Klinische FragestellungPränataler Hydrozephalus, Differentialdiagnose
Zusammenfassung
Umfassendes differentialdiagnostisches panel für Pränataler Hydrozephalus mit insgesamt 116 kuratierten Genen gemäß klinischer Verdachtsdiagnose
232,5 kb (Erweitertes Panel: inkl. additional genes)
- Chorionzotten (CVS)
- Fruchtwasser (nach AC)
- Nabelschnurblut (NB)
NGS +
[Sanger]
Genpanel
Ausgewählte Gene
Name | Exon-Länge (bp) | OMIM-G | Referenz-Seq. | Erbgang |
---|---|---|---|---|
AKT3 | 1440 | NM_005465.7 | AD | |
AP1S2 | 474 | NM_003916.5 | XLR | |
ARSB | 1602 | NM_000046.5 | AR | |
B3GALNT2 | 1503 | NM_152490.5 | AR | |
B3GLCT | 1497 | NM_194318.4 | AR | |
B4GAT1 | 1248 | NM_006876.3 | AR | |
B9D2 | 528 | NM_030578.4 | AR | |
BLTP1 | 15018 | NM_015312.4 | AR | |
BUB1B | 3153 | NM_001211.6 | AR | |
CC2D2A | 4863 | NM_001080522.2 | AR | |
CCDC88C | 6087 | NM_001080414.4 | AR | |
CCND2 | 870 | NM_001759.4 | AD | |
CENPF | 9403 | NM_016343.4 | AR | |
CEP83 | 2106 | NM_001042399.2 | AR | |
COL4A1 | 5010 | NM_001845.6 | AD | |
CRB2 | 3858 | NM_173689.7 | AR | |
CRPPA | 1356 | NM_001101426.4 | AR | |
DAG1 | 2688 | NM_004393.6 | AR | |
DENND5A | 3864 | NM_015213.4 | AR | |
DHCR24 | 1551 | NM_014762.4 | AR | |
EBP | 693 | NM_006579.3 | XL | |
EEF2 | 2577 | NM_001961.4 | AD | |
EML1 | 2448 | NM_004434.3 | AR | |
ERF | 1647 | NM_006494.4 | AD | |
FAM20C | 1755 | NM_020223.4 | AR | |
FANCB | 2580 | NM_001018113.3 | XLR | |
FGFR1 | 2469 | NM_023110.3 | AD | |
FGFR2 | 2466 | NM_000141.5 | AD | |
FGFR3 | 2421 | NM_000142.5 | AD | |
FKRP | 1488 | NM_024301.5 | AR | |
FKTN | 1386 | NM_001079802.2 | AR | |
FLNA | 7920 | NM_001456.4 | XL | |
FLVCR2 | 1581 | NM_017791.3 | AR | |
GFAP | 1299 | NM_002055.5 | AD | |
GLI3 | 4743 | NM_000168.6 | AD | |
GPSM2 | 2055 | NM_013296.5 | AR | |
GUSB | 1956 | NM_000181.4 | AR | |
HYLS1 | 900 | NM_145014.3 | AR | |
IDS | 1653 | NM_000202.8 | XLR | |
KIAA0586 | 5005 | NM_001244189.2 | AR | |
KIDINS220 | 5431 | NM_020738.4 | AD | |
L1CAM | 3774 | NM_000425.5 | XLR | |
LAMB1 | 5361 | NM_002291.3 | AR | |
LARGE1 | 2271 | NM_004737.7 | AR | |
MAN2B1 | 3036 | NM_000528.4 | AR | |
MPDZ | 6126 | NM_003829.5 | AR | |
MYMK | 671 | NM_001080483.3 | AR | |
NF1 | 8457 | NM_001042492.3 | AD | |
NF2 | 1788 | NM_000268.4 | AD | |
NSD1 | 8091 | NM_022455.5 | AD | |
OSTM1 | 1005 | NM_014028.4 | AR | |
PIK3CA | 3207 | NM_006218.4 | AD | |
PIK3R2 | 2187 | NM_005027.4 | AD | |
PLG | 2433 | NM_000301.5 | AR | |
POMGNT1 | 1983 | NM_017739.4 | AR | |
POMGNT2 | 1743 | NM_032806.6 | AR | |
POMK | 1053 | NM_032237.5 | AR | |
POMT1 | 2244 | NM_007171.4 | AR | |
POMT2 | 2253 | NM_013382.7 | AR | |
PPP2R5D | 1356 | NM_006245.4 | AD | |
PTCH1 | 4344 | NM_000264.5 | AD | |
PTEN | 1212 | NM_000314.8 | AD | |
RNF125 | 699 | NM_017831.4 | AD | |
RPS6KA3 | 2223 | NM_004586.3 | XL | |
RXYLT1 | 1355 | NM_014254.3 | AR | |
SKI | 2187 | NM_003036.4 | AD | |
SMARCC1 | 3318 | NM_003074.4 | AD | |
SNX10 | 606 | NM_001199835.1 | AR | |
