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Klinische FragestellungSpinale Muskelatrophie Typ 0, I, II, III, IV; Differentialdiagnose

Zusammenfassung

Kurzinformation

Umfassendes differentialdiagnostisches panel für Spinale Muskelatrophie Typ I-IV mit 2 Leitlinien-kuratierten sowie insgesamt 22 kuratierten Genen

ID
SP6754
Anzahl Loci
Loci-TypAnzahl
Gen42
Akkreditierte Untersuchung
Untersuchte Sequenzlänge
1,8 kb (Core-/Core-canditate-Gene)
100,9 kb (Erweitertes Panel: inkl. additional genes)
Analyse-Dauer
auf Anfrage
Untersuchungsmaterial
  • EDTA-Blut (3-5 ml)
Diagnostische Hinweise

Stufe 1: CNV-Analyse

DNA-Sequenzanalytik auf besonderen Auftrag hin

NGS +

[Sanger]

 

Locipanel

Gen

NameExon-Länge (bp)OMIM-GReferenz-Seq.Erbgang
SMN1885NM_000344.4AR
SMN2885NM_017411.4Mod
AR2763NM_000044.6XLR
ASAH11188NM_177924.5AR
ASCC11074NM_001198800.3AR
ATP7A4503NM_000052.7XLR
BICD22568NM_001003800.2AD
BSCL21197NM_032667.6AD
CHAT2247NM_020549.5AR
CHCHD10429NM_213720.3AD
CHRNE1482NM_000080.4AD, AR
COLQ1368NM_005677.4AR
DCTN13837NM_004082.5AD
DMD11058NM_004006.3XLR
DMPK1920NM_001081563.2AD
DNAJB2834NM_001039550.2AR
DOK71515NM_173660.5AR
DYNC1H113941NM_001376.5AD
EXOSC3828NM_016042.4AR
EXOSC8831NM_181503.3AR
FBXO382832NM_001271723.2AD
GAA2859NM_000152.5AR
GARS12220NM_002047.4AD
GFPT12046NM_001244710.2AR
HEXA1590NM_000520.6AR
HSPB1618NM_001540.5AD
HSPB8591NM_014365.3AD
IGHMBP22982NM_002180.3AR
PLEKHG53189NM_020631.6AR
RAPSN1239NM_005055.5AR
REEP1606NM_022912.3AR
SETX8034NM_015046.7AR
SLC52A21338NM_024531.5AR
SLC52A31410NM_033409.4AR
SLC5A71743NM_021815.5AR, AD
SYT21260NM_177402.5AD, AR
TRIP41759NM_016213.5AR
TRPV42616NM_021625.5AD
UBA13177NM_003334.4XL
VAPB732NM_004738.5AD
VRK11191NM_003384.3AR
WARS11451AD

Infos zur Erkrankung

Klinischer Kommentar

Infos zur Krankheit

Die Spinale Muskelatrophie (SMA) ist eine der häufigsten autosomal-rezessiv erblichen Erkrankungen in Europa, die bei schwerer Verlaufsform mit einem frühen kindlichen Tod einhergeht. Die Häufigkeit der heterozygoten Anlageträger wird mit 1/40 bis 1/60 für die europäische Bevölkerung angegeben. Auch in Kulturen mit einer hohen Frequenz an Konsanguinität sind autosomal-rezessive Erkrankungen wie SMA weit verbreitet (1). Bei der überwiegenden Mehrheit der betroffenen Kinder ist der Verlust beider SMN1-Genkopien die Erkrankungsursache. Die Eltern tragen dann in der Regel den SMN1-Genkopienverlust auf nur einem Allel. Nach aktuellem Kenntnisstand wird der unterschiedliche Verlauf der SMA Formen I bis III bzw. das unterschiedliche Manifestationsalter wesentlich durch die Anzahl der vorhandenen Kopien des chromosomal benachbarten und nahezu identischen SMN2-Gens beeinflusst. Von diesem Gen wird, im Vergleich zum SMN1-Gen, nur eine geringe Menge Volllängen-Transkript abgelesen (2, 3). - Mehrere gentherapeutische Ansätze sind zwischenzeitlich etabliert oder noch in der klinischen Erprobung. Z.B. das Medikament Nusinersen (SpinrazaTM) erhöht als Antisense-Oligonukleotid die Produktion des SMN Transkripts durch verbessertes Spleißen des SMN2-Gens, kann also nur wirken, wenn ausreichend Genkopien des SMN2-Gens vorliegen (4). Onasemnogene Abeparvovec (ZolgensmaTM) ist eine Adeno-assoziiertes Virus 9 basierte Gentherapie mit der eine Transgen-Kopie des SMN1-Gens eingeschleust wird, die für das SMN-Protein kodiert (5).

