Klinische FragestellungNierenkarzinom [Suszeptibilität]
Zusammenfassung
Ein kuratiertes panel mit 4 Leilinien-kuratierten Genen bzw. insgesamt 31 Genen zur umfassenden Untersuchung der genetisch bedingten Suszeptibilität für Nierenkarzinom
57,8 kb (Erweitertes Panel: inkl. additional genes)
- EDTA-Blut (3-5 ml)
NGS +
[Sanger]
Genpanel
Ausgewählte Gene
Name | Exon-Länge (bp) | OMIM-G | Referenz-Seq. | Erbgang |
---|---|---|---|---|
BAP1 | 2190 | NM_004656.4 | AD | |
FH | 1533 | NM_000143.4 | AD, Sus | |
FLCN | 1740 | NM_144997.7 | AD, Sus | |
HNF1A | 1896 | NM_000545.8 | AD, Sus | |
HNF1B | 1674 | NM_000458.4 | Sus | |
MET | 4227 | NM_001127500.3 | AD, Sus | |
MLH1 | 2271 | NM_000249.4 | AD, Sus | |
MSH2 | 2805 | NM_000251.3 | AD, Sus | |
MSH6 | 4083 | NM_000179.3 | AD, Sus | |
PMS2 | 2589 | NM_000535.7 | Sus, AD | |
PTEN | 1212 | NM_000314.8 | AD | |
SDHB | 843 | NM_003000.3 | AD | |
VHL | 642 | NM_000551.4 | AD | |
WT1 | 1569 | NM_024426.6 | Sus | |
CCND1 | 888 | NM_053056.3 | Sus | |
CDC73 | 1596 | NM_024529.5 | AD | |
CDKN2B | 417 | NM_004936.4 | AD | |
DICER1 | 5769 | NM_177438.3 | AD | |
EPCAM | 945 | NM_002354.3 | AD, Sus | |
MITF | 1260 | NM_000248.4 | AD | |
OGG1 | 1038 | NM_002542.6 | Sus, SMu | |
RNF139 | 1995 | NM_007218.4 | n.k. | |
SDHA | 1995 | NM_004168.4 | Sus | |
SDHAF2 | 501 | NM_017841.4 | AD | |
SDHC | 510 | NM_003001.5 | AD | |
SDHD | 480 | NM_003002.4 | AD, AR, Sus | |
SLC49A4 | 1437 | NM_032839.3 | AD, Sus | |
TMEM127 | 717 | NM_017849.4 | AD | |
TSC1 | 3495 | NM_000368.5 | AD | |
TSC2 | 5424 | NM_000548.5 | AD |
Infos zur Erkrankung
Erbliche Nierenkarzinome könnten 5-8% aller Nierenkarzinome ausmachen. Die Mehrzahl der primären Nierenmalignome sind Nierenzellkarzinome, die oft ein frühes Erkrankungsalter (≥45 Jahre), eine typische Histologie und häufig Bilateralität sowie Multizentrizität der Primärtumoren aufweisen. Der Wilms-Tumor (Nephroblastom) ist der häufigste Nierentumor des Kindesalters. Es sind mehr als 15 Syndrome mit vererbter Anfälligkeit für Nierenkrebs identifiziert, und es gibt über 25 bekannte Gene, die mit ihnen assoziiert sind. Die meisten Nierenmalignome werden dominant vererbt. Die Aggressivität der erblichen Nierenzellkarzinome variiert je nach Syndrom und Mutation. Die Anfälligkeit für Nierenkrebs kann durch eine Hochrisiko-, moderate Risiko- oder Niedrigrisiko-Genmutationen verursacht werden. Die mittels Molekulargenetik erzielte diagnostische Ausbeute ist derzeit unbekannt. Damit stellt ein negatives Ergebnis keinerlei Ausschluss der klinischen Diagnose dar.
