Klinische FragestellungSiegelringzell-Karzinom, Magen; Differentialdiagnose
Zusammenfassung
Umfassendes differentialdiagnostisches panel für Siegelringzell-Karzinom des Magens mit 2 Leitlinien-kuratierten Genen [je 1 "core" sowie 1 "core candidate"-Gen], 10 weiteren Leitlinien-kuratierten Genen bzw. zusammen genommen 16 kuratierten Genen gemäß klinischer Verdachtsdiagnose
47,8 kb (Erweitertes Panel: inkl. additional genes)
- EDTA-Blut (3-5 ml)
NGS +
[Sanger]
Genpanel
Ausgewählte Gene
Name | Exon-Länge (bp) | OMIM-G | Referenz-Seq. | Erbgang |
---|---|---|---|---|
CDH1 | 2649 | NM_004360.5 | AD, Sus | |
CTNNA1 | 2721 | NM_001903.5 | n.k., Sus | |
APC | 8532 | NM_000038.6 | AD, Sus | |
BRCA1 | 5592 | NM_007294.4 | n.k., Sus | |
BRCA2 | 10257 | NM_000059.4 | AD, AR, Sus | |
CHEK2 | 1632 | NM_007194.4 | AD, Sus | |
EPCAM | 945 | NM_002354.3 | AD, Sus | |
MLH1 | 2271 | NM_000249.4 | AD, Sus | |
MSH2 | 2805 | NM_000251.3 | AD, AR, Sus | |
MSH6 | 4083 | NM_000179.3 | AD, Sus | |
PMS2 | 2589 | NM_000535.7 | AD, Sus | |
PTEN | 1212 | NM_000314.8 | Sus | |
STK11 | 1302 | NM_000455.5 | AD, Sus | |
TP53 | 1182 | NM_000546.6 | AD, Sus |
Infos zur Erkrankung
Magenkrebs (GC) wird in zwei histologische Haupttypen eingeteilt, den diffusen und den intestinalen Typ sowie einen unbestimmten Mischtyp. Der intestinale und der diffuse Typ haben unterschiedliche Ätiologie und der diffuse Typ hat eine schlechtere Prognose. Das Siegelringzellkarzinom (SRCC), das zuvor dem diffusen Typ zugeordnet war, stellt einen eigenen Histotyp dar. Während die Inzidenz des GC weltweit abgenommen hat, nimmt die Inzidenz des SRCC stetig zu und macht 8-30% des GC aus. Das hereditäre diffuse Magenkarzinom (HDGC) ist eine autosomal dominante Erkrankung. 40% der HDGC-Familien weisen Keimbahnmutationen im CDH1-Gen auf, und das kumulative GC-Risiko für CDH1-Mutationsträger beträgt bis zum Alter von 80 Jahren 70% bei Männern und 56% bei Frauen, letztere mit einem 50-prozentigen Risiko für Brustkrebs. Somatische CDH1-Veränderungen wurden auch bei 30% aller Patienten mit GC gefunden. Da es sich bei CDH1 um ein Tumorsuppressor-Gen handelt, gehören zu den zweiten somatischen Treffern Promotor-Methylierung, somatische Mutation oder Verlust der Heterozygotie. Aufgrund ihrer hohen Anzahl und der Schwierigkeit, ihre funktionelle Rolle in vivo nachzuweisen, bleiben viele Mutationen klinisch unklar. Der mit einer CDH1-Mutation assoziierte GC ist hochgradig penetrant, tritt im frühen Alter auf mit schwerem Verlauf. Die DNA-diagnostische Ausbeute liegt bei maximal 50%, daher schließen negative Mutationstestergebnisse die klinische Diagnose nicht aus.
