Klinische FragestellungSpinale Muskelatrophie Typ 0, I, II, III, IV; Differentialdiagnose
Zusammenfassung
Umfassendes differentialdiagnostisches panel für Spinale Muskelatrophie Typ 0, I, II, III, IV mit 2 Leitlinien-kuratierten sowie insgesamt 42 kuratierten Genen
100,9 kb (Erweitertes Panel: inkl. additional genes)
- EDTA-Blut (3-5 ml)
Stufe 1: CNV-Analyse
DNA-Sequenzanalytik auf besonderen Auftrag hin
NGS +
[Sanger]
Genpanel
Ausgewählte Gene
Name | Exon-Länge (bp) | OMIM-G | Referenz-Seq. | Erbgang |
---|---|---|---|---|
SMN1 | 885 | NM_000344.4 | AR | |
SMN2 | 885 | NM_017411.4 | Mod | |
AR | 2763 | NM_000044.6 | XLR | |
ASAH1 | 1188 | NM_177924.5 | AR | |
ASCC1 | 1074 | NM_001198800.3 | AR | |
ATP7A | 4503 | NM_000052.7 | XLR | |
BICD2 | 2568 | NM_001003800.2 | AD | |
BSCL2 | 1197 | NM_032667.6 | AD | |
CHAT | 2247 | NM_020549.5 | AR | |
CHCHD10 | 429 | NM_213720.3 | AD | |
CHRNE | 1482 | NM_000080.4 | AD, AR | |
COLQ | 1368 | NM_005677.4 | AR | |
DCTN1 | 3837 | NM_004082.5 | AD | |
DMD | 11058 | NM_004006.3 | XLR | |
DMPK | 1920 | NM_001081563.2 | AD | |
DNAJB2 | 834 | NM_001039550.2 | AR | |
DOK7 | 1515 | NM_173660.5 | AR | |
DYNC1H1 | 13941 | NM_001376.5 | AD | |
EXOSC3 | 828 | NM_016042.4 | AR | |
EXOSC8 | 831 | NM_181503.3 | AR | |
FBXO38 | 2832 | NM_001271723.2 | AD | |
GAA | 2859 | NM_000152.5 | AR | |
GARS1 | 2220 | NM_002047.4 | AD | |
GFPT1 | 2046 | NM_001244710.2 | AR | |
HEXA | 1590 | NM_000520.6 | AR | |
HSPB1 | 618 | NM_001540.5 | AD | |
HSPB8 | 591 | NM_014365.3 | AD | |
IGHMBP2 | 2982 | NM_002180.3 | AR | |
PLEKHG5 | 3189 | NM_020631.6 | AR | |
RAPSN | 1239 | NM_005055.5 | AR | |
REEP1 | 606 | NM_022912.3 | AR | |
SETX | 8034 | NM_015046.7 | AR | |
SLC52A2 | 1338 | NM_024531.5 | AR | |
SLC52A3 | 1410 | NM_033409.4 | AR | |
SLC5A7 | 1743 | NM_021815.5 | AR, AD | |
SYT2 | 1260 | NM_177402.5 | AD, AR | |
TRIP4 | 1759 | NM_016213.5 | AR | |
TRPV4 | 2616 | NM_021625.5 | AD | |
UBA1 | 3177 | NM_003334.4 | XL | |
VAPB | 732 | NM_004738.5 | AD | |
VRK1 | 1191 | NM_003384.3 | AR | |
WARS1 | 1451 | AD |
Infos zur Erkrankung
Die Spinale Muskelatrophie (SMA) ist eine der häufigsten autosomal-rezessiv erblichen Erkrankungen mit einem statistischen Wiederholungsrisiko von 25% in Europa, die im schwersten Fall (SMA Typ 0 bzw. 1) mit einem frühen kindlichen Tod einhergeht. Die Häufigkeit der heterozygoten Anlageträger wird mit 1/40 für die deutsche Bevölkerung und weltweit mit ~1/50 angegeben (1, 2). Bei der überwiegenden Mehrheit der betroffenen Kinder ist der Verlust beider SMN1-Genkopien die Erkrankungsursache. Die Eltern tragen dann in der Regel den SMN1-Genkopienverlust auf nur einem Allel (obligate Heterozygotie). Nach aktuellem Kenntnisstand wird der unterschiedliche Verlauf der SMA bzw. das unterschiedliche Manifestationsalter wesentlich durch die Anzahl der vorhandenen Kopien des chromosomal benachbarten und nahezu identischen SMN2-Gens beeinflusst, wobei neben Ausnahmen ein breites Erkrankungsspektrum existiert. Eine phänotypische Charakterisierung auch hinsichtlich der mittlerweile grundsätzlichen Behandelbarkeit und der Prognose in „Non-Sitter“, „Sitter“ und „Walker“ ist deshalb etabliert, die auch den Aspekt einer Multisystemerkrankung und das interdisziplinäre therapeutische Management mit einbezieht (3, 4).
