Klinische FragestellungPränatale VATER/VACTERL-Assoziation, Differentialdiagnose
Zusammenfassung
Umfassendes differentialdiagnostisches panel für Pränatale VATER/VACTERL-Assoziation mit 11 "core candidate"-Genen bzw. insgesamt 44 kuratierten Genen gemäß klinischer Verdachtsdiagnose
41,9 kb (Erweitertes Panel: inkl. additional genes)
- Chorionzotten (CVS)
- Fruchtwasser (nach AC)
- Nabelschnurblut (NB)
NGS +
[Sanger]
Genpanel
Ausgewählte Gene
Name | Exon-Länge (bp) | OMIM-G | Referenz-Seq. | Erbgang |
---|---|---|---|---|
CHD7 | 8994 | NM_017780.4 | AD | |
EFTUD2 | 2919 | NM_004247.4 | AD | |
FANCB | 2580 | NM_001018113.3 | Ass | |
HAAO | 871 | NM_012205.3 | AR | |
KYNU | 924 | NM_001032998.2 | AR | |
MYCN | 1395 | NM_005378.6 | AD | |
SALL1 | 3975 | NM_002968.3 | AD | |
SALL4 | 3162 | NM_020436.5 | AD | |
TBX5 | 1557 | NM_000192.3 | AD | |
TRAP1 | 2115 | NM_016292.3 | AR | |
ZIC3 | 1404 | NM_003413.4 | XLR | |
CHD4 | 5739 | NM_001273.5 | AD | |
FGF10 | 627 | NM_004465.2 | AD | |
FGF8 | 735 | NM_033163.5 | AD | |
HOXA13 | 1167 | NM_000522.5 | AD | |
PUF60 | 1551 | NM_078480.3 | AD | |
TBX3 | 2172 | NM_005996.4 | AD |
Infos zur Erkrankung
Patienten mit VACTERL- (Vertebrale Defekte, Analatresie, Herzfehler, Tracheo-Ösophagus-Fistel, Nieren- und Gliedmaßen-Anomalien) Assoziation haben postnatal typischerweise mindestens 3 dieser charakteristischen Merkmale. Betroffene Personen können zusätzliche Symptome neben der Assoziation aufweisen. Wirbelsäulendefekte werden bei 60-80% der Personen mit VACTERL-Assoziation beobachtet, einschließlich verschmolzener Wirbel, fehlender oder zusätzlicher Wirbel. 60-90% dieser Patienten haben eine Anal-Verengung oder -Atresie, manchmal zusammen mit urogenitalen Fehlbildungen. Kardiale Defekte treten bei 40-80% der Patienten auf, wobei der Schweregrad von lebensbedrohlich bis zu subtilen Defekten reicht. 50-80% der Betroffenen weisen tracheo-ösophageale Fisteln auf. Nierenanomalien treten bei 50-80% auf, z.B. ein- oder beidseitige Nierenaplasie oder fehlentwickelte Nieren mit eingeschränkter Funktion. Gliedmaßen-Anomalien werden bei 40-50% der Patienten gesehen. Zu diesen Anomalien gehören häufig fehlentwickelte oder fehlende Daumen oder Unterarme und Hände. Einige der Merkmale der VACTERL-Assoziation können minimal ausgeprägt sein und werden daher erst später in der Kindheit oder im Erwachsenenalter erkannt. Die meisten Fälle treten sporadisch auf. Einige wenige betroffene Personen haben Familienmitglieder mit nur 1-2 Merkmalen. In diesen Familien fehlt oft ein klares Vererbungsmuster. Mehrere genetische und umweltbedingte Faktoren spielen wahrscheinlich eine Rolle bei der Bestimmung des Risikos für diese Erkrankung bzw. deren Ausprägung. Wenngleich das mittels Ultaschall ermittelte Spektrum der klinischen Symptome bei pränataler VACTERL-Assoziation naturgemäß weniger extensiv untersucht ist, ähneln die Anteile denen der postnatalen VACTERL-Verteilung: Wirbelsäulendefekte (>40%), Anal-Atresie ( ̴ 30%), kardiale Defekte (>70%), tracheo-ösophageale Fisteln ( ̴ 30%), Nierenfehlbildungen (>60%), Gliedmaßen-Fehlbildungen ( ̴ 40%) und 3 oder mehr schwerwiegende Auffälligkeiten (>90%).
Referenz: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK5192/
- Sympt.: VATER = Vertebral defefects [V], Anal atresia [A]...
- Sympt.: VACTERL = VATER + Cardiac malformations + Limb anomalies
- ...Tracheoesophageal fistula [T]- Esophageal atresia [E], Radial/Renal dysplasia [R]
- CHARGE syndrome: Coloboma [C], Heart defect [H], Atresia choanae [A] ...
