Klinische FragestellungMikrozephalie mit Holoprosenzephalie-Spektrum [incl. septooptischer Dysplasie]; Differentialdiagnose

Zusammenfassung

Kurzinformation

Umfassendes differentialdiagnostisches panel für Mikrozephalie bei Holoprosenzephalie-Spektrum (incl. septooptischer Dysplasie) mit 11 Leitlinien-kuratierten sowie insgesamt 14 kuratierten Genen gemäß klinischem Verdacht

MP1231

Anzahl Loci

Loci-Typ	Anzahl
Gen	14

Akkreditierte Untersuchung

Untersuchte Sequenzlänge

23,2 kb (Core-/Core-canditate-Gene)
38,8 kb (Erweitertes Panel: inkl. additional genes)

Analyse-Dauer

auf Anfrage

Untersuchungsmaterial

EDTA-Blut (3-5 ml)

Diagnostische Hinweise

NGS +

[Sanger]

Locipanel

Gen

Name	Exon-Länge (bp)	OMIM-G	Referenz-Seq.	Erbgang
CDON	3795	608707	NM_016952.5	AD
DISP1	4575	607502	NM_032890.5	AD
FGF8	735	600483	NM_033163.5	AD
FGFR1	2469	136350	NM_023110.3	AD
GLI2	4761	165230	NM_005270.5	AD
HESX1	558	601802	NM_003865.3	AD, AR
SHH	1389	600725	NM_000193.4	AD
SIX3	999	603714	NM_005413.4	AD
SUFU	1455	607035	NM_016169.4	AR, AD
TGIF1	819	602630	NM_173208.3	AD
ZIC2	1599	603073	NM_007129.5	AD
CNOT1	7401	604917	NM_001265612.2	AD
PTCH1	4344	601309	NM_000264.5	AD
STAG2	3807	300826	NM_001042749.2	XL

Infos zur Erkrankung

Klinischer Kommentar

Komplexe Hirnmissbildung infolge unvollständiger Spaltung des Prosenzephalons, die zwischen dem 18.-28. Tag der Schwangerschaft auftritt und sowohl Vorderhirn + Gesicht, neurologische Manifestationen + Gesichtsanomalien unterschiedlichen Schweregrads betrifft

Synonyme

Allelic: Growth hormone deficiency with pituitary anomalies (HESX1)
Allelic: Hypogonadotropic hypogonadism 2 with/-out anosmia (FGFR1)
Allelic: Jackson-Weiss syndrome (FGFR1)
Allelic: Microphthalmia with coloboma 5 (SHH)
Allelic: Osteoglophonic dysplasia (FGFR1)
Allelic: Pfeiffer syndrome (FGFR1)
Allelic: Pituitary hormone deficiency, combined, 5 (HESX1)
Allelic: Schizencephaly (SHH)
Allelic: Schizencephaly (SIX3)
Allelic: Single median maxillary central incisor (SHH)
Allelic: Trigonocephaly 1 (FGFR1)
Culler-Jones syndrome [hypopituitarism, mainly GH deficiency and/or postaxial polydactyly] (GLI2)
Encephalocraniocutaneous lipomatosis, somatic mosaic (FGFR1)
Hartsfield syndrome [holoprosencephaly, ectrodactyly, cleft/lip palate, mental retardation] (FGFR1)
Holoprosencephaly 11 (CDON)
Holoprosencephaly 12, with/-out pancreatic agenesis (CNOT1)
Holoprosencephaly 12, with/-out pancreatic agenesis (CNOT1) [not in TSO]
Holoprosencephaly 13 (STAG2)
Holoprosencephaly 2 (SIX3)
Holoprosencephaly 3 (SHH)
Holoprosencephaly 4 (TGIF1)
Holoprosencephaly 5 (ZIC2)
Holoprosencephaly 7 (PTCH1)
Holoprosencephaly 9 (GLI2)
Holoprosencephaly [Am J Med Genet 154C:52–61, 2010] (DISP1)
Hypogonadotropic hypogonadism 6 with/-out anosmia
Joubert syndrome 32 (SUFU)
Septooptic dysplasia (HESX1)
Vissers-Bodmer syndrome (CNOT1)

Erbgänge, Vererbungsmuster etc.

OMIM-Ps

Multiple OMIM-Ps

ICD10 Code

Bioinformatik und klinische Interpretation

Test-Stärken

DAkkS-akkreditiertes Labor
EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
unsere umfassenden klinischen Aussagen

Testeinschränkungen

Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
Gen-Konversionen
komplexe Inversionen
Balancierte Translokationen
Mitochondriale Varianten
Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
niedriger Mosaik-Status
Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
Varianten innerhalb von Pseudogenen
die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde

Laboranforderung

Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.
Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.
Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.
Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.