Klinische FragestellungMorbus Hirschsprung, syndromisch; Differentialdiagnose
Zusammenfassung
Umfassendes differentialdiagnostisches panel für Morbus Hirschsprung, syndromisch, mit 1 Leitlinien-kuratierten "core"-Gen, 11 weiteren "core-candidate"-Genen und insgesamt 49 kuratierten Genen gemäß klinischer Verdachtsdiagnose
79,3 kb (Erweitertes Panel: inkl. additional genes)
- EDTA-Blut (3-5 ml)
NGS +
[Sanger]
Genpanel
Ausgewählte Gene
Name | Exon-Länge (bp) | OMIM-G | Referenz-Seq. | Erbgang |
---|---|---|---|---|
ECE1 | 2313 | NM_001397.3 | AD | |
EDN3 | 717 | NM_207034.3 | AD, AR, Sus | |
EDNRB | 1329 | NM_000115.5 | AD, AR, Sus | |
GDNF | 636 | NM_000514.4 | AD | |
KIFBP | 1866 | NM_015634.4 | AR | |
L1CAM | 3774 | NM_000425.5 | XLR | |
PHOX2B | 945 | NM_003924.4 | AD | |
RET | 3345 | NM_020975.6 | AD | |
SOX10 | 1401 | NM_006941.4 | AD | |
TTC8 | 1518 | NM_198309.3 | AR | |
ZEB2 | 3645 | NM_014795.4 | AD | |
BBS1 | 1782 | NM_024649.5 | AR, digenisch | |
BBS10 | 2172 | NM_024685.4 | AR | |
BBS12 | 2133 | NM_152618.3 | AR | |
BBS2 | 2166 | NM_031885.5 | AR | |
BBS4 | 1560 | NM_033028.5 | AR | |
BBS7 | 2148 | NM_176824.3 | AR | |
CELSR3 | 9974 | NM_001407.3 | AD | |
DENND3 | 4626 | NM_014957.5 | AD | |
DHCR7 | 1428 | NM_001360.3 | AR | |
GFRA1 | 1398 | NM_005264.8 | Sus | |
MKKS | 1713 | NM_018848.3 | AR | |
MKS1 | 1680 | NM_017777.4 | AR | |
NCLN | 1707 | NM_020170.4 | AD | |
NKX2-1 | 1206 | NM_001079668.3 | AD | |
NRG1 | 1938 | NM_013956.5 | Ass | |
NRG3 | 2091 | NM_001010848.4 | Sus | |
NUP98 | 5507 | NM_005387.7 | AD | |
RMRP | 300 | NR_003051.3 | AR | |
SEMA3C | 2273 | NM_006379.5 | AD | |
SEMA3D | 2334 | NM_152754.3 | AD | |
TBATA | 2160 | NM_152710.4 | AD | |
TCF4 | 2016 | NM_001083962.2 | AD | |
VCL | 3405 | NM_014000.3 | AD |
Infos zur Erkrankung
- Hirschsprung IN Bardet-Biedl-Syndrom; Knorpel-Haar-Hypoplasie-anauxtische Dysplasie-Spektrum-Störungen; Kongenitales zentrales Hypoventilationssyndrom; Familiäre Dysautonomie (Riley-Day-Syndrom); Fryns-Syndrom; Goldberg-Shprintzen-Syndrom; Intestinale neuronale Dysplasie; L1-Syndrom; MEN 2A/FMTC; MEN 2B; Mowat-Wilson-Syndrom; Neurofibromatose 1; Pitt-Hopkins-Syndrom; Smith-Lemli-Opitz-Syndrom; Smith-Lemli-Opitz-Syndrom
- Alias: Aganglionic megacolon + other symptoms
- Alias: Agangliose + other symptoms
- Alias: Congenital intestinal aganglionosis + other symptoms
- Allelic: Anauxetic dysplasia 1 (RMRP)
- Allelic: CRASH syndrome (L1CAM)
- Allelic: Chorea, hereditary benign (NKX2-1)
- Allelic: Choreoathetosis, hypothyroidism + neonatal respiratory distress (NKX2-1)
- Allelic: Corneal dystrophy, Fuchs endothelial, 3 (TCF4)
- Allelic: Corpus callosum, partial agenesis of (L1CAM)
- Allelic: Hypertension, essential, susceptibility to (ECE1)
- Allelic: MASA syndrome (L1CAM)
- Allelic: McKusick-Kaufman syndrome (MKKS)
- Allelic: Medullary thyroid carcinoma (RET)
- Allelic: Metaphyseal dysplasia without hypotrichosis (RMRP)
- Allelic: Multiple endocrine neoplasia IIA (RET)
- Allelic: Multiple endocrine neoplasia IIB (RET)
- Allelic: Neuroblastoma, susceptibility to, 2 (PHOX2B)
- Allelic: Pheochromocytoma (RET)
- Allelic: Pheochromocytoma, modifier of (GDNF)
- Allelic: Retinitis pigmentosa 51 (TTC8)
- Allelic: Schizophrenia, susceptibility to (NRG1)
- Allelic: Thyroid cancer, nonmedullary, 1 (NKX2-1)
- ABCD syndrome (EDNRB)
- Acrocapitofemoral dysplasia (IHH)
- Bardet-Biedl syndrome 1 (BBS1, -4, -7, -10, -12)
- Bardet-Biedl syndrome 13 (MKS1)
- Bardet-Biedl syndrome 6 (MKKS)
- Bardet-Biedl syndrome 8 (TTC8)
- Brachydactyly, type A1 (IHH)
- Cartilage-hair hypoplasia (RMRP)
- Central hypoventilation syndrome, congenital, with/-out Hirschsprung disease (PHOX2B)
- Culler-Jones syndrome (GLI2)
- Epidermolysis bullosa, junctional 5A, intermediate (ITGB4)
- Epidermolysis bullosa, junctional 5B, with pyloric atresia (ITGB4)
- Episodic ataxia type 8 [panelapp?] (UBR4)
