Klinische FragestellungHornhaut-Dystrophie, Differentialdiagnose
Zusammenfassung
Umfassendes differentialdiagnostisches panel für Hornhaut-Dystrophie mit 17 bzw. zusammen genommen 22 kuratierten Genen gemäß klinischer Verdachtsdiagnose
52,3 kb (Erweitertes Panel: inkl. additional genes)
- EDTA-Blut (3-5 ml)
NGS +
Genpanel
Ausgewählte Gene
Name | Exon-Länge (bp) | OMIM-G | Referenz-Seq. | Erbgang |
---|---|---|---|---|
CHST6 | 1188 | NM_021615.5 | AR | |
COL17A1 | 4494 | NM_000494.4 | AD | |
COL8A2 | 2112 | NM_005202.4 | AD | |
DCN | 1080 | NM_001920.5 | AD | |
GRHL2 | 1878 | NM_024915.4 | AD | |
GSN | 2349 | NM_000177.5 | AD | |
KRT12 | 1485 | NM_000223.4 | AD | |
KRT3 | 1887 | NM_057088.3 | AD | |
PIKFYVE | 1647 | NM_001178000.2 | AD | |
PRDM5 | 1893 | NM_018699.4 | AR | |
SLC4A11 | 2676 | NM_032034.4 | AR | |
TACSTD2 | 972 | NM_002353.3 | AR | |
TCF4 | 2016 | NM_001083962.2 | AD | |
TGFBI | 2052 | NM_000358.3 | AD | |
UBIAD1 | 1017 | NM_013319.3 | AD | |
ZEB1 | 3327 | NM_001128128.3 | AD | |
ZNF469 | 11862 | NM_001367624.2 | AR | |
AGBL1 | 3339 | NM_152336.4 | AD | |
KERA | 1059 | NM_007035.4 | AR | |
LCAT | 1323 | NM_000229.2 | AR | |
OVOL2 | 832 | NM_021220.4 | AD | |
STS | 1752 | NM_000351.7 | XLR |
Infos zur Erkrankung
Hornhaut-Dystrophien (CDs) sind genetisch heterogene Erkrankungen, die durch die allmähliche Ansammlung von Ablagerungen in verschiedenen Schichten gekennzeichnet sind und zu Veränderungen der Transparenz und des Brechungsindex der Cornea führen. Klinisch werden diese Krankheiten in anatomische Kategorien eingeteilt, je nachdem, welche Hornhaut-Schicht betroffen ist. CDs werden demnach in 4 Kategorien eingeteilt: epithelial/subepithelial, epithelial-stromal, stromal und endothelial. Patienten mit CD können asymptomatisch sein, sofern aber Symptome auftreten, kommt es typischerweise zum beidseitigen Sehschärfe-Verlust, meist in Form eines irregulären Astigmatismus. Die Symptome können je nach Diagnose in jedem Alter auftreten. Je nachdem, welche Hornhaut-Schicht betroffen ist, weisen die Patienten auch Photophobie, trockene Augen, Hornhautödeme und wiederkehrende Hornhauterosionen auf, insbesondere bei den CDs auf Epithel-Basis, was erhebliche Schmerzen verursacht. Defekte in der Endothelzellschicht führen zu Narbenbildung, Vaskularisierung und folglich zum Verlust des Sehvermögens. Für die Mehrzahl der CDs ist eine Korrelation zwischen Phänotyp und Genotyp nicht nachgewiesen. CDs werden autosomal dominant und rezessiv oder X.-chromosomal vererbt. Da die diagnostische Ausbeute durch Molekulargenetik begrenzt ist (~70 %), schließt ein negatives DNA-Testergebnis die ophthalmologische Diagnose nicht aus.
Referenzen: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31301286/
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK2690/
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK91457/
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1304/
- Alias: Bietti crystalline corneoretinal dystrophy
- Alias: Cornea Dystrophie
- Alias: Corneal dystrophy, Fuchs endothelial,
- Alias: Corneal dystrophy, congenital stromal
- Allelic: Amyloidosis, Finnish type (GSN)
- Allelic: Anterior segment dysgenesis 2, multiple subtypes (FOXE3)
- Allelic: Aortic aneurysm, familial thoracic 11, susceptibility to (FOXE3)
- Allelic: Cataract 34, multiple types (FOXE3)
- Allelic: Craniofacial anomalies + anterior segment dysgenesis syndrome (VSX1)
- Allelic: Deafness, autosomal dominant 28 (GRHL2)
- Allelic: Deafness, autosomal recessive 77 (LOXHD1)
- Allelic: Ectodermal dysplasia/short stature syndrome (GRHL2)
- Allelic: Epidermolysis bullosa, junctional, localisata variant (COL17A1)
- Allelic: Epidermolysis bullosa, junctional, non-Herlitz type (COL17A1)
- Allelic: Pitt-Hopkins syndrome (TCF4)
- Bietti crystalline corneoretinal dystrophy (CYP4V2)
- Brittle cornea syndrome 1 (ZNF469)
- Brittle cornea syndrome 2 (PRDM5)
- Corneal dystrophy, Avellino type (TGFBI)
- Corneal dystrophy, Fuchs endothelial, 1 (COL8A2)
- Corneal dystrophy, Fuchs endothelial, 3 (TCF4)
- Corneal dystrophy, Fuchs endothelial, 4 (SLC4A11)
- Corneal dystrophy, Fuchs endothelial, 6 (ZEB1)
- Corneal dystrophy, Fuchs endothelial, 8 (AGBL1)
- Corneal dystrophy, Groenouw type I (TGFBI)
- Corneal dystrophy, Reis-Bucklers type (TGFBI)
- Corneal dystrophy, Schnyder type (UBIAD1)
- Corneal dystrophy, Thiel-Behnke type (TGFBI)
- Corneal dystrophy, congenital stromal (DCN)
- Corneal dystrophy, epithelial basement membrane (TGFBI)
- Corneal dystrophy, gelatinous drop-like (TACSTD2)
- Corneal dystrophy, lattice type I, IIIA (TGFBI)
- Corneal dystrophy, posterior polymorphous, 1 (OVOL2)
- Corneal dystrophy, posterior polymorphous, 2 (COL8A2)
- Corneal dystrophy, posterior polymorphous, 3 (ZEB1)
- Corneal dystrophy, posterior polymorphous, 4 (GRHL2)
- Corneal endothelial dystrophy + perceptive deafness (SLC4A11)
- Corneal endothelial dystrophy, AR (SLC4A11)
- Corneal fleck dystrophy (PIKFYVE)
- Epithelial recurrent erosion dystrophy (COL17A1)
- Keratoconus 1 (VSX1)
- Macular corneal dystrophy (CHST6)
- Meesmann corneal dystrophy 1 (KRT12)
- Meesmann corneal dystrophy 2 (KRT3)
- AD
- AR
- XLR
- Multiple OMIM-Ps
Bioinformatik und klinische Interpretation
Test-Stärken
- DAkkS-akkreditiertes Labor
- EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
- Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
- Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
- Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
- eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
- unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
- unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
- unsere umfassenden klinischen Aussagen
Testeinschränkungen
- Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
- Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
- es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
- die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
- Gen-Konversionen
- komplexe Inversionen
- Balancierte Translokationen
- Mitochondriale Varianten
- Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
- nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
- niedriger Mosaik-Status
- Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
- Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
- Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
- Varianten innerhalb von Pseudogenen
- die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde
Laboranforderung
Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.
Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.
Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.
Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.