Klinische FragestellungSpondyloepimetaphyseale Dysplasie, Differentialdiagnose
Zusammenfassung
Umfassendes differentialdiagnostisches panel für Spondyloepimetaphyseale Dysplasie mit 1 Leitlinien-kuratierten bzw. zusammen genommen 25 kuratierten Genen gemäß klinischer Verdachtsdiagnose
42,4 kb (Erweitertes Panel: inkl. additional genes)
- EDTA-Blut (3-5 ml)
NGS +
Genpanel
Ausgewählte Gene
Name | Exon-Länge (bp) | OMIM-G | Referenz-Seq. | Erbgang |
---|---|---|---|---|
ACAN | 7593 | NM_013227.4 | AR, AD | |
B3GALT6 | 990 | NM_080605.4 | AR | |
BGN | 1107 | NM_001711.6 | XL | |
COL2A1 | 4464 | NM_001844.5 | AD | |
KIF22 | 1794 | NM_001256269.2 | AD | |
MATN3 | 1461 | NM_002381.5 | AD | |
MMP13 | 1416 | NM_002427.4 | AD, AR | |
SIK3 | 3966 | NM_025164.6 | AR | |
TRPV4 | 2616 | NM_021625.5 | AD | |
AIFM1 | 1842 | NM_004208.4 | XLR | |
DDRGK1 | 945 | NM_023935.3 | AR | |
EXOC6B | 2436 | NM_015189.3 | AR | |
FGFR1 | 2469 | NM_023110.3 | AD | |
NANS | 1111 | NM_018946.4 | AR | |
RPL13 | 641 | NM_000977.4 | AD | |
RSPRY1 | 1843 | NM_133368.3 | AR | |
TONSL | 4246 | NM_013432.5 | AR | |
UFSP2 | 1422 | NM_018359.5 | AD |
Infos zur Erkrankung
Skelettdysplasien sind eine äußerst vielfältige und komplexe Gruppe jeweils seltener Krankheiten, die die Entwicklung und Homöostase des Skeletts beeinträchtigen. Spondyloepimetaphyseale Dysplasie geht einher mit extremem Kleinwuchs (66-71 cm) mit kurzem Hals und tonnenförmiger Brust, Brachydaktylie, Makrozephalie und schwerer Mittelgesichtshypoplasie. Zu den Besonderheiten der Wirbelsäule gehörten Platyspondylie mit multiplen Halswirbelspalten. Heterozygote Träger werden nur etwa 150 cm groß, entsprechend einem milden, proportionierten Kleinwuchs-Phänotyp. Spondyloepimetaphyseale Dysplasie im engeren Sinn wird autosomal rezessiv vererbt, wiewohl andere Mutationen in demselben Gen sich bei allelischen Leiden dominant auswirken – ebenso wie Mutationen in anderen Genen, die differentialdiagnostisch mitunter schwer abzutrennen sind. Die DNA-diagnostische Ausbeute ist nicht genauer bekannt. Daher bedeutet ein unauffälliger genetischer Befund keinen Ausschluss der klinischen Verdachtsdiagnose, insbesondere da die Differentialdiadiagnose mit (klinisch eng) verwandten Skelettdysplasien sehr schwierig sein kann.
Referenz: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK555103/
- Allelic: Al-Gazali syndrome (B3GALT6)
- Allelic: Cartilage-hair hypoplasia (RMRP)
- Allelic: Ehlers-Danlos syndrome, spondylodysplastic type, 2 (B3GALT6)
- Allelic: Epiphyseal dysplasia, multiple, 5 (MATN3)
- Allelic: Hip dysplasia, Beukes type (UFSP2)
- Allelic: Osteoarthritis susceptibility 2 (MATN3)
- Allelic: Short stature, adv. bone age, with/-out early osteoarthritis +/- osteochondr. diss. (ACAN)
- Allelic: Warburg-Cinotti syndrome (DDR2)
- Anauxetic dysplasia 1 (RMRP)
- Anauxetic dysplasia 2 (POP1)
- Brachyolmia 4 with mild epiphyseal + metaphyseal changes (PAPSS2)
- Cataracts, growth hormone def., sensory neurop., sensorineural hearing loss, skeletal dyspl. (IARS2)
- Dyggve-Melchior-Clausen disease (DYM)
- Epiphyseal dysplasia, multiple, 5 (MATN3)
- Liberfarb syndrome (PISD)
- Metaphyseal anadysplasia 1 (MMP13)
- Metaphyseal dysplasia without hypotrichosis (RMRP)
- Metaphyseal dysplasia, Spahr type (MMP13)
- Osteoglophonic dysplasia (FGFR1)
- Smith-McCort dysplasia (DYM)
- Spondyloepimetaphyseal dysplasia with joint laxity, type 1, with/-out fractures (B3GALT6)
- Spondyloepimetaphyseal dysplasia with joint laxity, type 2 (KIF22))
- Spondyloepimetaphyseal dysplasia with joint laxity, type 3 (EXOC6B)
- Spondyloepimetaphyseal dysplasia, Borochowitz-Cormier-Daire type (MATN3)
- Spondyloepimetaphyseal dysplasia, Camera-Genevieve type (NANS)
- Spondyloepimetaphyseal dysplasia, Di Rocco type (UFSP2)
- Spondyloepimetaphyseal dysplasia, Faden-Alkuraya type (RSPRY1)
- Spondyloepimetaphyseal dysplasia, Isidor-Toutain type (RPL13)
- Spondyloepimetaphyseal dysplasia, Krakow type (SIK3)
- Spondyloepimetaphyseal dysplasia, Missouri type (MMP13)
- Spondyloepimetaphyseal dysplasia, Shohat type (DDRGK1)
- Spondyloepimetaphyseal dysplasia, Strudwick type (COL2A1)
- Spondyloepimetaphyseal dysplasia, XL (BGN)
- Spondyloepimetaphyseal dysplasia, XL, with hypomyelinating leukodystrophy (AIFM1)
- Spondyloepimetaphyseal dysplasia, aggrecan type (ACAN)
- Spondyloepimetaphyseal dysplasia, sponastrime type (TONSL)
- Spondyloepiphyseal dysplasia, Kimberley type (ACAN)
- Spondyloepiphyseal dysplasia, Maroteaux type (TRPV4)
- Spondylometaepiphyseal dysplasia, short limb-hand type (DDR2)
- Spondylometaphyseal dysplasia, Kozlowski type (TRPV4)
- AD
- AR
- XL
- XLR
- Multiple OMIM-Ps
Bioinformatik und klinische Interpretation
Test-Stärken
- DAkkS-akkreditiertes Labor
- EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
- Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
- Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
- Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
- eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
- unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
- unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
- unsere umfassenden klinischen Aussagen
Testeinschränkungen
- Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
- Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
- es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
- die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
- Gen-Konversionen
- komplexe Inversionen
- Balancierte Translokationen
- Mitochondriale Varianten
- Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
- nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
- niedriger Mosaik-Status
- Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
- Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
- Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
- Varianten innerhalb von Pseudogenen
- die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde
Laboranforderung
Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.
Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.
Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.
Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.