Klinische FragestellungOptikus-Atrophie, hereditäre; Differentialdiagnose
Zusammenfassung
Umfassendes differentialdiagnostisches panel für Optikus-Atrophie, hereditäre, mit 3 Leitlinien-kuratierten, 12 "core candidate"- Genen und zusammen genommen 40 kuratierten Genen gemäß klinischer Verdachtsdiagnose
51,6 kb (Erweitertes Panel: inkl. additional genes)
- EDTA-Blut (3-5 ml)
NGS +
[Sanger]
Genpanel
Ausgewählte Gene
Name | Exon-Länge (bp) | OMIM-G | Referenz-Seq. | Erbgang |
---|---|---|---|---|
ACO2 | 2343 | NM_001098.3 | AR, AD | |
AFG3L2 | 2394 | NM_006796.3 | AD, AR | |
CISD2 | 408 | NM_001008388.5 | AR | |
DNAJC30 | 681 | NM_032317.3 | AR | |
MFN2 | 2274 | NM_014874.4 | AR, AD | |
MTRFR | 501 | NM_152269.5 | AR | |
NR2F1 | 1272 | NM_005654.6 | AD | |
OPA1 | 2883 | NM_015560.3 | AD, AR | |
OPA3 | 540 | NM_025136.4 | AD, AR | |
POLG | 3720 | NM_002693.3 | AD, AR | |
SLC25A46 | 1257 | NM_138773.4 | AR | |
SLC52A2 | 1338 | NM_024531.5 | AR | |
SPG7 | 2388 | NM_003119.4 | AD, AR | |
TMEM126A | 588 | NM_032273.4 | AR | |
AP3B2 | 3249 | NM_004644.5 | AR | |
ATAD3A | 1761 | NM_001170535.3 | AD | |
ATG7 | 2031 | NM_001136031.3 | AR | |
C19orf12 | 459 | NM_001031726.3 | AR, AD | |
DNM1L | 2211 | NM_012062.5 | AD | |
FDX2 | 566 | NM_001031734.4 | AR | |
HIKESHI | 647 | NM_016401.4 | AR | |
MAG | 1806 | NM_001199216.2 | AR | |
MFF | 1029 | NM_020194.5 | AR | |
NBAS | 7116 | NM_015909.4 | AR | |
NDUFA12 | 438 | NM_018838.5 | AR | |
SLC44A1 | 2345 | NM_080546.5 | AR | |
SSBP1 | 447 | NM_001256510.1 | AD, AR | |
TFG | 1203 | NM_006070.6 | AR | |
TIMM8A | 294 | NM_004085.4 | XLR | |
UCHL1 | 672 | NM_004181.5 | AR | |
WFS1 | 2673 | NM_006005.3 | AD, AR |
Infos zur Erkrankung
Optikus-Atrophie bzw. Optikus-Neuropathie ist das Endstadium eines Krankheitsprozesses, der den retinogenen Teil der Sehbahn durch neurovaskuläre Degeneration betrifft. Auch die hereditären Optikus-Neuropathien sind durch Degeneration der retinalen Ganglienzellen gekennzeichnet, was zur bilateralen Optikus-Atrophie und fortschreitendem Verlust der Sehschärfe führt. Zusätzlich leiden diese Patienten häufig an gestörten Farbsehen. Die häufigsten Formen hereditärer Optikus-Neuropathien sind die dominante Optikus-Atrophie und die Leber hereditäre Optikus-Neuropathie. Bei beiden Erkrankungen ist die neuronale und axonale Energieversorgung durch die Mitochondrien betroffen. Optikus-Atrophie kann in jedem Lebensalter eintreten, alle klassischen Erbgänge sind vertreten. Die DNA-diagnostische Ausbeute erreicht ca. 20%. Unauffällige molekulargenetische Befunde bedeuten daher keinen Ausschluss der ophthalmologischen Verdachtsdiagnose.
