome 2 (NFIX)
- Sotos syndrome 3 (APC2)
- Spinocerebellar ataxia, AR 20 (SNX14)
- Tenorio syndrome (RNF125)
- Thauvin-Robinet-Faivre syndrome (FIBP)
- Tuberous sclerosis-1 (TSC1)
- Tuberous sclerosis-2 (TSC2)
- Weaver syndrome (EZH2)
- AD
- AR
- SMu
- XL
- XLR
- Multiple OMIM-Ps
Bioinformatik und klinische Interpretation
Test-Stärken
- DAkkS-akkreditiertes Labor
- EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
- Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
- Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
- Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
- eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
- unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
- unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
- unsere umfassenden klinischen Aussagen
Testeinschränkungen
- Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
- Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
- es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
- die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
- Gen-Konversionen
- komplexe Inversionen
- Balancierte Translokationen
- Mitochondriale Varianten
- Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
- nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
- niedriger Mosaik-Status
- Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
- Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
- Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
- Varianten innerhalb von Pseudogenen
- die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde
Laboranforderung
Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.
Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.
Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.
Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.