Klinische FragestellungPränatal auffälliger Balken, Differentialdiagnose
Zusammenfassung
Umfassendes differentialdiagnostisches panel für Pränatal auffälliger Balken mit 44 bzw. zusammen genommen 117 kuratierten Genen gemäß klinischer Verdachtsdiagnose
259,0 kb (Erweitertes Panel: inkl. additional genes)
- Chorionzotten (CVS)
- Fruchtwasser (nach AC)
- Nabelschnurblut (NB)
NGS +
[Sanger]
Genpanel
Ausgewählte Gene
Name | Exon-Länge (bp) | OMIM-G | Referenz-Seq. | Erbgang |
---|---|---|---|---|
AKT3 | 1440 | NM_005465.7 | AD | |
ANOS1 | 2043 | NM_000216.4 | XLR | |
ARID1A | 6858 | NM_006015.6 | AD | |
ARID1B | 6750 | NM_001374820.1 | AD | |
CCND2 | 870 | NM_001759.4 | AD | |
CDON | 3795 | NM_016952.5 | AD | |
DCX | 1083 | NM_178153.3 | XL | |
DYNC1H1 | 13941 | NM_001376.5 | AD | |
EPG5 | 7740 | NM_020964.3 | AR | |
FOXG1 | 1470 | NM_005249.5 | AD | |
GLDC | 3063 | NM_000170.3 | AR | |
GLI2 | 4761 | NM_005270.5 | AD | |
HCCS | 807 | NM_005333.5 | XL | |
L1CAM | 3774 | NM_000425.5 | XLR | |
LRP2 | 13968 | NM_004525.3 | AR | |
MED12 | 6534 | NM_005120.3 | XLR | |
MID1 | 2004 | NM_000381.4 | XLR | |
NDE1 | 1008 | NM_001143979.2 | AR | |
PAFAH1B1 | 1233 | NM_000430.4 | AD | |
PAX6 | 1269 | NM_000280.5 | AD | |
PTCH1 | 4344 | NM_000264.5 | AD | |
RAB18 | 621 | NM_021252.5 | AR | |
RAB3GAP1 | 2946 | NM_012233.3 | AR | |
RAB3GAP2 | 4182 | NM_012414.4 | AR | |
RELN | 10383 | NM_005045.4 | AR | |
SHH | 1389 | NM_000193.4 | AD | |
SIX3 | 999 | NM_005413.4 | AD | |
SLC12A6 | 3453 | NM_133647.2 | AR | |
SMARCA2 | 4773 | NM_003070.5 | AD | |
SMARCA4 | 5040 | NM_001128849.3 | AD | |
SMARCB1 | 1158 | NM_003073.5 | AD | |
SMARCE1 | 1236 | NM_003079.5 | AD | |
SPG11 | 7332 | NM_025137.4 | AD | |
TBCD | 7465 | NM_005993.5 | AR | |
TGIF1 | 819 | NM_173208.3 | AD | |
TUBA1A | 1356 | NM_006009.4 | AD | |
TUBA8 | 1350 | NM_018943.3 | AR | |
TUBB | 1335 | NM_178014.4 | AD | |
TUBB2A | 1338 | NM_001069.3 | AD | |
TUBB2B | 1338 | NM_178012.5 | AD | |
UPF3B | 1452 | NM_080632.3 | XLR | |
ZEB2 | 3645 | NM_014795.4 | AD | |
ZIC2 | 1599 | NM_007129.5 | AD | |
ARID2 | 5508 | NM_152641.4 | AD | |
B9D2 | 528 | NM_030578.4 | AR | |
C12orf57 | 381 | NM_138425.4 | AR | |
CDK5 | 783 | NM_001164410.3 | AR | |
CDK5RAP2 | 5682 | NM_018249.6 | AR | |
CTNNA2 | 2583 | NM_001164883.2 | AR | |
DCC | 4344 | NM_005215.4 | AR | |
DHCR7 | 1428 | NM_001360.3 | AR | |
DISC1 | 2499 | NM_001012957.2 | AD | |
EOMES | 2118 | NM_001278182.2 | AR | |
FGFR2 | 2466 | NM_000141.5 | AD | |
FRMD4A | 4028 | NM_018027.5 | AR | |
GCSH | 522 | NM_004483.5 | AR | |
GLI3 | 4743 | NM_000168.6 | AD | |
KATNB1 | 1968 | NM_005886.3 | AR | |
KIF1A | 5073 | NM_004321.8 | AD, AR | |
KIF2A | 2235 | NM_001098511.3 | AD | |
KIF5C | 2874 | NM_004522.3 | AD | |
KIF7 | 4032 | NM_198525.3 | AR | |
LAMB1 | 5361 | NM_002291.3 | AR | |
MACF1 | 16293 | NM_012090.5 | AD | |
PAK3 | 1635 | NM_002578.5 | XLR | |
PDHB | 1080 | NM_000925.4 | AR | |
PTPN11 | 1782 | NM_002834.5 | AD | |
SZT2 | 10128 | NM_015284.4 | AR | |
TMTC3 | 2745 | NM_181783.4 | AR | |
TUBB3 | 1353 | NM_006086.4 | AD | |
TUBG1 | 1356 | NM_001070.5 | AD | |
VAX1 | 1005 | NM_001112704.2 | AR | |
YWHAE | 768 | NM_006761.5 | AD | |
ZNF462 | 7716 | NM_021224.6 | AD |
Infos zur Erkrankung