Referenz: DOI: 10.5772/intechopen.91933
- Alias: Inherited renal cancer-predisposing syndrome
- Alias: Renal cell carcinoma, clear cell, somatic
- Allelic: Colorectal cancer, hereditary nonpolyposis 1-4 (MLH1, MSH2, MSH6, PMS2)
- Allelic: Colorectal cancer, somatic (FLCN)
- Allelic: Colorectal cancer, susceptibility to (CCND1)
- Allelic: Cowden syndrome 1 (PTEN)
- Allelic: Deafness, AR 97 (MET)
- Allelic: Denys-Drash syndrome (WT1)
- Allelic: Diabetes mellitus, insulin-dependent, 20 (HNF1A)
- Allelic: Diabetes mellitus, noninsulin-dependent (HNF1B)
- Allelic: Diabetes mellitus, noninsulin-dependent, 2 (HNF1A)
- Allelic: Erythrocytosis, familial, 2 (VHL)
- Allelic: Frasier syndrome (WT1)
- Allelic: Fumarase deficiency (FH)
- Allelic: Gastrointestinal stromal tumor (SDHB)
- Allelic: Glioma susceptibility 2 (PTEN)
- Allelic: Goiter, multinodular 1, +/- Sertoli-Leydig cell tumors (DICER1)
- Allelic: Hemangioblastoma, cerebellar, somatic (VHL)
- Allelic: Hepatic adenoma, somatic (HNF1A)
- Allelic: Hepatocellular carcinoma, childhood type, somatic (MET)
- Allelic: Lhermitte-Duclos syndrome (PTEN)
- Allelic: MODY, type III (HNF1A)
- Allelic: Macrocephaly/autism syndrome (PTEN)
- Allelic: Meacham syndrome (WT1)
- Allelic: Meningioma (PTEN)
- Allelic: Mesothelioma, somatic (WT1)
- Allelic: Muir-Torre syndrome (MLH1, MSH2)
- Allelic: Multiple myeloma, susceptibility to (CCND1)
- Allelic: Nephrotic syndrome, type 4 (WT1)
- Allelic: Osteofibrous dysplasia, susceptibility to (MRT)
- Allelic: Paraganglioma + gastric stromal sarcoma (SDHB)
- Allelic: Paragangliomas 4 (SDHB)
- Allelic: Pheochromocytoma (SDHB)
- Allelic: Pheochromocytoma (VHL)
- Allelic: Pleuropulmonary blastoma (DICER1)
- Allelic: Pneumothorax, primary spontaneous (FLCN)
- Allelic: Prostate cancer, somatic (PTEN)
- Allelic: Renal cysts + diabetes syndrome (HNF1B)
- Birt-Hogg-Dube syndrome (FLCN)
- Leiomyomatosis + renal cell cancer (FH)
- Mismatch repair cancer syndrome (MLH1, MSH2, MSH6, PMS2)
- Renal carcinoma, chromophobe, somatic (FLCN)
- Renal cell carcinoma (HNF1A, HNF1B)
- Renal cell carcinoma, papillary (PRCC)
- Renal cell carcinoma, papillary, 1, familial + somatic (MET)
- Renal cell carcinoma, somatic (VHL)
- Rhabdomyosarcoma, embryonal, 2 (DICER1)
- Tumor predisposition syndrome (BAP1)
- Wilms tumor, type 1 (WT1)
- von Hippel-Lindau syndrome (VHL)
- von Hippel-Lindau syndrome, modifier of (CCND1)
- AD
- AR
- SMu
- Sus
- n.k.
- Multiple OMIM-Ps
Bioinformatik und klinische Interpretation
Test-Stärken
- DAkkS-akkreditiertes Labor
- EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
- Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
- Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
- Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
- eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
- unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
- unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
- unsere umfassenden klinischen Aussagen
Testeinschränkungen
- Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
- Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
- es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
- die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
- Gen-Konversionen
- komplexe Inversionen
- Balancierte Translokationen
- Mitochondriale Varianten
- Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
- nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
- niedriger Mosaik-Status
- Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
- Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
- Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
- Varianten innerhalb von Pseudogenen
- die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde
Laboranforderung
Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.
Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.
Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.
Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.