Klinische FragestellungMikrozephalie, primär/sekundär mit Wachstumsverzögerung; Differentialdiagnose
Zusammenfassung
Umfassendes differentialdiagnostisches panel für Mikrozephalie, primär oder sekundär bei Wachstumsverzögerung, mit 39 Leitlinien-kuratierten bzw. insgesamt 40 kurartierten Genen
- (Erweitertes Panel: inkl. additional genes)
- EDTA-Blut (3-5 ml)
NGS +
[Sanger]
Genpanel
Ausgewählte Gene
Name | Exon-Länge (bp) | OMIM-G | Referenz-Seq. | Erbgang |
---|---|---|---|---|
ASPM | 10434 | NM_018136.5 | AR | |
ATM | 9171 | NM_000051.4 | AR | |
ATR | 7935 | NM_001184.4 | AR | |
CDC6 | 1683 | NM_001254.4 | AR | |
CDT1 | 1641 | NM_030928.4 | AR | |
CENPJ | 4017 | NM_018451.5 | AR | |
CEP152 | 4965 | NM_014985.4 | AR | |
CEP63 | 2112 | NM_025180.5 | AR | |
CREBBP | 7329 | NM_004380.3 | AD | |
DHCR7 | 1428 | NM_001360.3 | AR | |
DNA2 | 3183 | NM_001080449.3 | AR | |
EP300 | 7245 | NM_001429.4 | AD | |
ERCC8 | 1191 | NM_000082.4 | AR | |
LIG4 | 2736 | NM_002312.3 | AR | |
MCPH1 | 2508 | NM_024596.5 | AR | |
NBN | 2265 | NM_002485.5 | AR | |
NHEJ1 | 900 | NM_024782.3 | AR | |
NIN | 4134 | NM_016350.5 | AR | |
NIPBL | 8415 | NM_133433.4 | AD | |
NSMCE2 | 1074 | NM_173685.4 | AR | |
ORC1 | 2586 | NM_004153.4 | AR | |
ORC4 | 1311 | NM_002552.5 | AR | |
ORC5 | 1512 | NM_002553.4 | n.k. | |
ORC6 | 759 | NM_014321.4 | AR | |
PCNT | 10011 | NM_006031.6 | AR | |
RAD21 | 1896 | NM_006265.3 | AD | |
RAD50 | 3939 | NM_005732.4 | AR | |
RBBP8 | 2694 | NM_002894.3 | AR | |
RNU4ATAC | 130 | NR_023343.1 | AR | |
SHH | 1389 | NM_000193.4 | AD | |
SIX3 | 999 | NM_005413.4 | AD | |
SMC1A | 3702 | NM_006306.4 | XL | |
SMC3 | 3654 | NM_005445.4 | AD | |
STIL | 3867 | NM_001048166.1 | AR | |
TRAIP | 1507 | NM_005879.3 | AR | |
TUBA1A | 1356 | NM_006009.4 | AD | |
TUBB2B | 1338 | NM_178012.5 | AD | |
VPS13B | 12069 | NM_017890.5 | AR | |
WDR62 | 4572 | NM_001083961.2 | AR | |
XRCC4 | 1005 | NM_003401.5 | AR |
Infos zur Erkrankung
Während primäre Mikrozephalie auf gestörter pränataler Hirnentwicklung beruht, entsteht sekundäre Mikrozephalie postnatal. Beide Formen reduzieren den okzipitofrontalen Kopfumfang signifikant unter dem Mittelwert für Alter und Geschlecht und sind mitunter mit intrauterinen Wachstumsstörungen und/oder Kleinwuchs assoziiert. Die Leitlinien „Klassifikation und Diagnostik der Mikrozephalie“ schreiben bei zusätzlichem Kleinwuchs explicit eine Reihe von Genen zur Untersuchung vor, die (einschließlich einer Tippfehler-Korrektur des Gens ORC5 in den Leitlinien -> korrekt ORC6) im panel enthalten sind. Bei Mikrozephalie mit Wachstumsverzögerung werden klassische autosomal dominante und rezessive Erbgänge beobachtet, multifaktorielle Geschehen erscheinen jedoch im Vordergrund. Die Diagnoseraten schwanken auch in dieser Mikrozephalie-Kategorie und sind vordringlich von den Indikationsstellungen und den klinischen Voruntersuchungs-Ergebnissen abhängig. Ein unauffälliger genetischer Befund bedeutet keinen Ausschluss der klinischen Verdachtsdiagnose.
