Klinische FragestellungAnalatresie/anorektale Fehlbildungen, Differentialdiagnose
Zusammenfassung
Umfassendes differentialdiagnostisches panel für Analatresie und anorektale Fehlbildungen mit 3 "core"-/"core candidate"-Genen bzw. insgesamt 26 kuratierten Genen gemäß klinischer Verdachtsdiagnose
42,1 kb (Erweitertes Panel: inkl. additional genes)
- EDTA-Blut (3-5 ml)
NGS +
[Sanger]
Genpanel
Ausgewählte Gene
Name | Exon-Länge (bp) | OMIM-G | Referenz-Seq. | Erbgang |
---|---|---|---|---|
CCNQ | 685 | NM_001130997.3 | XL | |
SALL1 | 3975 | NM_002968.3 | AD | |
SALL4 | 3162 | NM_020436.5 | AD | |
CDX1 | 798 | NM_001804.3 | AD | |
DACT1 | 2515 | NM_001079520.2 | XL | |
EDNRB | 1329 | NM_000115.5 | AD, AR, Sus | |
FANCB | 2580 | NM_001018113.3 | XLR | |
FOXF1 | 1140 | NM_001451.3 | AD | |
GLI3 | 4743 | NM_000168.6 | AD | |
KDM6A | 4206 | NM_021140.4 | XL | |
MED12 | 6534 | NM_005120.3 | XL | |
MID1 | 2004 | NM_000381.4 | XLR | |
RECQL4 | 3628 | NM_004260.4 | AR | |
RET | 3345 | NM_020975.6 | n.k. | |
ZIC3 | 1404 | NM_003413.4 | XLR |
Infos zur Erkrankung
siehe Akro-renales-okuläres Syndrom, Duane, IVIC, Okihiro, Townes-Brook Syndrome; VACTERL-Gene als DD, siehe auch PP0016; anorektale Fehlbildung angefügt
- Alias: Anal atresia
- Allelic: Alveolar capillary dysplasia with misalignment of pulmonary veins (FOXF1)
- Allelic: Baller-Gerold syndrome [craniosynostosis, radial aplasia] (RECQL4)
- Allelic: Central hypoventilation syndrome, congenital (RET)
- Allelic: Congenital heart defects, nonsyndromic, 1, XL (ZIC3)
- Allelic: Fanconi anemia, complementation group B (FANCB)
- Allelic: Greig cephalopolysyndactyly syndrome (GLI3)
- Allelic: Heterotaxy, visceral, 1, XL (ZIC3)
- Allelic: Hirschsprung disease, protection against (RET)
- Allelic: Hirschsprung disease, susceptibility to, 1 (RET)
- Allelic: Hirschsprung disease, susceptibility to, 2 (EDVRB)
- Allelic: Hypothalamic hamartomas, somatic (GLI3)
- Allelic: Intellectual developm. disorder + microcephaly with pontine + cerebellar hypoplasia (CASK)
- Allelic: Lujan-Fryns syndrome [mental retardation, XL; marfanoid habitus] (MED12)
- Allelic: Medullary thyroid carcinoma (RET)
- Allelic: Mental retardation, with/-out nystagmus (CASK)
- Allelic: Multiple endocrine neoplasia IIA + IIB (RET)
- Allelic: Ohdo syndrome, XL [blepharophimosis, mental retardation] (MED12)
- Allelic: Pallister-Hall syndrome (GLI3)
- Allelic: Peripheral neuropathy, myopathy, hoarseness + hearing loss (MYH14)
- Allelic: Pheochromocytoma (RET)
- Allelic: Polydactyly, postaxial, types A1 + B (GLI3)
- Allelic: Polydactyly, preaxial, type IV (GLI3)
- Allelic: RAPADILINO syndrome [radial + patellar aplasia/hypoplasia] (RECQL4)
- Allelic: Rhabdoid tumor predisposition syndrome 2 (SMARCA4)
- Allelic: Rothmund-Thomson syndrome, type 2 [poikiloderma, cong. bone defects, osteosarc.] (RECQL4)
- Allelic: Waardenburg syndrome, type 4A (EDNRB)
- ABCD syndrome [Albinism, Black lock, Cell migration disorder of gut, Deafness] (EDNRB)
- Anorectal malformation (CASK, CDX1, CDX2, FANCB, FOXF1, GLI3, MED12, MNX1, MYCN, MYH14, RET, ZIC3)
- Bardet-Biedl syndrome 1 (BBS1)
- Coffin-Siris syndrome 4 (SMARCA4)
- Currarino syndrome [part. sacral agenesis, presacral mass, anorectal malformation] (MNX1)
- Duane-radial ray [Okihiro; acro-renal-ocular] syndrome (SALL4)
- FG syndrome 4 (CASK)
- Fanconi anemia, complementation group C (FANCC)
- Feingold syndrome 1 (MYCN)
- Helsmoortel-van der Aa syndrome (ADNP)
- IVIC [upper limb anomalies, extraoc. motor disturb., cong. bilateral hearing loss] syndrome (SALL4)
- Intellectual developmental disorder, AD 70 (SETD2)
- Kabuki syndrome 2 (KDM6A)
- Luscan-Lumish syndrome (SETD2)
- Menke-Hennekam syndrome 1 (CREBBP)
- Menke-Hennekam syndrome 2 (EP300)
- Opitz GBBB syndrome, type I [hypertelorism, esophageal abnormality, hypospadias] (MID1)
- Opitz-Kaveggia [FG] syndrome [ment. retard., macrocephal, imperfor. anus, corp. call. agen.] (MED12)
- Pallister-Hall syndrome (GLI3)
- Rabin-Pappas syndrome (SETD2)
- Rubinstein-Taybi syndrome 1 (CREBBP)
- Rubinstein-Taybi syndrome 2 (EP300)
- STAR syndrome; toe Syndactyly, Telecanthus, Anogenital + Renal malformations (CCNQ)
- Townes-Brocks branchiootorenal-like syndrome (SALL1)
- Townes-Brocks syndrome 1 (SALL1)
- Townes-Brocks syndrome 2 (DACT1)
- VACTERL association with hydrocephalus (FANCB)
- VACTERL association, XL (ZIC3)
- VATER/VACTERL assoc., Alveolar capillary dysplasia + misalignment of pulmonary veins (FOXF1)
- AD
- AR
- Sus
- XL
- XLR
- n.k.
- Multiple OMIM-Ps
Bioinformatik und klinische Interpretation
Test-Stärken
- DAkkS-akkreditiertes Labor
- EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
- Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
- Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
- Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
- eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
- unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
- unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
- unsere umfassenden klinischen Aussagen
Testeinschränkungen
- Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
- Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
- es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
- die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
- Gen-Konversionen
- komplexe Inversionen
- Balancierte Translokationen
- Mitochondriale Varianten
- Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
- nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
- niedriger Mosaik-Status
- Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
- Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
- Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
- Varianten innerhalb von Pseudogenen
- die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde
Laboranforderung
Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.
Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.
Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.
Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.