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Klinische FragestellungMentale Retardierung bei Stoffwechsel-Störungen, Differentialdiagnose

Zusammenfassung

Kurzinformation

Umfassendes differentialdiagnostisches panel für Mentale Retardierung bei Stoffwechsel-Erkrankungen mit zusammen genommen 80 kuratierten Genen gemäß klinischer Verdachtsdiagnose

ID
MP7894
Anzahl Gene
80 Akkreditierte Untersuchung
Untersuchte Sequenzlänge
0,0 kb (Core-/Core-canditate-Gene)
112,5 kb (Erweitertes Panel: inkl. additional genes)
Analyse-Dauer
auf Anfrage
Untersuchungsmaterial
  • EDTA-Blut (3-5 ml)
Diagnostische Hinweise

NGS +

[Sanger]

 

Genpanel

Ausgewählte Gene

NameExon-Länge (bp)OMIM-GReferenz-Seq.Erbgang
ACY11227NM_000666.3AR
ADSL1455NM_000026.4AR
ALDH3A21458NM_000382.3AR
ALDH4A11512NM_001161504.2AR
ALDH5A11608NM_001080.3AR
ALG11395NM_019109.5AR
ALG111479NM_001004127.3AR
ALG121467NM_024105.4AR
ALG13417NM_001099922.3XL
ALG31173NM_005787.6AR
ALG61524NM_013339.4AR
ALG81404NM_024079.5AR
ALG91858NM_024740.2AR
ASAH11188NM_177924.5AR
ASPA942NM_000049.4AR
ATIC1779NM_004044.7AR
ATP7A4503NM_000052.7XLR
B4GALT11197NM_001497.4AR
CLPB2034NM_001258392.3AR, AD
COG12943NM_018714.3AR
COG42295NM_001195139.2AR, AD
COG52472NM_001161520.2AR
COG61848NM_001145079.2AR
COG72313NM_153603.4AR
COG81839NM_032382.5AR
DDC1443NM_000790.4AR
DDOST1371NM_005216.5AR
DHCR241551NM_014762.4AR
DHCR71428NM_001360.3AR
DOLK1617NM_014908.4AR
DPAGT11227NM_001382.4AR
DPM1783NM_003859.3AR
DPM2255NM_003863.4AR
DPM3369NM_018973.4AR
GALE1047NM_000403.4AR
GALT1140NM_000155.4AR
GCDH1317NM_000159.4AR
GCH1753NM_000161.3AD, AR
GLS1797NM_001256310.2AR
IDS1653NM_000202.8XLR
LAMP21233NM_002294.3XL
MGAT21344NM_002408.4AR
MOGS2196NM_001146158.2AR
MPDU1744NM_004870.4AR
MPI1272NM_002435.3AR
NGLY11911NM_001145293.2AR
OTC1065NM_000531.6XLR
PDHA11173NM_000284.4XL
PGAP2765NM_001256240.2AR
PGAP3963NM_033419.5AR
PGK11254NM_000291.4XLR
PGM11743NM_002633.3AR
PIGL759NM_004278.4AR
PIGO3270NM_032634.4AR
PIGV1482NM_017837.4AR
PIGW1515NM_178517.5AR
PMM2741NM_000303.3AR
PTS438NM_000317.3AR
QDPR735NM_000320.3AR
RFT11626NM_052859.4AR
SC5D900NM_001024956.3AR
SLC2A11479
  • Keine OMIM-Gs verknüpft
NM_006516.4AD, AR
SLC35A1837NM_001168398.2AR
SLC35A21182NM_001042498.3XL
SLC35C11056NM_001145265.2AR
SLC6A31863NM_001044.5AR
SLC6A81908NM_005629.4XLR
SPR786NM_003124.5AR
SRD5A3957NM_024592.5AR
SSR4555NM_001204526.1XLR
ST3GAL31128NM_006279.5AR
STT3A2118NM_001278503.2AR
TAT1365NM_000353.3AR
TCN21284NM_000355.4AR
TH1587NM_199292.3AR
TMEM165975NM_018475.5AR
TPP11692NM_000391.4AR
TREX1945NM_033629.6AD, AR
UMPS1443NM_000373.4AR
WDR451086NM_007075.4XL