Auffälligkeiten des Corpus Callosum (ACC) sind häufige Fehlbildungen im Gehirn und gewöhnlich nach der 20. Schwangerschaftswoche zu diagnostizieren. Föten mit isolierten ACC haben eine bessere Prognose als solche mit zusätzlichen Anomalien. Allerdings machen die unvorhersehbaren neurologischen Entwicklungsergebnisse der isolierten ACC die pränatale Beratung zu einer besonderen Herausforderung. ACC sind heterogene Erkrankungen, die als Manifestation im Rahmen von >200 genetisch bedingten Syndromen auftreten können und insbesondere auch in Assoziation mit größeren Fehlbildungen des embryonalen Vorderhirns beobachtet werden. Zu den häufigsten postnatalen Befunden bei Patienten mit ACC gehören mentale Retardierung, Sehstörungen, Sprachverzögerung und Krampfanfälle. Selbst bei Fällen ohne Entwicklungsverzögerung und normaler Intelligenz sind leichte Verhaltens- oder soziale Probleme sowie ADHS beschrieben. Genetische Faktoren sind sehr häufig. Bei den genetischen Ursachen wird in 30-45% der Fälle eine "syndromale Diagnose" gestellt, und in 20-35% kann eine monogene Ursache ermittelt werden. Die zahlreichen genetischen Ursachen von ACC gehen mit autosomal-dominantem, autosomal-rezessivem und X-chromosomalem Erbgang einher. Ein negatives molekulargenetisches Ergebnis stellt keinen Ausschluss der klinischen Diagnose dar.
Referenz: https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/B9780323371018000333?via%3Dihub
- Agenesis of the corpus callosum with peripheral neuropathy (SLC12A6)
- Allelic: Charcot-Marie-Tooth disease, axonal, type 2O (DYNC1H1)
- Allelic: Charcot-Marie-Tooth disease, axonal, type 2X (SPG11)
- Allelic: Metachondromatosis (PTPN11)
- Allelic: Neuropathy, hereditary sensory, type IIC (KIF1A)
- Allelic: Rigidity + multifocal seizure syndrome, lethal neonatal (BRAT1)
- Allelic: Spastic paraplegia 30, AD (KIF1A)
- Allelic: Spastic paraplegia 30, AR (KIF1A)
- Allelic: Spinal muscular atrophy, lower extremity-predominant 1, AD (DYNC1H1)
- Amyotrophic lateral sclerosis 5, juvenile (SPG11)
- Aniridia (PAX6)
- Anterior segment dysgenesis 5, multiple subtypes (PAX6)
- Aqueductal stenosis [panelapp] (SMARCC1)
- Bainbridge-Ropers syndrome (ASXL3)
- Basal cell nevus syndrome (PTCH1)
- Blepharophimosis-impaired intellectual development syndrome (SMARCA2)
- CRASH syndrome (L1CAM)
- Cataract with late-onset corneal dystrophy (PAX6)
- Coffin-Siris syndrome 1 (ARID1B)
- Coffin-Siris syndrome 2 (ARID1A)
- Coffin-Siris syndrome 3 (SMARCB1)
- Coffin-Siris syndrome 4 (SMARCA4)
- Coffin-Siris syndrome 5 (SMARCE1)
- Coloboma of optic nerve (PAX6)
- Coloboma, ocular (PAX6)
- Congenital hydrocephalus [panelapp] (SMARCC1)
- Corpus callosum abnormalities [panelapp] (SMARCC1)
- Corpus callosum, agenesis of, with facial anomalies, cerebellar ataxia (FRMD4A)
- Corpus callosum, partial agenesis of (L1CAM)
- Cortical dysplasia, complex, with other brain malformations 5 (TUBB2A)
- Cortical dysplasia, complex, with other brain malformations 6 ITUBB)
- Cortical dysplasia, complex, with other brain malformations 7 (TUBB2B)
- Culler-Jones syndrome (GLI2)
- Developmental + epileptic encephalopathy 1 (ARX)
- Donnai-Barrow syndrome (LRP2)
- Encephalopathy, progressive, early-onset, brain atrophy, thin corpus callosum (TBCD)
- Epilepsy, familial temporal lobe, 7 (RELN)
- Foveal hypoplasia 1 (PAX6)
- Glycine encephalopathy (GLDC)
- Hardikar syndrome (MED12)
- Holoprosencephaly 11 (CDON)
- Holoprosencephaly 2 (SIX3)
- Holoprosencephaly 3 (SHH)
- Holoprosencephaly 4 (TGIF1)
- Holoprosencephaly 5 (ZIC2)
- Holoprosencephaly 7 (PTCH1)
- Holoprosencephaly 9 (GLI2)
- Hydranencephaly with abnormal genitalia (ARX)
- Hydrocephalus due to aqueductal stenosis (L1CAM)
- Hydrocephalus with Hirschsprung disease (L1CAM)
- Hydrocephalus with congenital idiopathic intestinal pseudoobstruction (L1CAM)
- Hypogonadotropic hypogonadism 1 with/-out anosmia, Kallmann syndrome 1 (ANOS1)
- Intellectual developmental disorder with dysmorphic facies + ptosis (BRPF1)
- Intellectual developmental disorder, AD 13 (DYNC1H1)
- Intellectual developmental disorder, AD 36 (PPPR1A)
- Intellectual developmental disorder, XL 29 (ARX)
- Intellectual developmental disorder, XL syndromic 14 (UPFB)