STRADA | 1185 | NM_001003786.3 | AR | |
SUFU | 1455 | NM_016169.4 | AR | |
SUMF1 | 1125 | NM_182760.4 | AR | |
TBC1D32 | 4318 | NM_152730.6 | AR | |
TCF12 | 2121 | NM_207036.2 | AD | |
TCIRG1 | 2493 | NM_006019.4 | AR | |
TNFRSF11A | 1851 | NM_003839.4 | AR | |
TRIM71 | 2611 | NM_001039111.3 | AD | |
TWIST1 | 609 | NM_000474.4 | AD | |
USP9X | 7713 | NM_001039590.3 | XL | |
VHL | 642 | NM_000551.4 | AD | |
WASHC5 | 3480 | NM_014846.4 | AR | |
ZBTB20 | 2226 | NM_001164342.2 | AD | |
ZIC2 | 1599 | NM_007129.5 | AD | |
ZIC3 | 1404 | NM_003413.4 | XLR |
Infos zur Erkrankung
Auf pränatalen Hydrozephalus (HC) wird in der Regel durch die beobachtete Ventrikulomegalie (VM) im pränatalen Ultraschall geschlossen, die z.B. auf erhöhten intrakraniellen Druck zurückzuführen ist, in der Regel durch Obstruktion verursacht, schließlich zur progressiven Makrozephalie führt. Die Begriffe HC und VM werden häufig synonym verwendet. Die sonographischen Zeichen umfassen ein heterogenes Spektrum von Zuständen, das von pathologischen Prozessen mit schwerwiegenden Folgen für die neurologische Entwicklung bis hin zu normalen Veränderungen reicht. Zu den Ursachen für gestörte Liquor-Zirkulation und -Obstruktion gehören Aquädukt- und Monro-Foramen-Stenose, Neuralrohrdefekte, Dandy-Walker-Malformation sowie primäre Hirnfehlbildungen wie Holoprosenzephalie, kortikale Entwicklungs- und Corpus-Callosum-Anomalien. Neben Chromosomenstörungen (Trisomien 21, 18, 13; komplexen Aberrationen etc.) und Kopienzahl-Varianten werden die genetischen HC-Syndrome auch durch viele verschiedene Einzelgenmutationen verursacht. Störungen der neuronalen Adhäsion, des Vesikel-Transports und der Wnt-Signalwege sind in diesem Zusammenhang ebenso anzuführen wie Dystroglykanopathien, Ziliopathien, RASopathien, lysosomale Speicherkrankheiten, gestörte Wachstums- und Transkriptionsfaktor-Expression neben zahlreichen komplexen genetischen Syndromen. So umfasst z.B. das L1-Syndrom ein breites Spektrum, das von schwer bis leicht reicht und drei klinische Phänotypen einschließt: den X-chromosomalen Hydrocephalus mit Stenose des sylvischen Aquädukts, das MASA-Syndrom (Mentale Retardierung, Aphasie, Spastische Paraplegie, Adduzierte Daumen) einschließlich der X-chromosomal-bedingten komplizierten hereditären spastischen Paraplegie Typ 1 und schließlich die X-gebundene komplizierte Corpus-Callosum-Agenesie. Alle Phänotypen können bei den betroffenen Personen in ein und derselben Familie beobachtet werden, was die Variabilität des Syndroms widerspiegelt. Neben Umwelt-bedingten Formen (Infektionen) und multifaktoriellen Geschehen werden beim monogenen HC alle klassischen Vererbungsmuster beobachtet. Trotz besonders umfangreicher Genpanels ist die DNA-diagnostische Ausbeute begrenzt, aber abhängig von der klinischen Aufarbeitung des Falls bzw. der betroffenen Familie. So schließt ein negatives molekulargenetisches Ergebnis die klinische Diagnose keineswegs aus.