Infos zur Erkrankung

Klinischer Kommentar

Mentale Retardierung (akzeptierter englischer Begriff, „intellectual deficits“) ist ein lebenslang schwächender Zustand, der bis zu 2-3% der Bevölkerung in westlichen Ländern betrifft. Während die kausale Pathogenese extrem unterschiedlich ist, stellen bei >50% der Patienten genetische Ätiologien die häufigste Ursache dar. Dieser Prozentsatz nimmt angesichts von effizienten NGS-Technologien zu. Beinahe 6% der Kinder mit intellektuellem Defizit haben eine von >500 ererbte Stoffwechselstörungen. Die meisten davon werden durch einen genetischen Mangel eines Enzyms verursacht, das zur Umwandlung eines Moleküls in ein anderes benötigt wird. Angeborene Stoffwechselstörungen stellen die größte Kategorie von genetischen Erkrankungen dar, die für eine kausale Therapie in Frage kommen. Die meisten Stoffwechselstörungen werden autosomal rezessiv vererbt. DNA-diagnostische Ausbeuten für Stoffwechsel-Störungen sind sehr unterschiedlich und derzeit nicht zusammenfassend anzugeben. Die klinische Diagnose kann durch ein negatives molekulargenetisches Ergebnis keinesfalls ausgeschlossen werden.

 