- Intellectual developmental disorder, XL syndromic, Stocco dos Santos type (SHROOM4)
- Keratitis (PAX6)
- Koolen-De Vries syndrome (KANSL1)
- LEOPARD syndrome 1 (PTPN11)
- Linear skin defects with multiple congenital anomalies 1 (HCCS)
- Lissencephaly 1 (PAFAH1B1)
- Lissencephaly 2, Norman-Roberts type (RELN)
- Lissencephaly 3 (TUBA1A)
- Lissencephaly 4, with microcephaly (NDE1)
- Lissencephaly, XL (DCX)
- Lissencephaly, XL 2 (ARX)
- Lujan-Fryns syndrome (MED12)
- MASA syndrome (L1CAM)
- Macrothrombocytopenia, isolated, 2, AD (TUBA8)
- Martsolf syndrome 1 (RAB3GAP2)
- Martsolf syndrome 2 (RAB3GAP1)
- Megalencephaly-polymicrogyria-polydactyly-hydrocephalus syndrome 2 (AKT3)
- Megalencephaly-polymicrogyria-polydactyly-hydrocephalus syndrome 3 (CCND2)
- Meningioma, familial, susceptibility to (SMARCE1)
- Microcephaly, short stature + polymicrogyria with seizures (RTTN)
- Microhydranencephaly (NDE1)
- Microphthalmia with coloboma 5 (SHH)
- Morning glory disc anomaly (PAX6)
- Mowat-Wilson syndrome (ZEB2)
- NESCAV syndrome (KIF1A)
- Neurodevelopmental disorder with cerebellar atrophy with/-out seizures (BRAT1)
- Nicolaides-Baraitser syndrome (SMARCA2)
- Noonan syndrome 1 (PTPN11)
- Ohdo syndrome, XL (MED12)
- Opitz GBBB syndrome (MID1)
- Opitz-Kaveggia syndrome (MED12)
- Optic nerve hypoplasia (PAX6)
- Partington syndrome (ARX)
- Prenatally unusual structure of the corpus callosum
- Primrose syndrome (ZBTB20)
- Proud syndrome (ARX)
- Rett syndrome, congenital variant (FOXG1)
- Rhabdoid tumor predisposition syndrome 1 (SMARCB1)
- Rhabdoid tumor predisposition syndrome 2 (SMARCA4)
- Schizencephaly (SHH)
- Schizencephaly (SIX3)
- Schwannomatosis-1, susceptibility to (SMARCB1)
- Septal agenesis [panelapp] (SMARCC1)
- Single median maxillary central incisor (SHH)
- Spastic paraplegia 11, AR (SPG11)
- Subcortical laminal heterotopia, XL (DCX)
- Subcortical laminar heterotopia (PAFAH1B1)
- Symmetric circumferential skin creases, congenital, 1 ITUBB)
- Vici syndrome (EPG5)
- Warburg micro syndrome 1 (RAB3GAP1)
- Warburg micro syndrome 2 (RAB3GAP2)
- Warburg micro syndrome 3 (RAB18)
- Weiss-Kruszka syndrome (ZNF462)
- AD
- AR
- XL
- XLR
- Multiple OMIM-Ps
Bioinformatik und klinische Interpretation
Test-Stärken
- DAkkS-akkreditiertes Labor
- EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
- Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
- Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
- Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
- eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
- unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
- unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
- unsere umfassenden klinischen Aussagen
Testeinschränkungen
- Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
- Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
- es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
- die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
- Gen-Konversionen
- komplexe Inversionen
- Balancierte Translokationen
- Mitochondriale Varianten
- Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
- nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
- niedriger Mosaik-Status
- Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
- Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
- Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
- Varianten innerhalb von Pseudogenen
- die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde
Laboranforderung
Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.
Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.
Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.
Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.