Referenzen: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1484/
https://www.annualreviews.org/doi/pdf/10.1146/annurev-neuro-070815-014023
- Allelic: Chondrodysplasia punctata, XLD (EBP)
- Allelic: Osteolysis, familial expansile (TNFRSF11A)
- Allelic: Paget disease of bone 2, early-onset (TNFRSF11A)
- Acrocallosal syndrome (KIF7)
- Al-Gazali-Bakalinova syndrome (KIF7)
- Alexander disease (GFAP)
- Alkuraya-Kucinskas syndrome (KIAA1109)
- Angiopathy, hereditary, with nephropathy, aneurysms + muscle cramps (COL4A1)
- Antley-Bixler syndrome without genital anomalies or disordered steroidogenesis (FGFR2)
- Apert syndrome (FGFR2)
- Band heterotopia (EML1)
- Bardet-Biedl syndrome 13 (MKS1)
- Basal cell nevus syndrome (PTCH2)
- Brain small vessel disease with/-out ocular anomalies (COL4A1)
- CLAPO syndrome, somatic (PIK3CA)
- CLOVE syndrome, somatic (PIK3CA)
- COACH syndrome (CC2D2A)
- COACH syndrome 1 (TMEM67)
- COACH syndrome 3 (RPGRIP1L)
- CRASH syndrome (L1CAM)
- Carey-Fineman-Ziter syndrome (MYMK)
- Caudal regression syndrome (VANGL1)
- Cerebellar ataxia, impaired intellectual development, dysquilibrium syndrome 2 (WDR81)
- Chitayat syndrome (ERF)
- Chondrodysplasia + platyspondyly, distinctive brachydactyly, hydrocephaly, microphthalmia (HDAC6)
- Chudley-McCullough syndrome (GPSM2)
- Ciliary dyskinesia, primary, 1, with or without situs inversus (DNAI1)
- Coffin-Lowry syndrome (RPS6KA3)
- Coffin-Siris syndrome 3 (SMARCB1)
- Cole-Carpenter syndrome 1 (P4HB)
- Cole-Carpenter syndrome 2 (SEC24D)
- Congenital hydrocephalus, aqueductal stenosis, septal agenesis [panelapp] (SMARCC1)
- Corpus callosum abnormalities [panelapp] (SMARCC1)
- Craniosynostosis 1 (TWIST1)
- Craniosynostosis 3 (TCF12)
- Craniosynostosis 4 (ERF)
- Craniosynostosis, nonspecific (FGFR2)
- Crouzon syndrome (FGFR2)
- Desmosterolosis (DHCR24)
- Developmental + epileptic encephalopathy 1
- Dysplasminogenemia (PLG)
- Ellis-van Creveld syndrome (EVC2)
- Endocrine-cerebroosteodysplasia (CILK1)
- Epileptic encephalopathy, early infantile, 49 (DENND5A)
- Erythrocytosis, familial, 2 (VHL) 3
- Fanconi anemia, complementation group B (FANCB)
- Focal segmental glomerulosclerosis 9 (CRB2)
- Greig cephalopolysyndactyly syndrome (GLI3)
- Hartsfield syndrome (FGFR1)
- Heterotaxy, visceral, 1, XL (ZIC3)
- Holoprosencephaly 3 (SHH)
- Holoprosencephaly 5 (ZIC2)
- Holoprosencephaly 7 (PTCH1)
- Hydranencephaly with abnormal genitalia (ARX)
- Hydrocephalus due to aqueductal stenosis (L1CAM)
- Hydrocephalus with Hirschsprung disease (L1CAM)
- Hydrocephalus with cong. idiopathic intestinal pseudoobstruction (L1CAM)
- Hydrocephalus, cong., 1 (CCDC88C)
- Hydrocephalus, congenital communicating, 1 (TRIM71)
- Hydrocephalus, congenital, 2, with/-out brain or eye anomalies (MPDZ)
- Hydrocephalus, congenital, 3, with brain anomalies (WDR81)
- Hydrolethalus syndrome (HYLS1)
- Hydrolethalus syndrome 2 (KIF7)
- Intellectual developmental disorder, XL 29 (ARX)
- Jackson-Weiss syndrome (FGFR1, FGFR2)
- Joubert syndrome 12 (KIF7)
- Joubert syndrome 14 (TMEM237)
- Joubert syndrome 16 (TMEM138)
- Joubert syndrome 17 (CPLANE1)
- Joubert syndrome 2 (TMEM216)
- Joubert syndrome 20 (TMEM231)
- Joubert syndrome 23 (KIAA0586)
- Joubert syndrome 24 (TCTN2)
- Joubert syndrome 27 (B9D1)
- Joubert syndrome 28 (MKS1)
- Joubert syndrome 32 (SUFU)
- Joubert syndrome 34 (B9D2)
- Joubert syndrome 5 (CEP290)
- Joubert syndrome 6 (TMEM67)
- Joubert syndrome 7 (RPGRIP1L)
- Joubert syndrome 9 (CC2D2A)