Synonyme
  • Alias: Intellectual deficit, inborn error of metabolism
  • Alias: Intellectual disability, inborn error of metabolism
  • Alias: Intellectual disability, metabolic disorder
  • Alias: Psycho-motor retardation, inborn error of metabolism
  • Alias: Psycho-motor retardation, metabolic disorder
  • 3-methylglutaconic aciduria, type VII, with cataracts, neurologic involvement + neutropenia (CLPB)
  • AICA-ribosiduria due to ATIC deficiency (ATIC)
  • Adenylosuccinase deficiency (ADSL)
  • Aicardi-Goutieres syndrome 1, dominant + recessive (TREX1)
  • Allelic: Muscular dystrophy-dystroglycanopathy (limb-girdle), type C, 15 (DPM3)
  • Allelic: Myasthenic syndrome, congenital, 13, with tubular aggregates (DPAGT1)
  • Allelic: Occipital horn syndrome (ATP7A)
  • Allelic: Polycystic liver disease 3 with/-out kidney cysts (ALG8)
  • Allelic: Spinal muscular atrophy, distal, XL 3 (ATP7A)
  • Allelic: Systemic lupus erythematosus, susceptibility to (TREX1)
  • Aminoacylase 1 deficiency (ACY1)
  • Aromatic L-amino acid decarboxylase deficiency (DDC)
  • CHIME syndrome (PIGL)
  • Canavan disease (ASPA)
  • Cerebral creatine deficiency syndrome 1 (SLC6A8)
  • Ceroid lipofuscinosis, neuronal, 2 (TPP1)
  • Chilblain lupus (TREX1)
  • Congenital disorder of deglycosylation (NGLY1)
  • Congenital disorder of glycosylation, type IIa (MGAT2)
  • Congenital disorder of glycosylation, type IIb (MOGS)
  • Congenital disorder of glycosylation, type IIc (SLC35C1)
  • Congenital disorder of glycosylation, type IId (BGALT1)
  • Congenital disorder of glycosylation, type IIe (COG7)
  • Congenital disorder of glycosylation, type IIf (SLC35A1)
  • Congenital disorder of glycosylation, type IIg (COG1)
  • Congenital disorder of glycosylation, type IIh (COG8)
  • Congenital disorder of glycosylation, type IIi (COG5)
  • Congenital disorder of glycosylation, type IIj (COG4)
  • Congenital disorder of glycosylation, type IIk (TMEM165)
  • Congenital disorder of glycosylation, type IIl (COG6)
  • Congenital disorder of glycosylation, type IIm (SLC35A2)
  • Congenital disorder of glycosylation, type Ia (PMM2)
  • Congenital disorder of glycosylation, type Ib (MPI)
  • Congenital disorder of glycosylation, type Id (ALG3)
  • Congenital disorder of glycosylation, type Id (ALG6)
  • Congenital disorder of glycosylation, type Ie (DPM1)
  • Congenital disorder of glycosylation, type If (MPDU1)
  • Congenital disorder of glycosylation, type Ig (ALG12)
  • Congenital disorder of glycosylation, type Ih (ALG8)
  • Congenital disorder of glycosylation, type Ij (DPAGT1)
  • Congenital disorder of glycosylation, type Ik (ALG1)
  • Congenital disorder of glycosylation, type Il (ALG9)
  • Congenital disorder of glycosylation, type Im (DOLK)
  • Congenital disorder of glycosylation, type In (RFT1)
  • Congenital disorder of glycosylation, type Ip (ALG11)
  • Congenital disorder of glycosylation, type Iq (SRD5A3)
  • Congenital disorder of glycosylation, type Ir (DDOST)
  • Congenital disorder of glycosylation, type Is (ALG13)
  • Congenital disorder of glycosylation, type It (PGM1)
  • Congenital disorder of glycosylation, type Iu (DPM2)
  • Congenital disorder of glycosylation, type Iw (STT3A)
  • Congenital disorder of glycosylation, type Iy (SSR4)
  • Danon disease (LAMP2)
  • Desmosterolosis (DHCR24)
  • Developmental + epileptic encephalopathy 15 (ST3GAL3)
  • Developmental + epileptic encephalopathy 36 (ALG13)
  • Developmental + epileptic encephalopathy 71 (GLS)
  • Dystonia 9 (SLC2A1)
  • Dystonia, DOPA-responsive, with or without hyperphenylalaninemia (GCH1)
  • Dystonia, dopa-responsive, due to sepiapterin reductase deficiency (SPR)
  • Epilepsy, idiopathic generalized, susceptibility to, 12 (SLC2A1)
  • Farber lipogranulomatosis (ASAH1)
  • GLUT1 deficiency syndrome 1, infantile onset, severe (SLC2A1)
  • GLUT1 deficiency syndrome 2, childhood onset (SLC2A1)
  • Galactose epimerase deficiency (GALE)
  • Galactosemia (GALT)
  • Gillessen-Kaesbach-Nishimura syndrome (ALG9)
  • Global developmental delay, progressive ataxia, elevated glutamine (GLS)
  • Glutaricaciduria, type I (GCDH)
  • Glycosylphosphatidylinositol biosynthesis defect 11 (PIGW)
  • Hyperphenylalaninemia, BH4-deficient, A (PTS)
  • Hyperphenylalaninemia, BH4-deficient, B (GCH1)
  • Hyperphenylalaninemia, BH4-deficient, C (QDPR)
  • Hyperphosphatasia with mental retardation syndrome 1 (PIGV)
  • Hyperphosphatasia with mental retardation syndrome 2 (PIGO)
  • Hyperphosphatasia with mental retardation syndrome 3 (PGAP2)
  • Hyperphosphatasia with mental retardation syndrome 4 (PGAP3)
  • Hyperprolinemia, type II (ALD4A1)
  • Infantile cataract, skin abnormalities, glutamate excess, impaired intellectual development (GLS)
  • Intellectual developmental disorder, AR 12 (ST3GAL3)
  • Kahrizi syndrome (SRD5A3)
  • Lathosterolosis (SC5D)
  • Menkes disease (ATP7A)
  • Mucopolysaccharidosis II (IDS)
  • Muscular dystrophy-dystroglycanopathy (cong. with impaired intell. development), type B, 15 (DPM3)
  • Neurodegeneration with brain iron accumulation 5 (WDR45)
  • Nicotine dependence, protection against (SLC6A3)
  • Ornithine transcarbamylase deficiency (OTC)
  • Orotic aciduria (UMPS)
  • Parkinsonism-dystonia, infantile, 1 (SLC6A3)
  • Phosphoglycerate kinase 1 deficiency (PGK1)
  • Pyruvate dehydrogenase E1-alpha deficiency (PDHA1)
  • Saul-Wilson syndrome (COG4)
  • Segawa syndrome, recessive (TH)
  • Shaheen syndrome (COG6)
  • Sjogren-Larsson syndrome (ALH3A2)
  • Smith-Lemli-Opitz syndrome (DHCR7)
  • Spinal muscular atrophy with progressive myoclonic epilepsy (ASAH1)
  • Spinocerebellar ataxia, AR 7 (TPP1)
  • Stomatin-deficient cryohydrocytosis with neurologic defects (SLC2A1)
  • Succinic semialdehyde dehydrogenase deficiency (ALDH5A1)
  • Transcobalamin II deficiency (TCN2)
  • Tyrosinemia, type II (TAT)
  • Vasculopathy, retinal, with cerebral leukoencephalopathy + systemic manifestations (TREX1)
Erbgänge, Vererbungsmuster etc.
  • AD
  • AR
  • XL
  • XLR
OMIM-Ps
  • Multiple OMIM-Ps
ICD10 Code

Bioinformatik und klinische Interpretation

Test-Stärken

  • DAkkS-akkreditiertes Labor
  • EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
  • Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
  • Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
  • Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
  • eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
  • unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
  • unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
  • unsere umfassenden klinischen Aussagen

Testeinschränkungen

  • Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
  • Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
  • es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
  • die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
  • Gen-Konversionen
  • komplexe Inversionen
  • Balancierte Translokationen
  • Mitochondriale Varianten
  • Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
  • nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
  • niedriger Mosaik-Status
  • Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
  • Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
  • Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
  • Varianten innerhalb von Pseudogenen
  • die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde

Laboranforderung

  • Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.

  • Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.

  • Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.

  • Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.