Klinische FragestellungMentale Retardierung, X-chromosomal, nicht-syndromisch; Differentialdiagnose
Zusammenfassung
Umfassendes differentialdiagnostisches panel für Mentale Retardierung, X-chromosomal, nicht-syndromisch, mit 1 Leitlinien-kuratierten und 19 bzw. zusammen genommen 34 kuratierten Genen gemäß klinischer Verdachtsdiagnose
79,5 kb (Erweitertes Panel: inkl. additional genes)
- EDTA-Blut (3-5 ml)
X NGS +
[Sanger]
Genpanel
Ausgewählte Gene
Name | Exon-Länge (bp) | OMIM-G | Referenz-Seq. | Erbgang |
---|---|---|---|---|
ACSL4 | 2013 | NM_004458.3 | XL | |
AFF2 | 3936 | NM_002025.4 | XLR | |
BRWD3 | 5409 | NM_153252.5 | XLR | |
DLG3 | 2454 | NM_021120.4 | XLR | |
FRMPD4 | 3969 | NM_014728.3 | XL | |
FTSJ1 | 990 | NM_012280.4 | XLR | |
GDI1 | 1344 | NM_001493.3 | XL | |
IL1RAPL1 | 2091 | NM_014271.4 | XLR | |
IQSEC2 | 4467 | NM_001111125.3 | XL | |
MECP2 | 1461 | NM_004992.4 | XL | |
NEXMIF | 4551 | NM_001008537.3 | XL | |
OGT | 3141 | NM_181672.3 | XLR | |
PAK3 | 1635 | NM_002578.5 | XLR | |
RAB39B | 642 | NM_171998.4 | XLR | |
SYP | 942 | NM_003179.3 | XLR | |
THOC2 | 4782 | NM_001081550.2 | XLR | |
TSPAN7 | 750 | NM_004615.4 | XLR | |
USP9X | 7713 | NM_001039590.3 | XL | |
ZNF711 | 2286 | NM_021998.5 | XL | |
AP1S2 | 474 | NM_003916.5 | XLR | |
ATP6AP2 | 1053 | NM_005765.3 | XLR | |
CASK | 2766 | NM_003688.3 | XL | |
CLCN4 | 2283 | NM_001830.4 | XL | |
CNKSR2 | 3015 | NM_001168647.3 | XL | |
DDX3X | 1986 | NM_001193416.3 | XL | |
GRIA3 | 2685 | NM_000828.5 | XLR | |
HCFC1 | 6108 | NM_005334.3 | XLR | |
NAA10 | 663 | NM_001256119.2 | XL | |
RLIM | 1875 | NM_016120.4 | XLR | |
SYN1 | 2010 | NM_133499.2 | XL |
Infos zur Erkrankung
Die Komplexität des Gehirns und der intellektuellen Funktionsmechanismen beim Menschen ist immens, ebenso wie die Art und Weise, in der intellektuelle Behinderungen auftreten können. Die Ätiologie eines Drittels der genetisch bedingten Fälle mit intellektuellem Defizit ist unbekannt. Die zunehmende Zahl der identifizierten Gene, die mit mentaler Retardierung in Verbindung gebracht werden, lässt vermuten, dass dieser Phänotyp als Endergebnis der Unterbrechung verschiedener miteinander verbundener zellulärer und molekularer Wege entstehen kann. Die häufigste Erkrankung mit X-chromosomalem intellektuellem Defizit ist das Fragile-X-Syndrom (FXS), dominant vererbt mit unvollständiger Penetranz, das etwa 1-3/10 000 kaukasische Männer betrifft. Das mutierte FMR1-Gen weist überzählige CCG-Trinukleotidwiederholungen auf, ist hypermethyliert und produziert damit kein Protein. Das X-Chromosom beherbergt weiterhin unverhältnismäßig viele Gene (>140), deren Mutationen psychomotorische Retardierung bedingen. Die Pathogenitätsmechanismen beruhen in der Regel auf Punktmutationen sowie genomischen Umordnungen. Der X-gebundene Erbgang kann sowohl dominant wie auch rezessiv sein, die Expressivität ist je nach mutiertem Gen ggf. variabel sein. Ein unauffälliger genetischer Befund bedeutet keinen Ausschluss der klinischen Verdachtsdiagnose.
Referenz: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31898314/
- Alias: Intellectual disability XL
- Alias: Psycho-motor retardation XL
- Allelic: Epilepsy, XL, with variable learning disabilities + behavior disorders (SYN1)
- Allelic: FG syndrome 4 (CASK)
- Allelic: Raynaud-Claes syndrome (CLCN4)
- Asperger syndrome susceptibility, XL (NLGN3)
- Intellectual developmental disorder + microcephaly with pontine + cereb. hypoplasia (CASK)
- Intellectual developmental disorder, XL 107 (STEEP)
- Intellectual developmental disorder, XL 109 (AFF2)
- Intellectual developmental disorder, XL 50 (SYN1)
- Lissencephaly, XL (DCX)
- Mental retardation syndrome, XL, Siderius type (PHF8)
- Mental retardation, XL 1/78 (IQSEC2)
- Mental retardation, XL 104 (FRMPD4)
- Mental retardation, XL 106 (OGT)
- Mental retardation, XL 12/35 (THOC2)
- Mental retardation, XL 15 (CLCN4)
- Mental retardation, XL 21/34 (IL1RAPL1)
- Mental retardation, XL 29 and others (ARX)
- Mental retardation, XL 30/47 (PAK3)
- Mental retardation, XL 41 (GDI1)
- Mental retardation, XL 49 (CLCN4)
- Mental retardation, XL 58 (TSPAN)
- Mental retardation, XL 63 (ACSL4)
- Mental retardation, XL 72 (RAB39B)
- Mental retardation, XL 9/44 (FTSJ1)
- Mental retardation, XL 90 (DLG3)
- Mental retardation, XL 93 (BRWD3)
- Mental retardation, XL 96 (SYP)
- Mental retardation, XL 97 (ZNF711)
- Mental retardation, XL 98 (NEXMIF)
- Mental retardation, XL 99 (USP9X)
- Mental retardation, XL, syndromic 13 (MECP2)
- Mental retardation, with/-out nystagmus (CASK)
- Subcortical laminal heterotopia, XL (DCX)
- XL intellectual disability [MONDO:0100284, panelapp] (WNK3)
- XL
- XLR
- Multiple OMIM-Ps
Bioinformatik und klinische Interpretation
Test-Stärken
- DAkkS-akkreditiertes Labor
- EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
- Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
- Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
- Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
- eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
- unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
- unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
- unsere umfassenden klinischen Aussagen
Testeinschränkungen
- Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
- Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
- es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
- die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
- Gen-Konversionen
- komplexe Inversionen
- Balancierte Translokationen
- Mitochondriale Varianten
- Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
- nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
- niedriger Mosaik-Status
- Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
- Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
- Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
- Varianten innerhalb von Pseudogenen
- die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde
Laboranforderung
Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.
Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.
Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.
Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.