- Glycogen storage disease XIII (ENO3)
- Goldberg-Shprintzen megacolon syndrome (KIFBP)
- Greig cephalopolysyndactyly syndrome (GLI3)
- Hirschsprung disease [panelapp] (CELSR3)
- Hirschsprung disease, cardiac defects + autonomic dysfunction (ECE1)
- Hirschsprung disease, protection against (RET)
- Hirschsprung disease, short-segment aganglionosis (NKX2-1)
- Hirschsprung disease, susceptibility to [panelapp] (DENND3)
- Hirschsprung disease, susceptibility to [panelapp] (GFRA1)
- Hirschsprung disease, susceptibility to [panelapp] (NCLN)
- Hirschsprung disease, susceptibility to [panelapp] (NRG1)
- Hirschsprung disease, susceptibility to [panelapp] (NRG3)
- Hirschsprung disease, susceptibility to [panelapp] (NUP98)
- Hirschsprung disease, susceptibility to [panelapp] (SEMA3C)
- Hirschsprung disease, susceptibility to [panelapp] (SEMA3D)
- Hirschsprung disease, susceptibility to [panelapp] (TBATA)
- Hirschsprung disease, susceptibility to [panelapp] (VCL)
- Hirschsprung disease, susceptibility to, 1 (RET)
- Hirschsprung disease, susceptibility to, 2 (EDNRB)
- Hirschsprung disease, susceptibility to, 3 (GDNF)
- Hirschsprung disease, susceptibility to, 4 (EDN3)
- Hirschsprung disease,HSCR [panelapp] (BACE2)
- Holoprosencephaly 9 (GLI2)
- Hydrocephalus due to aqueductal stenosis (L1CAM)
- Hydrocephalus with Hirschsprung disease (L1CAM)
- Hydrocephalus with congenital idiopathic intestinal pseudoobstruction (L1CAM)
- Joubert syndrome 28 (MKS1)
- Meckel syndrome 1 (MKS1)
- Mowat-Wilson syndrome (ZEB2)
- Neuroblastoma with Hirschsprung disease (PHOX2B)
- PCWH syndrome (SOX10)
- Pallister-Hall syndrome (GLI3)
- Pitt-Hopkins syndrome (TCF4)
- Polydactyly, postaxial, type A8 (GLI1)
- Polydactyly, postaxial, types A1 + B (GLI3)
- Polydactyly, preaxial I (GLI1)
- Polydactyly, preaxial, type IV (GLI3)
- Short-segment Hirschsprung disease [panelapp] (VCL)
- Smith-Lemli-Opitz syndrome (DHCR7)
- Susceptibility to Hirschsprung disease [panelapp] (NRTN)
- Susceptibility to Hirschsprung disease [panelapp] (PSPN)
- Visceral neuropathy, familial, 2, AR (ERBB2)
- Waardenburg syndrome, type 2E, with/-out neurologic involvement (SOX10)
- Waardenburg syndrome, type 4A (EDNRB)
- Waardenburg syndrome, type 4B (EDN3)
- Waardenburg syndrome, type 4C (SOX10)
- AD
- AR
- Ass
- Sus
- XLR
- digenisch
- Multiple OMIM-Ps
Bioinformatik und klinische Interpretation
Test-Stärken
- DAkkS-akkreditiertes Labor
- EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
- Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
- Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
- Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
- eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
- unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
- unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
- unsere umfassenden klinischen Aussagen
Testeinschränkungen
- Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
- Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
- es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
- die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
- Gen-Konversionen
- komplexe Inversionen
- Balancierte Translokationen
- Mitochondriale Varianten
- Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
- nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
- niedriger Mosaik-Status
- Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
- Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
- Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
- Varianten innerhalb von Pseudogenen
- die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde
Laboranforderung
Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.
Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.
Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.
Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.