Klinische FragestellungPränatales Noonan-Syndromspektrum, Differentialdiagnose
Zusammenfassung
Umfassendes differentialdiagnostisches panel für Pränatales Noonan-Syndromspektrum mit 14 "core candidate"-Genen bzw. zusammen genommen 21 kuratierten Genen gemäß klinischer Verdachtsdiagnose
43,2 kb (Erweitertes Panel: inkl. additional genes)
- Chorionzotten (CVS)
- Fruchtwasser (nach AC)
- Nabelschnurblut (NB)
NGS +
[Sanger]
Genpanel
Ausgewählte Gene
Name | Exon-Länge (bp) | OMIM-G | Referenz-Seq. | Erbgang |
---|---|---|---|---|
BRAF | 2301 | NM_004333.6 | AD | |
CBL | 2721 | NM_005188.4 | AD | |
HRAS | 570 | NM_005343.4 | AD | |
KRAS | 567 | NM_004985.5 | AD | |
LZTR1 | 2523 | NM_006767.4 | AD, AR | |
MAP2K1 | 1182 | NM_002755.4 | AD | |
MAP2K2 | 1203 | NM_030662.4 | AD | |
NRAS | 570 | NM_002524.5 | AD | |
PTPN11 | 1782 | NM_002834.5 | AD | |
RAF1 | 1947 | NM_002880.4 | AD | |
RIT1 | 660 | NM_006912.6 | AD | |
RRAS2 | 384 | NM_012250.6 | AD | |
SOS1 | 4002 | NM_005633.4 | AD | |
SOS2 | 3999 | NM_006939.4 | AD | |
KAT6B | 6222 | NM_012330.4 | AD | |
MRAS | 636 | NM_001085049.3 | AD | |
NF1 | 8457 | NM_001042492.3 | AD | |
PPP1CB | 350 | NM_002709.3 | AD | |
SHOC2 | 1749 | NM_007373.4 | AD | |
SPRED1 | 1335 | NM_152594.3 | AD |
Infos zur Erkrankung
Das Noonan-Syndrom verursacht zahlreiche Gesundheits-Probleme und morphologische Stigmata. Zu den häufigsten Merkmalen gehören eine ungewöhnliche Fazies (breite Stirn, hängende Augenlider, Telecanthus), Kleinwuchs und Herzfehler. Die Erkrankung beginnt pränatal, obwohl mildere Fälle erst im Kindesalter diagnostiziert werden. In der Pränatal-Phase können bei den betroffenen Föten erhöhte Nackentransparenz, Hygroma colli, Hydrops fetalis, angeborene Herz- und Nierenfehler und größere Fruchtwasser-Mengen beobachtet werden. Später treten zusätzlich hypertrophe Kardiomyopathie, variable kognitive Defizite sowie Skelett-, ektodermale und hämatologische Anomalien auf. Das Noonan-Syndrom wird meist autosomal dominant vererbt, mit variabler Expressivität und daher schwer zu bestimmenden Penetranz-Raten. Zu den genetisch verwandten (allelischen) Störungen gehören die Noonan-ähnliche Störung, LEOPARD- und kardiofaziokutane Syndrome, die durch Mutationen in mehreren der rund ein Dutzend Gene verursacht werden, die auch das Noonan-Syndrom verursachen. In rund der Hälfte der Patienten mit Noonan-syndrom werden PTPN11-Mutationen vorgefunden, bei 13% im SOS1- und bei rund 8% im LZTR1-Gen, bei ~5% je in den RAF1- und RIT1-Genen. Weniger als 5% der Noonan-Fälle zeigen KRAS-Mutationen, weitere "Noonan-Gene" sind in <1% mutiert. Die Diagnose kann bei >85% der Betroffenen molekulargenetisch bestätigt werden, aber ein normales DNA-Ergebnis schließt die klinische Diagnose nicht aus.
Referenz: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1124/
- Sympt.: Short stature, facial dysmorphism, spectrum of congenital heart defects
- Alias: Female pseudo-Turner syndrome
- Alias: Male Turner syndrome
- Atypical Noonan syndrome (RRAS)
- Cardiofaciocutaneous syndrome (BRAF)
- Cardiofaciocutaneous syndrome 2 (KRAS)
- Cardiofaciocutaneous syndrome 3 (MAP2K1)
- Cardiofaciocutaneous syndrome 4 (MAP2K2)
- Costello syndrome (HRAS)
- Genitopatellar syndrome (KAT6B)
- LEOPARD syndrome 1 (PTPN11)
- LEOPARD syndrome 2 (RAF1)
- LEOPARD syndrome 3 (BRAF)
- Neurofibromatosis-Noonan syndrome (NF1)
- Noonan syndrome 1 (PTPN11)
- Noonan syndrome 11 (MRAS)
- Noonan syndrome 12 (RRAS)
- Noonan syndrome 2 + 10 (LZTR1)
- Noonan syndrome 3 (KRAS)
- Noonan syndrome 4 (SOS1)
- Noonan syndrome 5 (RAF1)
- Noonan syndrome 6 (NRAS)
- Noonan syndrome 7 (BRAF)
- Noonan syndrome 8 (RIT1)
- Noonan syndrome 9 (SOS2)
- Noonan syndrome-like disorder with loose anagen hair 2 (PPP1CB)
- Noonan syndrome-like disorder with/-out juvenile myelomonocytic leukemia (CBL)
- Noonan syndrome-like with loose anagen hair 1 (SHOC2)
- SBBYSS syndrome (KAT6B)
- AD
- AR
- Multiple OMIM-Ps
Bioinformatik und klinische Interpretation
Test-Stärken
- DAkkS-akkreditiertes Labor
- EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
- Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
- Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
- Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
- eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
- unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
- unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
- unsere umfassenden klinischen Aussagen
Testeinschränkungen
- Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
- Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
- es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
- die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
- Gen-Konversionen
- komplexe Inversionen
- Balancierte Translokationen
- Mitochondriale Varianten
- Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
- nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
- niedriger Mosaik-Status
- Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
- Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
- Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
- Varianten innerhalb von Pseudogenen
- die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde
Laboranforderung
Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.
Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.
Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.
Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.