Die Anzahl der SMN2-Kopien korreliert bei Abwesenheit funktionaler SMN1-Kopien zumeist mit der Schwere des Krankheitsbildes, Patienten mit milderem SMA-Phänotyp weisen in Studien mehr SMN2 Kopien auf, als Patienten mit schwerem SMA-Phänotyp. Eine sichere Vorhersage über den Phänotyp kann jedoch nicht getroffen werden, erlangt aber Bedeutung für SMN2-Kopienanzahl abhängige Therapien (5).
SMA ist grundsätzlich behandelbar. Es stehen Antisense-Oligonukleotid-, Genersatz- oder /und „SMA small molecule“-Therapie sowie deren Kombination in entsprechenden neuromuskulären Zentren mit der Expertise einer SMA-Behandlung zur Verfügung. Das Neugeborenen-Screening mit der Möglichkeit eines sehr frühzeitigen präsymptomatischen kausalen Therapiebeginns ist in Deutschland seit 1. Oktober 2021 eingeführt.
In Deutschland steht neben Pränatal-Diagnostik, Neugeborenen-Screening und frühzeitiger kausaler Therapie mit verbessertem Outcome auch die Möglichkeit einer Präimplantationsdiagnostik im Rahmen eines humangenetischen Beratungs- und multidisziplinären Behandlungskonzepts für Paare mit einem bereits betroffenem Kind zur Verfügung. Im Rahmen des Neugeborenen-Screenings können aktuell seltene Punktmutationen im SMN1-Gen (~4% der Fälle) nicht nachgewiesen werden.
Referenzen
(1) doi: 10.3233/JND-190428
(2) doi: 10.1146/annurev-genom-102319-103602
(3) doi: 10.1016/j.nmd.2017.11.005
(4) doi: 10.1016/j.nmd.2017.11.004
(5) http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1352/
- Alias: Infantile spinal muscular atrophy
- Alias: Proximal spinal muscular atrophy type 0, 1-4
- Alias: Spinal muscular atrophy-0, -1-4 [SMA]
- Alias: Werdnig-Hoffmann disease
- Allelic: Amyotrophic lateral sclerosis 8 (VAPB)
- Allelic: Amyotrophic lateral sclerosis, susceptibility to (DCTN1)
- Allelic: Androgen insensitivity (AR)
- Allelic: Androgen insensitivity, partial, with/-out breast cancer (AR)
- Allelic: Avascular necrosis of femoral head, primary, 2 (TRPV4)
- Allelic: Barrett esophagus/esophageal adenocarcinoma (ASCC1)
- Allelic: Brachyolmia type 3 (TRPV4)
- Allelic: Cardiomyopathy, dilated, 3B (DMD)
- Allelic: Charcot-Marie-Tooth disease, RI C (PLEKHG5)
- Allelic: Charcot-Marie-Tooth disease, axonal, type 20 (DYNC1H1)
- Allelic: Charcot-Marie-Tooth disease, axonal, type 2S (IGHMBP2)
- Allelic: Digital arthropathy-brachydactyly, familial (TRPV4)
- Allelic: Encephalopathy, progressive, +/- lipodystrophy (BSCL2)
- Allelic: Farber lipogranulomatosis (ASAH1)
- Allelic: Fetal akinesia deformation sequence 2 (RAPSN)
- Allelic: Fetal akinesia deformation sequence 3 (DOK7)
- Allelic: Frontotemporal dementia and/or amyotrophic lateral sclerosis 2 (CHCHD10)
- Allelic: Hereditary motor + sensory neuropathy, type IIc (TRPV4)
- Allelic: Hex A pseudodeficiency (HEXA)
- Allelic: Hypospadias 1, XL (AR)
- Allelic: Lipodystrophy, congenital generalized, type 2 (BSCL2)
- Allelic: Menkes disease (ATP7A)
- Allelic: Mental retardation, AD 13 (DYNC1H1)
- Allelic: Metatropic dysplasia (TRPV4)
- Allelic: Occipital horn syndrome (ATP7A)
- Allelic: Parastremmatic dwarfism (TRPV4)
- Allelic: Prostate cancer, susceptibility to (AR)
- Allelic: Scapuloperoneal spinal muscular atrophy (TRPV4)
- Allelic: Sodium serum level QTL 1 (TRPV4)
- Allelic: Spondyloepiphyseal dysplasia, Maroteaux type (TRPV4)
- Allelic: Spondylometaphyseal dysplasia, Kozlowski type (TRPV4)
- Amyotrophic lateral sclerosis 4, juvenile (SETX)
- Becker muscular dystrophy (DMD)
- Brown-Vialetto-Van Laere syndrome 2 (SLC52A2)
- Charcot-Marie-Tooth disease, axonal, type 2F (HSPB1)
- Charcot-Marie-Tooth disease, axonal, type 2L (HSPB8)
- Charcot-Marie-Tooth disease, type 2D (GARS1)
- Duchenne muscular dystrophy (DMD)
- GM2-gangliosidosis, several forms (HEXA)
- Glycogen storage disease II (GAA)
- Muscular dystrophy, congenital, Davignon-Chauveau type (TRIP4)
- Myasthenia, congenital, 12, with tubular aggregates (GFPT1)
- Myasthenic syndrome, congenital, 10 (DOK7)
- Myasthenic syndrome, congenital, 11, associated with acetylcholine receptor deficiency (RAPSN)