Referenz: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1248/
- Sympt.: Color vision deficits + centrocecal scotoma of variable density
- Sympt.: Visual impairment in early childhood, loss of visual acuity, temporal optic disc pallor
- Alias: Lebersche hereditäre Optikusatrophie (LHON)
- Alias: Optic atrophy
- Alias: Optic neuropathy
- Allelic: 3-methylglutaconic aciduria, type III (OPA3)
- Allelic: Cataract 41 (WFS1)
- Allelic: Charcot-Marie-Tooth disease, axonal, types 2A2A + 2A2B (MFN2)
- Allelic: Deafness, AD 6, 14, 38
- Allelic: Diabetes mellitus, noninsulin-dependent, association with (WFS1)
- Allelic: Encephalopathy, lethal, due to defective mitochondrial peroxisomal fission 1 (DNM1L)
- Allelic: Epileptic encephalopathy, early infantile, 48 (AP3B2)
- Allelic: Glaucoma, normal tension, susceptibility to (OPA1)
- Allelic: Hemolytic anemia due to hexokinase deficiency (HK1)
- Allelic: Hereditary motor + sensory neuropathy, Okinawa type (TFG)
- Allelic: Mitochondrial AR ataxia syndrome, includes SANDO + SCAE (POLG)
- Allelic: Mitochondrial DNA depletion syndrome 14, encephalocardiomyopathic type (OPA1)
- Allelic: Mitochondrial DNA depletion syndrome 4A, Alpers + 4B, MNGIE type (POLG)
- Allelic: Progressive external ophthalmoplegia, AR 1
- Allelic: Retinitis pigmentosa 79 (HK1)
- Allelic: Spastic ataxia 5, AR (AFG3L2)
- Allelic: Spastic paraplegia 55, AR (C12orf65)
- Allelic: Spinocerebellar ataxia 28 (AFG3L2)
- Arts syndrome (PRPS1)
- Auditory neuropathy + optic atrophy (FDXR)
- Behr syndrome (OPA1)
- Bosch-Boonstra-Schaaf optic atrophy syndrome (NR2F1)
- Brown-Vialetto-Van Laere syndrome 2 (SLC52A2)
- Coenzyme Q10 deficiency, primary, 2 (PDSS1)
- Combined oxidative phosphorylation deficiency 7 (C12orf65)
- Dystonia, childhood-onset, with optic atrophy + basal ganglia abnormalities (MECR)
- Encephalopathy due to defective mitochondrial + peroxisomal fission 2 (MFF)
- Friedreich ataxia (FXN)
- Harel-Yoon syndrome (ATAD3A)
- Hereditary motor + sensory neuropathy VIA (MFN2)
- Infantile cerebellar-retinal degeneration (ACO2)
- Leukodystrophy, hypomyelinating, 13 (HIKESHI)
- Leukodystrophy, hypomyelinating, 15 (EPRS1)
- Mitochondrial complex I deficiency, nuclear type 23 (NDUFA12)
- Mitochondrial complex I deficiency, nuclear type 5 (NDUFS1)
- Mitochondrial myopathy, episodic, with optic atrophy + reversible leukoencephalopathy (FDX2/FDX1L)
- Mohr-Tranebjaerg syndrome (TIMM8A)
- Multiple mitochondrial dysfunctions syndrome 4 (ISCA2)
- Neurodegeneration with brain iron accumulation 4 (19orf12)
- Neurodegeneration, childhood-onset, ataxia, tremor, optic atrophy, cognitive decline (SLC44A1)
- Neurodevelopmental disorder with visual defects + brain anomalies (HK1)
- Neuropathy, hereditary motor + sensory, Russe type (HK1)
- Neuropathy, hereditary motor + sensory, type VIB (SLC25A46)
- Optic atrophy 1 (OPA1)
- Optic atrophy 10 with/-out ataxia, mental retardation + seizures (RTN4IP1)
- Optic atrophy 12 (AFG3L2)
- Optic atrophy 13 with retinal + foveal abnormalities (SSBP1)
- Optic atrophy 3 with cataract (OPA3)
- Optic atrophy 5 (DNM1L)
- Optic atrophy 7 (TMEM126A)
- Optic atrophy 9 (ACO2)
- Optic atrophy plus syndrome (OPA1)
- Progressive external ophthalmoplegia, AD 1 (POLG)
- ROSAH [Retinal dystr., Opticus edema, Splenomegaly, Anhidrosis, migraine Headache] syndrome (ALPK1)
- Severe ID, global developmental delay, epilepsy [panelapp] (BLOC1S1)
- Short stature, optic nerve atrophy + Pelger-Huet anomaly (NBAS)
- Spastic ataxia 4, AR (MTPAP)
- Spastic paraplegia 35, AR (FA2H)
- Spastic paraplegia 43, AR (C19orf12)
- Spastic paraplegia 57, AR (TFG)
- Spastic paraplegia 7, AR (SPG7)
- Spastic paraplegia 75, AR (MAG)
- Spastic paraplegia 79, AR (UCHL)
- Spinocerebellar ataxia, AR 31 (ATG7)
- Wolfram syndrome 1 (WFS1)
- Wolfram syndrome 2 (CISD2)
- Wolfram-like syndrome, AD (WFS1)
- AD
- AR
- XLR
- Multiple OMIM-Ps
Bioinformatik und klinische Interpretation
Test-Stärken
- DAkkS-akkreditiertes Labor
- EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
- Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
- Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
- Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
- eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
- unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
- unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
- unsere umfassenden klinischen Aussagen
Testeinschränkungen
- Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
- Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
- es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
- die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
- Gen-Konversionen
- komplexe Inversionen
- Balancierte Translokationen
- Mitochondriale Varianten
- Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
- nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
- niedriger Mosaik-Status
- Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
- Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
- Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
- Varianten innerhalb von Pseudogenen
- die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde
Laboranforderung
Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.
Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.
Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.
Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.