Literatur: (1) Shafeghati Y et al. Arch Iranian Med. 7(1): 47 – 52; 2004. (2) Prior, TW et al.; Genet Med. 2011 Jul;13(7):686-94. (3) Prior, TW and Finanger, E; online Gene Reviews http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1352/. (4) Ottensen. Transl Neurosci. 2017; 8: 1–6. (5) Hoy SM. Onasemnogene Abeparvovec: First Global Approval. Drugs. 2019 Jul;79(11):1255-1262.

ORPHA:83330 Proximal spinal muscular atrophy type 1; ORPHA:83418 SMA type 2; ORPHA:83419 SMA type 3; ORPHA:83420 SMA type 4

ORPHA:83330 Proximal spinal muscular atrophy type 1

Severe infantile form: progressive muscle weakness + hypotonia resulting from degeneration/loss of the lower motor neurons in spinal cord + brain stem nuclei

ORPHA:83418 SMA type 2

Prevalence: 1-9/100 000 (prevalence 1/70 000, slightly more frequent in males than females)

Chronic infantile form: muscle weakness + hypotonia resulting from degeneration/loss of lower motor neurons in the spinal cord + brain stem nuclei

ORPHA:83419 SMA type 3

Prevalence: 1-9/1 000 000 (1/375000)

Relatively mild form: muscle weakness + hypotonia resulting from degeneration/loss of lower motor neurons in the spinal cord + brain stem nuclei

ORPHA:83420 SMA type 4

Adult-onset form: muscle weakness + hypotonia resulting from the degeneration/loss of lower motor neurons in the spinal cord + brain stem nuclei

 