Referenz: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1139/
- Alias: Hereditäres diffuses Magenkarzinom
- Alias: Siegelring-Karzinom
- Allelic: Acrodysostosis 1, with/-out hormone resistance (PRKAR1A) 3
- Allelic: Adenomatous polyposis coli (APC)
- Allelic: Adrenocortical carcinoma, pediatric (TP53)
- Allelic: Basal cell carcinoma 7 (TP53)
- Allelic: Blepharocheilodontic syndrome 1 (CDH1)
- Allelic: Bone marrow failure syndrome 5 (TP53)
- Allelic: Brain tumor-polyposis syndrome 2 (APC)
- Allelic: Breast cancer, lobular (CDH1)
- Allelic: Breast cancer, male, susceptibility to (BRCA2)
- Allelic: Breast cancer, somatic (TP53)
- Allelic: Breast cancer, susceptibility to (CHEK2)
- Allelic: Breast cancer, susceptibility to (PALB2)
- Allelic: Breast-ovarian cancer, familial, 2 (BRCA2)
- Allelic: Choroid plexus papilloma (TP53)
- Allelic: Colorectal cancer (TP53)
- Allelic: Colorectal cancer, susceptibility to (CHEK2)
- Allelic: Desmoid disease, hereditary (APC)
- Allelic: Diarrhea 5, with tufting enteropathy, congenital (EPCAM)
- Allelic: Endometrial cancer, familial (MSH6)
- Allelic: Endometrial carcinoma, somatic (CDH1)
- Allelic: Exudative vitreoretinopathy [MONDO:0019516] (CTNNA1)
- Allelic: Gardner syndrome (APC)
- Allelic: Glioblastoma 3 (BRCA2)
- Allelic: Glioma susceptibility 1 (TP53)
- Allelic: Glioma susceptibility 2 (PTEN)
- Allelic: Hepatocellular carcinoma, somatic (TP53)
- Allelic: Macrocephaly/autism syndrome (PTEN)
- Allelic: Macular dystrophy, patterned, 2 (CTNNA1)
- Allelic: Medulloblastoma (BRCA2)
- Allelic: Melanoma + neural system tumor syndrome (CDKN2A)
- Allelic: Melanoma, cutaneous malignant, 2 (CDKN2A)
- Allelic: Melanoma-pancreatic cancer syndrome (CDKN2A)
- Allelic: Meningioma (PTEN)
- Allelic: Myxoma, intracardiac (PRKAR1A)
- Allelic: Nasopharyngeal carcinoma, somatic (TP53)
- Allelic: Osteosarcoma (TP53)
- Allelic: Ovarian cancer, somatic (CDH1)
- Allelic: Pancreatic cancer 2 (BRCA2)
- Allelic: Pancreatic cancer, somatic (TP53)
- Allelic: Pancreatic cancer, susceptibility to, 3 (PALB2)
- Allelic: Pigmented nodular adrenocortical disease, primary, 1 (PRKAR1A)
- Allelic: Prostate cancer (BRCA2)
- Allelic: Prostate cancer, familial, susceptibility to (CHEK2)
- Allelic: Prostate cancer, susceptibility to (CDH1)
- Allelic: Wilms tumor (BRCA2)
- Ataxia-telangiectasia (ATM)
- Carney complex, type 1 (PRKAR1A)
- Cowden syndrome 1 (PTEN)
- Fanconi anemia, complementation group D1 (BRCA2)
- Fanconi anemia, complementation group N (PALB2)
- Gastric adenocarcinoma + proximal polyposis of the stomach (APC)
- Gastric cancer, hereditary diffuse, with/-out cleft lip and/or palate (CDH1)
- Hereditary diffuse gastric cancer [D-guideline] (CTNNA1)
- Lhermitte-Duclos disease (PTEN)
- Li-Fraumeni syndrome (TP53)
- Li-Fraumeni syndrome 2 (CHEK2)
- Lynch syndrome 1 (MSH2)
- Lynch syndrome 2 (MLH1)
- Lynch syndrome 4 (PMS2)
- Lynch syndrome 5 (MSH6)
- Lynch syndrome 8 (EPCAM)
- Mismatch repair cancer syndrome 1 (MLH1)
- Mismatch repair cancer syndrome 2 (MSH2)
- Mismatch repair cancer syndrome 3 (MSH6)
- Mismatch repair cancer syndrome 4 (PMS2)
- Muir-Torre syndrome (MLH1, MSH2)
- Peutz-Jeghers syndrome (STK11)
- AD
- AR
- Sus
- n.k.
- Multiple OMIM-Ps
Bioinformatik und klinische Interpretation
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