Klinische Fragestellung46XX-Gonadendysgenesie, Differentialdiagnose
Zusammenfassung
Ein kuratiertes panel mit 11 "core candidate"-Genen sowie insgesamt 28 kuratierten Genen zur umfassenden Untersuchung von genetisch bedingten Formen der 46XX-Gonadendysgenesie
29,2 kb (Erweitertes Panel: inkl. additional genes)
- EDTA-Blut (3-5 ml)
NGS +
Genpanel
Ausgewählte Gene
Name | Exon-Länge (bp) | OMIM-G | Referenz-Seq. | Erbgang |
---|---|---|---|---|
BMP15 | 1179 | NM_005448.2 | XL | |
FSHR | 2088 | NM_000145.4 | AR | |
GDF9 | 1365 | NM_005260.6 | AD | |
MCM9 | 3432 | NM_017696.3 | AR | |
MRPS22 | 1083 | NM_020191.4 | AR | |
NOG | 699 | NM_005450.6 | AD | |
NR5A1 | 1386 | NM_004959.5 | AD | |
NUP107 | 2778 | NM_020401.4 | AR | |
POU5F1 | 1083 | NM_002701.6 | AD | |
PSMC3IP | 654 | NM_016556.4 | AR | |
SOHLH1 | 1164 | NM_001101677.2 | AR | |
CYP21A2 | 1488 | NM_000500.9 | AR | |
EIF4ENIF1 | 3006 | NM_001164501.2 | AD | |
ESR2 | 1593 | NM_001437.3 | AD, AR | |
FANCM | 6147 | NM_020937.4 | AR |
Infos zur Erkrankung
Gonadendysgenesie wie bei Turner Syndrom (45X) kann auch bei chromosomalen Mosaiken (45X/46XX, 45X/46XX/47XXX, 45X/46XY) auftreten. Der übliche Phänotyp der 46XX Gonadendysgenesie umfasst normale Statur, sexuellen Infantilismus, bilaterale Stranggonaden, normale weibliche innere und äußere Genitalien und primäre Amenorrhoe. Die Stranggonade produziert gelegentlich Östrogene oder Androgene, aber maligne Transformation ist selten. Unvollständige Formen dieser Erkrankung können zu hypoplastischen Ovarien führen, die genügend Östrogen produzieren, um eine gewisse Brustentwicklung und einige wenige Menstruationsperioden zu verursachen, gefolgt von sekundärer Amenorrhoe. Dieses heterogene Syndrom tritt sporadisch auf, meist mit autosomal rezessivem oder dominantem Erbgang, in einigen Fällen ist es mit anderen angeborenen Fehlbildungen assoziiert. 46XX Gonadendysgenesie tritt auch im Zusammenhang mit autosomal rezessiv vererbter kongenitaler adrenaler Hyperplasie auf, welche zumeist durch CYP21A2-Mutationen bedingt ist. Vorstufen von 17-Hydroxyprogesteron werden angehäuft, zu Testosteron umgewandelt und verursachen Virilisierung des weiblichen Genitale. Die diagnostische Ausbeute insgesamt bei 46XX Gonadendysgenesie liegt etwas über 30%. Ein unauffälliger genetischer Befund bedeutet keinen sicheren Ausschluss der klinischen Verdachtsdiagnose.
Referenz: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK539886/
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6182188/
- Alias: 46XX pure/complete gonadal dysgenesis
- Alias: Hypergonadotropic amenorrhea; Hypergonadotropic hypogonadism
- Allelic: 46XY sex reversal 3 (NR5A1)
- Allelic: Adrenal hyperplasia, congenital, due to 21-hydroxylase deficiency (CYP21A2)
- Allelic: Adrenocortical insufficiency (NR5A1)
- Allelic: Combined oxidative phosphorylation deficiency 5 (MRPS22)
- Allelic: D-bifunctional protein deficiency (HSD17B4)
- Allelic: Galloway-Mowat syndrome 7 (NUP107)
- Allelic: Hydrops, lactic acidosis + sideroblastic anemia (LARS2)
- Allelic: Mitochondrial DNA depletion syndrome 7, hepatocerebral type (TWNK)
- Allelic: Nephrotic syndrome, type 11 (NUP107)
- Allelic: Ovarian hyperstimulation syndrome (FSHR)
- Allelic: Ovarian response to FSH stimulation (FSHR)
- Allelic: Premature ovarian failure 4 (BMP15)
- Allelic: Progressive external ophthalmoplegia + mitochondrial DNA deletions, AD 3 (TWNK)
- Allelic: Spermatogenic failure 32 (SOHLH1)
- Allelic: Spermatogenic failure 8 (NR5A1)
- 17,20-lyase deficiency, isolated (CYP17A1)
- 17-alpha-hydroxylase/17,20-lyase deficiency (CYP17A1)
- 46XX sex reversal 4 (NR5A1)
- Allelic: Blepharophimosis, epicanthus inversus, and ptosis, type 1 (FOXl2)
- Allelic: Blepharophimosis, epicanthus inversus, and ptosis, type 2 (FOXl2)
- Allelic: Spermatogenic failure 28 (FANCM)
- Autoimmune polyendocrinopathy syndrome , type I, with/-out reversible metaphyseal dysplasia (AIRE)
- Gonadal Dysgenesis [genecards] (SPIDR)
- Hyperandrogenism, nonclassic type, due to 21-hydroxylase deficiency (CYP21A2)
- Ovarian dysgenesis 1 (FSHR)
- Ovarian dysgenesis 2 (BMP15)
- Ovarian dysgenesis 3 (PSMC3IP)
- Ovarian dysgenesis 4 (MCM9)
- Ovarian dysgenesis 5 (SOHLH1)
- Ovarian dysgenesis 6 (NUP107)
- Ovarian dysgenesis 7 (MRPS22)
- Ovarian dysgenesis 8 (ESR2)
- Perrault syndrome 1 (HSD17B4)
- Perrault syndrome 2 (HARS2)
- Perrault syndrome 3 (CLPP)
- Perrault syndrome 4 (LARS2)
- Perrault syndrome 5 (TWNK)
- Perrault syndrome 6 (ERAL1)
- Premature ovarian failure 14 (GDF9)
- Premature ovarian failure 15 (FANCM)
- Premature ovarian failure 3 (FOXl2)
- Premature ovarian failure 7 (NR5A1)
- Primary ovarian failure [MONDO:0005387] (MSH4)
- Primary ovarian insufficiency [panelapp amber] (NOG)
- Primary ovarian insufficiency [panelapp amber] (POLR2C)
- Primary ovarian insufficiency [panelapp amber] (POLR3H)
- Primary ovarian insufficiency [panelapp green] (MSH4)
- Primary ovarian insufficiency [panelapp green] (SOHLH1)
- AD
- AR
- XL
- Multiple OMIM-Ps
Bioinformatik und klinische Interpretation
Test-Stärken
- DAkkS-akkreditiertes Labor
- EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
- Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
- Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
- Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
- eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
- unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
- unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
- unsere umfassenden klinischen Aussagen
Testeinschränkungen
- Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
- Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
- es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
- die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
- Gen-Konversionen
- komplexe Inversionen
- Balancierte Translokationen
- Mitochondriale Varianten
- Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
- nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
- niedriger Mosaik-Status
- Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
- Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
- Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
- Varianten innerhalb von Pseudogenen
- die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde
Laboranforderung
Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.
Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.
Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.
Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.