Synonyme
  • Alias: Infantile spinal muscular atrophy
  • Alias: Proximal spinal muscular atrophy type 0, 1-4
  • Alias: Spinal muscular atrophy-0, -1-4 [SMA]
  • Alias: Werdnig-Hoffmann disease
  • Allelic: Amyotrophic lateral sclerosis 8 (VAPB)
  • Allelic: Amyotrophic lateral sclerosis, susceptibility to (DCTN1)
  • Allelic: Androgen insensitivity (AR)
  • Allelic: Androgen insensitivity, partial, with/-out breast cancer (AR)
  • Allelic: Avascular necrosis of femoral head, primary, 2 (TRPV4)
  • Allelic: Barrett esophagus/esophageal adenocarcinoma (ASCC1)
  • Allelic: Brachyolmia type 3 (TRPV4)
  • Allelic: Cardiomyopathy, dilated, 3B (DMD)
  • Allelic: Charcot-Marie-Tooth disease, RI C (PLEKHG5)
  • Allelic: Charcot-Marie-Tooth disease, axonal, type 20 (DYNC1H1)
  • Allelic: Charcot-Marie-Tooth disease, axonal, type 2S (IGHMBP2)
  • Allelic: Digital arthropathy-brachydactyly, familial (TRPV4)
  • Allelic: Encephalopathy, progressive, +/- lipodystrophy (BSCL2)
  • Allelic: Farber lipogranulomatosis (ASAH1)
  • Allelic: Fetal akinesia deformation sequence 2 (RAPSN)
  • Allelic: Fetal akinesia deformation sequence 3 (DOK7)
  • Allelic: Frontotemporal dementia and/or amyotrophic lateral sclerosis 2 (CHCHD10)
  • Allelic: Hereditary motor + sensory neuropathy, type IIc (TRPV4)
  • Allelic: Hex A pseudodeficiency (HEXA)
  • Allelic: Hypospadias 1, XL (AR)
  • Allelic: Lipodystrophy, congenital generalized, type 2 (BSCL2)
  • Allelic: Menkes disease (ATP7A)
  • Allelic: Mental retardation, AD 13 (DYNC1H1)
  • Allelic: Metatropic dysplasia (TRPV4)
  • Allelic: Occipital horn syndrome (ATP7A)
  • Allelic: Parastremmatic dwarfism (TRPV4)
  • Allelic: Prostate cancer, susceptibility to (AR)
  • Allelic: Scapuloperoneal spinal muscular atrophy (TRPV4)
  • Allelic: Sodium serum level QTL 1 (TRPV4)
  • Allelic: Spondyloepiphyseal dysplasia, Maroteaux type (TRPV4)
  • Allelic: Spondylometaphyseal dysplasia, Kozlowski type (TRPV4)
  • Amyotrophic lateral sclerosis 4, juvenile (SETX)
  • Becker muscular dystrophy (DMD)
  • Brown-Vialetto-Van Laere syndrome 2 (SLC52A2)
  • Charcot-Marie-Tooth disease, axonal, type 2F (HSPB1)
  • Charcot-Marie-Tooth disease, axonal, type 2L (HSPB8)
  • Charcot-Marie-Tooth disease, type 2D (GARS1)
  • Duchenne muscular dystrophy (DMD)
  • GM2-gangliosidosis, several forms (HEXA)
  • Glycogen storage disease II (GAA)
  • Muscular dystrophy, congenital, Davignon-Chauveau type (TRIP4)
  • Myasthenia, congenital, 12, with tubular aggregates (GFPT1)
  • Myasthenic syndrome, congenital, 10 (DOK7)
  • Myasthenic syndrome, congenital, 11, associated with acetylcholine receptor deficiency (RAPSN)
  • Myasthenic syndrome, congenital, 20, presynaptic (SLC5A7)
  • Myasthenic syndrome, congenital, 4A, slow-channel + 4B, fast-channel (CHRNE)
  • Myasthenic syndrome, congenital, 4C, associated with acetylcholine receptor deficiency (CHRNE)
  • Myasthenic syndrome, congenital, 5 (COLQ)
  • Myasthenic syndrome, congenital, 6, presynaptic (CHAT)
  • Myasthenic syndrome, congenital, 7A, presynaptic, distal motor neuropathy, AD (SYT2)
  • Myasthenic syndrome, congenital, 7B, presynaptic, AR (SYT2)
  • Myopathy, isolated mitochondrial, AD (CHCHD10)
  • Myotonic dystrophy 1 (DMPK_CTG)
  • Neuronopathy, distal hereditary motor [MONDO:0000075] (EXOSC8)
  • Neuronopathy, distal hereditary motor, type II (HSPB1)
  • Neuronopathy, distal hereditary motor, type IIA (HSPB8)
  • Neuronopathy, distal hereditary motor, type IID (FBXO38)
  • Neuronopathy, distal hereditary motor, type IX (WARS1)
  • Neuronopathy, distal hereditary motor, type VA (GARS1)
  • Neuronopathy, distal hereditary motor, type VB (REEP1)
  • Neuronopathy, distal hereditary motor, type VI (IGHMBP2)
  • Neuronopathy, distal hereditary motor, type VIIA (SLC5A7)
  • Neuronopathy, distal hereditary motor, type VIIB (DCTN1)
  • Neuronopathy, distal hereditary motor, type VIII (TRPV)
  • Neuropathy, distal hereditary motor, type VC (BSCL2)
  • Perry syndrome (DCTN1)
  • Pontocerebellar hypoplasia type 1A (VRK1)
  • Pontocerebellar hypoplasia, type 1B (EXOSC3)
  • Pontocerebellar hypoplasia, type 1C (EXOSC8)
  • Silver spastic paraplegia syndrome (BSCL2)
  • Spastic paraplegia 31, AD (REEP1)
  • Spinal + bulbar muscular atrophy of Kennedy (AR_CAG)
  • Spinal muscular atrophy with congenital bone fractures 1 (TRIP4)
  • Spinal muscular atrophy with congenital bone fractures 2 (ASCC1)
  • Spinal muscular atrophy with progressive myoclonic epilepsy (ASAH1)
  • Spinal muscular atrophy, Jokela type (CHCHD10)
  • Spinal muscular atrophy, XL 2, infantile (UBA1)
  • Spinal muscular atrophy, distal, AR, 4 (PLEKHG5)
  • Spinal muscular atrophy, distal, AR, 5 (DNAJB2)
  • Spinal muscular atrophy, distal, XL 3 (ATP7A)
  • Spinal muscular atrophy, infantile, James type (GARS1)
  • Spinal muscular atrophy, late-onset, Finkel type (VAPB)
  • Spinal muscular atrophy, lower extremity-predominant 1, AD (DYNC1H1)
  • Spinal muscular atrophy, lower extremity-predominant, 2A + 2B, AD (BICD2)
  • Spinal muscular atrophy, type 0 [prenatal] (SMN1)
  • Spinal muscular atrophy, type III, modifier of (SMN2)
  • Spinocerebellar ataxia, autosomal recessive, with axonal neuropathy 2 (SETX)
  • Tay-Sachs disease (HEXA)
Erbgänge, Vererbungsmuster etc.
  • AD
  • AR
  • Mod
  • XL
  • XLR
OMIM-Ps
  • Multiple OMIM-Ps
ICD10 Code

Bioinformatik und klinische Interpretation

Test-Stärken

  • DAkkS-akkreditiertes Labor
  • EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
  • Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
  • Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
  • Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
  • eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
  • unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
  • unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
  • unsere umfassenden klinischen Aussagen

Testeinschränkungen

  • Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
  • Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
  • es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
  • die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
  • Gen-Konversionen
  • komplexe Inversionen
  • Balancierte Translokationen
  • Mitochondriale Varianten
  • Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
  • nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
  • niedriger Mosaik-Status
  • Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
  • Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
  • Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
  • Varianten innerhalb von Pseudogenen
  • die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde

Laboranforderung

  • Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.

  • Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.

  • Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.

  • Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.