- ... Retarded growth + development [R], Genital hypoplasia [G], Ear anomalies/deafness [E]
- Allelic: Aplasia of lacrimal + salivary glands (FGF19)
- Allelic: Congenital heart defects, nonsyndromic, 1, XL (ZIC3)
- Allelic: Duane-radial ray syndrome (SALL4)
- Allelic: Hand-foot-uterus syndrome (HOXA13)
- Allelic: Heterotaxy, visceral, 1, XL (ZIC3)
- Allelic: Hydroxykynureninuria (KYNU)
- Allelic: Hypogonadotropic hypogonadism 5 with/-out anosmia (CHD7)
- Allelic: Leukemia, acute promyelocytic (RARA)
- Allelic: Polydactyly, postaxial, types A1 + B (GLI3)
- Allelic: Polydactyly, preaxial, type IV (GLI3)
- Allelic: Retinitis pigmentosa 71 (IFT172)
- Allelic: Schizencephaly (SHH)
- Allelic: Single median maxillary central incisor (SHH)
- Alveolar capillary dysplasia with misalignment of pulmonary veins (FOXF1)
- Amelia, posterior, with pelvic + pulmonary hypoplasia syndrome (TBX4)
- Bardet-Biedl syndrome 20 (IFT172)
- CHARGE syndrome (VHD7)
- COACH syndrome 2 (CC2D2A)
- Caudal duplication anomaly (AXIN1)
- Cranioectodermal dysplasia 2 (WDR35)
- Cryptophthalmos, unilateral or bilateral, isolated (FREM2)
- Culler-Jones syndrome (GLI2)
- Fanconi anemia, complementation group A (FANCA)
- Fanconi anemia, complementation group B (FANCB)
- Fanconi anemia, complementation group C (FANCC)
- Fanconi anemia, complementation group D2 (FANCD2)
- Fanconi anemia, complementation group E (FANCE)
- Fanconi anemia, complementation group F (FANCF)
- Feingold syndrome 1 (MYCN)
- Fraser syndrome 2 (FREM2)
- Greig cephalopolysyndactyly syndrome (GLI3)
- Guttmacher syndrome (HOXA13)
- Holoprosencephaly 3 (SHH)
- Holoprosencephaly 9 (GLI2)
- Holt-Oram syndrome (TBX5)
- Hypogonadotropic hypogonadism 6 with/-out anosmia (FGF8)
- IVIC syndrome (SALL4)
- Ischiocoxopodopatellar syndrome with/-out pulmonary arterial hypertension (TBX4)
- Joubert syndrome 27 (B9D1)
- Joubert syndrome 9 (CC2D2A)
- LADD syndrome (FGF10)
- Mandibulofacial dysostosis, Guion-Almeida type (EFTUD2)
- Meckel syndrome 6 (CC2D2A)
- Meckel syndrome 9 (B9D1)
- Microphthalmia with coloboma 5 (SHH)
- Microphthalmia, syndromic 12 (RARB)
- Microphthalmia, syndromic 3 (SOX2)
- Mitchell-Riley s. [cong. diab., pancr. hypopl., intest. atresia, gallbladder a-/hypoplasia] (RFX6)
- Opitz GBBB syndrome, type I (MID1)
- Optic nerve hypoplasia + abnormalities of the central nervous system (SOX2)
- Pallister-Hall syndrome (GLI3)
- Pancreatic agenesis 2 (PTF1A)
- Pancreatic and cerebellar agenesis (PTF1A)
- Robinow syndrome, AD 1 (WNT5A)
- Short-rib thoracic dysplasia 10 with/-out polydactyly (IFT172)
- Short-rib thoracic dysplasia 3 with/-out polydactyly (DYNC2H1)
- Short-rib thoracic dysplasia 7 with/-out polydactyly (WDR35)
- Sifrim-Hitz-Weiss syndrome (CHD4)
- Townes-Brocks branchiootorenal-like syndrome (SALL1)
- Townes-Brocks syndrome 1 (SALL1)
- Townes-Brocks syndrome 2 (DACT1)
- Ulnar-mammary syndrome (TBX3)
- VACTERL association, XL (ZIC3)
- Verheij syndrome (PUF60)
- Vertebral, cardiac, renal + limb defects syndrome 1 (HAAO)
- Vertebral, cardiac, renal + limb defects syndrome 2 (KYNU)
- AD
- AR
- Ass
- XLR
- Multiple OMIM-Ps
Bioinformatik und klinische Interpretation
Test-Stärken
- DAkkS-akkreditiertes Labor
- EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
- Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
- Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
- Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
- eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
- unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
- unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
- unsere umfassenden klinischen Aussagen
Testeinschränkungen
- Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
- Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
- es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
- die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
- Gen-Konversionen
- komplexe Inversionen
- Balancierte Translokationen
- Mitochondriale Varianten
- Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
- nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
- niedriger Mosaik-Status
- Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
- Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
- Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
- Varianten innerhalb von Pseudogenen
- die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde
Laboranforderung
Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.
Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.
Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.
Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.