Referenz: https: www.awmf.org/uploads/tx_szleitlinien/022-028l_S2k_Klassifikation_Diagnostik_Mikrozephalie_2019-11.pdf
- Allelic: Mungan syndrome (RAD21)
- Allelic: Pancreatic carcinoma, somatic (RBBP8)
- Allelic: Roifman syndrome (RNU4ATAC)
- Allelic: UV-sensitive syndrome 2 (ERCC8)
- Allelicc: Progressive external ophthalmoplegia with mitochondrial DNA deletions, AD 6 (DNA2)
- Ataxia-telangiectasia (ATM)
- Cockayne syndrome, type A (ERCC8)
- Cohen syndrome (VPS13B)
- Cornelia de Lange syndrome 1 (NIPBL)
- Cornelia de Lange syndrome 2 (SMC1A)
- Cornelia de Lange syndrome 3 (SMC3)
- Cornelia de Lange syndrome 4 (RAD21)
- Cortical dysplasia, complex, with other brain malformations 7 (TUBB2B)
- Developmental + epileptic encephalopathy 85, with/-out midline brain defects (SMC1A)
- Holoprosencephaly 2 (SIX3)
- Holoprosencephaly 3 (SHH)
- Jawad syndrome (RBBP8)
- LIG4 syndrome (LIG4)
- Lissencephaly 3 (TUBA1A)
- Lowry-Wood syndrome (RNU4ATAC)
- Meier-Gorlin syndrome 1 (ORC1)
- Meier-Gorlin syndrome 2 (ORC4)
- Meier-Gorlin syndrome 3 (ORC6)
- Meier-Gorlin syndrome 4 (CDT1)
- Meier-Gorlin syndrome 5 (CDC6)
- Menke-Hennekam syndrome 1 (BREBBP)
- Menke-Hennekam syndrome 2 (EP300)
- Microcephalic osteodysplastic primordial dwarfism, type I (RNU4ATAC)
- Microcephalic osteodysplastic primordial dwarfism, type II (PCNT)
- Microcephaly 1, primary, AR (MCPH1)
- Microcephaly 2, primary, AR, with/-out cortical malformations (WDR62)
- Microcephaly 5, primary, AR (ASPM)
- Microcephaly 6, primary, AR (CENPJ)
- Microcephaly 7, primary, AR (STIL)
- Microcephaly 9, primary, AR (CEP152)
- Nijmegen breakage syndrome (NBN)
- Nijmegen breakage syndrome-like disorder (RAD50)
- Rubinstein-Taybi syndrome 1 (CREBBP)
- Rubinstein-Taybi syndrome 2 (EP300)
- Schizencephaly (SIX3)
- Seckel syndrome 1 (ATR)
- Seckel syndrome 10 (NSMCE2)
- Seckel syndrome 2 (RBBP8)
- Seckel syndrome 4 (CENPJ)
- Seckel syndrome 5 (CEP152)
- Seckel syndrome 6 (CEP63)
- Seckel syndrome 7 (NIN)
- Seckel syndrome 8 (DNA2)
- Seckel syndrome 9 (TRAIP)
- Severe combined immunodef., microcephaly, growth retard., sensitivity to ionizing radiation (NHEJ1)
- Short stature, microcephaly + endocrine dysfunction (XRCC4)
- Smith-Lemli-Opitz syndrome (DHCR7)
- AD
- AR
- XL
- n.k.
- Multiple OMIM-Ps
Bioinformatik und klinische Interpretation
Test-Stärken
- DAkkS-akkreditiertes Labor
- EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
- Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
- Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
- Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
- eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
- unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
- unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
- unsere umfassenden klinischen Aussagen
Testeinschränkungen
- Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
- Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
- es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
- die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
- Gen-Konversionen
- komplexe Inversionen
- Balancierte Translokationen
- Mitochondriale Varianten
- Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
- nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
- niedriger Mosaik-Status
- Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
- Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
- Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
- Varianten innerhalb von Pseudogenen
- die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde
Laboranforderung
Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.
Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.
Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.
Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.