- Myasthenic syndrome, congenital, 20, presynaptic (SLC5A7)
- Myasthenic syndrome, congenital, 4A, slow-channel + 4B, fast-channel (CHRNE)
- Myasthenic syndrome, congenital, 4C, associated with acetylcholine receptor deficiency (CHRNE)
- Myasthenic syndrome, congenital, 5 (COLQ)
- Myasthenic syndrome, congenital, 6, presynaptic (CHAT)
- Myasthenic syndrome, congenital, 7A, presynaptic, distal motor neuropathy, AD (SYT2)
- Myasthenic syndrome, congenital, 7B, presynaptic, AR (SYT2)
- Myopathy, isolated mitochondrial, AD (CHCHD10)
- Myotonic dystrophy 1 (DMPK_CTG)
- Neuronopathy, distal hereditary motor [MONDO:0000075] (EXOSC8)
- Neuronopathy, distal hereditary motor, type II (HSPB1)
- Neuronopathy, distal hereditary motor, type IIA (HSPB8)
- Neuronopathy, distal hereditary motor, type IID (FBXO38)
- Neuronopathy, distal hereditary motor, type IX (WARS1)
- Neuronopathy, distal hereditary motor, type VA (GARS1)
- Neuronopathy, distal hereditary motor, type VB (REEP1)
- Neuronopathy, distal hereditary motor, type VI (IGHMBP2)
- Neuronopathy, distal hereditary motor, type VIIA (SLC5A7)
- Neuronopathy, distal hereditary motor, type VIIB (DCTN1)
- Neuronopathy, distal hereditary motor, type VIII (TRPV)
- Neuropathy, distal hereditary motor, type VC (BSCL2)
- Perry syndrome (DCTN1)
- Pontocerebellar hypoplasia type 1A (VRK1)
- Pontocerebellar hypoplasia, type 1B (EXOSC3)
- Pontocerebellar hypoplasia, type 1C (EXOSC8)
- Silver spastic paraplegia syndrome (BSCL2)
- Spastic paraplegia 31, AD (REEP1)
- Spinal + bulbar muscular atrophy of Kennedy (AR_CAG)
- Spinal muscular atrophy with congenital bone fractures 1 (TRIP4)
- Spinal muscular atrophy with congenital bone fractures 2 (ASCC1)
- Spinal muscular atrophy with progressive myoclonic epilepsy (ASAH1)
- Spinal muscular atrophy, Jokela type (CHCHD10)
- Spinal muscular atrophy, XL 2, infantile (UBA1)
- Spinal muscular atrophy, distal, AR, 4 (PLEKHG5)
- Spinal muscular atrophy, distal, AR, 5 (DNAJB2)
- Spinal muscular atrophy, distal, XL 3 (ATP7A)
- Spinal muscular atrophy, infantile, James type (GARS1)
- Spinal muscular atrophy, late-onset, Finkel type (VAPB)
- Spinal muscular atrophy, lower extremity-predominant 1, AD (DYNC1H1)
- Spinal muscular atrophy, lower extremity-predominant, 2A + 2B, AD (BICD2)
- Spinal muscular atrophy, type 0 [prenatal] (SMN1)
- Spinal muscular atrophy, type III, modifier of (SMN2)
- Spinocerebellar ataxia, autosomal recessive, with axonal neuropathy 2 (SETX)
- Tay-Sachs disease (HEXA)
- AD
- AR
- Mod
- XL
- XLR
- Multiple OMIM-Ps
Bioinformatik und klinische Interpretation
Test-Stärken
- DAkkS-akkreditiertes Labor
- EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
- Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
- Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
- Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
- eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
- unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
- unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
- unsere umfassenden klinischen Aussagen
Testeinschränkungen
- Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
- Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
- es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
- die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
- Gen-Konversionen
- komplexe Inversionen
- Balancierte Translokationen
- Mitochondriale Varianten
- Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
- nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
- niedriger Mosaik-Status
- Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
- Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
- Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
- Varianten innerhalb von Pseudogenen
- die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde
Laboranforderung
Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.
Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.
Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.
Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.