- LADD syndrome (FGFR2, FGFR3)
- Lhermitte-Duclos syndrome (PTEN)
- Lissencephaly 5 (LAMB1)
- Lissencephaly, XL 2 (ARX)
- Lymphangioleiomyomatosis (TSC1)
- MASA syndrome (L1CAM)
- MEND: Male Ebp disorder with Neurologic Defects syndrome (EBP)
- Macrocephaly/autism syndrome (PTEN)
- Mannosidosis, alpha-, types I + II MAN2B1)
- Meckel syndrome 1 (MKS1)
- Meckel syndrome 11 (TMEM231)
- Meckel syndrome 2 (TMEM216)
- Meckel syndrome 3 (TMEM67)
- Meckel syndrome 5 (RPGRIP1L)
- Meckel syndrome 6 (CC2D2A)
- Meckel syndrome 7 (NPHP3)
- Meckel syndrome 8 (TCTN2)
- Megalencephaly-capillary malformation-polymicrogyria syndrome, somatic (PIK3CA)
- Megalencephaly-polymicrogyria-polydactyly-hydrocephalus syndrome 1 (PIK3R2)
- Megalencephaly-polymicrogyria-polydactyly-hydrocephalus syndrome 2 (AKT3)
- Megalencephaly-polymicrogyria-polydactyly-hydrocephalus syndrome 3 (CCND2)
- Mental retardation, AD 35 (PPP2R5D)
- Mental retardation, XL 19 (RPS6KA3)
- Mental retardation, XL 99 (USP9X)
- Mental retardation, XL 99, syndromic, female-restricted (USP9X)
- Mental retardation, XL syndromic 5 (AP1S2)
- Microangiopathy + leukoencephalopathy, pontine, AD (COL4A1)
- Microphthalmia with coloboma 5 (SHH)
- Mosaic variegated aneuploidy syndrome 1 (BUB1B)
- Mucopolysaccharidosis II (IDS)
- Mucopolysaccharidosis VII (GUSB)
- Mucopolysaccharidosis type VI [Maroteaux-Lamy] (ARSB)
- Muenke syndrome (FGFR3)
- Multiple sulfatase deficiency (SUMF1)
- Muscular dystrophy-dystroglycanopathy (cong. with brain + eye anom.), A13 [MONDO:0014120] (B3GNT2)
- Muscular dystrophy-dystroglycanopathy (cong. with brain + eye anomalies), type A, 1 (POMT)
- Muscular dystrophy-dystroglycanopathy (cong. with brain + eye anomalies), type A, 10 (RXYLT1)
- Muscular dystrophy-dystroglycanopathy (cong. with brain + eye anomalies), type A, 11 (B3GALNT2)
- Muscular dystrophy-dystroglycanopathy (cong. with brain + eye anomalies), type A, 12 (POMK)
- Muscular dystrophy-dystroglycanopathy (cong. with brain + eye anomalies), type A, 13 (B4GAT1)
- Muscular dystrophy-dystroglycanopathy (cong. with brain + eye anomalies), type A, 2 (POMT2)
- Muscular dystrophy-dystroglycanopathy (cong. with brain + eye anomalies), type A, 3 (POMGNT1)
- Muscular dystrophy-dystroglycanopathy (cong. with brain + eye anomalies), type A, 4 (FKTN)
- Muscular dystrophy-dystroglycanopathy (cong. with brain + eye anomalies), type A, 5 (FKRP)
- Muscular dystrophy-dystroglycanopathy (cong. with brain + eye anomalies), type A, 6 (LARGE1)
- Muscular dystrophy-dystroglycanopathy (cong. with brain + eye anomalies), type A, 7 (CRPPA)
- Muscular dystrophy-dystroglycanopathy (cong. with brain + eye anomalies), type A, 8 (POMGNT2)
- Muscular dystrophy-dystroglycanopathy (cong. with brain + eye anomalies), type A, 9 (DAG1)
- Muscular dystrophy-dystroglycanopathy (cong. with mental retardation), type B, 1 (POMT)
- Muscular dystrophy-dystroglycanopathy (cong. with mental retardation), type B, 2 (POMT2)
- Muscular dystrophy-dystroglycanopathy (cong. with mental retardation), type B, 3 (POMGNT1)
- Muscular dystrophy-dystroglycanopathy (cong. with mental retardation), type B, 6 (LARGE1)
- Muscular dystrophy-dystroglycanopathy (cong. with/-out mental retardation), type B, 5 (FKRP)
- Muscular dystrophy-dystroglycanopathy (cong. without mental retardation), type B, 4 (FKTN)
- Muscular dystrophy-dystroglycanopathy (limb-girdle) type C, 8 (POMGNT2)
- Myotubular myopathy, XL ((MTM1)
- Nephronophthisis 11 (TMEM67)
- Nephronophthisis 18 (CEP83)
- Nephronophthisis 3 (NPHP3)
- Neural tube defects (VANGL2)
- Neural tube defects, susceptibility to (VANGL1)
- Neurofibromatosis, type 1 (NF1)
- Neurofibromatosis, type 2 (NF2)
- Orofaciodigital syndrome VI (CPLANE1)
- Orofaciodigital syndrome [MONDO:0015375] (TBC1D32)
- Osteopetrosis, AR (TCIRG1)
- Osteopetrosis, AR 5 (OSTM1)
- Osteopetrosis, AR 7 (TNFRSF11A)
- Osteopetrosis, AR 8 (SNX10)
- Otopalatodigital syndrome, type I + II (FLNA)
- Pallister-Hall syndrome (GLI3)
- Partington syndrome (ARX)
- Peters-plus syndrome (B3GLCT)
- Pfeiffer syndrome (FGFR1, FGFR2)
- Pheochromocytoma (VHL)
- Plasminogen deficiency, type I (PLG)
- Polyhydramnios, megalencephaly + symptomatic epilepsy (STRADA)
- Primrose syndrome (ZBTB20)
- Proliferative vasculopathy + hydranencephaly-hydrocephaly syndrome (FLVCR2)
- Proud syndrome (ARX)
- RHYNS syndrome (TMEM67)
- Raine syndrome (FAM20C)
- Renal-hepatic-pancreatic dysplasia 1 (NPHP3)
- Ritscher-Schinzel syndrome 1 (WASHC5)
- Robinow-Sorauf syndrome (TWIST1)
- SADDAN (FGFR3)
- Saethre-Chotzen syndrome (FGFR2)
- Saethre-Chotzen syndrome with/-out eyelid anomalies (TWIST1)
- Schizencephaly (SHH)
- Short-rib thoracic dysplasia 14 with polydactyly (KIAA0586)
- Shprintzen-Goldberg syndrome (SKI)
- Single median maxillary central incisor (SHH)
- Sotos syndrome 1 (NSD1)
- Spastic paraplegia, intellectual disability, nystagmus + obesity (KIDINS220)
- Spinocerebellar ataxia 26 (EEF2)
- Stromme syndrome (CENPF)
- Sweeney-Cox syndrome (TWIST1)
- Tenorio syndrome (RNF125)
- Tetra-amelia syndrome 1 (WNT3)
- Tuberous sclerosis-1 (TSC1)
- Tuberous sclerosis-2 (TSC2)
- VACTERL association (HOXD13)
- VACTERL association, XL (ZIC3)
- Ventriculomegaly and arthrogryposis (KIDINS220)
- Ventriculomegaly with cystic kidney disease (CRB2)
- Watson syndrome (NF1)
- Weyers acrofacial dysostosis (EVC2)
- von Hippel-Lindau syndrome (VHL)
- AD
- AR
- XL
- XLR
- Multiple OMIM-Ps
Bioinformatik und klinische Interpretation
Test-Stärken
- DAkkS-akkreditiertes Labor
- EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
- Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
- Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
- Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
- eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
- unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
- unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
- unsere umfassenden klinischen Aussagen
Testeinschränkungen
- Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
- Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
- es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
- die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
- Gen-Konversionen
- komplexe Inversionen
- Balancierte Translokationen
- Mitochondriale Varianten
- Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
- nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
- niedriger Mosaik-Status
- Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
- Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
- Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
- Varianten innerhalb von Pseudogenen
- die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde
Laboranforderung
Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.
Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.
Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.
Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.